MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces cattleya NRRL 8057 plasmid pSCAT

Total Repeats: 2272

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016113	GCAAC	2	10	422	431	40 %	0 %	20 %	40 %	357407372
2	NC_016113	CCAAC	2	10	505	514	40 %	0 %	0 %	60 %	357407372
3	NC_016113	CCGCG	2	10	1294	1303	0 %	0 %	40 %	60 %	357407374
4	NC_016113	GACCT	2	10	1365	1374	20 %	20 %	20 %	40 %	357407374
5	NC_016113	ACTCC	2	10	1775	1784	20 %	20 %	0 %	60 %	357407374
6	NC_016113	GCCGG	2	10	1902	1911	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016113	CCGCG	2	10	2765	2774	0 %	0 %	40 %	60 %	357407375
8	NC_016113	TGTCC	2	10	2905	2914	0 %	40 %	20 %	40 %	357407375
9	NC_016113	GCGGG	2	10	3042	3051	0 %	0 %	80 %	20 %	357407376
10	NC_016113	GCGCT	2	10	4586	4595	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016113	GTCCG	2	10	4857	4866	0 %	20 %	40 %	40 %	357407379
12	NC_016113	CCGGC	2	10	5020	5029	0 %	0 %	40 %	60 %	357407379
13	NC_016113	GTGCG	2	10	5285	5294	0 %	20 %	60 %	20 %	357407379
14	NC_016113	GGCGC	2	10	5438	5447	0 %	0 %	60 %	40 %	357407379
15	NC_016113	CGGCG	2	10	7824	7833	0 %	0 %	60 %	40 %	357407381
16	NC_016113	GAAGG	2	10	8497	8506	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016113	GCCCG	2	10	9974	9983	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016113	CGGGA	2	10	10206	10215	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016113	CCGGC	2	10	10951	10960	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_016113	CGGAC	2	10	11222	11231	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016113	CCCGG	2	10	11446	11455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_016113	TGCGG	2	10	11651	11660	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016113	GCGCC	2	10	11688	11697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_016113	GGGCC	2	10	12626	12635	0 %	0 %	60 %	40 %	357407384
25	NC_016113	GCGGA	2	10	13237	13246	20 %	0 %	60 %	20 %	357407384
26	NC_016113	GCCGC	2	10	13475	13484	0 %	0 %	40 %	60 %	357407384
27	NC_016113	CGCGC	2	10	15013	15022	0 %	0 %	40 %	60 %	357407387
28	NC_016113	GGCCC	2	10	15836	15845	0 %	0 %	40 %	60 %	357407389
29	NC_016113	CCGGA	2	10	15961	15970	20 %	0 %	40 %	40 %	357407389
30	NC_016113	CACGG	2	10	16952	16961	20 %	0 %	40 %	40 %	357407390
31	NC_016113	GGACC	2	10	17818	17827	20 %	0 %	40 %	40 %	357407391
32	NC_016113	GACCT	2	10	18441	18450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016113	CGCAG	2	10	19479	19488	20 %	0 %	40 %	40 %	357407393
34	NC_016113	GCACA	2	10	20003	20012	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016113	GCGAG	2	10	21020	21029	20 %	0 %	60 %	20 %	357407395
36	NC_016113	CCGGA	2	10	23037	23046	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016113	GGGCC	2	10	24061	24070	0 %	0 %	60 %	40 %	357407399
38	NC_016113	GCCGC	2	10	24513	24522	0 %	0 %	40 %	60 %	357407400
39	NC_016113	GGCCA	2	10	25639	25648	20 %	0 %	40 %	40 %	357407400
40	NC_016113	GATGT	2	10	27332	27341	20 %	40 %	40 %	0 %	357407401
41	NC_016113	CGGAC	2	10	29156	29165	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016113	GGTGT	2	10	29632	29641	0 %	40 %	60 %	0 %	357407404
43	NC_016113	GCCGG	2	10	30856	30865	0 %	0 %	60 %	40 %	357407405
44	NC_016113	GCGGA	2	10	32638	32647	20 %	0 %	60 %	20 %	357407407
45	NC_016113	AGCCG	2	10	33762	33771	20 %	0 %	40 %	40 %	357407408
46	NC_016113	CGCGG	2	10	34537	34546	0 %	0 %	60 %	40 %	357407409
47	NC_016113	GCCGT	2	10	35538	35547	0 %	20 %	40 %	40 %	357407409
48	NC_016113	GGCGC	2	10	36391	36400	0 %	0 %	60 %	40 %	357407409
49	NC_016113	GGCCG	2	10	38711	38720	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016113	GTCGT	2	10	38873	38882	0 %	40 %	40 %	20 %	357407411
51	NC_016113	GCTGT	2	10	39720	39729	0 %	40 %	40 %	20 %	357407412
52	NC_016113	GCGCG	2	10	39827	39836	0 %	0 %	60 %	40 %	357407412
