MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016633	GAT	2	6	28419	28424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314474
502	NC_016633	AT	3	6	28448	28453	50 %	50 %	0 %	0 %	374314474
503	NC_016633	A	6	6	28468	28473	100 %	0 %	0 %	0 %	374314474
504	NC_016633	GAA	2	6	28485	28490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314474
505	NC_016633	AAG	2	6	28510	28515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314474
506	NC_016633	CAA	2	6	28538	28543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314474
507	NC_016633	ATC	2	6	28558	28563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314474
508	NC_016633	GCA	2	6	28753	28758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314474
509	NC_016633	CTC	2	6	28802	28807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314474
510	NC_016633	GTT	2	6	28818	28823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314474
511	NC_016633	AAC	2	6	28867	28872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314474
512	NC_016633	CAAT	2	8	28952	28959	50 %	25 %	0 %	25 %	374314474
513	NC_016633	A	6	6	29060	29065	100 %	0 %	0 %	0 %	374314474
514	NC_016633	ATT	2	6	29151	29156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314474
515	NC_016633	CAA	2	6	29229	29234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314474
516	NC_016633	GAT	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314474
517	NC_016633	AGG	2	6	29293	29298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314474
518	NC_016633	GGC	2	6	29361	29366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314474
519	NC_016633	GCC	2	6	29379	29384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314474
520	NC_016633	GCAGCG	2	12	29467	29478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374314474
521	NC_016633	GAG	2	6	29496	29501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314474
522	NC_016633	GCC	2	6	29517	29522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314474
523	NC_016633	GGC	2	6	29568	29573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314474
524	NC_016633	CCA	2	6	29841	29846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314475
525	NC_016633	CATT	2	8	29963	29970	25 %	50 %	0 %	25 %	374314475
526	NC_016633	ATA	2	6	30052	30057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314475
527	NC_016633	TGG	2	6	30114	30119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314475
528	NC_016633	CAATGG	2	12	30125	30136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374314475
529	NC_016633	AAT	2	6	30138	30143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314475
530	NC_016633	CAA	2	6	30339	30344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314476
531	NC_016633	AAG	2	6	30360	30365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314476
532	NC_016633	TTG	2	6	30389	30394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314476
533	NC_016633	CAA	2	6	30411	30416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314476
534	NC_016633	GCA	2	6	30431	30436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314476
535	NC_016633	CAT	2	6	30522	30527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314476
536	NC_016633	AGC	2	6	30562	30567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314476
537	NC_016633	CAG	2	6	30670	30675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314476
538	NC_016633	GCA	2	6	30692	30697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314476
539	NC_016633	TGC	2	6	30811	30816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314476
540	NC_016633	CAT	2	6	30889	30894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314476
541	NC_016633	ATA	2	6	30913	30918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314476
542	NC_016633	GCA	2	6	31004	31009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314476
543	NC_016633	CCA	2	6	31028	31033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314476
544	NC_016633	CCA	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314476
545	NC_016633	CAG	2	6	31185	31190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314476
546	NC_016633	ACAA	2	8	31303	31310	75 %	0 %	0 %	25 %	374314477
547	NC_016633	TGA	2	6	31321	31326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314477
548	NC_016633	GAA	2	6	31392	31397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314477
549	NC_016633	AGC	2	6	31433	31438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314477
550	NC_016633	AGT	2	6	31470	31475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314477
551	NC_016633	AGA	2	6	31497	31502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314477
552	NC_016633	TGA	2	6	31507	31512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314477
553	NC_016633	TACC	2	8	31528	31535	25 %	25 %	0 %	50 %	374314477
554	NC_016633	CTT	2	6	31564	31569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314477
555	NC_016633	ATT	2	6	31641	31646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314477
556	NC_016633	T	6	6	31698	31703	0 %	100 %	0 %	0 %	374314477
557	NC_016633	TTCT	2	8	31922	31929	0 %	75 %	0 %	25 %	374314477
558	NC_016633	CTT	2	6	32206	32211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314478
559	NC_016633	T	7	7	32216	32222	0 %	100 %	0 %	0 %	374314478
560	NC_016633	T	6	6	32266	32271	0 %	100 %	0 %	0 %	374314478
561	NC_016633	AGA	2	6	32289	32294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314478
562	NC_016633	TCA	3	9	32304	32312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314478
563	NC_016633	TAA	2	6	32348	32353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314478
