MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 5077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015952	GAACCT	2	12	74	85	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015952	CCCG	2	8	136	143	0 %	0 %	25 %	75 %	345007716
3	NC_015952	GCC	2	6	157	162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007716
4	NC_015952	CATC	2	8	188	195	25 %	25 %	0 %	50 %	345007716
5	NC_015952	CCT	2	6	206	211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007716
6	NC_015952	CCG	2	6	236	241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007716
7	NC_015952	AGC	2	6	271	276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007716
8	NC_015952	GCC	3	9	292	300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007716
9	NC_015952	CGG	2	6	321	326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007716
10	NC_015952	CCGG	2	8	348	355	0 %	0 %	50 %	50 %	345007716
11	NC_015952	ACC	2	6	382	387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007716
12	NC_015952	CGC	2	6	456	461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007716
13	NC_015952	CCT	2	6	494	499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007716
14	NC_015952	ACC	2	6	514	519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007716
15	NC_015952	TCGC	2	8	538	545	0 %	25 %	25 %	50 %	345007716
16	NC_015952	C	6	6	670	675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_015952	ACC	2	6	676	681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015952	CCGT	2	8	788	795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015952	AAG	2	6	996	1001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007717
20	NC_015952	CGA	3	9	1004	1012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007717
21	NC_015952	CGG	2	6	1025	1030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007717
22	NC_015952	CGCGC	2	10	1046	1055	0 %	0 %	40 %	60 %	345007717
23	NC_015952	CTT	2	6	1094	1099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007717
24	NC_015952	CGC	2	6	1121	1126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007717
25	NC_015952	CGG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007717
26	NC_015952	ATC	2	6	1215	1220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007717
27	NC_015952	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007717
28	NC_015952	ATG	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007717
29	NC_015952	TCG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007717
30	NC_015952	CCG	2	6	1355	1360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007717
31	NC_015952	TGC	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007717
32	NC_015952	GCC	2	6	1401	1406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007717
33	NC_015952	GGC	2	6	1412	1417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007717
34	NC_015952	TGC	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007717
35	NC_015952	CGG	2	6	1502	1507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007717
36	NC_015952	CCACA	2	10	1556	1565	40 %	0 %	0 %	60 %	345007717
37	NC_015952	GC	3	6	1566	1571	0 %	0 %	50 %	50 %	345007717
38	NC_015952	GGA	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007717
39	NC_015952	ACC	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007717
40	NC_015952	TCG	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007718
41	NC_015952	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007718
42	NC_015952	AAG	3	9	1778	1786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007718
43	NC_015952	GTG	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007718
44	NC_015952	CGC	2	6	1807	1812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007718
45	NC_015952	TG	3	6	1813	1818	0 %	50 %	50 %	0 %	345007718
46	NC_015952	CCGG	2	8	1858	1865	0 %	0 %	50 %	50 %	345007718
47	NC_015952	GGC	2	6	1867	1872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007718
48	NC_015952	GC	3	6	1878	1883	0 %	0 %	50 %	50 %	345007718
49	NC_015952	GAG	2	6	1904	1909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007718
50	NC_015952	CGA	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015952	CTC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007719
52	NC_015952	G	6	6	2117	2122	0 %	0 %	100 %	0 %	345007719
53	NC_015952	ACC	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007719
54	NC_015952	TGGA	2	8	2305	2312	25 %	25 %	50 %	0 %	345007719
55	NC_015952	TCG	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007719
56	NC_015952	TTC	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007719
57	NC_015952	AAG	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007719
58	NC_015952	G	6	6	2517	2522	0 %	0 %	100 %	0 %	345007719
59	NC_015952	CCG	2	6	2543	2548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007719
60	NC_015952	GGA	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007719
61	NC_015952	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007719
62	NC_015952	TGA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007719
63	NC_015952	TGG	2	6	2657	2662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007719
64	NC_015952	CGC	2	6	2673	2678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007719
65	NC_015952	TGA	2	6	2688	2693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007719
66	NC_015952	TGA	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007719
67	NC_015952	AGC	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007719
68	NC_015952	GA	3	6	2814	2819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015952	GGT	2	6	2830	2835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015952	CGG	2	6	2851	2856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015952	GCTG	2	8	2920	2927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015952	CCG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015952	GA	3	6	3036	3041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015952	GC	3	6	3064	3069	0 %	0 %	50 %	50 %	345007720
