MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016633	AGC	2	6	117324	117329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314559
2002	NC_016633	ATT	2	6	117445	117450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314559
2003	NC_016633	TA	3	6	117552	117557	50 %	50 %	0 %	0 %	374314559
2004	NC_016633	TGA	3	9	117617	117625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314559
2005	NC_016633	CAT	2	6	117686	117691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314559
2006	NC_016633	CCTTT	2	10	117710	117719	0 %	60 %	0 %	40 %	374314559
2007	NC_016633	GAA	2	6	118046	118051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314559
2008	NC_016633	GCC	2	6	118132	118137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314559
2009	NC_016633	TGG	2	6	118143	118148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314559
2010	NC_016633	GCG	2	6	118183	118188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314559
2011	NC_016633	CAGG	2	8	118247	118254	25 %	0 %	50 %	25 %	374314559
2012	NC_016633	TGGC	2	8	118310	118317	0 %	25 %	50 %	25 %	374314559
2013	NC_016633	CAG	2	6	118327	118332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314559
2014	NC_016633	TTC	2	6	118344	118349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314559
2015	NC_016633	CAT	2	6	118379	118384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314559
2016	NC_016633	TCT	2	6	118387	118392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314559
2017	NC_016633	GAT	2	6	118403	118408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314559
2018	NC_016633	CGC	2	6	118661	118666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314559
2019	NC_016633	CCT	2	6	118700	118705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314559
2020	NC_016633	CTTACC	2	12	118719	118730	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374314559
2021	NC_016633	AAGGTT	2	12	118776	118787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314559
2022	NC_016633	ATG	2	6	118810	118815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314559
2023	NC_016633	CTAT	2	8	118825	118832	25 %	50 %	0 %	25 %	374314559
2024	NC_016633	TCT	2	6	118837	118842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314559
2025	NC_016633	CTT	2	6	118932	118937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314559
2026	NC_016633	TTG	2	6	118941	118946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314559
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2028	NC_016633	GAG	2	6	119066	119071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314559
2029	NC_016633	GAT	2	6	119079	119084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314559
2030	NC_016633	CTCA	2	8	119120	119127	25 %	25 %	0 %	50 %	374314559
2031	NC_016633	GAA	2	6	119162	119167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314559
2032	NC_016633	TTG	2	6	119200	119205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314559
2033	NC_016633	AGA	2	6	119222	119227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314559
2034	NC_016633	TTG	2	6	119265	119270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314559
2035	NC_016633	GT	3	6	119425	119430	0 %	50 %	50 %	0 %	374314559
2036	NC_016633	GAA	2	6	119432	119437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314559
2037	NC_016633	AAC	2	6	119460	119465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314559
2038	NC_016633	AAG	2	6	119499	119504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314559
2039	NC_016633	GAAGA	2	10	119514	119523	60 %	0 %	40 %	0 %	374314559
2040	NC_016633	CCTTG	2	10	119543	119552	0 %	40 %	20 %	40 %	374314559
2041	NC_016633	TCCT	2	8	119559	119566	0 %	50 %	0 %	50 %	374314559
2042	NC_016633	T	6	6	119575	119580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_016633	ATC	2	6	119766	119771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314560
2044	NC_016633	TCA	2	6	119781	119786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314560
2045	NC_016633	CATA	2	8	119867	119874	50 %	25 %	0 %	25 %	374314560
2046	NC_016633	TC	3	6	119878	119883	0 %	50 %	0 %	50 %	374314560
2047	NC_016633	TAA	2	6	120011	120016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314560
2048	NC_016633	GATT	2	8	120017	120024	25 %	50 %	25 %	0 %	374314560
2049	NC_016633	TCA	2	6	120032	120037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314560
2050	NC_016633	TTC	2	6	120052	120057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_016633	CTT	2	6	120087	120092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2052	NC_016633	TTCT	2	8	120112	120119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2053	NC_016633	A	8	8	120136	120143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_016633	A	7	7	120173	120179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_016633	TCT	2	6	120250	120255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314561
2056	NC_016633	AGGT	2	8	120350	120357	25 %	25 %	50 %	0 %	374314561
2057	NC_016633	TCC	2	6	120398	120403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2058	NC_016633	TTTA	2	8	120436	120443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_016633	TAT	2	6	120485	120490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314562
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2061	NC_016633	ATAC	2	8	120553	120560	50 %	25 %	0 %	25 %	374314562
2062	NC_016633	ATG	2	6	120590	120595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314562
2063	NC_016633	AGC	2	6	120761	120766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314562
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2066	NC_016633	T	6	6	120887	120892	0 %	100 %	0 %	0 %	374314562
2067	NC_016633	CAT	2	6	120948	120953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314562
2068	NC_016633	TGA	2	6	121113	121118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314562
