MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016810	TAA	2	6	230638	230643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016810	CAG	2	6	230660	230665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698174
5003	NC_016810	TGC	2	6	230679	230684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698174
5004	NC_016810	TGC	2	6	230718	230723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698174
5005	NC_016810	CGA	2	6	230793	230798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698174
5006	NC_016810	CAC	2	6	230901	230906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698174
5007	NC_016810	AAG	2	6	230912	230917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698174
5008	NC_016810	CGG	3	9	230988	230996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698174
5009	NC_016810	ACC	2	6	231029	231034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698174
5010	NC_016810	GCG	3	9	231097	231105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698174
5011	NC_016810	CTG	2	6	231146	231151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698174
5012	NC_016810	CCA	2	6	231152	231157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698174
5013	NC_016810	CAG	2	6	231177	231182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698174
5014	NC_016810	ATC	2	6	231221	231226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_016810	GAT	2	6	231246	231251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016810	A	7	7	231261	231267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016810	TA	3	6	231273	231278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016810	A	6	6	231311	231316	100 %	0 %	0 %	0 %	378698175
5019	NC_016810	GTG	2	6	231341	231346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698175
5020	NC_016810	GAT	2	6	231428	231433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698175
5021	NC_016810	TC	3	6	231445	231450	0 %	50 %	0 %	50 %	378698175
5022	NC_016810	ATC	2	6	231489	231494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698175
5023	NC_016810	TTA	2	6	231537	231542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698175
5024	NC_016810	ATA	2	6	231555	231560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698175
5025	NC_016810	GCT	2	6	231607	231612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698175
5026	NC_016810	ATT	2	6	231734	231739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698175
5027	NC_016810	TAT	2	6	231813	231818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698175
5028	NC_016810	ATG	2	6	231858	231863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698175
5029	NC_016810	GGTG	2	8	231898	231905	0 %	25 %	75 %	0 %	378698175
5030	NC_016810	GC	3	6	231928	231933	0 %	0 %	50 %	50 %	378698175
5031	NC_016810	GGCG	2	8	232035	232042	0 %	0 %	75 %	25 %	378698175
5032	NC_016810	GGC	2	6	232121	232126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5033	NC_016810	CGA	2	6	232138	232143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698175
5034	NC_016810	AT	3	6	232182	232187	50 %	50 %	0 %	0 %	378698175
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5036	NC_016810	GCGG	2	8	232230	232237	0 %	0 %	75 %	25 %	378698175
5037	NC_016810	GAA	2	6	232325	232330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698175
5038	NC_016810	GGC	2	6	232454	232459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5039	NC_016810	CCT	2	6	232479	232484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698175
5040	NC_016810	CGG	2	6	232513	232518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5041	NC_016810	GCT	2	6	232576	232581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698175
5042	NC_016810	TGA	2	6	232696	232701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698175
5043	NC_016810	GAA	2	6	232742	232747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698175
5044	NC_016810	TGA	2	6	233023	233028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698175
5045	NC_016810	CAA	2	6	233062	233067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698175
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5048	NC_016810	CTA	2	6	233203	233208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698175
5049	NC_016810	CGG	2	6	233275	233280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5050	NC_016810	GCG	2	6	233295	233300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5051	NC_016810	GCACC	2	10	233329	233338	20 %	0 %	20 %	60 %	378698175
5052	NC_016810	CGG	2	6	233347	233352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5053	NC_016810	GCT	2	6	233359	233364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698175
5054	NC_016810	TA	3	6	233418	233423	50 %	50 %	0 %	0 %	378698175
5055	NC_016810	ACT	2	6	233463	233468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698175
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5057	NC_016810	A	6	6	233594	233599	100 %	0 %	0 %	0 %	378698175
