MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 106501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015976	CG	3	6	38641	38646	0 %	0 %	50 %	50 %	347526429
1002	NC_015976	GC	3	6	38713	38718	0 %	0 %	50 %	50 %	347526429
1003	NC_015976	CCG	2	6	38810	38815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526429
1004	NC_015976	CAT	2	6	38838	38843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526429
1005	NC_015976	AG	3	6	38862	38867	50 %	0 %	50 %	0 %	347526429
1006	NC_015976	GCG	2	6	38884	38889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1007	NC_015976	CAT	3	9	38946	38954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526429
1008	NC_015976	GGC	2	6	38961	38966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1009	NC_015976	CGG	2	6	38991	38996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1010	NC_015976	CGG	2	6	39006	39011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1011	NC_015976	CAT	2	6	39045	39050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526429
1012	NC_015976	TCGC	2	8	39076	39083	0 %	25 %	25 %	50 %	347526429
1013	NC_015976	GCT	2	6	39087	39092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1014	NC_015976	CGG	2	6	39093	39098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1015	NC_015976	GCC	2	6	39136	39141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526429
1016	NC_015976	GCT	2	6	39147	39152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1017	NC_015976	CTGG	2	8	39261	39268	0 %	25 %	50 %	25 %	347526429
1018	NC_015976	CGT	2	6	39291	39296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1019	NC_015976	CGC	2	6	39323	39328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526429
1020	NC_015976	GCT	2	6	39339	39344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1021	NC_015976	CAT	2	6	39348	39353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526429
1022	NC_015976	CGC	2	6	39360	39365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526429
1023	NC_015976	CTCG	2	8	39408	39415	0 %	25 %	25 %	50 %	347526429
1024	NC_015976	CG	3	6	39417	39422	0 %	0 %	50 %	50 %	347526429
1025	NC_015976	TAT	2	6	39454	39459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526429
1026	NC_015976	ATCGGC	2	12	39493	39504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1027	NC_015976	CG	3	6	39583	39588	0 %	0 %	50 %	50 %	347526429
1028	NC_015976	TGCCG	2	10	39642	39651	0 %	20 %	40 %	40 %	347526429
1029	NC_015976	CGG	2	6	39686	39691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1030	NC_015976	CGC	2	6	39720	39725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526429
1031	NC_015976	TCA	2	6	39755	39760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526429
1032	NC_015976	TCG	2	6	39842	39847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1033	NC_015976	CGG	2	6	39899	39904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1034	NC_015976	CTC	2	6	39928	39933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526429
1035	NC_015976	GCG	2	6	39945	39950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1036	NC_015976	CGC	2	6	40005	40010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526429
1037	NC_015976	GCT	2	6	40014	40019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1038	NC_015976	CTG	2	6	40033	40038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1039	NC_015976	CGC	2	6	40092	40097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526429
1040	NC_015976	GCT	2	6	40104	40109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526429
1041	NC_015976	GCG	2	6	40112	40117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526429
1042	NC_015976	G	7	7	40117	40123	0 %	0 %	100 %	0 %	347526429
1043	NC_015976	GATC	2	8	40231	40238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_015976	GCT	2	6	40349	40354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526430
1045	NC_015976	TTC	2	6	40357	40362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526430
1046	NC_015976	CG	3	6	40397	40402	0 %	0 %	50 %	50 %	347526430
1047	NC_015976	AGC	2	6	40403	40408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526430
1048	NC_015976	TGG	2	6	40442	40447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526430
1049	NC_015976	TG	3	6	40526	40531	0 %	50 %	50 %	0 %	347526430
1050	NC_015976	GGCT	2	8	40546	40553	0 %	25 %	50 %	25 %	347526430
1051	NC_015976	TGC	2	6	40631	40636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526430
1052	NC_015976	GGC	2	6	40638	40643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526430
1053	NC_015976	TGC	2	6	40649	40654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526430
1054	NC_015976	GGA	2	6	40683	40688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526430
1055	NC_015976	AGC	2	6	40694	40699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526430
1056	NC_015976	CGATC	2	10	40770	40779	20 %	20 %	20 %	40 %	347526430
1057	NC_015976	CG	3	6	40794	40799	0 %	0 %	50 %	50 %	347526430
1058	NC_015976	CGA	2	6	40875	40880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526430
1059	NC_015976	CGC	2	6	40944	40949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526430
1060	NC_015976	GGCC	3	12	40956	40967	0 %	0 %	50 %	50 %	347526430
1061	NC_015976	CCA	2	6	40997	41002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526430
1062	NC_015976	GC	3	6	41030	41035	0 %	0 %	50 %	50 %	347526430
1063	NC_015976	CTG	2	6	41083	41088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526430
1064	NC_015976	GC	3	6	41144	41149	0 %	0 %	50 %	50 %	347526430
1065	NC_015976	CGG	2	6	41192	41197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526430
1066	NC_015976	GCG	2	6	41210	41215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526430
1067	NC_015976	CG	3	6	41306	41311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_015976	GCG	2	6	41333	41338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015976	CGC	2	6	41491	41496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526431
1070	NC_015976	GCGCTG	2	12	41504	41515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347526431
1071	NC_015976	GGC	2	6	41516	41521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526431