75	NC_015952	C	6	6	3087	3092	0 %	0 %	0 %	100 %	345007720
76	NC_015952	GCCC	2	8	3226	3233	0 %	0 %	25 %	75 %	345007720
77	NC_015952	CCA	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007720
78	NC_015952	CAT	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007720
79	NC_015952	GTC	2	6	3282	3287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007720
80	NC_015952	CAC	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007720
81	NC_015952	CCT	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007720
82	NC_015952	GAG	2	6	3441	3446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007720
83	NC_015952	CGC	2	6	3462	3467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007720
84	NC_015952	AGG	2	6	3472	3477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007720
85	NC_015952	G	6	6	3476	3481	0 %	0 %	100 %	0 %	345007720
86	NC_015952	TCACCG	2	12	3493	3504	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007720
87	NC_015952	GAG	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007720
88	NC_015952	CGG	2	6	3677	3682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007720
89	NC_015952	GAG	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007720
90	NC_015952	CGG	2	6	3782	3787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007720
91	NC_015952	CCG	2	6	3877	3882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007720
92	NC_015952	GCT	2	6	3931	3936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007720
93	NC_015952	GTC	2	6	3987	3992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007720
94	NC_015952	TCA	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007720
95	NC_015952	CGC	2	6	4139	4144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007720
96	NC_015952	CTG	2	6	4214	4219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007720
97	NC_015952	CAT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007721
98	NC_015952	TCC	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007721
99	NC_015952	CCA	2	6	4289	4294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007721
100	NC_015952	CAG	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007721
101	NC_015952	GC	3	6	4358	4363	0 %	0 %	50 %	50 %	345007721
102	NC_015952	GCT	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015952	ACG	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007722
104	NC_015952	GC	3	6	4582	4587	0 %	0 %	50 %	50 %	345007722
105	NC_015952	ACC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007722
106	NC_015952	CGC	2	6	4610	4615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007722
107	NC_015952	ATC	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007722
108	NC_015952	CAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007722
109	NC_015952	GTC	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007722
110	NC_015952	CGC	2	6	4696	4701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007722
111	NC_015952	CGA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007722
112	NC_015952	GCT	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007722
113	NC_015952	GGGC	2	8	4906	4913	0 %	0 %	75 %	25 %	345007722
114	NC_015952	GGCCG	2	10	4919	4928	0 %	0 %	60 %	40 %	345007722
115	NC_015952	CGC	2	6	4936	4941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007722
116	NC_015952	TGA	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007722
117	NC_015952	CGC	2	6	5043	5048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015952	GC	3	6	5074	5079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015952	ACGG	2	8	5083	5090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015952	CGG	3	9	5144	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015952	CAC	2	6	5175	5180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015952	ATG	2	6	5188	5193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015952	TC	3	6	5268	5273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015952	ACC	2	6	5322	5327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007723
125	NC_015952	CAT	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007723
126	NC_015952	GAA	2	6	5468	5473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007723
127	NC_015952	TTC	2	6	5478	5483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007723
128	NC_015952	GGA	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007723
129	NC_015952	GTG	2	6	5513	5518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007723
130	NC_015952	CG	3	6	5621	5626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015952	CCG	2	6	5634	5639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015952	CCGC	2	8	5646	5653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_015952	GCC	2	6	5660	5665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_015952	GAG	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015952	CCG	2	6	5682	5687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015952	TGA	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015952	AGGT	2	8	5805	5812	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015952	CG	3	6	5943	5948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015952	CCG	2	6	5972	5977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015952	CAC	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_015952	CCCG	2	8	6101	6108	0 %	0 %	25 %	75 %	345007724
142	NC_015952	ACC	2	6	6115	6120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007724
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170	NC_015952	CCGG	2	8	7375	7382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_015952	TGC	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_015952	ACT	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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267	NC_015952	GCC	2	6	11012	11017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007729
