MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 297766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015957	ACTCC	2	10	106925	106934	20 %	20 %	0 %	60 %	345008052
3002	NC_015957	GCC	2	6	106972	106977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008052
3003	NC_015957	ACC	2	6	106990	106995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008052
3004	NC_015957	CGA	3	9	107022	107030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008052
3005	NC_015957	ACT	2	6	107039	107044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008052
3006	NC_015957	GAT	2	6	107070	107075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008052
3007	NC_015957	CCGC	2	8	107093	107100	0 %	0 %	25 %	75 %	345008052
3008	NC_015957	GCT	2	6	107115	107120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008052
3009	NC_015957	CCG	2	6	107168	107173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008052
3010	NC_015957	CGG	3	9	107217	107225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3011	NC_015957	GCG	2	6	107246	107251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3012	NC_015957	CCG	2	6	107276	107281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008052
3013	NC_015957	AGG	2	6	107282	107287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008052
3014	NC_015957	GCC	2	6	107308	107313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008052
3015	NC_015957	CGA	2	6	107327	107332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008052
3016	NC_015957	CGAGC	2	10	107355	107364	20 %	0 %	40 %	40 %	345008052
3017	NC_015957	CAA	2	6	107397	107402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345008052
3018	NC_015957	AGG	2	6	107417	107422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008052
3019	NC_015957	GCC	2	6	107428	107433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008052
3020	NC_015957	CGA	2	6	107436	107441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008052
3021	NC_015957	CAA	2	6	107460	107465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345008052
3022	NC_015957	AAC	2	6	107500	107505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345008052
3023	NC_015957	GGC	2	6	107528	107533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3024	NC_015957	GCG	2	6	107546	107551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3025	NC_015957	CGG	2	6	107577	107582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3026	NC_015957	ACA	2	6	107621	107626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345008052
3027	NC_015957	ACGG	2	8	107662	107669	25 %	0 %	50 %	25 %	345008052
3028	NC_015957	ACG	2	6	107687	107692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008052
3029	NC_015957	CGG	2	6	107711	107716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3030	NC_015957	GCC	2	6	107720	107725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008052
3031	NC_015957	GCG	2	6	107793	107798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3032	NC_015957	TGG	2	6	107804	107809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008052
3033	NC_015957	GCA	2	6	107814	107819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008052
3034	NC_015957	CCGT	2	8	107896	107903	0 %	25 %	25 %	50 %	345008052
3035	NC_015957	GGC	2	6	107915	107920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3036	NC_015957	CGG	2	6	107925	107930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008052
3037	NC_015957	GCC	2	6	108022	108027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008053
3038	NC_015957	G	6	6	108040	108045	0 %	0 %	100 %	0 %	345008053
3039	NC_015957	GTC	2	6	108086	108091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3040	NC_015957	GTC	2	6	108146	108151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3041	NC_015957	GC	3	6	108198	108203	0 %	0 %	50 %	50 %	345008053
3042	NC_015957	CGG	2	6	108220	108225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008053
3043	NC_015957	CGC	2	6	108270	108275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008053
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3045	NC_015957	GGCG	2	8	108313	108320	0 %	0 %	75 %	25 %	345008053
3046	NC_015957	CAG	2	6	108323	108328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3047	NC_015957	CGG	2	6	108331	108336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008053
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3049	NC_015957	CGGCG	2	10	108370	108379	0 %	0 %	60 %	40 %	345008053
3050	NC_015957	GGT	2	6	108416	108421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008053
3051	NC_015957	CAG	2	6	108425	108430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3052	NC_015957	AGC	2	6	108453	108458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3053	NC_015957	GCA	2	6	108461	108466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008053
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3055	NC_015957	CTC	2	6	108503	108508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008053
3056	NC_015957	GGT	2	6	108547	108552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008053
3057	NC_015957	ACGC	2	8	108591	108598	25 %	0 %	25 %	50 %	345008053
3058	NC_015957	AGG	2	6	108615	108620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008053
3059	NC_015957	GTC	2	6	108629	108634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3060	NC_015957	CGC	2	6	108655	108660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008053
3061	NC_015957	CGGCG	2	10	108676	108685	0 %	0 %	60 %	40 %	345008053
