MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 chromosome

Total Repeats: 297766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015957	CCGG	2	8	214586	214593	0 %	0 %	50 %	50 %	345008162
6002	NC_015957	AGA	2	6	214608	214613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008162
6003	NC_015957	TGCC	2	8	214631	214638	0 %	25 %	25 %	50 %	345008162
6004	NC_015957	GCGCC	2	10	214685	214694	0 %	0 %	40 %	60 %	345008162
6005	NC_015957	TCG	2	6	214700	214705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008162
6006	NC_015957	CGT	2	6	214707	214712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008162
6007	NC_015957	AGG	2	6	214722	214727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008162
6008	NC_015957	TGG	2	6	214772	214777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008162
6009	NC_015957	GGA	2	6	214791	214796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008162
6010	NC_015957	GAA	2	6	214849	214854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008162
6011	NC_015957	ACG	2	6	214889	214894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008162
6012	NC_015957	CCGC	2	8	214941	214948	0 %	0 %	25 %	75 %	345008162
6013	NC_015957	GCTCG	2	10	214996	215005	0 %	20 %	40 %	40 %	345008162
6014	NC_015957	CTCGAC	2	12	215086	215097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345008162
6015	NC_015957	GTC	2	6	215134	215139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008162
6016	NC_015957	GTC	2	6	215143	215148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008162
6017	NC_015957	GC	3	6	215179	215184	0 %	0 %	50 %	50 %	345008162
6018	NC_015957	GCCT	2	8	215186	215193	0 %	25 %	25 %	50 %	345008162
6019	NC_015957	GCT	2	6	215202	215207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008162
6020	NC_015957	CGC	2	6	215208	215213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008162
6021	NC_015957	GTA	2	6	215281	215286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008162
6022	NC_015957	TCCT	2	8	215358	215365	0 %	50 %	0 %	50 %	345008163
6023	NC_015957	GCT	2	6	215376	215381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6024	NC_015957	GGC	2	6	215423	215428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008163
6025	NC_015957	GGC	2	6	215450	215455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008163
6026	NC_015957	GAG	2	6	215487	215492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008163
6027	NC_015957	GGC	2	6	215574	215579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008163
6028	NC_015957	ACC	2	6	215581	215586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008163
6029	NC_015957	CGG	2	6	215601	215606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008163
6030	NC_015957	GCA	2	6	215609	215614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6031	NC_015957	TCG	2	6	215635	215640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6032	NC_015957	CGT	2	6	215694	215699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6033	NC_015957	GTC	2	6	215733	215738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6034	NC_015957	CTC	2	6	215808	215813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345008163
6035	NC_015957	CGG	2	6	215837	215842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008163
6036	NC_015957	GCCC	2	8	216026	216033	0 %	0 %	25 %	75 %	345008163
6037	NC_015957	AAG	2	6	216067	216072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008163
6038	NC_015957	CAG	2	6	216099	216104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6039	NC_015957	GTCG	2	8	216123	216130	0 %	25 %	50 %	25 %	345008163
6040	NC_015957	CG	3	6	216175	216180	0 %	0 %	50 %	50 %	345008163
6041	NC_015957	CCGA	2	8	216205	216212	25 %	0 %	25 %	50 %	345008163
6042	NC_015957	CAC	2	6	216238	216243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008163
6043	NC_015957	CGT	2	6	216248	216253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6044	NC_015957	CGA	2	6	216266	216271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6045	NC_015957	CGTC	2	8	216281	216288	0 %	25 %	25 %	50 %	345008163
6046	NC_015957	ACC	2	6	216292	216297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008163
6047	NC_015957	AGT	2	6	216299	216304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008163
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6050	NC_015957	CGC	2	6	216500	216505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008163
6051	NC_015957	GCT	2	6	216509	216514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6052	NC_015957	GTGC	2	8	216562	216569	0 %	25 %	50 %	25 %	345008163
6053	NC_015957	CGA	2	6	216593	216598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6054	NC_015957	CAC	2	6	216606	216611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008163
6055	NC_015957	CTG	2	6	216612	216617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6056	NC_015957	GA	3	6	216694	216699	50 %	0 %	50 %	0 %	345008163
6057	NC_015957	TCG	2	6	216700	216705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6058	NC_015957	ACACG	2	10	216710	216719	40 %	0 %	20 %	40 %	345008163
6059	NC_015957	CAC	2	6	216724	216729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008163
6060	NC_015957	CG	3	6	216747	216752	0 %	0 %	50 %	50 %	345008163
6061	NC_015957	C	6	6	216770	216775	0 %	0 %	0 %	100 %	345008163
6062	NC_015957	GCG	2	6	216777	216782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008163
6063	NC_015957	CG	3	6	216816	216821	0 %	0 %	50 %	50 %	345008163
6064	NC_015957	CGCGG	2	10	216842	216851	0 %	0 %	60 %	40 %	345008163
6065	NC_015957	GGC	3	9	216894	216902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008163
