MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016810	AT	3	6	209787	209792	50 %	50 %	0 %	0 %	378698158
4502	NC_016810	GTT	2	6	209803	209808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698158
4503	NC_016810	ACG	2	6	209872	209877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698158
4504	NC_016810	GCC	2	6	209884	209889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698158
4505	NC_016810	ATT	2	6	209975	209980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698158
4506	NC_016810	TGG	2	6	210170	210175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698158
4507	NC_016810	ATT	2	6	210193	210198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698158
4508	NC_016810	GGCT	2	8	210254	210261	0 %	25 %	50 %	25 %	378698158
4509	NC_016810	ATC	2	6	210314	210319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698158
4510	NC_016810	TGA	2	6	210330	210335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698158
4511	NC_016810	CCA	2	6	210362	210367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698158
4512	NC_016810	TTCGG	2	10	210372	210381	0 %	40 %	40 %	20 %	378698158
4513	NC_016810	GGA	2	6	210447	210452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698158
4514	NC_016810	GC	4	8	210481	210488	0 %	0 %	50 %	50 %	378698158
4515	NC_016810	TGA	2	6	210504	210509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698158
4516	NC_016810	TAT	2	6	210579	210584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698158
4517	NC_016810	T	6	6	210699	210704	0 %	100 %	0 %	0 %	378698158
4518	NC_016810	CGC	2	6	210724	210729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698158
4519	NC_016810	TA	3	6	210737	210742	50 %	50 %	0 %	0 %	378698158
4520	NC_016810	ATA	2	6	210755	210760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698158
4521	NC_016810	CGG	2	6	210784	210789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698158
4522	NC_016810	TCTT	2	8	210822	210829	0 %	75 %	0 %	25 %	378698158
4523	NC_016810	AGC	2	6	210864	210869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698158
4524	NC_016810	TGC	2	6	210938	210943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698158
4525	NC_016810	CTT	2	6	211116	211121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698159
4526	NC_016810	GCC	2	6	211181	211186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698159
4527	NC_016810	GAT	2	6	211201	211206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698159
4528	NC_016810	CTTGC	2	10	211381	211390	0 %	40 %	20 %	40 %	378698159
4529	NC_016810	CTT	2	6	211410	211415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_016810	GGC	2	6	211556	211561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698160
4531	NC_016810	CAG	2	6	211601	211606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698160
4532	NC_016810	GTC	2	6	211631	211636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698160
4533	NC_016810	TTCA	2	8	211652	211659	25 %	50 %	0 %	25 %	378698160
4534	NC_016810	GGCAAT	2	12	211670	211681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378698160
4535	NC_016810	TCA	2	6	211732	211737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698160
4536	NC_016810	GCT	2	6	211765	211770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698160
4537	NC_016810	TGAGC	2	10	211793	211802	20 %	20 %	40 %	20 %	378698160
4538	NC_016810	AAT	2	6	211823	211828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698160
4539	NC_016810	CGA	2	6	211837	211842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698160
4540	NC_016810	CCA	2	6	211867	211872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698160
4541	NC_016810	CGC	2	6	211969	211974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698160
4542	NC_016810	AG	3	6	212012	212017	50 %	0 %	50 %	0 %	378698160
4543	NC_016810	ACGT	2	8	212031	212038	25 %	25 %	25 %	25 %	378698160
4544	NC_016810	CAC	2	6	212204	212209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698160
4545	NC_016810	CGT	2	6	212251	212256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698160
4546	NC_016810	TGG	2	6	212269	212274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698160
4547	NC_016810	GAC	2	6	212308	212313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698160
4548	NC_016810	GCA	2	6	212326	212331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698160
4549	NC_016810	CAA	2	6	212356	212361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698160
4550	NC_016810	TGA	2	6	212378	212383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016810	GCGCT	2	10	212396	212405	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4552	NC_016810	CGCGT	2	10	212448	212457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4553	NC_016810	TTC	2	6	212497	212502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698161
4554	NC_016810	CTG	2	6	212539	212544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698161
4555	NC_016810	CGG	2	6	212547	212552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698161
4556	NC_016810	CCG	2	6	212606	212611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698161
4557	NC_016810	GCCGAT	2	12	212668	212679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378698161
4558	NC_016810	GCAC	2	8	212727	212734	25 %	0 %	25 %	50 %	378698161
4559	NC_016810	CCAGCA	2	12	212736	212747	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378698161
4560	NC_016810	CAG	2	6	212785	212790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698161
4561	NC_016810	GCC	2	6	212827	212832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698161
4562	NC_016810	CCAG	2	8	212916	212923	25 %	0 %	25 %	50 %	378698161
4563	NC_016810	GCC	2	6	212926	212931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698161
4564	NC_016810	CGCA	2	8	212956	212963	25 %	0 %	25 %	50 %	378698161
4565	NC_016810	GC	3	6	213045	213050	0 %	0 %	50 %	50 %	378698161
4566	NC_016810	CG	3	6	213061	213066	0 %	0 %	50 %	50 %	378698161
4567	NC_016810	CAGG	2	8	213096	213103	25 %	0 %	50 %	25 %	378698161
4568	NC_016810	AG	3	6	213134	213139	50 %	0 %	50 %	0 %	378698161
4569	NC_016810	TCG	2	6	213167	213172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698161
4570	NC_016810	T	6	6	213223	213228	0 %	100 %	0 %	0 %	378698161
4571	NC_016810	CTTG	2	8	213231	213238	0 %	50 %	25 %	25 %	378698161
4572	NC_016810	GCA	2	6	213246	213251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698161
4573	NC_016810	TGG	3	9	213258	213266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698161