53	NC_016113	CCGGT	2	10	40207	40216	0 %	20 %	40 %	40 %	357407412
54	NC_016113	GCCCG	2	10	40788	40797	0 %	0 %	40 %	60 %	357407412
55	NC_016113	CGCGG	2	10	42094	42103	0 %	0 %	60 %	40 %	357407412
56	NC_016113	GGCGT	2	10	42138	42147	0 %	20 %	60 %	20 %	357407412
57	NC_016113	TCAAT	2	10	43251	43260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016113	GCGCG	2	10	45409	45418	0 %	0 %	60 %	40 %	357407415
59	NC_016113	ACGGC	2	10	47172	47181	20 %	0 %	40 %	40 %	357407418
60	NC_016113	GCCGG	2	10	50053	50062	0 %	0 %	60 %	40 %	357407420
61	NC_016113	CGGCC	2	10	50139	50148	0 %	0 %	40 %	60 %	357407420
62	NC_016113	CGGGC	2	10	52119	52128	0 %	0 %	60 %	40 %	357407421
63	NC_016113	ACCGC	2	10	53829	53838	20 %	0 %	20 %	60 %	357407423
64	NC_016113	GGCGC	2	10	54533	54542	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016113	CTCGC	2	10	54891	54900	0 %	20 %	20 %	60 %	357407425
66	NC_016113	CGTCG	2	10	55727	55736	0 %	20 %	40 %	40 %	357407426
67	NC_016113	CACGG	2	10	57136	57145	20 %	0 %	40 %	40 %	357407427
68	NC_016113	CGGCG	2	10	57907	57916	0 %	0 %	60 %	40 %	357407428
69	NC_016113	ACACG	2	10	58781	58790	40 %	0 %	20 %	40 %	357407429
70	NC_016113	TGCGC	2	10	59068	59077	0 %	20 %	40 %	40 %	357407429
71	NC_016113	CCTCG	2	10	59657	59666	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_016113	CCGGG	2	10	60272	60281	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016113	CGGCG	2	10	61752	61761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016113	GCCGG	2	10	62005	62014	0 %	0 %	60 %	40 %	357407432
75	NC_016113	TGGAG	2	10	62974	62983	20 %	20 %	60 %	0 %	357407432
76	NC_016113	CTCGG	2	10	63336	63345	0 %	20 %	40 %	40 %	357407433
77	NC_016113	GTGCG	2	10	63555	63564	0 %	20 %	60 %	20 %	357407433
78	NC_016113	CTCTG	2	10	64063	64072	0 %	40 %	20 %	40 %	357407433
79	NC_016113	GGGAC	2	10	64723	64732	20 %	0 %	60 %	20 %	357407434
80	NC_016113	TCCGG	2	10	65560	65569	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016113	CGACG	2	10	65619	65628	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016113	GGGCC	2	10	67635	67644	0 %	0 %	60 %	40 %	357407436
83	NC_016113	CGCGC	2	10	68271	68280	0 %	0 %	40 %	60 %	357407437
84	NC_016113	GGGCC	2	10	68789	68798	0 %	0 %	60 %	40 %	357407437
85	NC_016113	GACAC	2	10	69271	69280	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016113	CCGGG	2	10	70606	70615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016113	CGGCA	2	10	72592	72601	20 %	0 %	40 %	40 %	357407441
88	NC_016113	TCTCC	2	10	72970	72979	0 %	40 %	0 %	60 %	357407442
89	NC_016113	CGGCC	2	10	73079	73088	0 %	0 %	40 %	60 %	357407442
90	NC_016113	GCGCC	2	10	73098	73107	0 %	0 %	40 %	60 %	357407442
91	NC_016113	CCGGT	2	10	74596	74605	0 %	20 %	40 %	40 %	357407443
92	NC_016113	GCTGG	2	10	74698	74707	0 %	20 %	60 %	20 %	357407443
93	NC_016113	GACGG	2	10	75071	75080	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016113	CGACT	2	10	75596	75605	20 %	20 %	20 %	40 %	357407444
95	NC_016113	CGACG	2	10	75766	75775	20 %	0 %	40 %	40 %	357407444
96	NC_016113	GAGCG	2	10	76468	76477	20 %	0 %	60 %	20 %	357407445
97	NC_016113	TCGCG	2	10	77982	77991	0 %	20 %	40 %	40 %	357407446
98	NC_016113	ACCGC	2	10	78585	78594	20 %	0 %	20 %	60 %	357407447
99	NC_016113	CGCGA	2	10	79255	79264	20 %	0 %	40 %	40 %	357407448
100	NC_016113	GCGGG	2	10	79355	79364	0 %	0 %	80 %	20 %	357407448
101	NC_016113	CGGCC	2	10	80555	80564	0 %	0 %	40 %	60 %	357407450
102	NC_016113	CGGAG	2	10	80722	80731	20 %	0 %	60 %	20 %	357407450
103	NC_016113	GTCCT	2	10	82341	82350	0 %	40 %	20 %	40 %	357407452
104	NC_016113	CCCGG	2	10	82466	82475	0 %	0 %	40 %	60 %	357407452
105	NC_016113	ACCTG	2	10	82885	82894	20 %	20 %	20 %	40 %	357407452
106	NC_016113	CCGGG	2	10	84053	84062	0 %	0 %	60 %	40 %	357407453
107	NC_016113	AGGCC	2	10	84764	84773	20 %	0 %	40 %	40 %	357407454
108	NC_016113	CTCGC	2	10	84895	84904	0 %	20 %	20 %	60 %	357407454
