MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 63182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016633	GTG	2	6	287481	287486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016633	ATG	2	6	287537	287542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016633	CAG	2	6	287553	287558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_016633	ATT	2	6	287585	287590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016633	A	8	8	287715	287722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016633	TGT	2	6	287735	287740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016633	AATC	2	8	287768	287775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_016633	AAAAGG	2	12	287782	287793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016633	TA	3	6	287824	287829	50 %	50 %	0 %	0 %	374314709
5010	NC_016633	GGCT	2	8	287869	287876	0 %	25 %	50 %	25 %	374314709
5011	NC_016633	T	6	6	287906	287911	0 %	100 %	0 %	0 %	374314709
5012	NC_016633	CAAAG	2	10	287919	287928	60 %	0 %	20 %	20 %	374314709
5013	NC_016633	TCA	2	6	287938	287943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314709
5014	NC_016633	TGC	2	6	287984	287989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314709
5015	NC_016633	TCT	2	6	288019	288024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314709
5016	NC_016633	T	7	7	288086	288092	0 %	100 %	0 %	0 %	374314709
5017	NC_016633	CTC	2	6	288100	288105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314709
5018	NC_016633	CA	3	6	288154	288159	50 %	0 %	0 %	50 %	374314709
5019	NC_016633	CGTT	2	8	288220	288227	0 %	50 %	25 %	25 %	374314709
5020	NC_016633	TTC	2	6	288249	288254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314709
5021	NC_016633	CTGC	2	8	288303	288310	0 %	25 %	25 %	50 %	374314709
5022	NC_016633	TCA	2	6	288335	288340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314709
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5024	NC_016633	TCC	2	6	288499	288504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314709
5025	NC_016633	GAC	2	6	288586	288591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374314709
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5027	NC_016633	G	6	6	288624	288629	0 %	0 %	100 %	0 %	374314709
5028	NC_016633	GTTTG	2	10	288675	288684	0 %	60 %	40 %	0 %	374314709
5029	NC_016633	TTG	2	6	288778	288783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314709
5030	NC_016633	CCT	2	6	288799	288804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374314709
5031	NC_016633	T	6	6	288853	288858	0 %	100 %	0 %	0 %	374314709
5032	NC_016633	AAT	2	6	288905	288910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314709
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5034	NC_016633	TGG	2	6	288959	288964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314709
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5036	NC_016633	AGG	2	6	289054	289059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374314709
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5039	NC_016633	GCTATT	2	12	289617	289628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5040	NC_016633	CAG	2	6	289667	289672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_016633	GAA	2	6	289728	289733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314711
5042	NC_016633	AAC	2	6	289750	289755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374314711
5043	NC_016633	TGC	2	6	289777	289782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314711
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5045	NC_016633	TGGTAC	2	12	289888	289899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374314711
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5047	NC_016633	A	6	6	289944	289949	100 %	0 %	0 %	0 %	374314711
5048	NC_016633	TTTG	2	8	290004	290011	0 %	75 %	25 %	0 %	374314711
5049	NC_016633	ATT	2	6	290031	290036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374314711
5050	NC_016633	T	6	6	290089	290094	0 %	100 %	0 %	0 %	374314711
5051	NC_016633	CTA	2	6	290104	290109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374314711
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5053	NC_016633	AGA	2	6	290204	290209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314711
5054	NC_016633	TATT	2	8	290226	290233	25 %	75 %	0 %	0 %	374314711
5055	NC_016633	TGC	2	6	290269	290274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374314711
5056	NC_016633	CTTT	2	8	290279	290286	0 %	75 %	0 %	25 %	374314711
5057	NC_016633	GAT	2	6	290315	290320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314711
5058	NC_016633	A	6	6	290363	290368	100 %	0 %	0 %	0 %	374314711
5059	NC_016633	TGA	2	6	290404	290409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314711
5060	NC_016633	AGA	2	6	290483	290488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016633	CTT	2	6	290600	290605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_016633	GTT	2	6	290683	290688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016633	GAT	3	9	290738	290746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016633	CCA	2	6	290916	290921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_016633	GA	3	6	290932	290937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016633	GA	3	6	291006	291011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016633	CGT	2	6	291060	291065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_016633	CTAT	2	8	291077	291084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_016633	AAT	2	6	291144	291149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016633	TCTT	2	8	291270	291277	0 %	75 %	0 %	25 %	374314712
5071	NC_016633	A	6	6	291286	291291	100 %	0 %	0 %	0 %	374314712
5072	NC_016633	ACC	3	9	291334	291342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374314712
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5076	NC_016633	TACC	2	8	291527	291534	25 %	25 %	0 %	50 %	374314712
5077	NC_016633	CTT	2	6	291541	291546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314712
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5080	NC_016633	TGT	2	6	291633	291638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374314712
5081	NC_016633	TGA	2	6	291663	291668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374314712
5082	NC_016633	ATTGC	2	10	291700	291709	20 %	40 %	20 %	20 %	374314712
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5088	NC_016633	ATTG	2	8	292059	292066	25 %	50 %	25 %	0 %	374314712
5089	NC_016633	GAA	2	6	292093	292098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314712
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5092	NC_016633	TTGC	2	8	292236	292243	0 %	50 %	25 %	25 %	374314713
5093	NC_016633	T	6	6	292271	292276	0 %	100 %	0 %	0 %	374314713
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5098	NC_016633	TGG	3	9	292521	292529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374314713
5099	NC_016633	T	6	6	292530	292535	0 %	100 %	0 %	0 %	374314713
5100	NC_016633	TGTC	2	8	292560	292567	0 %	50 %	25 %	25 %	374314713
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5106	NC_016633	CT	3	6	292840	292845	0 %	50 %	0 %	50 %	374314713
5107	NC_016633	AGGC	2	8	292855	292862	25 %	0 %	50 %	25 %	374314713
5108	NC_016633	A	6	6	292874	292879	100 %	0 %	0 %	0 %	374314713
5109	NC_016633	TTGC	2	8	292893	292900	0 %	50 %	25 %	25 %	374314713
5110	NC_016633	T	6	6	292910	292915	0 %	100 %	0 %	0 %	374314713
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5113	NC_016633	T	6	6	292974	292979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016633	T	6	6	293028	293033	0 %	100 %	0 %	0 %	374314714
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5117	NC_016633	TTC	2	6	293061	293066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314714
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5120	NC_016633	TC	3	6	293167	293172	0 %	50 %	0 %	50 %	374314714
5121	NC_016633	ATA	2	6	293178	293183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374314714
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5124	NC_016633	TGTAT	2	10	293313	293322	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_016633	CTT	2	6	293398	293403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374314715
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5253	NC_016633	CTT	2	6	299331	299336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5254	NC_016633	T	8	8	299349	299356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_016633	ATGGT	2	10	299361	299370	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_016633	GAA	2	6	299413	299418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5258	NC_016633	TCT	2	6	299505	299510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_016633	T	6	6	299520	299525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_016633	T	8	8	299529	299536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_016633	T	7	7	299637	299643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5272	NC_016633	TAC	2	6	300253	300258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5273	NC_016633	ATT	2	6	300283	300288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5370	NC_016633	GAA	2	6	304659	304664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5373	NC_016633	AAG	2	6	304766	304771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374314725
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