MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces sp. SirexAA-E chromosome

Total Repeats: 212652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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159002	NC_015953	CT	3	6	5558417	5558422	0 %	50 %	0 %	50 %	345002506
159003	NC_015953	GCCCT	2	10	5558486	5558495	0 %	20 %	20 %	60 %	345002506
159004	NC_015953	CG	3	6	5558520	5558525	0 %	0 %	50 %	50 %	345002506
159005	NC_015953	GGTGCT	2	12	5558533	5558544	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345002506
159006	NC_015953	AC	3	6	5558612	5558617	50 %	0 %	0 %	50 %	345002506
159007	NC_015953	CAA	2	6	5558620	5558625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345002506
159008	NC_015953	GGACA	2	10	5558650	5558659	40 %	0 %	40 %	20 %	345002506
159009	NC_015953	CTTC	2	8	5558709	5558716	0 %	50 %	0 %	50 %	345002506
159010	NC_015953	CCG	2	6	5558734	5558739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159011	NC_015953	GTT	2	6	5558812	5558817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159015	NC_015953	GC	3	6	5558899	5558904	0 %	0 %	50 %	50 %	345002507
159016	NC_015953	CGG	2	6	5558917	5558922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002507
159017	NC_015953	GAG	2	6	5558952	5558957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002507
159018	NC_015953	GCAGC	2	10	5558993	5559002	20 %	0 %	40 %	40 %	345002507
159019	NC_015953	CGG	2	6	5559049	5559054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002507
159020	NC_015953	GCC	2	6	5559057	5559062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002507
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159022	NC_015953	CGT	2	6	5559086	5559091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002507
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159024	NC_015953	TGA	2	6	5559139	5559144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345002507
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159026	NC_015953	CTG	2	6	5559189	5559194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002507
159027	NC_015953	GCAC	2	8	5559212	5559219	25 %	0 %	25 %	50 %	345002507
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159032	NC_015953	CAC	2	6	5559358	5559363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002508
159033	NC_015953	GAG	2	6	5559395	5559400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002508
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159053	NC_015953	GCT	2	6	5559991	5559996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002508
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159086	NC_015953	CGGGC	3	15	5560969	5560983	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159087	NC_015953	CGGG	2	8	5560989	5560996	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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159116	NC_015953	CAC	2	6	5561959	5561964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002509
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159118	NC_015953	CGG	2	6	5562025	5562030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002509
159119	NC_015953	CGA	2	6	5562046	5562051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002509
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159122	NC_015953	CCG	2	6	5562103	5562108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002509
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159124	NC_015953	GTT	2	6	5562162	5562167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345002510
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159206	NC_015953	CTGTG	2	10	5565067	5565076	0 %	40 %	40 %	20 %	345002512
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159211	NC_015953	G	6	6	5565229	5565234	0 %	0 %	100 %	0 %	345002512
159212	NC_015953	GGT	2	6	5565243	5565248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002512
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159215	NC_015953	GGC	2	6	5565402	5565407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002512
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159217	NC_015953	TGC	2	6	5565461	5565466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002512
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159220	NC_015953	CTG	2	6	5565511	5565516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002512
159221	NC_015953	AGG	2	6	5565530	5565535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002512
159222	NC_015953	CGC	2	6	5565613	5565618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002512
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159225	NC_015953	CGA	2	6	5565924	5565929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002512
159226	NC_015953	GCA	2	6	5565938	5565943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002512
159227	NC_015953	CAGCGG	2	12	5566020	5566031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345002513
159228	NC_015953	ACC	2	6	5566039	5566044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345002513
159229	NC_015953	CCG	2	6	5566147	5566152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002513
159230	NC_015953	GCCCT	2	10	5566216	5566225	0 %	20 %	20 %	60 %	345002513
159231	NC_015953	GTC	2	6	5566272	5566277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159232	NC_015953	CGTGC	2	10	5566281	5566290	0 %	20 %	40 %	40 %	345002513
159233	NC_015953	CCG	2	6	5566319	5566324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002513
159234	NC_015953	CGG	2	6	5566352	5566357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002513
159235	NC_015953	GCC	2	6	5566386	5566391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002513
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159237	NC_015953	GCG	2	6	5566420	5566425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002513
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159241	NC_015953	CAG	2	6	5566482	5566487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159242	NC_015953	CGA	2	6	5566499	5566504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
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159244	NC_015953	TTG	2	6	5566546	5566551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345002513
