MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 4210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015976	CTGTC	2	10	106	115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_015976	CCGGC	2	10	471	480	0 %	0 %	40 %	60 %	347526386
3	NC_015976	GGCAG	2	10	1956	1965	20 %	0 %	60 %	20 %	347526388
4	NC_015976	CCGCC	2	10	3668	3677	0 %	0 %	20 %	80 %	347526390
5	NC_015976	TGTCA	2	10	4001	4010	20 %	40 %	20 %	20 %	347526391
6	NC_015976	GCGAC	2	10	4161	4170	20 %	0 %	40 %	40 %	347526391
7	NC_015976	GCGGG	2	10	4450	4459	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015976	ACCCC	2	10	4505	4514	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_015976	CCGGT	2	10	5411	5420	0 %	20 %	40 %	40 %	347526393
10	NC_015976	ACCGC	2	10	6550	6559	20 %	0 %	20 %	60 %	347526395
11	NC_015976	GCCCG	2	10	7185	7194	0 %	0 %	40 %	60 %	347526396
12	NC_015976	GTCCG	2	10	7483	7492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015976	CTGGA	2	10	7665	7674	20 %	20 %	40 %	20 %	347526397
14	NC_015976	CCTGC	2	10	9321	9330	0 %	20 %	20 %	60 %	347526397
15	NC_015976	CGGCG	2	10	9508	9517	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_015976	CCGCG	2	10	9721	9730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_015976	AGCTG	2	10	10075	10084	20 %	20 %	40 %	20 %	347526398
18	NC_015976	GCCGC	2	10	10672	10681	0 %	0 %	40 %	60 %	347526398
19	NC_015976	GCCCG	2	10	11592	11601	0 %	0 %	40 %	60 %	347526399
20	NC_015976	CGCAG	2	10	12693	12702	20 %	0 %	40 %	40 %	347526400
21	NC_015976	GGCCG	2	10	14794	14803	0 %	0 %	60 %	40 %	347526400
22	NC_015976	CGATG	2	10	14980	14989	20 %	20 %	40 %	20 %	347526400
23	NC_015976	CGGGC	2	10	15636	15645	0 %	0 %	60 %	40 %	347526400
24	NC_015976	CCCGG	2	10	17434	17443	0 %	0 %	40 %	60 %	347526401
25	NC_015976	AGCGA	2	10	18537	18546	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015976	CGCGA	2	10	19143	19152	20 %	0 %	40 %	40 %	347526403
27	NC_015976	GCCGC	2	10	20990	20999	0 %	0 %	40 %	60 %	347526407
28	NC_015976	GCTCA	2	10	21140	21149	20 %	20 %	20 %	40 %	347526407
29	NC_015976	CCGGC	2	10	21199	21208	0 %	0 %	40 %	60 %	347526407
30	NC_015976	CGTCA	2	10	21488	21497	20 %	20 %	20 %	40 %	347526407
31	NC_015976	CGGGG	2	10	25908	25917	0 %	0 %	80 %	20 %	347526411
32	NC_015976	TGCCC	2	10	27819	27828	0 %	20 %	20 %	60 %	347526412
33	NC_015976	GCTCC	2	10	27833	27842	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015976	CGGCG	2	10	28233	28242	0 %	0 %	60 %	40 %	347526413
35	NC_015976	CCGGG	2	10	28334	28343	0 %	0 %	60 %	40 %	347526413
36	NC_015976	CCGCT	2	10	28895	28904	0 %	20 %	20 %	60 %	347526414
37	NC_015976	CGGAA	2	10	30351	30360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015976	CGCGC	2	10	30484	30493	0 %	0 %	40 %	60 %	347526419
39	NC_015976	GCGCG	2	10	30658	30667	0 %	0 %	60 %	40 %	347526419
40	NC_015976	CGCTG	2	10	30867	30876	0 %	20 %	40 %	40 %	347526419
41	NC_015976	CGGCG	2	10	33301	33310	0 %	0 %	60 %	40 %	347526421
42	NC_015976	GCGCG	2	10	34440	34449	0 %	0 %	60 %	40 %	347526423
43	NC_015976	AGGCG	2	10	34548	34557	20 %	0 %	60 %	20 %	347526423
44	NC_015976	CCAGC	2	10	34824	34833	20 %	0 %	20 %	60 %	347526423
45	NC_015976	CGGGC	2	10	35724	35733	0 %	0 %	60 %	40 %	347526424
46	NC_015976	GATCG	2	10	36354	36363	20 %	20 %	40 %	20 %	347526425
47	NC_015976	AGGCG	2	10	36785	36794	20 %	0 %	60 %	20 %	347526425
48	NC_015976	GGCCG	2	10	37048	37057	0 %	0 %	60 %	40 %	347526425
49	NC_015976	GCCAT	2	10	37282	37291	20 %	20 %	20 %	40 %	347526426
50	NC_015976	TGCCC	2	10	37960	37969	0 %	20 %	20 %	60 %	347526427
51	NC_015976	GCGCC	2	10	38426	38435	0 %	0 %	40 %	60 %	347526428
52	NC_015976	TGCCG	2	10	39642	39651	0 %	20 %	40 %	40 %	347526429
