MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016633	GA	3	6	231977	231982	50 %	0 %	50 %	0 %	374314662
4002	NC_016633	AGT	2	6	232023	232028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314662
4003	NC_016633	AAC	2	6	232145	232150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314662
4004	NC_016633	ATT	2	6	232187	232192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314662
4005	NC_016633	TCT	2	6	232353	232358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314662
4006	NC_016633	T	6	6	232410	232415	0 %	100 %	0 %	0 %	374314662
4007	NC_016633	CAA	2	6	232491	232496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314662
4008	NC_016633	TCGA	2	8	232497	232504	25 %	25 %	25 %	25 %	374314662
4009	NC_016633	CTT	2	6	232579	232584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314662
4010	NC_016633	T	6	6	232583	232588	0 %	100 %	0 %	0 %	374314662
4011	NC_016633	GATCG	2	10	232610	232619	20 %	20 %	40 %	20 %	374314662
4012	NC_016633	GGT	2	6	232634	232639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314662
4013	NC_016633	CTTGT	2	10	232682	232691	0 %	60 %	20 %	20 %	374314662
4014	NC_016633	ACTTTG	2	12	232740	232751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374314662
4015	NC_016633	GCCAAG	2	12	232766	232777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314662
4016	NC_016633	GC	3	6	232783	232788	0 %	0 %	50 %	50 %	374314662
4017	NC_016633	AGG	2	6	232846	232851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314662
4018	NC_016633	TCCT	2	8	232856	232863	0 %	50 %	0 %	50 %	374314662
4019	NC_016633	CAT	2	6	232870	232875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314662
4020	NC_016633	ATG	2	6	232986	232991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314662
4021	NC_016633	GTT	2	6	232996	233001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314662
4022	NC_016633	TTA	2	6	233002	233007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314662
4023	NC_016633	GAA	2	6	233142	233147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314662
4024	NC_016633	GAT	2	6	233165	233170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314662
4025	NC_016633	GGAC	2	8	233191	233198	25 %	0 %	50 %	25 %	374314662
4026	NC_016633	GCT	2	6	233234	233239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314662
4027	NC_016633	ATT	2	6	233328	233333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314662
4028	NC_016633	CTT	2	6	233344	233349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314662
4029	NC_016633	AGGAA	2	10	233365	233374	60 %	0 %	40 %	0 %	374314662
4030	NC_016633	AACCG	2	10	233493	233502	40 %	0 %	20 %	40 %	374314663
4031	NC_016633	ATA	2	6	233521	233526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314663
4032	NC_016633	TTG	2	6	233533	233538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314663
4033	NC_016633	GGC	2	6	233559	233564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314663
4034	NC_016633	CTT	2	6	233675	233680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314663
4035	NC_016633	CTG	2	6	233777	233782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314663
4036	NC_016633	GAA	2	6	233940	233945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314663
4037	NC_016633	TCA	2	6	233977	233982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314663
4038	NC_016633	ACC	2	6	234057	234062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314663
4039	NC_016633	CTG	2	6	234089	234094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314663
4040	NC_016633	TTTTG	2	10	234247	234256	0 %	80 %	20 %	0 %	374314663
4041	NC_016633	CCATG	2	10	234293	234302	20 %	20 %	20 %	40 %	374314663
4042	NC_016633	GAA	2	6	234328	234333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314663
4043	NC_016633	AGG	2	6	234445	234450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314663
4044	NC_016633	GTG	2	6	234500	234505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314663
4045	NC_016633	GATC	2	8	234521	234528	25 %	25 %	25 %	25 %	374314663
4046	NC_016633	TTGA	2	8	234534	234541	25 %	50 %	25 %	0 %	374314663
4047	NC_016633	TATT	2	8	234598	234605	25 %	75 %	0 %	0 %	374314663
4048	NC_016633	TCT	2	6	234616	234621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314663
4049	NC_016633	T	7	7	234639	234645	0 %	100 %	0 %	0 %	374314663
4050	NC_016633	TGT	2	6	234692	234697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314663
4051	NC_016633	ATA	2	6	234711	234716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314663
4052	NC_016633	CTAT	2	8	234825	234832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_016633	AAGAT	2	10	234849	234858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016633	ATT	2	6	234876	234881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016633	A	6	6	234891	234896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016633	A	8	8	234911	234918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016633	TAA	2	6	234919	234924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016633	G	6	6	234933	234938	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016633	AAT	2	6	234960	234965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016633	AAT	2	6	234987	234992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016633	TTG	2	6	235022	235027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016633	CAG	2	6	235059	235064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_016633	AGCAG	2	10	235129	235138	40 %	0 %	40 %	20 %	374314664