109	NC_016113	TGACA	2	10	85946	85955	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016113	GCGCG	2	10	86754	86763	0 %	0 %	60 %	40 %	357407455
111	NC_016113	GCGGA	2	10	87622	87631	20 %	0 %	60 %	20 %	357407456
112	NC_016113	TTCTG	2	10	87998	88007	0 %	60 %	20 %	20 %	357407456
113	NC_016113	CGCCC	2	10	88882	88891	0 %	0 %	20 %	80 %	357407457
114	NC_016113	CGGCC	2	10	89323	89332	0 %	0 %	40 %	60 %	357407457
115	NC_016113	CGGCC	2	10	90252	90261	0 %	0 %	40 %	60 %	357407458
116	NC_016113	CGGCG	2	10	92506	92515	0 %	0 %	60 %	40 %	357407460
117	NC_016113	GCACC	2	10	95359	95368	20 %	0 %	20 %	60 %	357407462
118	NC_016113	GTCCG	2	10	96820	96829	0 %	20 %	40 %	40 %	357407463
119	NC_016113	CGCCC	2	10	96875	96884	0 %	0 %	20 %	80 %	357407463
120	NC_016113	TTTTC	2	10	98519	98528	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016113	GCCGG	2	10	98743	98752	0 %	0 %	60 %	40 %	357407465
122	NC_016113	CGACC	2	10	100296	100305	20 %	0 %	20 %	60 %	357407465
123	NC_016113	GCGCC	2	10	101100	101109	0 %	0 %	40 %	60 %	357407465
124	NC_016113	GGCCG	2	10	101201	101210	0 %	0 %	60 %	40 %	357407466
125	NC_016113	TCGCG	2	10	103787	103796	0 %	20 %	40 %	40 %	357407468
126	NC_016113	CGCGC	2	10	104118	104127	0 %	0 %	40 %	60 %	357407468
127	NC_016113	GCGAG	2	10	104147	104156	20 %	0 %	60 %	20 %	357407468
128	NC_016113	TCCCG	2	10	104965	104974	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_016113	GCAGC	2	10	105035	105044	20 %	0 %	40 %	40 %	357407469
130	NC_016113	CCGGG	2	10	105367	105376	0 %	0 %	60 %	40 %	357407469
131	NC_016113	GCGCC	2	10	105998	106007	0 %	0 %	40 %	60 %	357407469
132	NC_016113	GCGGT	2	10	106366	106375	0 %	20 %	60 %	20 %	357407470
133	NC_016113	GGTGG	2	10	106420	106429	0 %	20 %	80 %	0 %	357407470
134	NC_016113	CGGTG	2	10	106470	106479	0 %	20 %	60 %	20 %	357407471
135	NC_016113	GCGGT	2	10	106496	106505	0 %	20 %	60 %	20 %	357407471
136	NC_016113	GGGCG	2	10	106858	106867	0 %	0 %	80 %	20 %	357407471
137	NC_016113	ACGGG	2	10	106955	106964	20 %	0 %	60 %	20 %	357407471
138	NC_016113	CTGCC	2	10	110185	110194	0 %	20 %	20 %	60 %	357407473
139	NC_016113	GCCGG	2	10	111880	111889	0 %	0 %	60 %	40 %	357407475
140	NC_016113	ACGGT	2	10	112001	112010	20 %	20 %	40 %	20 %	357407475
141	NC_016113	CGGCG	2	10	112293	112302	0 %	0 %	60 %	40 %	357407475
142	NC_016113	GGACC	2	10	114686	114695	20 %	0 %	40 %	40 %	357407477
143	NC_016113	GGCCG	2	10	115154	115163	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016113	CCGGT	2	10	118599	118608	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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146	NC_016113	CAGCG	2	10	119148	119157	20 %	0 %	40 %	40 %	357407482
147	NC_016113	CCGCC	2	10	120565	120574	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
148	NC_016113	CGCGG	2	10	120992	121001	0 %	0 %	60 %	40 %	357407484
149	NC_016113	CCGGC	2	10	121668	121677	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
150	NC_016113	GCCCG	2	10	122504	122513	0 %	0 %	40 %	60 %	357407486
151	NC_016113	CCGGC	2	10	122711	122720	0 %	0 %	40 %	60 %	357407486
152	NC_016113	CCCGG	2	10	123037	123046	0 %	0 %	40 %	60 %	357407486
153	NC_016113	ACCGG	2	10	123611	123620	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_016113	GGCCC	2	10	124054	124063	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
156	NC_016113	TCGGC	2	10	124359	124368	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
157	NC_016113	TGCGG	2	10	124370	124379	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_016113	CGGCG	2	10	133181	133190	0 %	0 %	60 %	40 %	357407492
164	NC_016113	CGTCG	2	10	135250	135259	0 %	20 %	40 %	40 %	357407494
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167	NC_016113	GCCCG	2	10	139891	139900	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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172	NC_016113	CGGCG	2	10	141773	141782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