268	NC_015952	ATCG	2	8	11018	11025	25 %	25 %	25 %	25 %	345007729
269	NC_015952	AGGA	2	8	11046	11053	50 %	0 %	50 %	0 %	345007729
270	NC_015952	GTT	2	6	11156	11161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007729
271	NC_015952	CCG	2	6	11226	11231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007729
272	NC_015952	CGA	2	6	11233	11238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007729
273	NC_015952	CGG	2	6	11302	11307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007729
274	NC_015952	GCGTG	2	10	11323	11332	0 %	20 %	60 %	20 %	345007729
275	NC_015952	GTC	2	6	11336	11341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007729
276	NC_015952	GCTG	2	8	11362	11369	0 %	25 %	50 %	25 %	345007729
277	NC_015952	GTA	2	6	11405	11410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007729
278	NC_015952	G	6	6	11416	11421	0 %	0 %	100 %	0 %	345007729
279	NC_015952	GCAGGC	2	12	11432	11443	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007729
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281	NC_015952	GGGAG	2	10	11479	11488	20 %	0 %	80 %	0 %	345007729
282	NC_015952	CGA	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007729
283	NC_015952	TCG	2	6	11556	11561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007729
284	NC_015952	GTG	2	6	11589	11594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007729
285	NC_015952	CGC	2	6	11659	11664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007729
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287	NC_015952	TGA	2	6	11809	11814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007729
288	NC_015952	CGG	2	6	11821	11826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007729
289	NC_015952	CCG	2	6	11838	11843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007729
290	NC_015952	CGG	2	6	11873	11878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007729
291	NC_015952	G	6	6	11877	11882	0 %	0 %	100 %	0 %	345007729
292	NC_015952	GGT	2	6	11885	11890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007729
293	NC_015952	CGA	2	6	11899	11904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007729
294	NC_015952	GGA	2	6	11990	11995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007729
295	NC_015952	GCG	2	6	11996	12001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007729
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299	NC_015952	GGA	2	6	12140	12145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007729
300	NC_015952	GCC	2	6	12188	12193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007729
301	NC_015952	GGA	2	6	12194	12199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007729
302	NC_015952	GAT	2	6	12215	12220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007729
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316	NC_015952	CGG	2	6	12644	12649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
317	NC_015952	GCG	2	6	12652	12657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
318	NC_015952	CAG	2	6	12658	12663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
319	NC_015952	CAG	2	6	12748	12753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007730
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343	NC_015952	CCA	2	6	13599	13604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007730
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352	NC_015952	AGG	2	6	14135	14140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
353	NC_015952	AGT	2	6	14173	14178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
354	NC_015952	CTG	2	6	14193	14198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
355	NC_015952	GCC	2	6	14244	14249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007731
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373	NC_015952	CAC	2	6	14956	14961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
374	NC_015952	GA	3	6	15068	15073	50 %	0 %	50 %	0 %	345007732
375	NC_015952	GGACCT	2	12	15143	15154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007732
376	NC_015952	GGA	2	6	15155	15160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007732
377	NC_015952	AGCGC	2	10	15161	15170	20 %	0 %	40 %	40 %	345007732
378	NC_015952	GCG	2	6	15198	15203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007732
379	NC_015952	TCG	2	6	15276	15281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007732
380	NC_015952	CGG	2	6	15282	15287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007732
381	NC_015952	AAG	2	6	15315	15320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007732
382	NC_015952	CTG	2	6	15356	15361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007732
383	NC_015952	GC	3	6	15436	15441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
384	NC_015952	GTG	2	6	15447	15452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
385	NC_015952	ACGG	2	8	15475	15482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
386	NC_015952	CG	3	6	15483	15488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
387	NC_015952	GTT	2	6	15507	15512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007733
388	NC_015952	TCC	2	6	15532	15537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007733
389	NC_015952	GCG	2	6	15544	15549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007733
390	NC_015952	TGC	2	6	15581	15586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007733
391	NC_015952	GAT	2	6	15588	15593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007733
392	NC_015952	GTGCG	2	10	15678	15687	0 %	20 %	60 %	20 %	345007733
393	NC_015952	G	6	6	15701	15706	0 %	0 %	100 %	0 %	345007733
394	NC_015952	GCC	2	6	15712	15717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007733
395	NC_015952	CGG	2	6	15728	15733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007733
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