4574	NC_016810	G	6	6	213328	213333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_016810	GCA	2	6	213413	213418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698162
4576	NC_016810	AGATC	2	10	213462	213471	40 %	20 %	20 %	20 %	378698162
4577	NC_016810	CGGT	2	8	213542	213549	0 %	25 %	50 %	25 %	378698162
4578	NC_016810	TTC	2	6	213667	213672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698162
4579	NC_016810	GCG	3	9	213738	213746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698162
4580	NC_016810	GAA	2	6	213758	213763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378698162
4581	NC_016810	CGA	2	6	213768	213773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698162
4582	NC_016810	GGC	2	6	213808	213813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698162
4583	NC_016810	CGCGG	2	10	213884	213893	0 %	0 %	60 %	40 %	378698163
4584	NC_016810	CG	3	6	213894	213899	0 %	0 %	50 %	50 %	378698163
4585	NC_016810	ACG	2	6	213915	213920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4586	NC_016810	GCG	2	6	213921	213926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698163
4587	NC_016810	TCG	2	6	213937	213942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4588	NC_016810	CGG	2	6	213972	213977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698163
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4590	NC_016810	TAT	2	6	214028	214033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378698163
4591	NC_016810	GC	3	6	214045	214050	0 %	0 %	50 %	50 %	378698163
4592	NC_016810	CGCGG	2	10	214068	214077	0 %	0 %	60 %	40 %	378698163
4593	NC_016810	CAT	2	6	214214	214219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378698163
4594	NC_016810	CGT	2	6	214238	214243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4595	NC_016810	T	6	6	214271	214276	0 %	100 %	0 %	0 %	378698163
4596	NC_016810	CAG	2	6	214287	214292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4597	NC_016810	GGC	2	6	214308	214313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378698163
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4600	NC_016810	AAC	2	6	214441	214446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378698163
4601	NC_016810	GGT	2	6	214457	214462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378698163
4602	NC_016810	GTT	2	6	214472	214477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698163
4603	NC_016810	GC	3	6	214533	214538	0 %	0 %	50 %	50 %	378698163
4604	NC_016810	GGA	2	6	214540	214545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378698163
4605	NC_016810	GC	3	6	214633	214638	0 %	0 %	50 %	50 %	378698163
4606	NC_016810	CTT	2	6	214700	214705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698163
4607	NC_016810	CCG	2	6	214720	214725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378698163
4608	NC_016810	GTA	2	6	214758	214763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698163
4609	NC_016810	TCT	2	6	214798	214803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378698163
4610	NC_016810	TGT	2	6	214820	214825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378698163
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4612	NC_016810	ATG	2	6	214887	214892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378698163
4613	NC_016810	ACG	2	6	214953	214958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698163
4614	NC_016810	CCA	2	6	214961	214966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378698163
4615	NC_016810	AAT	2	6	214981	214986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378698163
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4617	NC_016810	CTC	2	6	215217	215222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698163
4618	NC_016810	TAA	2	6	215293	215298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016810	AG	3	6	215343	215348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_016810	CAT	2	6	215370	215375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_016810	CGC	2	6	215379	215384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_016810	GCA	2	6	215512	215517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378698164
4623	NC_016810	CTC	2	6	215519	215524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378698164
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4626	NC_016810	TCG	2	6	215787	215792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698164
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4641	NC_016810	TGC	2	6	216325	216330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698164
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4643	NC_016810	CAGC	2	8	216423	216430	25 %	0 %	25 %	50 %	378698165
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4652	NC_016810	TAA	2	6	217004	217009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4653	NC_016810	GTTC	2	8	217046	217053	0 %	50 %	25 %	25 %	378698166
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4740	NC_016810	CG	3	6	220643	220648	0 %	0 %	50 %	50 %	378698168
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4742	NC_016810	GA	3	6	220843	220848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4743	NC_016810	TCT	3	9	220851	220859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4745	NC_016810	GAA	2	6	220871	220876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_016810	CGT	2	6	220992	220997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698169
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4867	NC_016810	GATG	2	8	225750	225757	25 %	25 %	50 %	0 %	378698170
4868	NC_016810	GTC	2	6	225760	225765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378698170
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4992	NC_016810	TAT	2	6	230410	230415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4993	NC_016810	TAAA	2	8	230434	230441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_016810	A	6	6	230439	230444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_016810	TTAT	2	8	230496	230503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_016810	GTT	2	6	230510	230515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_016810	CTT	2	6	230518	230523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4998	NC_016810	ATATA	2	10	230557	230566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_016810	CTA	2	6	230570	230575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5000	NC_016810	TG	3	6	230605	230610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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