53	NC_015976	CGATC	2	10	40770	40779	20 %	20 %	20 %	40 %	347526430
54	NC_015976	AAGCG	2	10	43564	43573	40 %	0 %	40 %	20 %	347526432
55	NC_015976	GCGCG	2	10	44181	44190	0 %	0 %	60 %	40 %	347526433
56	NC_015976	GGTCC	2	10	45096	45105	0 %	20 %	40 %	40 %	347526434
57	NC_015976	CGATG	2	10	47491	47500	20 %	20 %	40 %	20 %	347526436
58	NC_015976	TGGCG	2	10	47953	47962	0 %	20 %	60 %	20 %	347526437
59	NC_015976	GCGCG	2	10	50355	50364	0 %	0 %	60 %	40 %	347526440
60	NC_015976	GCCAG	2	10	52468	52477	20 %	0 %	40 %	40 %	347526441
61	NC_015976	CGCGC	2	10	53158	53167	0 %	0 %	40 %	60 %	347526442
62	NC_015976	CATCG	2	10	53603	53612	20 %	20 %	20 %	40 %	347526443
63	NC_015976	CGGGA	2	10	55241	55250	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015976	CGCGG	2	10	59506	59515	0 %	0 %	60 %	40 %	347526448
65	NC_015976	TCGCT	2	10	59683	59692	0 %	40 %	20 %	40 %	347526448
66	NC_015976	ATGGA	2	10	61030	61039	40 %	20 %	40 %	0 %	347526450
67	NC_015976	GCGAG	2	10	61376	61385	20 %	0 %	60 %	20 %	347526450
68	NC_015976	GCCTT	2	10	61495	61504	0 %	40 %	20 %	40 %	347526450
69	NC_015976	ACGTC	2	10	63302	63311	20 %	20 %	20 %	40 %	347526452
70	NC_015976	GCTGC	2	10	63343	63352	0 %	20 %	40 %	40 %	347526452
71	NC_015976	GACCC	2	10	63691	63700	20 %	0 %	20 %	60 %	347526452
72	NC_015976	GCCGC	2	10	63853	63862	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015976	ATCCC	2	10	64235	64244	20 %	20 %	0 %	60 %	347526453
74	NC_015976	CCTTC	2	10	64437	64446	0 %	40 %	0 %	60 %	347526453
75	NC_015976	GATCG	2	10	65370	65379	20 %	20 %	40 %	20 %	347526454
76	NC_015976	CTCGC	2	10	65479	65488	0 %	20 %	20 %	60 %	347526454
77	NC_015976	ATCCG	2	10	65513	65522	20 %	20 %	20 %	40 %	347526454
78	NC_015976	CGCGC	2	10	66178	66187	0 %	0 %	40 %	60 %	347526455
79	NC_015976	CGGCT	2	10	67210	67219	0 %	20 %	40 %	40 %	347526456
80	NC_015976	CGAAG	2	10	67402	67411	40 %	0 %	40 %	20 %	347526456
81	NC_015976	AGCGC	2	10	71654	71663	20 %	0 %	40 %	40 %	347526459
82	NC_015976	GGCCC	2	10	72695	72704	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_015976	GCGCC	2	10	74946	74955	0 %	0 %	40 %	60 %	347526462
84	NC_015976	GCCGC	2	10	76414	76423	0 %	0 %	40 %	60 %	347526464
85	NC_015976	GGCCA	2	10	80185	80194	20 %	0 %	40 %	40 %	347526467
86	NC_015976	CACGC	2	10	80434	80443	20 %	0 %	20 %	60 %	347526467
87	NC_015976	GCCGC	2	10	81058	81067	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_015976	GCCCG	2	10	82000	82009	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_015976	GGGCG	2	10	82039	82048	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015976	CCATC	2	10	82351	82360	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_015976	AGGCA	2	10	82737	82746	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015976	TCCTG	2	10	84636	84645	0 %	40 %	20 %	40 %	347526471
93	NC_015976	AGCGC	2	10	88470	88479	20 %	0 %	40 %	40 %	347526476
94	NC_015976	CGCGC	2	10	89136	89145	0 %	0 %	40 %	60 %	347526476
95	NC_015976	CGATT	2	10	89298	89307	20 %	40 %	20 %	20 %	347526476
96	NC_015976	CCGGC	2	10	89412	89421	0 %	0 %	40 %	60 %	347526476
97	NC_015976	AGGCG	2	10	89725	89734	20 %	0 %	60 %	20 %	347526476
98	NC_015976	GCCGG	2	10	90858	90867	0 %	0 %	60 %	40 %	347526477
99	NC_015976	CGATG	2	10	91128	91137	20 %	20 %	40 %	20 %	347526477
100	NC_015976	TGCCC	2	10	91920	91929	0 %	20 %	20 %	60 %	347526477
101	NC_015976	GGGCC	2	10	92097	92106	0 %	0 %	60 %	40 %	347526477
102	NC_015976	GCCGG	2	10	92390	92399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_015976	CGGGG	2	10	93307	93316	0 %	0 %	80 %	20 %	347526478
104	NC_015976	GCGCA	2	10	93544	93553	20 %	0 %	40 %	40 %	347526479
105	NC_015976	CGCTC	2	10	93976	93985	0 %	20 %	20 %	60 %	347526480
