MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016633	TTG	2	6	58539	58544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016633	TCTT	2	8	58560	58567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_016633	AGT	2	6	58579	58584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016633	GAA	2	6	58855	58860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314501
1005	NC_016633	GAA	2	6	58934	58939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314501
1006	NC_016633	TTG	2	6	59084	59089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314501
1007	NC_016633	A	6	6	59151	59156	100 %	0 %	0 %	0 %	374314501
1008	NC_016633	ATT	2	6	59178	59183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314501
1009	NC_016633	AAT	2	6	59391	59396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314502
1010	NC_016633	TGT	2	6	59436	59441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314502
1011	NC_016633	T	6	6	59479	59484	0 %	100 %	0 %	0 %	374314502
1012	NC_016633	GGA	2	6	59491	59496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314502
1013	NC_016633	TTTC	2	8	59562	59569	0 %	75 %	0 %	25 %	374314502
1014	NC_016633	AG	3	6	59598	59603	50 %	0 %	50 %	0 %	374314502
1015	NC_016633	CTT	2	6	59610	59615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314502
1016	NC_016633	CG	3	6	59616	59621	0 %	0 %	50 %	50 %	374314502
1017	NC_016633	TCA	2	6	59624	59629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314502
1018	NC_016633	TTC	2	6	59729	59734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314502
1019	NC_016633	AGC	2	6	59852	59857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314502
1020	NC_016633	TAG	2	6	59872	59877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314502
1021	NC_016633	T	6	6	59899	59904	0 %	100 %	0 %	0 %	374314502
1022	NC_016633	GAT	2	6	59964	59969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314503
1023	NC_016633	TCA	2	6	60163	60168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314503
1024	NC_016633	AAGC	2	8	60338	60345	50 %	0 %	25 %	25 %	374314503
1025	NC_016633	GCC	2	6	60383	60388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314503
1026	NC_016633	GGT	2	6	60486	60491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314503
1027	NC_016633	GCG	2	6	60512	60517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314503
1028	NC_016633	AG	3	6	60542	60547	50 %	0 %	50 %	0 %	374314503
1029	NC_016633	TCCAT	2	10	60619	60628	20 %	40 %	0 %	40 %	374314503
1030	NC_016633	A	6	6	60685	60690	100 %	0 %	0 %	0 %	374314503
1031	NC_016633	ATTTT	2	10	60805	60814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016633	GAA	2	6	60934	60939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314504
1033	NC_016633	AT	3	6	60998	61003	50 %	50 %	0 %	0 %	374314504
1034	NC_016633	TGT	2	6	61025	61030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314504
1035	NC_016633	GGGA	2	8	61040	61047	25 %	0 %	75 %	0 %	374314504
1036	NC_016633	C	6	6	61274	61279	0 %	0 %	0 %	100 %	374314504
1037	NC_016633	GAA	2	6	61318	61323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314504
1038	NC_016633	G	6	6	61419	61424	0 %	0 %	100 %	0 %	374314504
1039	NC_016633	CAG	2	6	61450	61455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314504
1040	NC_016633	TAGC	2	8	61464	61471	25 %	25 %	25 %	25 %	374314504
1041	NC_016633	GAAT	2	8	61530	61537	50 %	25 %	25 %	0 %	374314504
1042	NC_016633	CTG	2	6	61559	61564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314504
1043	NC_016633	AGG	2	6	61575	61580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314504
1044	NC_016633	CAA	2	6	61624	61629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314504
1045	NC_016633	CT	3	6	61678	61683	0 %	50 %	0 %	50 %	374314504
1046	NC_016633	ATT	2	6	61709	61714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314504
1047	NC_016633	TAA	2	6	61910	61915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314505
1048	NC_016633	TAT	2	6	61979	61984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314505
1049	NC_016633	TCT	2	6	62126	62131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314505
1050	NC_016633	AG	3	6	62137	62142	50 %	0 %	50 %	0 %	374314505
1051	NC_016633	ACAT	2	8	62172	62179	50 %	25 %	0 %	25 %	374314505
1052	NC_016633	ATA	2	6	62252	62257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314505
1053	NC_016633	AGA	2	6	62264	62269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314505
1054	NC_016633	CAA	2	6	62279	62284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314505
1055	NC_016633	ACCA	2	8	62407	62414	50 %	0 %	0 %	50 %	374314505
1056	NC_016633	T	6	6	62468	62473	0 %	100 %	0 %	0 %	374314505
1057	NC_016633	TAG	2	6	62503	62508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016633	ACTG	2	8	62510	62517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_016633	TAC	2	6	62636	62641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_016633	T	6	6	62731	62736	0 %	100 %	0 %	0 %	374314506
1061	NC_016633	TGA	2	6	62786	62791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314506
1062	NC_016633	A	6	6	62868	62873	100 %	0 %	0 %	0 %	374314506