5058	NC_016810	GGC	2	6	233627	233632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5059	NC_016810	CGC	2	6	233634	233639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698175
5060	NC_016810	ACA	2	6	233658	233663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698175
5061	NC_016810	TGC	2	6	233820	233825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698175
5062	NC_016810	TCA	2	6	233843	233848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698175
5063	NC_016810	GCG	2	6	233899	233904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698175
5064	NC_016810	CT	3	6	233930	233935	0 %	50 %	0 %	50 %	378698175
5065	NC_016810	ATG	2	6	233974	233979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698176
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5093	NC_016810	CGG	3	9	235531	235539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698178
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5105	NC_016810	GGAG	2	8	236424	236431	25 %	0 %	75 %	0 %	378698180
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5109	NC_016810	CAGTT	2	10	236718	236727	20 %	40 %	20 %	20 %	378698180
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5117	NC_016810	A	9	9	237146	237154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016810	GGC	2	6	237161	237166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_016810	GTT	2	6	237186	237191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_016810	TAT	2	6	237245	237250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698181
5122	NC_016810	GTC	2	6	237255	237260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5123	NC_016810	TG	3	6	237266	237271	0 %	50 %	50 %	0 %	378698181
5124	NC_016810	CGAC	2	8	237272	237279	25 %	0 %	25 %	50 %	378698181
5125	NC_016810	TCC	2	6	237322	237327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698181
5126	NC_016810	GAA	2	6	237339	237344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698181
5127	NC_016810	GAA	2	6	237411	237416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698181
5128	NC_016810	GCC	2	6	237429	237434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
5129	NC_016810	GAC	2	6	237444	237449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5130	NC_016810	CCT	2	6	237464	237469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698181
5131	NC_016810	GTG	2	6	237502	237507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698181
5132	NC_016810	TTCA	2	8	237546	237553	25 %	50 %	0 %	25 %	378698181
5133	NC_016810	GCC	2	6	237568	237573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
5134	NC_016810	CGA	2	6	237649	237654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5135	NC_016810	CGC	2	6	237680	237685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
5136	NC_016810	GAT	2	6	237687	237692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698181
5137	NC_016810	CAGGT	2	10	237703	237712	20 %	20 %	40 %	20 %	378698181
5138	NC_016810	ACG	2	6	237718	237723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5139	NC_016810	GTA	2	6	237726	237731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698181
5140	NC_016810	TCG	2	6	237775	237780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5141	NC_016810	CAG	2	6	237786	237791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5142	NC_016810	GC	3	6	237814	237819	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
5143	NC_016810	GCG	2	6	237842	237847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698181
5144	NC_016810	CGA	2	6	237878	237883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5145	NC_016810	CG	3	6	237921	237926	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
5146	NC_016810	GC	3	6	238016	238021	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
5147	NC_016810	CAG	2	6	238038	238043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5148	NC_016810	AGC	2	6	238064	238069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5149	NC_016810	TCG	2	6	238130	238135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698181
5150	NC_016810	GC	3	6	238226	238231	0 %	0 %	50 %	50 %	378698181
5151	NC_016810	CAT	2	6	238349	238354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698181
5152	NC_016810	GCC	2	6	238395	238400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
5153	NC_016810	CGC	2	6	238433	238438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698181
5154	NC_016810	TCT	2	6	238650	238655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5155	NC_016810	CGC	2	6	238748	238753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698182
5156	NC_016810	GGC	2	6	238770	238775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5157	NC_016810	GC	3	6	238853	238858	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
5158	NC_016810	CGG	2	6	238968	238973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5159	NC_016810	GGA	2	6	239004	239009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698182
5160	NC_016810	TGG	2	6	239026	239031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698182
