MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces bingchenggensis BCW-1 chromosome

Total Repeats: 12638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016582	GCCGC	2	10	600	609	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016582	TCGGG	2	10	4666	4675	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016582	ACGGC	2	10	9390	9399	20 %	0 %	40 %	40 %	374982768
4	NC_016582	CCGAA	2	10	10242	10251	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016582	GAGCG	2	10	10852	10861	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016582	GAGCG	2	10	11483	11492	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016582	GGAGG	2	10	11556	11565	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016582	CAGGC	2	10	11730	11739	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016582	CCACG	2	10	14976	14985	20 %	0 %	20 %	60 %	374982774
10	NC_016582	CGGCG	2	10	17633	17642	0 %	0 %	60 %	40 %	374982776
11	NC_016582	GGCCG	2	10	17979	17988	0 %	0 %	60 %	40 %	374982776
12	NC_016582	CGGAC	2	10	18366	18375	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016582	CCGAC	2	10	20469	20478	20 %	0 %	20 %	60 %	374982779
14	NC_016582	GGGTG	2	10	22080	22089	0 %	20 %	80 %	0 %	374982782
15	NC_016582	CTGTC	2	10	22850	22859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016582	GCGCG	2	10	23176	23185	0 %	0 %	60 %	40 %	374982784
17	NC_016582	GGCCG	2	10	23485	23494	0 %	0 %	60 %	40 %	374982784
18	NC_016582	CCGGA	2	10	23714	23723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016582	CGATC	2	10	23858	23867	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016582	CCGCC	2	10	25750	25759	0 %	0 %	20 %	80 %	374982786
21	NC_016582	CGCGG	2	10	26521	26530	0 %	0 %	60 %	40 %	374982786
22	NC_016582	TCGCC	2	10	26613	26622	0 %	20 %	20 %	60 %	374982786
23	NC_016582	GACCG	2	10	27218	27227	20 %	0 %	40 %	40 %	374982786
24	NC_016582	GGCCA	2	10	27718	27727	20 %	0 %	40 %	40 %	374982786
25	NC_016582	CCCGG	2	10	28868	28877	0 %	0 %	40 %	60 %	374982787
26	NC_016582	GGACG	2	10	29551	29560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016582	TCGAC	2	10	29741	29750	20 %	20 %	20 %	40 %	374982788
28	NC_016582	CCGTG	2	10	30228	30237	0 %	20 %	40 %	40 %	374982788
29	NC_016582	ACCGG	2	10	30363	30372	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016582	ACCGT	2	10	30407	30416	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016582	CCGGA	2	10	31283	31292	20 %	0 %	40 %	40 %	374982789
32	NC_016582	TCGGC	2	10	32648	32657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016582	GTGCT	2	10	33470	33479	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016582	CGCCC	2	10	34136	34145	0 %	0 %	20 %	80 %	374982792
35	NC_016582	CGGCC	2	10	37289	37298	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_016582	GGCCT	2	10	37477	37486	0 %	20 %	40 %	40 %	374982798
37	NC_016582	CGCCC	2	10	40100	40109	0 %	0 %	20 %	80 %	374982800
38	NC_016582	ACCCG	2	10	41832	41841	20 %	0 %	20 %	60 %	374982801
39	NC_016582	TCGGC	2	10	42181	42190	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016582	ACAGG	2	10	42346	42355	40 %	0 %	40 %	20 %	374982802
41	NC_016582	GCCCG	2	10	42473	42482	0 %	0 %	40 %	60 %	374982802
42	NC_016582	CGGTC	2	10	43329	43338	0 %	20 %	40 %	40 %	374982804
43	NC_016582	GCACG	2	10	43888	43897	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016582	ACCGC	2	10	44433	44442	20 %	0 %	20 %	60 %	374982806
45	NC_016582	GTCTG	2	10	46539	46548	0 %	40 %	40 %	20 %	374982807
46	NC_016582	CTGCA	2	10	48966	48975	20 %	20 %	20 %	40 %	374982808
47	NC_016582	CCCGC	2	10	49283	49292	0 %	0 %	20 %	80 %	374982808
48	NC_016582	CGGCC	2	10	50836	50845	0 %	0 %	40 %	60 %	374982811