1063	NC_016633	A	8	8	62885	62892	100 %	0 %	0 %	0 %	374314506
1064	NC_016633	ATG	2	6	63032	63037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314506
1065	NC_016633	GCA	2	6	63045	63050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314506
1066	NC_016633	A	6	6	63082	63087	100 %	0 %	0 %	0 %	374314506
1067	NC_016633	ATC	2	6	63196	63201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314506
1068	NC_016633	GGT	2	6	63208	63213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314506
1069	NC_016633	CCTG	2	8	63415	63422	0 %	25 %	25 %	50 %	374314507
1070	NC_016633	TCA	3	9	63493	63501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314507
1071	NC_016633	CTG	2	6	63511	63516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314507
1072	NC_016633	TCA	2	6	63534	63539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314507
1073	NC_016633	TCG	2	6	63735	63740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314507
1074	NC_016633	ACG	2	6	63766	63771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314507
1075	NC_016633	CCGTA	2	10	63797	63806	20 %	20 %	20 %	40 %	374314507
1076	NC_016633	TCGT	2	8	63842	63849	0 %	50 %	25 %	25 %	374314507
1077	NC_016633	TA	3	6	63892	63897	50 %	50 %	0 %	0 %	374314507
1078	NC_016633	TAG	2	6	64081	64086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314507
1079	NC_016633	ACTG	2	8	64116	64123	25 %	25 %	25 %	25 %	374314507
1080	NC_016633	A	6	6	64160	64165	100 %	0 %	0 %	0 %	374314507
1081	NC_016633	ATC	2	6	64250	64255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314507
1082	NC_016633	TTTG	2	8	64350	64357	0 %	75 %	25 %	0 %	374314507
1083	NC_016633	AG	3	6	64452	64457	50 %	0 %	50 %	0 %	374314507
1084	NC_016633	T	6	6	64537	64542	0 %	100 %	0 %	0 %	374314507
1085	NC_016633	AGA	2	6	64566	64571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314507
1086	NC_016633	A	6	6	64589	64594	100 %	0 %	0 %	0 %	374314507
1087	NC_016633	AGC	2	6	64601	64606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314507
1088	NC_016633	A	6	6	64734	64739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016633	T	6	6	64749	64754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016633	TCT	2	6	64771	64776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_016633	GTT	2	6	64825	64830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314508
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1094	NC_016633	AT	3	6	65035	65040	50 %	50 %	0 %	0 %	374314508
1095	NC_016633	CCTG	2	8	65177	65184	0 %	25 %	25 %	50 %	374314508
1096	NC_016633	GGAA	2	8	65185	65192	50 %	0 %	50 %	0 %	374314508
1097	NC_016633	GATG	2	8	65375	65382	25 %	25 %	50 %	0 %	374314508
1098	NC_016633	ACC	2	6	65406	65411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314508
1099	NC_016633	TGTAT	2	10	65499	65508	20 %	60 %	20 %	0 %	374314508
1100	NC_016633	CTG	2	6	65521	65526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314508
1101	NC_016633	TACA	2	8	65598	65605	50 %	25 %	0 %	25 %	374314508
1102	NC_016633	AAGG	2	8	65627	65634	50 %	0 %	50 %	0 %	374314508
1103	NC_016633	ACC	2	6	65646	65651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314508
1104	NC_016633	GTA	2	6	65652	65657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314508
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1106	NC_016633	T	6	6	65712	65717	0 %	100 %	0 %	0 %	374314508
1107	NC_016633	ATC	2	6	65724	65729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314508
1108	NC_016633	AAT	2	6	65758	65763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314508
1109	NC_016633	GAC	2	6	65787	65792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314508
1110	NC_016633	GCA	2	6	65992	65997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314508
1111	NC_016633	AGC	2	6	66040	66045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314508
1112	NC_016633	GAT	2	6	66120	66125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016633	ACG	2	6	66204	66209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314509
1114	NC_016633	AACA	2	8	66224	66231	75 %	0 %	0 %	25 %	374314509
1115	NC_016633	CAG	2	6	66271	66276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314509
1116	NC_016633	CGG	2	6	66460	66465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314509
1117	NC_016633	CAT	2	6	66466	66471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314509
1118	NC_016633	A	6	6	66510	66515	100 %	0 %	0 %	0 %	374314509
1119	NC_016633	CTGG	2	8	66614	66621	0 %	25 %	50 %	25 %	374314509
1120	NC_016633	ATC	2	6	66624	66629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314509
1121	NC_016633	GAGCAT	2	12	66638	66649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374314509
1122	NC_016633	AGA	2	6	66652	66657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314509
1123	NC_016633	TA	3	6	66758	66763	50 %	50 %	0 %	0 %	374314509
1124	NC_016633	CCA	2	6	66827	66832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314509
1125	NC_016633	GTC	2	6	66876	66881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314509
1126	NC_016633	GGTG	2	8	66934	66941	0 %	25 %	75 %	0 %	374314509