6066	NC_015957	CAGCC	2	10	216903	216912	20 %	0 %	20 %	60 %	345008163
6067	NC_015957	CGT	2	6	216947	216952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008163
6068	NC_015957	ACT	2	6	216969	216974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_015957	CAC	2	6	217168	217173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345008164
6070	NC_015957	TGGGTG	2	12	217197	217208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008164
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6072	NC_015957	CGT	2	6	217266	217271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008164
6073	NC_015957	GC	3	6	217294	217299	0 %	0 %	50 %	50 %	345008164
6074	NC_015957	GGA	2	6	217318	217323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008164
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6081	NC_015957	GC	3	6	217677	217682	0 %	0 %	50 %	50 %	345008164
6082	NC_015957	TGA	2	6	217699	217704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345008164
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6085	NC_015957	CCGC	2	8	217885	217892	0 %	0 %	25 %	75 %	345008165
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6088	NC_015957	CTG	2	6	217989	217994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008165
6089	NC_015957	CCTTGG	2	12	218052	218063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008165
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6091	NC_015957	GTC	2	6	218165	218170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008165
6092	NC_015957	GCA	2	6	218205	218210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008165
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6094	NC_015957	GCA	2	6	218352	218357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008165
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6096	NC_015957	TGG	2	6	218460	218465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008165
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6100	NC_015957	GACA	2	8	218621	218628	50 %	0 %	25 %	25 %	345008165
6101	NC_015957	CCA	2	6	218649	218654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_015957	CGC	2	6	218726	218731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_015957	CCA	2	6	218737	218742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_015957	CG	3	6	218814	218819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_015957	CGA	2	6	218831	218836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_015957	CCA	2	6	218848	218853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_015957	TGC	2	6	218878	218883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_015957	GCT	2	6	218960	218965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_015957	CCG	2	6	219058	219063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_015957	GCG	2	6	219085	219090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_015957	GCG	2	6	219123	219128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_015957	GCCG	2	8	219137	219144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_015957	CGC	2	6	219201	219206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_015957	CGA	2	6	219221	219226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_015957	CTA	2	6	219233	219238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_015957	GAG	2	6	219309	219314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015957	GAA	2	6	219329	219334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015957	CCG	2	6	219362	219367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_015957	CCA	2	6	219434	219439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_015957	GTC	2	6	219525	219530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_015957	CGA	2	6	219596	219601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_015957	CGC	2	6	219617	219622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_015957	GGC	2	6	219657	219662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_015957	GCC	2	6	219708	219713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_015957	CTG	2	6	219745	219750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6165	NC_015957	GCC	2	6	221216	221221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6238	NC_015957	CTCGC	2	10	224670	224679	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6239	NC_015957	GGA	2	6	224707	224712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6245	NC_015957	TCG	2	6	224974	224979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008173
6246	NC_015957	TCG	2	6	225103	225108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008173
6247	NC_015957	CCCA	2	8	225178	225185	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6248	NC_015957	CTG	2	6	225220	225225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6249	NC_015957	GCTCAT	2	12	225235	225246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_015957	ACCG	2	8	225313	225320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6251	NC_015957	AAG	2	6	225330	225335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_015957	GCT	2	6	225363	225368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008174
6253	NC_015957	ACCG	2	8	225442	225449	25 %	0 %	25 %	50 %	345008174
6254	NC_015957	GGT	2	6	225547	225552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008174
6255	NC_015957	GCG	3	9	225649	225657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008174
6256	NC_015957	GACCG	2	10	225683	225692	20 %	0 %	40 %	40 %	345008175
6257	NC_015957	GAC	2	6	225729	225734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008175