1072	NC_015976	GC	3	6	41558	41563	0 %	0 %	50 %	50 %	347526431
1073	NC_015976	CAG	2	6	41567	41572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526431
1074	NC_015976	GCCG	2	8	41608	41615	0 %	0 %	50 %	50 %	347526431
1075	NC_015976	GACC	2	8	41677	41684	25 %	0 %	25 %	50 %	347526431
1076	NC_015976	CGC	2	6	41710	41715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526431
1077	NC_015976	ATG	2	6	41742	41747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526431
1078	NC_015976	CTT	2	6	41797	41802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526431
1079	NC_015976	TTC	2	6	41813	41818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526431
1080	NC_015976	TAT	2	6	41828	41833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526431
1081	NC_015976	ATG	2	6	41855	41860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526431
1082	NC_015976	CG	3	6	41951	41956	0 %	0 %	50 %	50 %	347526431
1083	NC_015976	GC	5	10	41987	41996	0 %	0 %	50 %	50 %	347526431
1084	NC_015976	CAA	2	6	42007	42012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526431
1085	NC_015976	GAG	2	6	42077	42082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526431
1086	NC_015976	GC	3	6	42155	42160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_015976	CTT	2	6	42245	42250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526432
1088	NC_015976	CAG	2	6	42296	42301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1089	NC_015976	GC	3	6	42356	42361	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1090	NC_015976	GCA	2	6	42364	42369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1091	NC_015976	ACG	2	6	42396	42401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1092	NC_015976	GC	3	6	42423	42428	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1093	NC_015976	AGC	2	6	42462	42467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1094	NC_015976	GC	3	6	42481	42486	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1095	NC_015976	GCCAGT	2	12	42492	42503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1096	NC_015976	GCCAGC	2	12	42504	42515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347526432
1097	NC_015976	CGC	2	6	42524	42529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1098	NC_015976	AGG	2	6	42573	42578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526432
1099	NC_015976	CAG	2	6	42698	42703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1100	NC_015976	CGC	2	6	42721	42726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1101	NC_015976	CCA	2	6	42742	42747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526432
1102	NC_015976	CGA	2	6	42805	42810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1103	NC_015976	CTGA	2	8	42824	42831	25 %	25 %	25 %	25 %	347526432
1104	NC_015976	CGC	2	6	42845	42850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1105	NC_015976	CTG	2	6	42938	42943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1106	NC_015976	ATA	2	6	42950	42955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526432
1107	NC_015976	GCC	2	6	43090	43095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1108	NC_015976	CG	3	6	43099	43104	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1109	NC_015976	GCA	2	6	43120	43125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1110	NC_015976	GTCC	2	8	43183	43190	0 %	25 %	25 %	50 %	347526432
1111	NC_015976	TAGAAA	2	12	43200	43211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347526432
1112	NC_015976	CGGA	2	8	43260	43267	25 %	0 %	50 %	25 %	347526432
1113	NC_015976	TGC	2	6	43268	43273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1114	NC_015976	GCA	2	6	43342	43347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1115	NC_015976	AGC	2	6	43404	43409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1116	NC_015976	CCG	2	6	43411	43416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526432
1117	NC_015976	CAG	2	6	43439	43444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1118	NC_015976	GCG	2	6	43536	43541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526432
1119	NC_015976	AAGCG	2	10	43564	43573	40 %	0 %	40 %	20 %	347526432
1120	NC_015976	GCCG	2	8	43597	43604	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1121	NC_015976	CG	3	6	43624	43629	0 %	0 %	50 %	50 %	347526432
1122	NC_015976	GCA	2	6	43639	43644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1123	NC_015976	GCCC	3	12	43662	43673	0 %	0 %	25 %	75 %	347526432
1124	NC_015976	GTC	2	6	43691	43696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526432
1125	NC_015976	CG	3	6	43768	43773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_015976	CG	3	6	43831	43836	0 %	0 %	50 %	50 %	347526433
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1254	NC_015976	CTGGAT	2	12	48130	48141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347526437
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1256	NC_015976	CG	3	6	48232	48237	0 %	0 %	50 %	50 %	347526437
1257	NC_015976	CGA	2	6	48317	48322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526437
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1262	NC_015976	CGC	2	6	48613	48618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526437
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1294	NC_015976	CGA	2	6	50113	50118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1375	NC_015976	GCA	2	6	53690	53695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526443
1376	NC_015976	AAC	2	6	53754	53759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526443
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1491	NC_015976	GTC	2	6	58543	58548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1492	NC_015976	CCAA	2	8	58556	58563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1493	NC_015976	TGCA	2	8	58575	58582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1494	NC_015976	TTG	2	6	58618	58623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1495	NC_015976	ATCC	2	8	58677	58684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1500	NC_015976	ATT	2	6	58865	58870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526447

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