564	NC_016633	TGC	2	6	32363	32368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314478
565	NC_016633	CTTC	2	8	32384	32391	0 %	50 %	0 %	50 %	374314478
566	NC_016633	AAAC	2	8	32406	32413	75 %	0 %	0 %	25 %	374314478
567	NC_016633	AT	3	6	32523	32528	50 %	50 %	0 %	0 %	374314478
568	NC_016633	GCA	2	6	32562	32567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314478
569	NC_016633	ATA	2	6	32579	32584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314478
570	NC_016633	A	6	6	32584	32589	100 %	0 %	0 %	0 %	374314478
571	NC_016633	GAT	2	6	32592	32597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314478
572	NC_016633	TCA	3	9	32715	32723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314478
573	NC_016633	GT	3	6	32748	32753	0 %	50 %	50 %	0 %	374314478
574	NC_016633	TC	3	6	32866	32871	0 %	50 %	0 %	50 %	374314478
575	NC_016633	AAC	2	6	32879	32884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314478
576	NC_016633	TC	3	6	32902	32907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016633	TTG	2	6	32930	32935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314479
578	NC_016633	GAT	2	6	32941	32946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314479
579	NC_016633	CAT	2	6	33006	33011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314479
580	NC_016633	GTATT	2	10	33174	33183	20 %	60 %	20 %	0 %	374314479
581	NC_016633	A	6	6	33491	33496	100 %	0 %	0 %	0 %	374314479
582	NC_016633	GT	3	6	33543	33548	0 %	50 %	50 %	0 %	374314479
583	NC_016633	TGC	2	6	33564	33569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314479
584	NC_016633	TGT	2	6	33661	33666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314479
585	NC_016633	AAC	2	6	33694	33699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314479
586	NC_016633	TA	3	6	33714	33719	50 %	50 %	0 %	0 %	374314479
587	NC_016633	T	8	8	33784	33791	0 %	100 %	0 %	0 %	374314479
588	NC_016633	T	6	6	33793	33798	0 %	100 %	0 %	0 %	374314479
589	NC_016633	AGA	2	6	33817	33822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314479
590	NC_016633	TG	3	6	33842	33847	0 %	50 %	50 %	0 %	374314479
591	NC_016633	AGC	2	6	33853	33858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314479
592	NC_016633	CTG	2	6	33862	33867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314479
593	NC_016633	TA	3	6	33891	33896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016633	CTG	2	6	34014	34019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016633	A	7	7	34024	34030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016633	CATCA	2	10	34037	34046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
597	NC_016633	CAA	2	6	34215	34220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314480
598	NC_016633	CGTTT	2	10	34294	34303	0 %	60 %	20 %	20 %	374314480
599	NC_016633	GAC	2	6	34331	34336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314480
600	NC_016633	GAA	2	6	34374	34379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314480
601	NC_016633	ATT	2	6	34431	34436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314480
602	NC_016633	CAT	2	6	34601	34606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314480
603	NC_016633	TTGC	2	8	34695	34702	0 %	50 %	25 %	25 %	374314480
604	NC_016633	GGC	2	6	34730	34735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314480
605	NC_016633	GAA	2	6	34766	34771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314480
606	NC_016633	TCC	2	6	34836	34841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314480
607	NC_016633	CCTT	2	8	35027	35034	0 %	50 %	0 %	50 %	374314481
608	NC_016633	GAT	2	6	35119	35124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314481
609	NC_016633	AAT	2	6	35168	35173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314481
610	NC_016633	GCAG	2	8	35181	35188	25 %	0 %	50 %	25 %	374314481
611	NC_016633	CGG	2	6	35193	35198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314481
612	NC_016633	AGA	2	6	35216	35221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314481
613	NC_016633	TAGG	2	8	35262	35269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016633	TAA	2	6	35286	35291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016633	AAG	2	6	35551	35556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314482
616	NC_016633	CGG	2	6	35559	35564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314482
617	NC_016633	GAG	2	6	35679	35684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314482
618	NC_016633	TCGA	2	8	35731	35738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_016633	TTG	2	6	35749	35754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016633	ACA	2	6	35775	35780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016633	AAGG	2	8	35878	35885	50 %	0 %	50 %	0 %	374314483
622	NC_016633	TGG	2	6	35897	35902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314483
623	NC_016633	ACC	2	6	35927	35932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314483
624	NC_016633	TCT	2	6	35982	35987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314483
625	NC_016633	ATT	2	6	35988	35993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314483
626	NC_016633	TCTG	2	8	36043	36050	0 %	50 %	25 %	25 %	374314483
627	NC_016633	TGC	2	6	36098	36103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314483
628	NC_016633	AAG	2	6	36113	36118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314483
629	NC_016633	TCG	2	6	36158	36163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314483
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633	NC_016633	T	6	6	36532	36537	0 %	100 %	0 %	0 %	374314483
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