6258	NC_015957	CTG	2	6	225819	225824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008175
6259	NC_015957	GGCCCT	2	12	225922	225933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345008176
6260	NC_015957	TGG	2	6	225953	225958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008176
6261	NC_015957	TGAC	2	8	226065	226072	25 %	25 %	25 %	25 %	345008176
6262	NC_015957	GCC	2	6	226151	226156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008176
6263	NC_015957	TGCC	2	8	226187	226194	0 %	25 %	25 %	50 %	345008176
6264	NC_015957	GCGG	2	8	226219	226226	0 %	0 %	75 %	25 %	345008176
6265	NC_015957	GGA	2	6	226363	226368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008176
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6268	NC_015957	TCG	2	6	226605	226610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008176
6269	NC_015957	GCG	2	6	226660	226665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008176
6270	NC_015957	CTG	2	6	226691	226696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008176
6271	NC_015957	GAA	2	6	226702	226707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008176
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6273	NC_015957	CA	3	6	226767	226772	50 %	0 %	0 %	50 %	345008176
6274	NC_015957	GAA	2	6	226810	226815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008176
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6276	NC_015957	GCTG	2	8	226825	226832	0 %	25 %	50 %	25 %	345008176
6277	NC_015957	TGG	2	6	226848	226853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008176
6278	NC_015957	GAA	2	6	226864	226869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345008176
6279	NC_015957	ATC	2	6	226895	226900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008176
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6281	NC_015957	GGA	2	6	227011	227016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345008176
6282	NC_015957	GCT	2	6	227197	227202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008176
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6286	NC_015957	ACCGTG	2	12	227343	227354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345008177
6287	NC_015957	CAT	2	6	227363	227368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345008177
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6291	NC_015957	CGT	2	6	227477	227482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008177
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6304	NC_015957	CCG	2	6	227974	227979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008177
6305	NC_015957	GCCG	2	8	228003	228010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6306	NC_015957	CCCCG	2	10	228028	228037	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6307	NC_015957	AGC	2	6	228064	228069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6332	NC_015957	CCG	2	6	228877	228882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008178
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6347	NC_015957	GATC	2	8	229794	229801	25 %	25 %	25 %	25 %	345008179
6348	NC_015957	GATG	2	8	229839	229846	25 %	25 %	50 %	0 %	345008179
6349	NC_015957	CAG	2	6	229851	229856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008179
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6352	NC_015957	TCAG	2	8	229916	229923	25 %	25 %	25 %	25 %	345008179
6353	NC_015957	GCTC	2	8	229976	229983	0 %	25 %	25 %	50 %	345008179
6354	NC_015957	GCA	2	6	230019	230024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008179
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6357	NC_015957	TGG	3	9	230148	230156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008179
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6361	NC_015957	CGT	2	6	230481	230486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008179
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6364	NC_015957	CTTC	2	8	230655	230662	0 %	50 %	0 %	50 %	345008179
6365	NC_015957	CGC	2	6	230683	230688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008179
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6369	NC_015957	CGTGT	2	10	230800	230809	0 %	40 %	40 %	20 %	345008179
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6385	NC_015957	GTG	2	6	231369	231374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6483	NC_015957	GCG	2	6	234838	234843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6487	NC_015957	CGG	3	9	235000	235008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345008182
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6490	NC_015957	TGC	3	9	235131	235139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008182
6491	NC_015957	GTC	2	6	235142	235147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008182
6492	NC_015957	GCC	2	6	235148	235153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345008182
6493	NC_015957	GTG	2	6	235154	235159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345008182
6494	NC_015957	AGCG	2	8	235187	235194	25 %	0 %	50 %	25 %	345008182
6495	NC_015957	GC	3	6	235239	235244	0 %	0 %	50 %	50 %	345008182
6496	NC_015957	TGC	2	6	235287	235292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008182
6497	NC_015957	TCG	3	9	235335	235343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345008182
6498	NC_015957	CACC	2	8	235369	235376	25 %	0 %	0 %	75 %	345008182
6499	NC_015957	CCCG	2	8	235382	235389	0 %	0 %	25 %	75 %	345008182
6500	NC_015957	GCA	2	6	235410	235415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345008182

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