173	NC_016113	TGGCC	2	10	142557	142566	0 %	20 %	40 %	40 %	357407503
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176	NC_016113	CGGCG	2	10	145377	145386	0 %	0 %	60 %	40 %	357407505
177	NC_016113	GGCCA	2	10	145663	145672	20 %	0 %	40 %	40 %	357407505
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184	NC_016113	CGGGG	2	10	149146	149155	0 %	0 %	80 %	20 %	357407508
185	NC_016113	CCGTG	2	10	150658	150667	0 %	20 %	40 %	40 %	357407509
186	NC_016113	CACGT	2	10	152656	152665	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
187	NC_016113	GGGCC	2	10	154422	154431	0 %	0 %	60 %	40 %	357407511
188	NC_016113	ACCAC	2	10	154676	154685	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
189	NC_016113	CCGTG	2	10	156059	156068	0 %	20 %	40 %	40 %	357407512
190	NC_016113	GGGGC	2	10	156510	156519	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
191	NC_016113	GGCCG	2	10	156569	156578	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
192	NC_016113	GATCG	2	10	157408	157417	20 %	20 %	40 %	20 %	357407515
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196	NC_016113	GGCGG	2	10	163776	163785	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
197	NC_016113	TCCGG	2	10	163825	163834	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_016113	ACCGC	2	10	165901	165910	20 %	0 %	20 %	60 %	357407523
199	NC_016113	ACCGC	2	10	166362	166371	20 %	0 %	20 %	60 %	357407523
200	NC_016113	GCCCG	2	10	166766	166775	0 %	0 %	40 %	60 %	357407523
201	NC_016113	GCACC	2	10	167027	167036	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
202	NC_016113	CCGGT	2	10	167209	167218	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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240	NC_016113	TCACC	2	10	195474	195483	20 %	20 %	0 %	60 %	357407549
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243	NC_016113	CGCGT	2	10	197544	197553	0 %	20 %	40 %	40 %	357407549
244	NC_016113	CGGCG	2	10	201162	201171	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
245	NC_016113	TGGGG	2	10	201723	201732	0 %	20 %	80 %	0 %	357407550
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261	NC_016113	GCCGG	2	10	216488	216497	0 %	0 %	60 %	40 %	357407567
262	NC_016113	GCCGT	2	10	216659	216668	0 %	20 %	40 %	40 %	357407567
263	NC_016113	CGAGC	2	10	216991	217000	20 %	0 %	40 %	40 %	357407567
264	NC_016113	GCCGT	2	10	217470	217479	0 %	20 %	40 %	40 %	357407567
265	NC_016113	GCGGG	2	10	217565	217574	0 %	0 %	80 %	20 %	357407567
266	NC_016113	GCCCC	2	10	219269	219278	0 %	0 %	20 %	80 %	357407568
267	NC_016113	CGGGC	2	10	220405	220414	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
268	NC_016113	CGACG	2	10	221390	221399	20 %	0 %	40 %	40 %	357407570
269	NC_016113	GGCGG	2	10	221432	221441	0 %	0 %	80 %	20 %	357407570
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271	NC_016113	GACCG	2	10	222323	222332	20 %	0 %	40 %	40 %	357407571
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273	NC_016113	CTTCG	2	10	223435	223444	0 %	40 %	20 %	40 %	357407572
274	NC_016113	CGTTT	2	10	224298	224307	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
275	NC_016113	ACGTT	2	10	224354	224363	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_016113	CGGCA	2	10	227380	227389	20 %	0 %	40 %	40 %	357407577
284	NC_016113	CGGTG	2	10	227897	227906	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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295	NC_016113	GGCCC	2	10	236280	236289	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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500	NC_016113	CCCCT	2	10	417243	417252	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding

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