2069	NC_016633	ACA	2	6	121248	121253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314562
2070	NC_016633	TTC	2	6	121270	121275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314562
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2072	NC_016633	AT	3	6	121337	121342	50 %	50 %	0 %	0 %	374314562
2073	NC_016633	TCT	2	6	121355	121360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314562
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2075	NC_016633	CAT	2	6	121447	121452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314562
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2077	NC_016633	CTGG	2	8	121490	121497	0 %	25 %	50 %	25 %	374314562
2078	NC_016633	T	6	6	121530	121535	0 %	100 %	0 %	0 %	374314562
2079	NC_016633	T	7	7	121560	121566	0 %	100 %	0 %	0 %	374314562
2080	NC_016633	CTA	2	6	121599	121604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314562
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2082	NC_016633	GTTT	2	8	121635	121642	0 %	75 %	25 %	0 %	374314563
2083	NC_016633	TCA	2	6	121663	121668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314563
2084	NC_016633	TGC	2	6	121698	121703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314563
2085	NC_016633	CTATTC	2	12	121751	121762	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374314563
2086	NC_016633	TA	3	6	121766	121771	50 %	50 %	0 %	0 %	374314563
2087	NC_016633	T	7	7	121804	121810	0 %	100 %	0 %	0 %	374314563
2088	NC_016633	GTA	2	6	121814	121819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314563
2089	NC_016633	ATGG	2	8	121864	121871	25 %	25 %	50 %	0 %	374314563
2090	NC_016633	CGT	2	6	121908	121913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314563
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2092	NC_016633	CAC	2	6	122166	122171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314563
2093	NC_016633	TCTGA	2	10	122215	122224	20 %	40 %	20 %	20 %	374314563
2094	NC_016633	CAA	2	6	122268	122273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314563
2095	NC_016633	TGC	2	6	122328	122333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314563
2096	NC_016633	AAAC	2	8	122354	122361	75 %	0 %	0 %	25 %	374314563
2097	NC_016633	TAC	2	6	122390	122395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314563
2098	NC_016633	AT	3	6	122424	122429	50 %	50 %	0 %	0 %	374314564
2099	NC_016633	T	7	7	122432	122438	0 %	100 %	0 %	0 %	374314564
2100	NC_016633	TA	3	6	122555	122560	50 %	50 %	0 %	0 %	374314564
2101	NC_016633	GTCCAT	2	12	122716	122727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374314564
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2104	NC_016633	TCCA	2	8	122784	122791	25 %	25 %	0 %	50 %	374314564
2105	NC_016633	TAG	2	6	122856	122861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314564
2106	NC_016633	GAA	2	6	122949	122954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314564
2107	NC_016633	GATAG	2	10	122984	122993	40 %	20 %	40 %	0 %	374314564
2108	NC_016633	CAAGG	2	10	123020	123029	40 %	0 %	40 %	20 %	374314564
2109	NC_016633	AAG	2	6	123116	123121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314564
2110	NC_016633	T	6	6	123395	123400	0 %	100 %	0 %	0 %	374314564
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2113	NC_016633	T	6	6	123484	123489	0 %	100 %	0 %	0 %	374314564
2114	NC_016633	CAA	2	6	123499	123504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314564
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2118	NC_016633	TTCC	2	8	123815	123822	0 %	50 %	0 %	50 %	374314565
2119	NC_016633	TTG	2	6	123856	123861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314565
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2121	NC_016633	TGGT	2	8	123994	124001	0 %	50 %	50 %	0 %	374314565
2122	NC_016633	CTG	2	6	124037	124042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314565
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2124	NC_016633	GAT	2	6	124239	124244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314565
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2374	NC_016633	CTTG	2	8	138778	138785	0 %	50 %	25 %	25 %	374314579
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2382	NC_016633	TGA	3	9	139566	139574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314579
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2482	NC_016633	T	7	7	145689	145695	0 %	100 %	0 %	0 %	374314583
2483	NC_016633	AAG	2	6	145932	145937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314583
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2486	NC_016633	ATGCT	2	10	146069	146078	20 %	40 %	20 %	20 %	374314583
2487	NC_016633	GGC	2	6	146148	146153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314583
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2489	NC_016633	AG	3	6	146224	146229	50 %	0 %	50 %	0 %	374314583
2490	NC_016633	AGC	2	6	146376	146381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314583
2491	NC_016633	GATG	2	8	146387	146394	25 %	25 %	50 %	0 %	374314583
2492	NC_016633	AAG	2	6	146509	146514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_016633	A	6	6	146564	146569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_016633	CAT	2	6	146593	146598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2495	NC_016633	TGC	2	6	146612	146617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314584
2496	NC_016633	GCTT	2	8	146639	146646	0 %	50 %	25 %	25 %	374314584
2497	NC_016633	A	6	6	146696	146701	100 %	0 %	0 %	0 %	374314584
2498	NC_016633	A	6	6	146777	146782	100 %	0 %	0 %	0 %	374314584
2499	NC_016633	CCT	2	6	146827	146832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314584
2500	NC_016633	CCT	2	6	146845	146850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314584

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