5161	NC_016810	CGG	2	6	239055	239060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5162	NC_016810	CGGCG	2	10	239196	239205	0 %	0 %	60 %	40 %	378698182
5163	NC_016810	CT	3	6	239212	239217	0 %	50 %	0 %	50 %	378698182
5164	NC_016810	GCG	2	6	239218	239223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5165	NC_016810	CGC	2	6	239231	239236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698182
5166	NC_016810	TAT	2	6	239253	239258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
5167	NC_016810	TCA	2	6	239321	239326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698182
5168	NC_016810	ATT	2	6	239368	239373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
5169	NC_016810	TAT	2	6	239433	239438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
5170	NC_016810	TGC	2	6	239474	239479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698182
5171	NC_016810	GGC	2	6	239509	239514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5172	NC_016810	A	6	6	239521	239526	100 %	0 %	0 %	0 %	378698182
5173	NC_016810	GCG	2	6	239540	239545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5174	NC_016810	CGG	2	6	239550	239555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5175	NC_016810	TTGA	2	8	239575	239582	25 %	50 %	25 %	0 %	378698182
5176	NC_016810	GCCG	2	8	239583	239590	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
5177	NC_016810	GGC	2	6	239596	239601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5178	NC_016810	CGC	2	6	239622	239627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698182
5179	NC_016810	CTG	2	6	239653	239658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698182
5180	NC_016810	TTA	2	6	239666	239671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698182
5181	NC_016810	ACG	2	6	239683	239688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698182
5182	NC_016810	TGCTT	2	10	239690	239699	0 %	60 %	20 %	20 %	378698182
5183	NC_016810	TTC	2	6	239700	239705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698182
5184	NC_016810	GC	3	6	239708	239713	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
5185	NC_016810	G	6	6	239715	239720	0 %	0 %	100 %	0 %	378698182
5186	NC_016810	GCT	2	6	239751	239756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698182
5187	NC_016810	GGC	3	9	239775	239783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5188	NC_016810	GGC	2	6	239850	239855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5189	NC_016810	GC	3	6	239862	239867	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
5190	NC_016810	TGCTGG	2	12	239885	239896	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378698182
5191	NC_016810	GC	3	6	240004	240009	0 %	0 %	50 %	50 %	378698182
5192	NC_016810	GGC	2	6	240036	240041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698182
5193	NC_016810	TGA	2	6	240165	240170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698183
5194	NC_016810	GCA	2	6	240199	240204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698183
5195	NC_016810	CGG	2	6	240273	240278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698183
5196	NC_016810	TGG	2	6	240365	240370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698183
5197	NC_016810	TGG	2	6	240395	240400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698183
5198	NC_016810	AACC	2	8	240450	240457	50 %	0 %	0 %	50 %	378698183
5199	NC_016810	CTTC	2	8	240488	240495	0 %	50 %	0 %	50 %	378698183
5200	NC_016810	GCC	2	6	240660	240665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698184
5201	NC_016810	ACC	2	6	240684	240689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698184
5202	NC_016810	CAT	2	6	240695	240700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698184
5203	NC_016810	ATA	2	6	240762	240767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698184
5204	NC_016810	AAT	2	6	240830	240835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698184
5205	NC_016810	CGC	2	6	240838	240843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698184
5206	NC_016810	ACAG	2	8	240866	240873	50 %	0 %	25 %	25 %	378698184
5207	NC_016810	TGGC	2	8	240983	240990	0 %	25 %	50 %	25 %	378698184
5208	NC_016810	CGA	2	6	241027	241032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698184
5209	NC_016810	CGC	2	6	241099	241104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698184
5210	NC_016810	ACG	2	6	241116	241121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698184
5211	NC_016810	GTT	2	6	241294	241299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698185
5212	NC_016810	GCG	2	6	241302	241307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698185
5213	NC_016810	ATA	2	6	241311	241316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698185
5214	NC_016810	CCG	2	6	241512	241517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698185
5215	NC_016810	GTC	2	6	241521	241526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698185
