MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sphingobium sp. SYK-6 chromosome

Total Repeats: 106501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015976	CAG	2	6	173457	173462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526556
4502	NC_015976	CGAG	2	8	173495	173502	25 %	0 %	50 %	25 %	347526556
4503	NC_015976	GCC	2	6	173523	173528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526556
4504	NC_015976	CAGC	2	8	173535	173542	25 %	0 %	25 %	50 %	347526556
4505	NC_015976	CAG	2	6	173556	173561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526556
4506	NC_015976	GGC	2	6	173627	173632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526556
4507	NC_015976	CAG	2	6	173703	173708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526556
4508	NC_015976	CCA	2	6	173717	173722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526556
4509	NC_015976	CGG	2	6	173726	173731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526556
4510	NC_015976	GC	3	6	173755	173760	0 %	0 %	50 %	50 %	347526556
4511	NC_015976	CGG	2	6	173773	173778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526556
4512	NC_015976	CGG	2	6	173810	173815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526556
4513	NC_015976	GCC	2	6	173835	173840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526556
4514	NC_015976	CAG	2	6	173886	173891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526556
4515	NC_015976	CACC	2	8	173922	173929	25 %	0 %	0 %	75 %	347526556
4516	NC_015976	GCC	2	6	174009	174014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526556
4517	NC_015976	GGT	2	6	174036	174041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526556
4518	NC_015976	CGC	2	6	174096	174101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526556
4519	NC_015976	GCG	2	6	174124	174129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526556
4520	NC_015976	GC	3	6	174135	174140	0 %	0 %	50 %	50 %	347526556
4521	NC_015976	GCGG	2	8	174160	174167	0 %	0 %	75 %	25 %	347526556
4522	NC_015976	CAA	2	6	174260	174265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526556
4523	NC_015976	AGC	2	6	174286	174291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526556
4524	NC_015976	AGCC	2	8	174306	174313	25 %	0 %	25 %	50 %	347526556
4525	NC_015976	GCA	2	6	174314	174319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526556
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4527	NC_015976	CGT	2	6	174335	174340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526556
4528	NC_015976	CAGG	2	8	174386	174393	25 %	0 %	50 %	25 %	347526556
4529	NC_015976	CGG	2	6	174407	174412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526556
4530	NC_015976	TGT	2	6	174416	174421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526556
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4532	NC_015976	CGC	2	6	174496	174501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526556
4533	NC_015976	AGC	2	6	174514	174519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526556
4534	NC_015976	CG	3	6	174528	174533	0 %	0 %	50 %	50 %	347526556
4535	NC_015976	CCGGG	2	10	174534	174543	0 %	0 %	60 %	40 %	347526556
4536	NC_015976	GCCG	2	8	174546	174553	0 %	0 %	50 %	50 %	347526556
4537	NC_015976	TGGG	2	8	174583	174590	0 %	25 %	75 %	0 %	347526556
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4539	NC_015976	AGC	2	6	174614	174619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_015976	CG	3	6	174667	174672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_015976	CGG	2	6	174709	174714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526557
4542	NC_015976	CG	3	6	174741	174746	0 %	0 %	50 %	50 %	347526557
4543	NC_015976	GC	3	6	174776	174781	0 %	0 %	50 %	50 %	347526557
4544	NC_015976	CGC	2	6	174825	174830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526557
4545	NC_015976	CCG	2	6	174831	174836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526557
4546	NC_015976	GGC	2	6	174855	174860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526557
4547	NC_015976	CCG	2	6	174957	174962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526557
4548	NC_015976	CGG	2	6	174984	174989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526557
4549	NC_015976	GAC	2	6	175030	175035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526557
4550	NC_015976	CGCGG	2	10	175057	175066	0 %	0 %	60 %	40 %	347526557
4551	NC_015976	TCC	2	6	175073	175078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526557
4552	NC_015976	ATG	2	6	175085	175090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526557
4553	NC_015976	ACGG	2	8	175151	175158	25 %	0 %	50 %	25 %	347526557
4554	NC_015976	GCC	2	6	175305	175310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526557
4555	NC_015976	G	7	7	175327	175333	0 %	0 %	100 %	0 %	347526557
4556	NC_015976	CAGC	2	8	175409	175416	25 %	0 %	25 %	50 %	347526557
4557	NC_015976	CG	4	8	175423	175430	0 %	0 %	50 %	50 %	347526557
4558	NC_015976	TCA	2	6	175503	175508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526557
4559	NC_015976	TCG	2	6	175511	175516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526557
4560	NC_015976	GCC	2	6	175577	175582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526557
4561	NC_015976	GCA	2	6	175602	175607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526557
4562	NC_015976	GC	3	6	175724	175729	0 %	0 %	50 %	50 %	347526557
4563	NC_015976	CGG	3	9	175731	175739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526557
4564	NC_015976	GC	3	6	175744	175749	0 %	0 %	50 %	50 %	347526557
4565	NC_015976	CG	3	6	175814	175819	0 %	0 %	50 %	50 %	347526557
4566	NC_015976	AGCT	2	8	175997	176004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_015976	GGC	2	6	176015	176020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_015976	TGC	2	6	176102	176107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4570	NC_015976	TGC	2	6	176138	176143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4571	NC_015976	GGA	2	6	176148	176153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526558
