MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 106501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015976	T	6	6	154562	154567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015976	AAGA	2	8	154590	154597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015976	GCC	2	6	154623	154628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526541
4004	NC_015976	GAT	2	6	154665	154670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526541
4005	NC_015976	CGG	2	6	154675	154680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526541
4006	NC_015976	ATTG	2	8	154681	154688	25 %	50 %	25 %	0 %	347526541
4007	NC_015976	TCG	2	6	154726	154731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4008	NC_015976	TCT	2	6	154751	154756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526541
4009	NC_015976	GAT	2	6	154758	154763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526541
4010	NC_015976	CCG	2	6	154790	154795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526541
4011	NC_015976	CG	3	6	154794	154799	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4012	NC_015976	GGC	2	6	154803	154808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526541
4013	NC_015976	CGT	2	6	154860	154865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4014	NC_015976	TGT	2	6	154875	154880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526541
4015	NC_015976	CTT	2	6	155028	155033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526541
4016	NC_015976	GCCG	2	8	155051	155058	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4017	NC_015976	TCG	2	6	155062	155067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4018	NC_015976	CAGC	2	8	155091	155098	25 %	0 %	25 %	50 %	347526541
4019	NC_015976	GC	4	8	155110	155117	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4020	NC_015976	GTT	2	6	155130	155135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526541
4021	NC_015976	TCA	2	6	155147	155152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526541
4022	NC_015976	CGC	2	6	155159	155164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526541
4023	NC_015976	GGT	2	6	155215	155220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526541
4024	NC_015976	CG	3	6	155243	155248	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4025	NC_015976	GCA	2	6	155300	155305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4026	NC_015976	GAA	2	6	155325	155330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526541
4027	NC_015976	GCC	2	6	155358	155363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526541
4028	NC_015976	AGC	2	6	155452	155457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4029	NC_015976	GCCG	2	8	155462	155469	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4030	NC_015976	GC	3	6	155474	155479	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4031	NC_015976	CAG	3	9	155511	155519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4032	NC_015976	GCC	2	6	155528	155533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526541
4033	NC_015976	GCA	2	6	155567	155572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4034	NC_015976	GAC	3	9	155589	155597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4035	NC_015976	TCG	2	6	155603	155608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4036	NC_015976	ATA	2	6	155655	155660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526541
4037	NC_015976	AGGA	2	8	155728	155735	50 %	0 %	50 %	0 %	347526541
4038	NC_015976	CCT	2	6	155744	155749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526541
4039	NC_015976	GAT	2	6	155772	155777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526541
4040	NC_015976	GAC	2	6	155823	155828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4041	NC_015976	CG	3	6	155831	155836	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4042	NC_015976	GC	3	6	155837	155842	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4043	NC_015976	GAT	2	6	155862	155867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526541
4044	NC_015976	CG	3	6	155882	155887	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4045	NC_015976	CGG	2	6	155921	155926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526541
4046	NC_015976	CAG	2	6	155937	155942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4047	NC_015976	ATGG	2	8	155955	155962	25 %	25 %	50 %	0 %	347526541
4048	NC_015976	GCT	2	6	155970	155975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4049	NC_015976	CGG	2	6	156032	156037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526541
4050	NC_015976	CG	3	6	156078	156083	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4051	NC_015976	GAT	2	6	156099	156104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526541
4052	NC_015976	TGG	2	6	156128	156133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526541
4053	NC_015976	CGG	2	6	156158	156163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526541
4054	NC_015976	TCG	2	6	156299	156304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526541
4055	NC_015976	GCC	2	6	156358	156363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526541
4056	NC_015976	CG	3	6	156364	156369	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4057	NC_015976	GC	3	6	156406	156411	0 %	0 %	50 %	50 %	347526541