5216	NC_016810	GAA	2	6	241585	241590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698185
5217	NC_016810	GCG	2	6	241632	241637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698185
5218	NC_016810	CTGC	2	8	241660	241667	0 %	25 %	25 %	50 %	378698185
5219	NC_016810	GGC	2	6	241694	241699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698185
5220	NC_016810	CCAC	2	8	241744	241751	25 %	0 %	0 %	75 %	378698185
5221	NC_016810	CCG	2	6	241803	241808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698185
5222	NC_016810	CGA	2	6	241816	241821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698185
5223	NC_016810	ATTC	2	8	241856	241863	25 %	50 %	0 %	25 %	378698185
5224	NC_016810	T	6	6	241888	241893	0 %	100 %	0 %	0 %	378698185
5225	NC_016810	CGGG	2	8	241900	241907	0 %	0 %	75 %	25 %	378698185
5226	NC_016810	GCT	2	6	241919	241924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698185
5227	NC_016810	CGG	2	6	241945	241950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698185
5228	NC_016810	GA	3	6	241975	241980	50 %	0 %	50 %	0 %	378698185
5229	NC_016810	CG	3	6	241990	241995	0 %	0 %	50 %	50 %	378698185
5230	NC_016810	AGC	2	6	242025	242030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698185
5231	NC_016810	CGC	2	6	242112	242117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698186
5232	NC_016810	ACC	2	6	242182	242187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698186
5233	NC_016810	TAA	2	6	242300	242305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698186
5234	NC_016810	CGC	2	6	242312	242317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698186
5235	NC_016810	CT	3	6	242352	242357	0 %	50 %	0 %	50 %	378698186
5236	NC_016810	CGG	2	6	242372	242377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698186
5237	NC_016810	CCGG	2	8	242404	242411	0 %	0 %	50 %	50 %	378698186
5238	NC_016810	CGT	2	6	242459	242464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698186
5239	NC_016810	GAC	2	6	242484	242489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698186
5240	NC_016810	TGA	2	6	242540	242545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698186
5241	NC_016810	GCC	2	6	242590	242595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698186
5242	NC_016810	GCC	2	6	242667	242672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698186
5243	NC_016810	GCA	2	6	242708	242713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698186
5244	NC_016810	CTT	3	9	242720	242728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698186
5245	NC_016810	ATG	2	6	242740	242745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698186
5246	NC_016810	ATCG	2	8	242846	242853	25 %	25 %	25 %	25 %	378698187
5247	NC_016810	TCG	2	6	242879	242884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698187
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5342	NC_016810	AT	3	6	247260	247265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5343	NC_016810	AC	3	6	247305	247310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5349	NC_016810	CGAT	2	8	247648	247655	25 %	25 %	25 %	25 %	378698190
5350	NC_016810	CATA	2	8	247694	247701	50 %	25 %	0 %	25 %	378698190
5351	NC_016810	TCA	2	6	247712	247717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5353	NC_016810	CCA	2	6	247759	247764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5354	NC_016810	A	7	7	247773	247779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_016810	AGA	2	6	247794	247799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_016810	GCG	2	6	247827	247832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5357	NC_016810	CTA	2	6	247966	247971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698191
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5361	NC_016810	T	8	8	248068	248075	0 %	100 %	0 %	0 %	378698191
5362	NC_016810	TCT	2	6	248106	248111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698191
5363	NC_016810	GC	3	6	248152	248157	0 %	0 %	50 %	50 %	378698191
5364	NC_016810	T	6	6	248160	248165	0 %	100 %	0 %	0 %	378698191
5365	NC_016810	TTA	2	6	248202	248207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698191
5366	NC_016810	G	6	6	248217	248222	0 %	0 %	100 %	0 %	378698191
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5491	NC_016810	GTT	2	6	253683	253688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698194
5492	NC_016810	GGT	2	6	253729	253734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698194
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5494	NC_016810	GAT	2	6	253863	253868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5496	NC_016810	TCAG	2	8	253903	253910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5497	NC_016810	T	6	6	253979	253984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_016810	ACTG	2	8	253995	254002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5499	NC_016810	TGC	2	6	254031	254036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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