MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016633	T	6	6	146971	146976	0 %	100 %	0 %	0 %	374314584
2502	NC_016633	GCTA	2	8	147008	147015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_016633	CTAT	2	8	147081	147088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_016633	TGG	2	6	147176	147181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314585
2505	NC_016633	AGG	2	6	147209	147214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314585
2506	NC_016633	TTC	2	6	147216	147221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314585
2507	NC_016633	CCG	2	6	147293	147298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314585
2508	NC_016633	A	6	6	147427	147432	100 %	0 %	0 %	0 %	374314585
2509	NC_016633	C	6	6	147641	147646	0 %	0 %	0 %	100 %	374314585
2510	NC_016633	GAT	2	6	147690	147695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314585
2511	NC_016633	CTT	2	6	147755	147760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314585
2512	NC_016633	TTC	2	6	147829	147834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314585
2513	NC_016633	GAT	2	6	148027	148032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314585
2514	NC_016633	CTA	2	6	148095	148100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314585
2515	NC_016633	CAG	2	6	148114	148119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314585
2516	NC_016633	TGG	2	6	148121	148126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314585
2517	NC_016633	GTGA	2	8	148135	148142	25 %	25 %	50 %	0 %	374314585
2518	NC_016633	CT	3	6	148147	148152	0 %	50 %	0 %	50 %	374314585
2519	NC_016633	ATG	2	6	148231	148236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314586
2520	NC_016633	ACT	2	6	148240	148245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314586
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2522	NC_016633	TGT	2	6	148319	148324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314586
2523	NC_016633	TG	3	6	148366	148371	0 %	50 %	50 %	0 %	374314586
2524	NC_016633	TTA	2	6	148440	148445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314586
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2526	NC_016633	TTG	2	6	148505	148510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314586
2527	NC_016633	CGGA	2	8	148551	148558	25 %	0 %	50 %	25 %	374314586
2528	NC_016633	CAA	2	6	148577	148582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314586
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2530	NC_016633	T	6	6	148729	148734	0 %	100 %	0 %	0 %	374314586
2531	NC_016633	TA	3	6	148744	148749	50 %	50 %	0 %	0 %	374314586
2532	NC_016633	GGA	2	6	148810	148815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314586
2533	NC_016633	TTACC	2	10	148841	148850	20 %	40 %	0 %	40 %	374314586
2534	NC_016633	GCC	2	6	149008	149013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314586
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2538	NC_016633	A	6	6	149137	149142	100 %	0 %	0 %	0 %	374314586
2539	NC_016633	TGG	2	6	149149	149154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314586
2540	NC_016633	CTG	2	6	149166	149171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314586
2541	NC_016633	T	6	6	149182	149187	0 %	100 %	0 %	0 %	374314586
2542	NC_016633	ATC	2	6	149209	149214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314586
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2544	NC_016633	GGTA	2	8	149352	149359	25 %	25 %	50 %	0 %	374314586
2545	NC_016633	GAA	2	6	149399	149404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314586
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2547	NC_016633	AGAT	2	8	149588	149595	50 %	25 %	25 %	0 %	374314586
2548	NC_016633	CCAT	2	8	149596	149603	25 %	25 %	0 %	50 %	374314586
2549	NC_016633	TGA	2	6	149669	149674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314586
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2551	NC_016633	TGC	2	6	149733	149738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314586
2552	NC_016633	TCT	2	6	149741	149746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314586
2553	NC_016633	TGA	2	6	149768	149773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314586
2554	NC_016633	GCA	2	6	149815	149820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314586
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2556	NC_016633	GAT	2	6	149985	149990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314587
2557	NC_016633	CTG	2	6	150007	150012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314587
2558	NC_016633	AAGG	2	8	150036	150043	50 %	0 %	50 %	0 %	374314587
2559	NC_016633	TAT	2	6	150098	150103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314587
2560	NC_016633	TA	3	6	150136	150141	50 %	50 %	0 %	0 %	374314587
2561	NC_016633	TAGCG	2	10	150227	150236	20 %	20 %	40 %	20 %	374314587
2562	NC_016633	ATA	2	6	150238	150243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314587
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2571	NC_016633	TC	3	6	150979	150984	0 %	50 %	0 %	50 %	374314587
2572	NC_016633	T	8	8	151144	151151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_016633	A	7	7	151154	151160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_016633	T	8	8	151175	151182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_016633	GGTAT	2	10	151186	151195	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2582	NC_016633	ATTC	2	8	151550	151557	25 %	50 %	0 %	25 %	374314588
2583	NC_016633	GAAT	2	8	151628	151635	50 %	25 %	25 %	0 %	374314588
2584	NC_016633	ATG	2	6	151653	151658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314588
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2586	NC_016633	CTTTT	2	10	151826	151835	0 %	80 %	0 %	20 %	374314588
2587	NC_016633	TATC	2	8	151845	151852	25 %	50 %	0 %	25 %	374314588
2588	NC_016633	ATT	2	6	151935	151940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_016633	ATG	2	6	151950	151955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2596	NC_016633	GTA	2	6	152484	152489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314589
2597	NC_016633	GGA	2	6	152723	152728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314589
2598	NC_016633	GCT	2	6	152739	152744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314589
2599	NC_016633	GCT	2	6	152767	152772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314589
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2603	NC_016633	TTC	2	6	153047	153052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314589
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2605	NC_016633	ACG	2	6	153163	153168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314589
2606	NC_016633	CAT	2	6	153263	153268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314589
2607	NC_016633	TGG	2	6	153302	153307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314589
2608	NC_016633	GAG	2	6	153409	153414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314589
2609	NC_016633	GTC	2	6	153459	153464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314589
2610	NC_016633	TGC	2	6	153476	153481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314589
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2612	NC_016633	T	7	7	153521	153527	0 %	100 %	0 %	0 %	374314589
2613	NC_016633	ATACT	2	10	153538	153547	40 %	40 %	0 %	20 %	374314589
2614	NC_016633	TGC	2	6	153600	153605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314590
2615	NC_016633	TGG	2	6	153645	153650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314590
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2617	NC_016633	GA	3	6	153715	153720	50 %	0 %	50 %	0 %	374314590
2618	NC_016633	TTC	2	6	153745	153750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314590
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