MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 106501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015976	CGC	2	6	115382	115387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526501
3002	NC_015976	GC	3	6	115386	115391	0 %	0 %	50 %	50 %	347526501
3003	NC_015976	GCC	2	6	115485	115490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526501
3004	NC_015976	CGG	2	6	115577	115582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526501
3005	NC_015976	CGG	2	6	115589	115594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526501
3006	NC_015976	CGC	2	6	115598	115603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526501
3007	NC_015976	GAA	2	6	115608	115613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526501
3008	NC_015976	TGA	2	6	115625	115630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526501
3009	NC_015976	GCCGTA	2	12	115659	115670	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526501
3010	NC_015976	CGC	2	6	115703	115708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526501
3011	NC_015976	TTC	2	6	115735	115740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526501
3012	NC_015976	GCC	2	6	115752	115757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526501
3013	NC_015976	ATC	2	6	115783	115788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526501
3014	NC_015976	AGG	2	6	115789	115794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526501
3015	NC_015976	TCA	2	6	115811	115816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526501
3016	NC_015976	TTG	2	6	115825	115830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526501
3017	NC_015976	CGG	2	6	115859	115864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526501
3018	NC_015976	CCT	2	6	115868	115873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526501
3019	NC_015976	GGGCA	2	10	115884	115893	20 %	0 %	60 %	20 %	347526501
3020	NC_015976	CGC	2	6	115925	115930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526501
3021	NC_015976	TCT	2	6	115934	115939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526501
3022	NC_015976	TTG	2	6	116071	116076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526502
3023	NC_015976	TCG	2	6	116108	116113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526502
3024	NC_015976	GAC	2	6	116116	116121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526502
3025	NC_015976	CCGCG	2	10	116160	116169	0 %	0 %	40 %	60 %	347526502
3026	NC_015976	TGA	2	6	116283	116288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526502
3027	NC_015976	ATG	2	6	116294	116299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526502
3028	NC_015976	TGC	2	6	116307	116312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526502
3029	NC_015976	TGG	2	6	116319	116324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_015976	CAAG	2	8	116339	116346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3031	NC_015976	AGC	2	6	116423	116428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_015976	A	6	6	116444	116449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015976	GCA	2	6	116453	116458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015976	GC	4	8	116510	116517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_015976	CCT	3	9	116585	116593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_015976	GGGC	2	8	116602	116609	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_015976	TCC	2	6	116643	116648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526503
3038	NC_015976	CCG	2	6	116687	116692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526503
3039	NC_015976	GAT	2	6	116701	116706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526503
3040	NC_015976	ACGG	2	8	116723	116730	25 %	0 %	50 %	25 %	347526503
3041	NC_015976	GTC	2	6	116731	116736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526503
3042	NC_015976	GTC	2	6	116833	116838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526503
3043	NC_015976	ATC	2	6	116851	116856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526503
3044	NC_015976	GAGGG	2	10	116887	116896	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015976	CGGG	2	8	116965	116972	0 %	0 %	75 %	25 %	347526504
3046	NC_015976	AGCTC	2	10	117015	117024	20 %	20 %	20 %	40 %	347526504
3047	NC_015976	TGG	2	6	117144	117149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526504
3048	NC_015976	GCC	2	6	117154	117159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526504
3049	NC_015976	CGC	2	6	117175	117180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526504
3050	NC_015976	TTC	2	6	117188	117193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526504
3051	NC_015976	TCA	2	6	117213	117218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526504
3052	NC_015976	CG	3	6	117228	117233	0 %	0 %	50 %	50 %	347526504
3053	NC_015976	CGAG	2	8	117251	117258	25 %	0 %	50 %	25 %	347526504
3054	NC_015976	GAC	2	6	117259	117264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526504
3055	NC_015976	GCC	2	6	117332	117337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526504
3056	NC_015976	GGC	2	6	117352	117357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526504
3057	NC_015976	CCA	2	6	117381	117386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526504
3058	NC_015976	GC	3	6	117437	117442	0 %	0 %	50 %	50 %	347526504
3059	NC_015976	GC	3	6	117483	117488	0 %	0 %	50 %	50 %	347526504
3060	NC_015976	G	6	6	117493	117498	0 %	0 %	100 %	0 %	347526504
3061	NC_015976	TCA	2	6	117513	117518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526504