106	NC_015976	CCGGA	2	10	94578	94587	20 %	0 %	40 %	40 %	347526481
107	NC_015976	CGGCG	2	10	94746	94755	0 %	0 %	60 %	40 %	347526481
108	NC_015976	GGCTT	2	10	96486	96495	0 %	40 %	40 %	20 %	347526484
109	NC_015976	GCCAC	2	10	97166	97175	20 %	0 %	20 %	60 %	347526485
110	NC_015976	CGCAT	2	10	97860	97869	20 %	20 %	20 %	40 %	347526486
111	NC_015976	GATCG	2	10	99045	99054	20 %	20 %	40 %	20 %	347526487
112	NC_015976	CGACG	2	10	101113	101122	20 %	0 %	40 %	40 %	347526488
113	NC_015976	CCGGC	2	10	103641	103650	0 %	0 %	40 %	60 %	347526491
114	NC_015976	CTCTG	2	10	104377	104386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015976	GCATG	2	10	105453	105462	20 %	20 %	40 %	20 %	347526493
116	NC_015976	CCTGC	2	10	107791	107800	0 %	20 %	20 %	60 %	347526494
117	NC_015976	CGTCG	2	10	108184	108193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015976	CTTGC	2	10	110907	110916	0 %	40 %	20 %	40 %	347526497
119	NC_015976	GGCGC	2	10	114419	114428	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015976	GGGCA	2	10	115884	115893	20 %	0 %	60 %	20 %	347526501
121	NC_015976	CCGCG	2	10	116160	116169	0 %	0 %	40 %	60 %	347526502
122	NC_015976	GAGGG	2	10	116887	116896	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015976	AGCTC	2	10	117015	117024	20 %	20 %	20 %	40 %	347526504
124	NC_015976	CCGCA	2	10	117652	117661	20 %	0 %	20 %	60 %	347526504
125	NC_015976	GGGGA	2	10	117823	117832	20 %	0 %	80 %	0 %	347526504
126	NC_015976	CGGGG	2	10	117897	117906	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015976	GCCGC	2	10	119123	119132	0 %	0 %	40 %	60 %	347526506
128	NC_015976	CCCTG	2	10	120234	120243	0 %	20 %	20 %	60 %	347526507
129	NC_015976	TCCCG	2	10	120325	120334	0 %	20 %	20 %	60 %	347526507
130	NC_015976	CGCAT	2	10	120810	120819	20 %	20 %	20 %	40 %	347526509
131	NC_015976	ATCTC	2	10	122819	122828	20 %	40 %	0 %	40 %	347526510
132	NC_015976	CGCTG	2	10	124340	124349	0 %	20 %	40 %	40 %	347526511
133	NC_015976	CGACC	2	10	124394	124403	20 %	0 %	20 %	60 %	347526511
134	NC_015976	CGGCG	2	10	124585	124594	0 %	0 %	60 %	40 %	347526511
135	NC_015976	TGAGC	2	10	125011	125020	20 %	20 %	40 %	20 %	347526512
136	NC_015976	GCTGG	2	10	125073	125082	0 %	20 %	60 %	20 %	347526512
137	NC_015976	TGCCT	2	10	126493	126502	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015976	CACCG	2	10	126823	126832	20 %	0 %	20 %	60 %	347526514
139	NC_015976	GGGCA	2	10	127933	127942	20 %	0 %	60 %	20 %	347526514
140	NC_015976	GCGAC	2	10	128018	128027	20 %	0 %	40 %	40 %	347526514
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240	NC_015976	CTGAT	2	10	235017	235026	20 %	40 %	20 %	20 %	347526610
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249	NC_015976	CTCGG	2	10	241221	241230	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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252	NC_015976	CCGGC	2	10	245552	245561	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
253	NC_015976	CATCG	2	10	245598	245607	20 %	20 %	20 %	40 %	347526619
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259	NC_015976	ATGCA	2	10	255840	255849	40 %	20 %	20 %	20 %	347526626
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261	NC_015976	GATCA	2	10	257278	257287	40 %	20 %	20 %	20 %	347526627
262	NC_015976	GACAG	2	10	257573	257582	40 %	0 %	40 %	20 %	347526627
263	NC_015976	GGATC	2	10	258592	258601	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
264	NC_015976	CCGGT	2	10	259561	259570	0 %	20 %	40 %	40 %	347526628
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267	NC_015976	CGCGG	2	10	261940	261949	0 %	0 %	60 %	40 %	347526629
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