4058	NC_015976	CGATA	2	10	156428	156437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4059	NC_015976	CCTTG	2	10	156539	156548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4060	NC_015976	CGC	2	6	156609	156614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_015976	GCG	2	6	156670	156675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4062	NC_015976	CGGGCA	2	12	156676	156687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347526542
4063	NC_015976	GCC	2	6	156713	156718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526542
4064	NC_015976	GC	3	6	156727	156732	0 %	0 %	50 %	50 %	347526542
4065	NC_015976	TGC	2	6	156790	156795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4066	NC_015976	GGC	2	6	156801	156806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4067	NC_015976	GGC	3	9	156876	156884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4068	NC_015976	GC	4	8	156907	156914	0 %	0 %	50 %	50 %	347526542
4069	NC_015976	CGA	2	6	157112	157117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4070	NC_015976	GCGGA	2	10	157119	157128	20 %	0 %	60 %	20 %	347526542
4071	NC_015976	GC	3	6	157131	157136	0 %	0 %	50 %	50 %	347526542
4072	NC_015976	TCA	2	6	157147	157152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526542
4073	NC_015976	GGGC	2	8	157175	157182	0 %	0 %	75 %	25 %	347526542
4074	NC_015976	GAA	2	6	157244	157249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526542
4075	NC_015976	GA	3	6	157333	157338	50 %	0 %	50 %	0 %	347526542
4076	NC_015976	CGG	3	9	157393	157401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4077	NC_015976	TGC	2	6	157406	157411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4078	NC_015976	CGC	2	6	157477	157482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526542
4079	NC_015976	GCG	2	6	157489	157494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4080	NC_015976	GCT	2	6	157517	157522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4081	NC_015976	CAT	2	6	157595	157600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526542
4082	NC_015976	ACG	2	6	157707	157712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4083	NC_015976	CCCG	2	8	157739	157746	0 %	0 %	25 %	75 %	347526542
4084	NC_015976	GGC	2	6	157785	157790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4085	NC_015976	GAC	2	6	157838	157843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4086	NC_015976	CTT	2	6	157886	157891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526542
4087	NC_015976	CAA	2	6	157895	157900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526542
4088	NC_015976	CG	3	6	157927	157932	0 %	0 %	50 %	50 %	347526542
4089	NC_015976	GGC	2	6	157942	157947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4090	NC_015976	CGA	2	6	158012	158017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4091	NC_015976	CGG	2	6	158047	158052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4092	NC_015976	G	6	6	158051	158056	0 %	0 %	100 %	0 %	347526542
4093	NC_015976	TCG	2	6	158146	158151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526542
4094	NC_015976	CG	4	8	158150	158157	0 %	0 %	50 %	50 %	347526542
4095	NC_015976	GCC	2	6	158160	158165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526542
4096	NC_015976	TCC	2	6	158189	158194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526542
4097	NC_015976	TGA	2	6	158272	158277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526542
4098	NC_015976	GGC	2	6	158301	158306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526542
4099	NC_015976	GC	3	6	158327	158332	0 %	0 %	50 %	50 %	347526542
4100	NC_015976	GCCGA	2	10	158337	158346	20 %	0 %	40 %	40 %	347526542
4101	NC_015976	G	6	6	158358	158363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015976	CG	3	6	158440	158445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_015976	CG	3	6	158454	158459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_015976	CTG	2	6	158560	158565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_015976	TGG	2	6	158589	158594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015976	CGG	2	6	158632	158637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526543
4107	NC_015976	CGGCG	2	10	158648	158657	0 %	0 %	60 %	40 %	347526543
4108	NC_015976	GCT	2	6	158690	158695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526543
4109	NC_015976	GTC	2	6	158718	158723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526543
4110	NC_015976	GCC	3	9	158784	158792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526543
4111	NC_015976	GCGG	2	8	158817	158824	0 %	0 %	75 %	25 %	347526543
4112	NC_015976	TGC	2	6	158869	158874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526543
4113	NC_015976	TCC	2	6	158884	158889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526543
4114	NC_015976	GC	3	6	158908	158913	0 %	0 %	50 %	50 %	347526543
4115	NC_015976	GCT	2	6	158915	158920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526543
4116	NC_015976	TTC	2	6	158922	158927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526543
4117	NC_015976	GCT	2	6	158942	158947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526543