3062	NC_015957	AGT	2	6	108700	108705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008053
3063	NC_015957	TTC	2	6	108714	108719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008053
3064	NC_015957	GCC	2	6	108734	108739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008053
3065	NC_015957	TCCG	2	8	108743	108750	0 %	25 %	25 %	50 %	345008053
3066	NC_015957	CAT	2	6	108761	108766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008053
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3068	NC_015957	ATG	2	6	108792	108797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008053
3069	NC_015957	GTA	2	6	108815	108820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008053
3070	NC_015957	CGA	2	6	108823	108828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3071	NC_015957	CGT	2	6	108847	108852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008053
3072	NC_015957	GGC	2	6	108874	108879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008053
3073	NC_015957	CGA	2	6	109050	109055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_015957	GCG	2	6	109242	109247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008054
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3080	NC_015957	GGCG	2	8	109426	109433	0 %	0 %	75 %	25 %	345008054
3081	NC_015957	GAG	2	6	109451	109456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008054
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3083	NC_015957	GC	3	6	109522	109527	0 %	0 %	50 %	50 %	345008054
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3089	NC_015957	GCGCT	2	10	109685	109694	0 %	20 %	40 %	40 %	345008054
3090	NC_015957	TGG	2	6	109704	109709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008054
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3099	NC_015957	TGC	2	6	109959	109964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008054
3100	NC_015957	GC	3	6	109990	109995	0 %	0 %	50 %	50 %	345008054
3101	NC_015957	CG	3	6	110053	110058	0 %	0 %	50 %	50 %	345008054
3102	NC_015957	AGC	2	6	110070	110075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008054
3103	NC_015957	CGG	2	6	110085	110090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008054
3104	NC_015957	CGAG	2	8	110133	110140	25 %	0 %	50 %	25 %	345008054
3105	NC_015957	GCC	2	6	110193	110198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_015957	CCA	2	6	110230	110235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008055
3107	NC_015957	GGT	2	6	110245	110250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008055
3108	NC_015957	GGC	2	6	110426	110431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008055
3109	NC_015957	GGGT	2	8	110467	110474	0 %	25 %	75 %	0 %	345008055
3110	NC_015957	CGCCC	2	10	110479	110488	0 %	0 %	20 %	80 %	345008055
3111	NC_015957	GGC	2	6	110489	110494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008055
3112	NC_015957	GCC	2	6	110506	110511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008055
3113	NC_015957	CGG	2	6	110549	110554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008055
3114	NC_015957	GCAGCC	2	12	110572	110583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345008055
3115	NC_015957	GAC	2	6	110600	110605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008055
3116	NC_015957	TCC	2	6	110640	110645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008055
3117	NC_015957	GGC	2	6	110659	110664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008055
3118	NC_015957	CGG	2	6	110683	110688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008055
3119	NC_015957	CGG	2	6	110734	110739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008055
3120	NC_015957	CAG	2	6	110819	110824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008055
3121	NC_015957	CTGGC	2	10	110832	110841	0 %	20 %	40 %	40 %	345008055
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3224	NC_015957	CCG	2	6	114308	114313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3231	NC_015957	CCCATC	2	12	114583	114594	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345008058
3232	NC_015957	GGTC	2	8	114643	114650	0 %	25 %	50 %	25 %	345008058
3233	NC_015957	TCA	2	6	114679	114684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008058
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3236	NC_015957	GT	3	6	114933	114938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_015957	GTC	2	6	114958	114963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_015957	ATGT	2	8	115039	115046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_015957	TCC	2	6	115194	115199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008059
3240	NC_015957	TGC	2	6	115212	115217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008059
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3242	NC_015957	ACG	2	6	115263	115268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008059
3243	NC_015957	CGA	2	6	115273	115278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008059
3244	NC_015957	GCC	2	6	115388	115393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008059
3245	NC_015957	GAA	2	6	115396	115401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008059
3246	NC_015957	TCG	2	6	115416	115421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008059
3247	NC_015957	CACC	2	8	115450	115457	25 %	0 %	0 %	75 %	345008059
3248	NC_015957	ATCGG	2	10	115467	115476	20 %	20 %	40 %	20 %	345008059
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3255	NC_015957	CGG	2	6	115708	115713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008059