4572	NC_015976	GAT	2	6	176227	176232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526558
4573	NC_015976	GCTGC	2	10	176266	176275	0 %	20 %	40 %	40 %	347526558
4574	NC_015976	CGA	2	6	176286	176291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4575	NC_015976	TCA	2	6	176292	176297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526558
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4578	NC_015976	CCT	2	6	176367	176372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526558
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4580	NC_015976	GCC	2	6	176434	176439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526558
4581	NC_015976	GC	3	6	176451	176456	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4582	NC_015976	TCGCG	2	10	176463	176472	0 %	20 %	40 %	40 %	347526558
4583	NC_015976	GCA	2	6	176517	176522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4585	NC_015976	TCG	2	6	176663	176668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4586	NC_015976	AGCG	2	8	176717	176724	25 %	0 %	50 %	25 %	347526558
4587	NC_015976	GGCATC	2	12	176728	176739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4588	NC_015976	CAG	2	6	176743	176748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4589	NC_015976	GC	3	6	176754	176759	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4590	NC_015976	CGC	2	6	176777	176782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526558
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4593	NC_015976	TTC	2	6	176845	176850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526558
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4596	NC_015976	AGC	2	6	177038	177043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4598	NC_015976	CGG	2	6	177057	177062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
4599	NC_015976	CG	3	6	177101	177106	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4600	NC_015976	CG	3	6	177197	177202	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4601	NC_015976	GCC	2	6	177208	177213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347526558
4602	NC_015976	CGAT	2	8	177233	177240	25 %	25 %	25 %	25 %	347526558
4603	NC_015976	GGCGC	2	10	177268	177277	0 %	0 %	60 %	40 %	347526558
4604	NC_015976	GCG	2	6	177399	177404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
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4606	NC_015976	CTC	2	6	177430	177435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347526558
4607	NC_015976	GCG	3	9	177442	177450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
4608	NC_015976	GGAC	2	8	177488	177495	25 %	0 %	50 %	25 %	347526558
4609	NC_015976	ACG	2	6	177509	177514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4610	NC_015976	GCA	2	6	177546	177551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
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4612	NC_015976	TCA	2	6	177741	177746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526558
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4615	NC_015976	GA	3	6	177872	177877	50 %	0 %	50 %	0 %	347526558
4616	NC_015976	CG	3	6	177920	177925	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4617	NC_015976	CGA	2	6	177957	177962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4618	NC_015976	AATG	2	8	178083	178090	50 %	25 %	25 %	0 %	347526558
4619	NC_015976	GCA	2	6	178097	178102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526558
4620	NC_015976	GC	5	10	178109	178118	0 %	0 %	50 %	50 %	347526558
4621	NC_015976	TCGATG	2	12	178175	178186	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347526558
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4623	NC_015976	CGG	2	6	178206	178211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526558
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4727	NC_015976	TTA	2	6	181670	181675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4729	NC_015976	A	7	7	181796	181802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4732	NC_015976	C	6	6	182026	182031	0 %	0 %	0 %	100 %	347526561
4733	NC_015976	GCT	3	9	182040	182048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526561
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4738	NC_015976	CGG	2	6	182397	182402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4739	NC_015976	ATG	2	6	182481	182486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526562
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4741	NC_015976	GC	3	6	182548	182553	0 %	0 %	50 %	50 %	347526562
4742	NC_015976	GTG	2	6	182574	182579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526562
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4974	NC_015976	GACGC	2	10	191277	191286	20 %	0 %	40 %	40 %	347526571
4975	NC_015976	CG	3	6	191338	191343	0 %	0 %	50 %	50 %	347526571
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4993	NC_015976	GGA	2	6	191908	191913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526572
4994	NC_015976	GGC	2	6	191931	191936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526572
4995	NC_015976	GTC	2	6	191963	191968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526572
4996	NC_015976	GCCC	2	8	191974	191981	0 %	0 %	25 %	75 %	347526572
4997	NC_015976	TCG	2	6	192006	192011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526572
4998	NC_015976	TGG	2	6	192027	192032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526572
4999	NC_015976	CGG	2	6	192043	192048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526572
5000	NC_015976	CGG	2	6	192054	192059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526572

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