49	NC_016582	TTCCC	2	10	53251	53260	0 %	40 %	0 %	60 %	374982813
50	NC_016582	CCGGG	2	10	53451	53460	0 %	0 %	60 %	40 %	374982813
51	NC_016582	AGTCT	2	10	54161	54170	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016582	TCCCG	2	10	55334	55343	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016582	ACCCC	2	10	55993	56002	20 %	0 %	0 %	80 %	374982817
54	NC_016582	TCATC	2	10	56123	56132	20 %	40 %	0 %	40 %	374982817
55	NC_016582	GCTCG	2	10	56531	56540	0 %	20 %	40 %	40 %	374982817
56	NC_016582	GCGCG	2	10	57321	57330	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016582	GGTGG	2	10	58084	58093	0 %	20 %	80 %	0 %	374982819
58	NC_016582	GGGCC	2	10	61872	61881	0 %	0 %	60 %	40 %	374982824
59	NC_016582	GCGCC	2	10	61891	61900	0 %	0 %	40 %	60 %	374982824
60	NC_016582	GCCTG	2	10	61986	61995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016582	GTGAC	2	10	62064	62073	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016582	CCGGT	2	10	62653	62662	0 %	20 %	40 %	40 %	374982825
63	NC_016582	CGCGG	2	10	62684	62693	0 %	0 %	60 %	40 %	374982825
64	NC_016582	CCGAC	2	10	64967	64976	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_016582	GCTGT	2	10	65473	65482	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016582	GGACG	2	10	66213	66222	20 %	0 %	60 %	20 %	374982830
67	NC_016582	CCAGG	2	10	66793	66802	20 %	0 %	40 %	40 %	374982830
68	NC_016582	GCACC	2	10	67005	67014	20 %	0 %	20 %	60 %	374982830
69	NC_016582	CGCGT	2	10	67941	67950	0 %	20 %	40 %	40 %	374982831
70	NC_016582	GGCCG	2	10	67951	67960	0 %	0 %	60 %	40 %	374982831
71	NC_016582	CCGAC	2	10	68955	68964	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_016582	GAACC	2	10	69080	69089	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016582	GGACA	2	10	69101	69110	40 %	0 %	40 %	20 %	374982833
74	NC_016582	GCCGC	2	10	69318	69327	0 %	0 %	40 %	60 %	374982833
75	NC_016582	AGGCA	2	10	69789	69798	40 %	0 %	40 %	20 %	374982834
76	NC_016582	CGATG	2	10	70287	70296	20 %	20 %	40 %	20 %	374982834
77	NC_016582	TCAGG	2	10	70755	70764	20 %	20 %	40 %	20 %	374982834
78	NC_016582	GCGGT	2	10	71618	71627	0 %	20 %	60 %	20 %	374982835
79	NC_016582	GGCCG	2	10	73092	73101	0 %	0 %	60 %	40 %	374982836
80	NC_016582	CCGTC	2	10	73790	73799	0 %	20 %	20 %	60 %	374982837
81	NC_016582	CCTTG	2	10	75232	75241	0 %	40 %	20 %	40 %	374982838
82	NC_016582	GTCGA	2	10	75797	75806	20 %	20 %	40 %	20 %	374982839
83	NC_016582	TGCCG	2	10	76401	76410	0 %	20 %	40 %	40 %	374982840
84	NC_016582	CCCGA	2	10	77942	77951	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016582	GTCCC	2	10	78748	78757	0 %	20 %	20 %	60 %	374982842
86	NC_016582	TGCCC	2	10	79082	79091	0 %	20 %	20 %	60 %	374982842
87	NC_016582	TCCGG	2	10	79810	79819	0 %	20 %	40 %	40 %	374982843
88	NC_016582	GCGCC	2	10	80273	80282	0 %	0 %	40 %	60 %	374982843
89	NC_016582	ACCGA	2	10	82317	82326	40 %	0 %	20 %	40 %	374982846
90	NC_016582	CCCGG	2	10	84904	84913	0 %	0 %	40 %	60 %	374982850
91	NC_016582	CTCGG	2	10	86637	86646	0 %	20 %	40 %	40 %	374982852
92	NC_016582	TCCGC	2	10	87088	87097	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_016582	AGCCG	2	10	87201	87210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016582	CCCGT	2	10	87230	87239	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_016582	GGCAC	2	10	88722	88731	20 %	0 %	40 %	40 %	374982855
96	NC_016582	GCACG	2	10	89022	89031	20 %	0 %	40 %	40 %	374982855
97	NC_016582	CCGCC	2	10	89570	89579	0 %	0 %	20 %	80 %	374982855
98	NC_016582	TGCGG	2	10	91909	91918	0 %	20 %	60 %	20 %	374982858
99	NC_016582	GCCGC	2	10	93594	93603	0 %	0 %	40 %	60 %	374982859
100	NC_016582	GCCGC	2	10	93651	93660	0 %	0 %	40 %	60 %	374982859