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3259	NC_015957	TCG	2	6	115833	115838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008059
3260	NC_015957	GCG	2	6	115839	115844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008059
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3264	NC_015957	GCT	2	6	115882	115887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008059
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3282	NC_015957	CCGGC	2	10	116329	116338	0 %	0 %	40 %	60 %	345008059
3283	NC_015957	TCGT	2	8	116375	116382	0 %	50 %	25 %	25 %	345008059
3284	NC_015957	G	6	6	116415	116420	0 %	0 %	100 %	0 %	345008059
3285	NC_015957	GTC	2	6	116426	116431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008059
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3293	NC_015957	AC	3	6	116680	116685	50 %	0 %	0 %	50 %	345008059
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3296	NC_015957	GCCG	2	8	116767	116774	0 %	0 %	50 %	50 %	345008059
3297	NC_015957	TGG	3	9	116835	116843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008059
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3303	NC_015957	CGA	2	6	116956	116961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008059
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3322	NC_015957	CGCCA	2	10	117581	117590	20 %	0 %	20 %	60 %	345008059
3323	NC_015957	CAG	2	6	117652	117657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008059
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3326	NC_015957	CGG	2	6	117805	117810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3327	NC_015957	GCGA	2	8	117855	117862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3328	NC_015957	GTGAC	2	10	117955	117964	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3329	NC_015957	CA	3	6	118053	118058	50 %	0 %	0 %	50 %	345008060
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3332	NC_015957	ACC	2	6	118157	118162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008060
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3335	NC_015957	TCT	2	6	118197	118202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345008060
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3348	NC_015957	ACG	2	6	118587	118592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008060
3349	NC_015957	CTG	2	6	118610	118615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008060
3350	NC_015957	ACCAC	2	10	118623	118632	40 %	0 %	0 %	60 %	345008060
3351	NC_015957	GC	3	6	118679	118684	0 %	0 %	50 %	50 %	345008060
3352	NC_015957	TGC	2	6	118725	118730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008060
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3357	NC_015957	GAG	2	6	118898	118903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008060
3358	NC_015957	ACGC	2	8	118904	118911	25 %	0 %	25 %	50 %	345008060
3359	NC_015957	CGT	2	6	118915	118920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008060
3360	NC_015957	CGG	2	6	118936	118941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008060
3361	NC_015957	GCC	2	6	118958	118963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008060
3362	NC_015957	TCC	2	6	118988	118993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008060
3363	NC_015957	TGA	2	6	119007	119012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008060
3364	NC_015957	GTC	2	6	119042	119047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008060
3365	NC_015957	CG	3	6	119095	119100	0 %	0 %	50 %	50 %	345008060
3366	NC_015957	GGC	2	6	119102	119107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008060
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3481	NC_015957	GCC	2	6	122941	122946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008066
3482	NC_015957	GTC	2	6	122985	122990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008066
3483	NC_015957	GCA	2	6	123131	123136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008066
3484	NC_015957	GCG	2	6	123163	123168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008066
3485	NC_015957	CCG	2	6	123257	123262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008067
3486	NC_015957	CTG	2	6	123284	123289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008067
3487	NC_015957	CGC	2	6	123291	123296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008067
3488	NC_015957	GAG	2	6	123305	123310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008067
3489	NC_015957	CG	3	6	123355	123360	0 %	0 %	50 %	50 %	345008067
3490	NC_015957	CGGT	2	8	123385	123392	0 %	25 %	50 %	25 %	345008067
3491	NC_015957	GTC	2	6	123485	123490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3492	NC_015957	TGG	2	6	123505	123510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3493	NC_015957	GTCA	2	8	123552	123559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3494	NC_015957	GCGCC	2	10	123682	123691	0 %	0 %	40 %	60 %	345008068
3495	NC_015957	GCG	2	6	123735	123740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008068
3496	NC_015957	GAG	3	9	123830	123838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008068
3497	NC_015957	AAGG	2	8	123862	123869	50 %	0 %	50 %	0 %	345008068
3498	NC_015957	GGTC	2	8	123877	123884	0 %	25 %	50 %	25 %	345008068
3499	NC_015957	GCG	2	6	124039	124044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008068
3500	NC_015957	AGA	2	6	124179	124184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008068

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