3062	NC_015976	GAA	2	6	117538	117543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526504
3063	NC_015976	GCA	2	6	117573	117578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526504
3064	NC_015976	CCGCA	2	10	117652	117661	20 %	0 %	20 %	60 %	347526504
3065	NC_015976	GC	3	6	117747	117752	0 %	0 %	50 %	50 %	347526504
3066	NC_015976	GC	4	8	117767	117774	0 %	0 %	50 %	50 %	347526504
3067	NC_015976	GCG	2	6	117788	117793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526504
3068	NC_015976	CAT	2	6	117796	117801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526504
3069	NC_015976	GGC	2	6	117813	117818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526504
3070	NC_015976	GGGGA	2	10	117823	117832	20 %	0 %	80 %	0 %	347526504
3071	NC_015976	CGGGG	2	10	117897	117906	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_015976	GC	3	6	117955	117960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_015976	CAT	2	6	118071	118076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526505
3074	NC_015976	CAT	2	6	118092	118097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526505
3075	NC_015976	CAG	2	6	118098	118103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526505
3076	NC_015976	CGG	2	6	118173	118178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526505
3077	NC_015976	GCT	2	6	118203	118208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526505
3078	NC_015976	CGGC	2	8	118226	118233	0 %	0 %	50 %	50 %	347526505
3079	NC_015976	ATCA	2	8	118270	118277	50 %	25 %	0 %	25 %	347526505
3080	NC_015976	TGGC	2	8	118414	118421	0 %	25 %	50 %	25 %	347526505
3081	NC_015976	TGCCGA	2	12	118542	118553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526505
3082	NC_015976	AGC	2	6	118554	118559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526505
3083	NC_015976	GCG	2	6	118582	118587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526505
3084	NC_015976	CCG	2	6	118589	118594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526505
3085	NC_015976	GCA	2	6	118609	118614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526505
3086	NC_015976	CTG	2	6	118616	118621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526505
3087	NC_015976	CGC	3	9	118632	118640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526505
3088	NC_015976	GCCG	2	8	118641	118648	0 %	0 %	50 %	50 %	347526505
3089	NC_015976	CAG	2	6	118715	118720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3090	NC_015976	CGC	2	6	118731	118736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526506
3091	NC_015976	TCG	2	6	118751	118756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3092	NC_015976	CCG	2	6	118776	118781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526506
3093	NC_015976	TGA	2	6	118794	118799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526506
3094	NC_015976	TGA	2	6	118818	118823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526506
3095	NC_015976	GAC	2	6	118852	118857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3096	NC_015976	AGG	2	6	118883	118888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526506
3097	NC_015976	CAG	2	6	118927	118932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3098	NC_015976	GAA	2	6	118936	118941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526506
3099	NC_015976	GCC	2	6	118960	118965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526506
3100	NC_015976	GCGCCC	2	12	118980	118991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526506
3101	NC_015976	TGGAAC	2	12	119027	119038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347526506
3102	NC_015976	GCA	2	6	119082	119087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3103	NC_015976	GCCGC	2	10	119123	119132	0 %	0 %	40 %	60 %	347526506
3104	NC_015976	GGC	2	6	119137	119142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526506
3105	NC_015976	ACC	2	6	119158	119163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526506
3106	NC_015976	AC	3	6	119170	119175	50 %	0 %	0 %	50 %	347526506
3107	NC_015976	GC	3	6	119224	119229	0 %	0 %	50 %	50 %	347526506
3108	NC_015976	GC	3	6	119236	119241	0 %	0 %	50 %	50 %	347526506
3109	NC_015976	ATA	2	6	119248	119253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526506
3110	NC_015976	GCC	2	6	119264	119269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526506
3111	NC_015976	GGC	2	6	119305	119310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526506
3112	NC_015976	GC	3	6	119347	119352	0 %	0 %	50 %	50 %	347526506
3113	NC_015976	AGA	2	6	119361	119366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347526506
3114	NC_015976	CAG	3	9	119395	119403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3115	NC_015976	AGC	2	6	119414	119419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3116	NC_015976	GCA	2	6	119454	119459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526506
3117	NC_015976	GCG	2	6	119508	119513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526506
3118	NC_015976	GC	3	6	119522	119527	0 %	0 %	50 %	50 %	347526506
3119	NC_015976	CG	3	6	119528	119533	0 %	0 %	50 %	50 %	347526506
3120	NC_015976	CTCA	2	8	119587	119594	25 %	25 %	0 %	50 %	347526506
3121	NC_015976	CGG	2	6	119617	119622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_015976	GCT	2	6	119659	119664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526507
3123	NC_015976	GGA	2	6	119769	119774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526507
3124	NC_015976	G	6	6	119783	119788	0 %	0 %	100 %	0 %	347526507
3125	NC_015976	GTC	2	6	119803	119808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526507
