MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016633	TTTGTA	2	12	341552	341563	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374314761
6002	NC_016633	ATT	3	9	341613	341621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314761
6003	NC_016633	A	6	6	341679	341684	100 %	0 %	0 %	0 %	374314761
6004	NC_016633	GGA	2	6	341695	341700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016633	ACAGA	2	10	341718	341727	60 %	0 %	20 %	20 %	374314762
6006	NC_016633	A	6	6	341732	341737	100 %	0 %	0 %	0 %	374314762
6007	NC_016633	TTC	2	6	341823	341828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314762
6008	NC_016633	AAT	2	6	341847	341852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314762
6009	NC_016633	ATG	2	6	341947	341952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314762
6010	NC_016633	AGC	2	6	341994	341999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314762
6011	NC_016633	CTG	2	6	342067	342072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314762
6012	NC_016633	TA	3	6	342128	342133	50 %	50 %	0 %	0 %	374314762
6013	NC_016633	GGC	2	6	342237	342242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374314762
6014	NC_016633	AT	3	6	342267	342272	50 %	50 %	0 %	0 %	374314762
6015	NC_016633	ATCCTC	2	12	342286	342297	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374314762
6016	NC_016633	GAAT	2	8	342348	342355	50 %	25 %	25 %	0 %	374314762
6017	NC_016633	TC	3	6	342397	342402	0 %	50 %	0 %	50 %	374314762
6018	NC_016633	GTA	2	6	342469	342474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314762
6019	NC_016633	TTA	2	6	342580	342585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016633	AGT	2	6	342643	342648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314763
6021	NC_016633	A	7	7	342656	342662	100 %	0 %	0 %	0 %	374314763
6022	NC_016633	AATTAT	2	12	343179	343190	50 %	50 %	0 %	0 %	374314763
6023	NC_016633	GA	3	6	343210	343215	50 %	0 %	50 %	0 %	374314763
6024	NC_016633	A	7	7	343231	343237	100 %	0 %	0 %	0 %	374314763
6025	NC_016633	TTC	2	6	343265	343270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314763
6026	NC_016633	TTCC	2	8	343280	343287	0 %	50 %	0 %	50 %	374314763
6027	NC_016633	ACC	2	6	343298	343303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314763
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6029	NC_016633	GCA	2	6	343477	343482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314764
6030	NC_016633	GAA	2	6	343615	343620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314764
6031	NC_016633	TGG	2	6	343630	343635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314764
6032	NC_016633	GAT	2	6	343673	343678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314764
6033	NC_016633	GAA	2	6	343734	343739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314764
6034	NC_016633	GAG	2	6	343884	343889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314764
6035	NC_016633	T	6	6	343928	343933	0 %	100 %	0 %	0 %	374314764
6036	NC_016633	ATG	2	6	343966	343971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314764
6037	NC_016633	AT	3	6	343991	343996	50 %	50 %	0 %	0 %	374314764
6038	NC_016633	TCT	2	6	344026	344031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314764
6039	NC_016633	CTG	2	6	344034	344039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314764
6040	NC_016633	GTC	2	6	344061	344066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314764
6041	NC_016633	ATTGG	2	10	344085	344094	20 %	40 %	40 %	0 %	374314764
6042	NC_016633	GAG	2	6	344128	344133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314764
6043	NC_016633	TTC	2	6	344159	344164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314764
6044	NC_016633	GAA	2	6	344208	344213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314764
6045	NC_016633	TGC	2	6	344465	344470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314764
6046	NC_016633	GGA	2	6	344573	344578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016633	TTGG	2	8	344599	344606	0 %	50 %	50 %	0 %	374314765
6048	NC_016633	CAT	2	6	344614	344619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314765
6049	NC_016633	CAT	2	6	344640	344645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314765
6050	NC_016633	TGC	2	6	344756	344761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314765
6051	NC_016633	AGG	2	6	344825	344830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314765
6052	NC_016633	CATG	2	8	344988	344995	25 %	25 %	25 %	25 %	374314765
6053	NC_016633	TGC	2	6	345087	345092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314765
6054	NC_016633	AGC	2	6	345105	345110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314765
6055	NC_016633	GGAAG	2	10	345114	345123	40 %	0 %	60 %	0 %	374314765
6056	NC_016633	AG	3	6	345236	345241	50 %	0 %	50 %	0 %	374314765
6057	NC_016633	TTCG	2	8	345393	345400	0 %	50 %	25 %	25 %	374314765
6058	NC_016633	CCG	2	6	345509	345514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374314765
6059	NC_016633	CCTTG	2	10	345627	345636	0 %	40 %	20 %	40 %	374314765
6060	NC_016633	TGG	2	6	345800	345805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314765
6061	NC_016633	ATG	2	6	345841	345846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314765
6062	NC_016633	ATT	2	6	346054	346059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314765
6063	NC_016633	TTAT	2	8	346117	346124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016633	TTG	2	6	346146	346151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016633	CAAG	2	8	346176	346183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6066	NC_016633	GAA	2	6	346247	346252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314766
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6082	NC_016633	TGA	2	6	347392	347397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314766
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6089	NC_016633	GATAT	2	10	347769	347778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_016633	TGA	2	6	347781	347786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6092	NC_016633	TA	3	6	347816	347821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016633	ATCA	2	8	347871	347878	50 %	25 %	0 %	25 %	374314767
6094	NC_016633	CCTGGA	2	12	347994	348005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374314767
6095	NC_016633	A	6	6	348037	348042	100 %	0 %	0 %	0 %	374314767
6096	NC_016633	TGG	2	6	348114	348119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314767
6097	NC_016633	TATT	2	8	348174	348181	25 %	75 %	0 %	0 %	374314767
6098	NC_016633	TTG	2	6	348185	348190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314767
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6106	NC_016633	GATTC	2	10	348466	348475	20 %	40 %	20 %	20 %	374314767
6107	NC_016633	GAT	2	6	348586	348591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314767
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6109	NC_016633	ATTT	2	8	348716	348723	25 %	75 %	0 %	0 %	374314767
6110	NC_016633	GAC	2	6	348763	348768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314767
6111	NC_016633	TCT	2	6	348781	348786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314767
6112	NC_016633	AAG	2	6	348829	348834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314767
6113	NC_016633	CT	3	6	348838	348843	0 %	50 %	0 %	50 %	374314767
6114	NC_016633	ATGC	2	8	348856	348863	25 %	25 %	25 %	25 %	374314767
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6118	NC_016633	T	6	6	349110	349115	0 %	100 %	0 %	0 %	374314767
6119	NC_016633	CAT	2	6	349116	349121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314767
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6121	NC_016633	CAA	2	6	349303	349308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314767
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6244	NC_016633	TAC	2	6	356269	356274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314773
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6494	NC_016633	TATTG	2	10	371254	371263	20 %	60 %	20 %	0 %	374314789
6495	NC_016633	ACT	2	6	371267	371272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314789
6496	NC_016633	GAT	2	6	371301	371306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314789
6497	NC_016633	AT	3	6	371305	371310	50 %	50 %	0 %	0 %	374314789
6498	NC_016633	TCT	2	6	371314	371319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314789
6499	NC_016633	T	7	7	371319	371325	0 %	100 %	0 %	0 %	374314789
6500	NC_016633	CT	3	6	371330	371335	0 %	50 %	0 %	50 %	374314789

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