4064	NC_016633	CAA	2	6	235157	235162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314664
4065	NC_016633	GAG	2	6	235194	235199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314664
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4069	NC_016633	AGAT	2	8	235532	235539	50 %	25 %	25 %	0 %	374314664
4070	NC_016633	AAG	2	6	235607	235612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314664
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4073	NC_016633	T	6	6	235752	235757	0 %	100 %	0 %	0 %	374314664
4074	NC_016633	AAG	2	6	235787	235792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314664
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4077	NC_016633	T	6	6	235842	235847	0 %	100 %	0 %	0 %	374314664
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4080	NC_016633	GCC	2	6	235905	235910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314664
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4084	NC_016633	CAG	2	6	236004	236009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314664
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4088	NC_016633	CCTC	2	8	236339	236346	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4089	NC_016633	ATT	2	6	236351	236356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016633	A	6	6	236401	236406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016633	AGGGT	2	10	236417	236426	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_016633	GTT	2	6	236853	236858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314665
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4100	NC_016633	TGGC	2	8	237003	237010	0 %	25 %	50 %	25 %	374314665
4101	NC_016633	TGG	2	6	237015	237020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314665
4102	NC_016633	TGA	2	6	237053	237058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314665
4103	NC_016633	AGGA	2	8	237202	237209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016633	ACA	2	6	237212	237217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_016633	TAT	2	6	237311	237316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314666
4106	NC_016633	TAA	2	6	237319	237324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314666
4107	NC_016633	TTC	2	6	237375	237380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314666
4108	NC_016633	CTG	2	6	237481	237486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314666
4109	NC_016633	T	7	7	237550	237556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016633	TGT	2	6	237675	237680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016633	A	6	6	237709	237714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016633	AC	3	6	237731	237736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_016633	CT	3	6	237780	237785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_016633	GAAA	2	8	237821	237828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016633	A	6	6	237826	237831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016633	T	6	6	237859	237864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016633	TAG	2	6	237878	237883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016633	CTA	2	6	237903	237908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_016633	GTTC	2	8	237929	237936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_016633	GTA	2	6	237940	237945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016633	CTTT	2	8	237969	237976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_016633	AGAA	2	8	238018	238025	75 %	0 %	25 %	0 %	374314667
4123	NC_016633	TGA	2	6	238032	238037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314667
4124	NC_016633	GAA	2	6	238053	238058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314667
4125	NC_016633	TGA	2	6	238234	238239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314667
4126	NC_016633	TC	3	6	238400	238405	0 %	50 %	0 %	50 %	374314667
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4138	NC_016633	CTG	2	6	238799	238804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4241	NC_016633	GA	3	6	244272	244277	50 %	0 %	50 %	0 %	374314673
4242	NC_016633	AAGGGC	2	12	244282	244293	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374314673
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4244	NC_016633	TAA	2	6	244398	244403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_016633	ACA	2	6	244460	244465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314674
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4253	NC_016633	GAA	2	6	244854	244859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314674
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4488	NC_016633	TCC	2	6	258677	258682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4489	NC_016633	A	6	6	258700	258705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_016633	TCTT	2	8	258827	258834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4491	NC_016633	GAAG	2	8	258836	258843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4496	NC_016633	AG	3	6	259256	259261	50 %	0 %	50 %	0 %	374314684
4497	NC_016633	TCT	2	6	259292	259297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314684
4498	NC_016633	TG	3	6	259310	259315	0 %	50 %	50 %	0 %	374314684
4499	NC_016633	AG	3	6	259380	259385	50 %	0 %	50 %	0 %	374314684
4500	NC_016633	GTT	2	6	259460	259465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314684

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