3126	NC_015976	GCC	2	6	119846	119851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526507
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3129	NC_015976	CG	3	6	119981	119986	0 %	0 %	50 %	50 %	347526507
3130	NC_015976	TCG	2	6	120099	120104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526507
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3139	NC_015976	TCCCG	2	10	120325	120334	0 %	20 %	20 %	60 %	347526507
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3168	NC_015976	CATT	2	8	121830	121837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3169	NC_015976	GGGAGA	2	12	121895	121906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3170	NC_015976	ATC	2	6	122032	122037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526510
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3181	NC_015976	GCT	2	6	122487	122492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526510
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3209	NC_015976	GC	3	6	123580	123585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3229	NC_015976	GC	3	6	124321	124326	0 %	0 %	50 %	50 %	347526511
3230	NC_015976	CGCTG	2	10	124340	124349	0 %	20 %	40 %	40 %	347526511
3231	NC_015976	CGACC	2	10	124394	124403	20 %	0 %	20 %	60 %	347526511
3232	NC_015976	CGGG	2	8	124475	124482	0 %	0 %	75 %	25 %	347526511
3233	NC_015976	GCG	2	6	124483	124488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526511
3234	NC_015976	CG	3	6	124499	124504	0 %	0 %	50 %	50 %	347526511
3235	NC_015976	CGGCG	2	10	124585	124594	0 %	0 %	60 %	40 %	347526511
3236	NC_015976	CGC	2	6	124628	124633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526511
3237	NC_015976	GCAG	2	8	124642	124649	25 %	0 %	50 %	25 %	347526511
3238	NC_015976	GAT	2	6	124683	124688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526511
3239	NC_015976	GCT	2	6	124712	124717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526511
3240	NC_015976	CGGC	2	8	124782	124789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3241	NC_015976	TAT	2	6	124813	124818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_015976	TGC	2	6	124899	124904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526512
3243	NC_015976	TGAGC	2	10	125011	125020	20 %	20 %	40 %	20 %	347526512
3244	NC_015976	GC	3	6	125019	125024	0 %	0 %	50 %	50 %	347526512
3245	NC_015976	CGGC	2	8	125035	125042	0 %	0 %	50 %	50 %	347526512
3246	NC_015976	GTC	2	6	125066	125071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526512
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3283	NC_015976	GAT	2	6	126462	126467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3370	NC_015976	CGG	2	6	130206	130211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526515
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3372	NC_015976	GC	3	6	130240	130245	0 %	0 %	50 %	50 %	347526515
3373	NC_015976	GCCGG	2	10	130296	130305	0 %	0 %	60 %	40 %	347526515
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3432	NC_015976	CTG	2	6	132405	132410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526515
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3460	NC_015976	CAA	2	6	133554	133559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3461	NC_015976	GAAT	2	8	133603	133610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3471	NC_015976	GGGA	2	8	133923	133930	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3472	NC_015976	CGGT	2	8	134005	134012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3473	NC_015976	GGC	2	6	134016	134021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526518
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3477	NC_015976	GC	3	6	134211	134216	0 %	0 %	50 %	50 %	347526518
3478	NC_015976	ACC	2	6	134245	134250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526518
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3481	NC_015976	CCGC	2	8	134358	134365	0 %	0 %	25 %	75 %	347526518
3482	NC_015976	CGA	2	6	134376	134381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526518
3483	NC_015976	GGC	2	6	134397	134402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526518
3484	NC_015976	GAT	2	6	134433	134438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526518
3485	NC_015976	CCAGCC	2	12	134520	134531	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	347526518
3486	NC_015976	GGA	2	6	134542	134547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526518
3487	NC_015976	TCC	2	6	134589	134594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3488	NC_015976	GAC	2	6	134632	134637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526519
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3490	NC_015976	GC	4	8	134675	134682	0 %	0 %	50 %	50 %	347526519
3491	NC_015976	AAC	2	6	134758	134763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526519
3492	NC_015976	GCC	2	6	134769	134774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526519
3493	NC_015976	CGA	2	6	134822	134827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526519
3494	NC_015976	GAT	2	6	134886	134891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526519
3495	NC_015976	AGAT	2	8	134920	134927	50 %	25 %	25 %	0 %	347526519
3496	NC_015976	AGC	2	6	134968	134973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526519
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3499	NC_015976	CCG	2	6	135040	135045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526519
3500	NC_015976	CGA	3	9	135065	135073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526519

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