4118	NC_015976	GCC	2	6	158993	158998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526543
4119	NC_015976	TCA	2	6	159152	159157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526544
4120	NC_015976	GCG	2	6	159172	159177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526544
4121	NC_015976	CTG	2	6	159193	159198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526544
4122	NC_015976	CGT	2	6	159225	159230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526544
4123	NC_015976	CCCG	2	8	159231	159238	0 %	0 %	25 %	75 %	347526544
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4243	NC_015976	CGCC	2	8	163504	163511	0 %	0 %	25 %	75 %	347526549
4244	NC_015976	GGTCC	2	10	163516	163525	0 %	20 %	40 %	40 %	347526549
4245	NC_015976	TCA	2	6	163636	163641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526549
4246	NC_015976	GTT	2	6	163655	163660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526549
4247	NC_015976	ATGC	2	8	163667	163674	25 %	25 %	25 %	25 %	347526549
4248	NC_015976	CG	3	6	163721	163726	0 %	0 %	50 %	50 %	347526549
4249	NC_015976	GGC	2	6	163742	163747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526549
4250	NC_015976	CAC	2	6	163787	163792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526549
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4253	NC_015976	CGG	2	6	163813	163818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526549
4254	NC_015976	CG	3	6	163843	163848	0 %	0 %	50 %	50 %	347526549
4255	NC_015976	CG	3	6	163996	164001	0 %	0 %	50 %	50 %	347526549
4256	NC_015976	ATC	2	6	164049	164054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526549
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4259	NC_015976	TGA	2	6	164158	164163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526549
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4270	NC_015976	CG	3	6	164678	164683	0 %	0 %	50 %	50 %	347526549
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4274	NC_015976	GAA	2	6	164798	164803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526549
4275	NC_015976	GCC	2	6	164810	164815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526549
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4277	NC_015976	CAG	2	6	164915	164920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526549
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4280	NC_015976	GCAG	2	8	164993	165000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4281	NC_015976	GATGCG	2	12	165097	165108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347526550
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4300	NC_015976	CGG	2	6	165996	166001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4302	NC_015976	TTC	2	6	166037	166042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4323	NC_015976	TCGC	2	8	166783	166790	0 %	25 %	25 %	50 %	347526552
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4327	NC_015976	CTCG	2	8	166926	166933	0 %	25 %	25 %	50 %	347526552
4328	NC_015976	GCCA	2	8	166956	166963	25 %	0 %	25 %	50 %	347526552
4329	NC_015976	GCCC	2	8	166970	166977	0 %	0 %	25 %	75 %	347526552
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4332	NC_015976	CGA	2	6	167063	167068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
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4342	NC_015976	GGCC	2	8	167438	167445	0 %	0 %	50 %	50 %	347526552
4343	NC_015976	ATA	2	6	167487	167492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526552
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4346	NC_015976	CG	5	10	167682	167691	0 %	0 %	50 %	50 %	347526552
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4350	NC_015976	GAA	2	6	167781	167786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526552
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4355	NC_015976	TCG	2	6	168010	168015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4356	NC_015976	GCC	2	6	168044	168049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526552
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4359	NC_015976	GCT	3	9	168182	168190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4360	NC_015976	GGA	2	6	168199	168204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526552
4361	NC_015976	AGC	2	6	168214	168219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4362	NC_015976	AGGCG	2	10	168276	168285	20 %	0 %	60 %	20 %	347526552
4363	NC_015976	AAGGG	2	10	168305	168314	40 %	0 %	60 %	0 %	347526552
4364	NC_015976	CAG	2	6	168333	168338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4365	NC_015976	CGA	2	6	168401	168406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
4366	NC_015976	CG	3	6	168426	168431	0 %	0 %	50 %	50 %	347526552
4367	NC_015976	ACG	2	6	168478	168483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526552
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4369	NC_015976	GGCC	2	8	168590	168597	0 %	0 %	50 %	50 %	347526552
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4482	NC_015976	GCTG	2	8	172725	172732	0 %	25 %	50 %	25 %	347526555
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4494	NC_015976	GGAT	2	8	173172	173179	25 %	25 %	50 %	0 %	347526555
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