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159247	NC_015953	CTC	3	9	5566617	5566625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002513
159248	NC_015953	CTC	2	6	5566647	5566652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345002513
159249	NC_015953	GATC	2	8	5566736	5566743	25 %	25 %	25 %	25 %	345002513
159250	NC_015953	GCC	2	6	5566760	5566765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002513
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159252	NC_015953	CGT	2	6	5566826	5566831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
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159258	NC_015953	CCG	2	6	5566967	5566972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002513
159259	NC_015953	CAG	2	6	5566977	5566982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159260	NC_015953	CGGT	2	8	5566993	5567000	0 %	25 %	50 %	25 %	345002513
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159262	NC_015953	CCG	2	6	5567018	5567023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002513
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159264	NC_015953	GCG	2	6	5567083	5567088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002513
159265	NC_015953	TCG	2	6	5567092	5567097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159266	NC_015953	CGCT	2	8	5567110	5567117	0 %	25 %	25 %	50 %	345002513
159267	NC_015953	TGTCGC	2	12	5567237	5567248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
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159277	NC_015953	CTT	2	6	5567589	5567594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345002513
159278	NC_015953	CGA	2	6	5567600	5567605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159279	NC_015953	ACG	2	6	5567662	5567667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159280	NC_015953	GCG	2	6	5567676	5567681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002513
159281	NC_015953	CT	3	6	5567692	5567697	0 %	50 %	0 %	50 %	345002513
159282	NC_015953	ACGCGT	2	12	5567738	5567749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345002513
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159288	NC_015953	CGT	2	6	5567990	5567995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159289	NC_015953	TCG	2	6	5568022	5568027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159290	NC_015953	TCA	2	6	5568038	5568043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002513
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159293	NC_015953	GTC	2	6	5568096	5568101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
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159295	NC_015953	CGA	2	6	5568134	5568139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159296	NC_015953	CGT	2	6	5568182	5568187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159297	NC_015953	CGA	2	6	5568233	5568238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159298	NC_015953	AGGA	2	8	5568379	5568386	50 %	0 %	50 %	0 %	345002513
159299	NC_015953	TCG	2	6	5568397	5568402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159300	NC_015953	ACG	2	6	5568403	5568408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159301	NC_015953	TCT	2	6	5568422	5568427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345002513
159302	NC_015953	GTC	2	6	5568435	5568440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002513
159303	NC_015953	CGG	3	9	5568441	5568449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002513
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159305	NC_015953	GCCC	2	8	5568537	5568544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
159306	NC_015953	ACA	2	6	5568623	5568628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159308	NC_015953	GCTT	2	8	5568663	5568670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
159309	NC_015953	CGG	2	6	5568757	5568762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002514
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159311	NC_015953	GGA	2	6	5568814	5568819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002514
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159313	NC_015953	ACG	2	6	5568855	5568860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002514
159314	NC_015953	CGG	2	6	5568979	5568984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345002514
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159316	NC_015953	ACT	2	6	5569020	5569025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002514
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159318	NC_015953	GCT	2	6	5569090	5569095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002514
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159326	NC_015953	CG	3	6	5569292	5569297	0 %	0 %	50 %	50 %	345002514
159327	NC_015953	TTC	2	6	5569298	5569303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345002514
159328	NC_015953	CGTA	2	8	5569304	5569311	25 %	25 %	25 %	25 %	345002514
159329	NC_015953	CAA	2	6	5569321	5569326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345002514
159330	NC_015953	GTC	2	6	5569340	5569345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345002514
159331	NC_015953	ACG	2	6	5569410	5569415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002514
159332	NC_015953	AGC	2	6	5569419	5569424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002514
159333	NC_015953	CGC	2	6	5569425	5569430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002514
159334	NC_015953	CAT	2	6	5569450	5569455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345002514
159335	NC_015953	AGC	2	6	5569461	5569466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345002514
159336	NC_015953	GGT	2	6	5569474	5569479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345002514
159337	NC_015953	GAG	2	6	5569484	5569489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345002514
159338	NC_015953	CG	3	6	5569499	5569504	0 %	0 %	50 %	50 %	345002514
159339	NC_015953	GCC	2	6	5569511	5569516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345002514
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