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1128	NC_016633	TTTG	2	8	66961	66968	0 %	75 %	25 %	0 %	374314509
1129	NC_016633	TAA	2	6	67006	67011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314510
1130	NC_016633	AAT	2	6	67056	67061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314510
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1149	NC_016633	CT	3	6	67970	67975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1151	NC_016633	A	6	6	68098	68103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_016633	T	6	6	68368	68373	0 %	100 %	0 %	0 %	374314511
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1161	NC_016633	GCTC	2	8	68571	68578	0 %	25 %	25 %	50 %	374314511
1162	NC_016633	A	6	6	68665	68670	100 %	0 %	0 %	0 %	374314511
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1192	NC_016633	AAG	2	6	70303	70308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1223	NC_016633	TTC	2	6	71970	71975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314514
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1227	NC_016633	GAT	2	6	72329	72334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314514
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1230	NC_016633	AAT	2	6	72527	72532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1231	NC_016633	TAAG	2	8	72580	72587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1232	NC_016633	CAA	2	6	72594	72599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1237	NC_016633	CAA	2	6	72758	72763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314515
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1249	NC_016633	CAG	2	6	73469	73474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314516
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1252	NC_016633	CTC	2	6	73656	73661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_016633	TA	3	6	73810	73815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_016633	A	6	6	73828	73833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_016633	GAT	2	6	73975	73980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314517
1256	NC_016633	TTG	2	6	74066	74071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314517
1257	NC_016633	TCC	2	6	74096	74101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314517
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1260	NC_016633	GAA	2	6	74160	74165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314517
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1269	NC_016633	AAG	2	6	74882	74887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314517
1270	NC_016633	AAG	2	6	74900	74905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314517
1271	NC_016633	AGGAAA	2	12	74924	74935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314517
1272	NC_016633	GTA	2	6	74950	74955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314517
1273	NC_016633	CAAA	2	8	75050	75057	75 %	0 %	0 %	25 %	374314518
1274	NC_016633	GTTT	2	8	75100	75107	0 %	75 %	25 %	0 %	374314518
1275	NC_016633	TCT	2	6	75238	75243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314518
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1277	NC_016633	TTGGG	2	10	75301	75310	0 %	40 %	60 %	0 %	374314518
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1286	NC_016633	CTAT	2	8	76074	76081	25 %	50 %	0 %	25 %	374314518
1287	NC_016633	CAT	2	6	76125	76130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314518
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1290	NC_016633	TGA	2	6	76233	76238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314518
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1327	NC_016633	TCGG	2	8	78172	78179	0 %	25 %	50 %	25 %	374314519
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1352	NC_016633	T	6	6	80124	80129	0 %	100 %	0 %	0 %	374314520
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1356	NC_016633	ATT	2	6	80340	80345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1362	NC_016633	ATA	2	6	80629	80634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314521
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1372	NC_016633	CA	3	6	81194	81199	50 %	0 %	0 %	50 %	374314522
1373	NC_016633	AGAA	2	8	81210	81217	75 %	0 %	25 %	0 %	374314522
1374	NC_016633	CCT	2	6	81236	81241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1375	NC_016633	AAAG	2	8	81263	81270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_016633	TTA	2	6	81280	81285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1377	NC_016633	AT	3	6	81297	81302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_016633	CTTG	2	8	81312	81319	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1379	NC_016633	CA	3	6	81338	81343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1380	NC_016633	A	7	7	81364	81370	100 %	0 %	0 %	0 %	374314523
1381	NC_016633	CTTGCG	2	12	81391	81402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314523
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1498	NC_016633	TTC	2	6	88278	88283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314530
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