101	NC_016582	CTGTG	2	10	94477	94486	0 %	40 %	40 %	20 %	374982860
102	NC_016582	GCGCG	2	10	94591	94600	0 %	0 %	60 %	40 %	374982861
103	NC_016582	CGGTC	2	10	95167	95176	0 %	20 %	40 %	40 %	374982861
104	NC_016582	GCGTC	2	10	97310	97319	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016582	TTGTG	2	10	97348	97357	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016582	TCCGC	2	10	97430	97439	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_016582	CGGCA	2	10	97643	97652	20 %	0 %	40 %	40 %	374982863
108	NC_016582	CCGGC	2	10	98893	98902	0 %	0 %	40 %	60 %	374982864
109	NC_016582	CGCAT	2	10	99975	99984	20 %	20 %	20 %	40 %	374982865
110	NC_016582	ACCGA	2	10	100757	100766	40 %	0 %	20 %	40 %	374982866
111	NC_016582	ACGCG	2	10	102018	102027	20 %	0 %	40 %	40 %	374982866
112	NC_016582	CCGGC	2	10	103218	103227	0 %	0 %	40 %	60 %	374982867
113	NC_016582	CGTCG	2	10	103245	103254	0 %	20 %	40 %	40 %	374982867
114	NC_016582	CGGAC	2	10	103262	103271	20 %	0 %	40 %	40 %	374982867
115	NC_016582	CCGGG	2	10	105068	105077	0 %	0 %	60 %	40 %	374982868
116	NC_016582	CCGGC	2	10	105952	105961	0 %	0 %	40 %	60 %	374982868
117	NC_016582	CTCGT	2	10	106331	106340	0 %	40 %	20 %	40 %	374982868
118	NC_016582	TCGCA	2	10	107312	107321	20 %	20 %	20 %	40 %	374982868
119	NC_016582	CCCAT	2	10	108201	108210	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_016582	CGGCG	2	10	108320	108329	0 %	0 %	60 %	40 %	374982870
121	NC_016582	CGGCC	2	10	108589	108598	0 %	0 %	40 %	60 %	374982870
122	NC_016582	CGTGG	2	10	109338	109347	0 %	20 %	60 %	20 %	374982871
123	NC_016582	CTGCC	2	10	109393	109402	0 %	20 %	20 %	60 %	374982871
124	NC_016582	GTGCG	2	10	109615	109624	0 %	20 %	60 %	20 %	374982871
125	NC_016582	CCGAC	2	10	110489	110498	20 %	0 %	20 %	60 %	374982871
126	NC_016582	TCCTC	2	10	110639	110648	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_016582	TCGCG	2	10	110777	110786	0 %	20 %	40 %	40 %	374982872
128	NC_016582	CGACG	2	10	111565	111574	20 %	0 %	40 %	40 %	374982873
129	NC_016582	GCATC	2	10	112549	112558	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016582	CGGGC	2	10	112692	112701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016582	TCCGG	2	10	112742	112751	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016582	GCCGC	2	10	113457	113466	0 %	0 %	40 %	60 %	374982877
133	NC_016582	ACGGT	2	10	114350	114359	20 %	20 %	40 %	20 %	374982877
134	NC_016582	GCGAT	2	10	114929	114938	20 %	20 %	40 %	20 %	374982877
135	NC_016582	CCTGC	2	10	117429	117438	0 %	20 %	20 %	60 %	374982881
136	NC_016582	CCCCG	2	10	117637	117646	0 %	0 %	20 %	80 %	374982881
137	NC_016582	CGCGG	2	10	117844	117853	0 %	0 %	60 %	40 %	374982881
138	NC_016582	CGTGA	2	10	117879	117888	20 %	20 %	40 %	20 %	374982881
139	NC_016582	CGCGG	2	10	119839	119848	0 %	0 %	60 %	40 %	374982883
140	NC_016582	GCTCG	2	10	120188	120197	0 %	20 %	40 %	40 %	374982884
141	NC_016582	ACGCC	2	10	120770	120779	20 %	0 %	20 %	60 %	374982884
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143	NC_016582	CGGCC	2	10	122368	122377	0 %	0 %	40 %	60 %	374982885
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152	NC_016582	ACCGC	2	10	134175	134184	20 %	0 %	20 %	60 %	374982893
153	NC_016582	CGGCG	2	10	134351	134360	0 %	0 %	60 %	40 %	374982893
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262	NC_016582	GCGGG	2	10	253000	253009	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
263	NC_016582	GTGCC	2	10	253055	253064	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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401	NC_016582	GGCCG	2	10	375006	375015	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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