MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI02

Total Repeats: 5077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015952	CGC	2	6	38383	38388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007754
1002	NC_015952	CGT	2	6	38435	38440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1003	NC_015952	GCAC	2	8	38446	38453	25 %	0 %	25 %	50 %	345007754
1004	NC_015952	CAG	2	6	38477	38482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1005	NC_015952	TGG	2	6	38521	38526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007754
1006	NC_015952	GCC	2	6	38544	38549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007754
1007	NC_015952	GCG	2	6	38550	38555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007754
1008	NC_015952	GGAGAA	2	12	38567	38578	50 %	0 %	50 %	0 %	345007754
1009	NC_015952	CCG	2	6	38602	38607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007754
1010	NC_015952	ACG	2	6	38628	38633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1011	NC_015952	GCG	2	6	38659	38664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007754
1012	NC_015952	TCA	2	6	38665	38670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007754
1013	NC_015952	GAGG	2	8	38681	38688	25 %	0 %	75 %	0 %	345007754
1014	NC_015952	GCG	2	6	38730	38735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007754
1015	NC_015952	TCG	2	6	38754	38759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1016	NC_015952	GGA	2	6	38761	38766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007754
1017	NC_015952	GCGGAG	2	12	38799	38810	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345007754
1018	NC_015952	CAG	2	6	38828	38833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1019	NC_015952	CGCGC	2	10	38843	38852	0 %	0 %	40 %	60 %	345007754
1020	NC_015952	TCG	2	6	38955	38960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1021	NC_015952	GAC	2	6	39014	39019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1022	NC_015952	GGT	2	6	39046	39051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007754
1023	NC_015952	GGC	2	6	39100	39105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007754
1024	NC_015952	GCA	2	6	39106	39111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1025	NC_015952	GCC	2	6	39131	39136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007754
1026	NC_015952	GTA	2	6	39146	39151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007754
1027	NC_015952	CGGCG	2	10	39200	39209	0 %	0 %	60 %	40 %	345007754
1028	NC_015952	G	6	6	39414	39419	0 %	0 %	100 %	0 %	345007754
1029	NC_015952	GTC	2	6	39428	39433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1030	NC_015952	GCA	2	6	39436	39441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007754
1031	NC_015952	CCG	2	6	39470	39475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007754
1032	NC_015952	GCTCA	2	10	39501	39510	20 %	20 %	20 %	40 %	345007755
1033	NC_015952	GCG	2	6	39530	39535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007755
1034	NC_015952	CCG	2	6	39567	39572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007755
1035	NC_015952	CGG	2	6	39624	39629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007755
1036	NC_015952	CGG	2	6	39712	39717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007755
1037	NC_015952	CTT	2	6	39724	39729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007755
1038	NC_015952	GC	3	6	39787	39792	0 %	0 %	50 %	50 %	345007755
1039	NC_015952	AACTG	2	10	39888	39897	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1040	NC_015952	TCG	2	6	39898	39903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015952	GGGAT	2	10	39929	39938	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015952	C	6	6	39992	39997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1043	NC_015952	CCTTC	2	10	40012	40021	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1044	NC_015952	ATC	2	6	40043	40048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015952	GGA	3	9	40060	40068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015952	ACG	2	6	40070	40075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_015952	CAC	2	6	40085	40090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007756
1048	NC_015952	ACC	2	6	40112	40117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007756
1049	NC_015952	TCG	2	6	40139	40144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007756
1050	NC_015952	CGC	2	6	40164	40169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007756
1051	NC_015952	CGG	2	6	40202	40207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007756
1052	NC_015952	GCC	2	6	40214	40219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007756
1053	NC_015952	CAC	2	6	40233	40238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007756
1054	NC_015952	C	6	6	40283	40288	0 %	0 %	0 %	100 %	345007756
1055	NC_015952	TTC	2	6	40375	40380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007756
1056	NC_015952	GTC	2	6	40399	40404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007756
1057	NC_015952	GCC	2	6	40422	40427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007756
1058	NC_015952	CGC	2	6	40478	40483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007756
1059	NC_015952	CTG	2	6	40488	40493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007756
1060	NC_015952	GAA	2	6	40498	40503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015952	CCG	2	6	40515	40520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_015952	GC	3	6	40534	40539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_015952	CGGGC	2	10	40606	40615	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1064	NC_015952	C	6	6	40632	40637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1065	NC_015952	GACC	2	8	40659	40666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_015952	GAGC	2	8	40766	40773	25 %	0 %	50 %	25 %	345007757
1067	NC_015952	CTG	2	6	40802	40807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007757
1068	NC_015952	CAC	2	6	40859	40864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007757
1069	NC_015952	GCC	2	6	40905	40910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007757
1070	NC_015952	GAT	2	6	40943	40948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007757
1071	NC_015952	GCC	2	6	40974	40979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007757
1072	NC_015952	GCG	2	6	41023	41028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007757
1073	NC_015952	CTC	2	6	41030	41035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007757
1074	NC_015952	CGC	2	6	41040	41045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007757
1075	NC_015952	AG	3	6	41189	41194	50 %	0 %	50 %	0 %	345007757
1076	NC_015952	CTT	2	6	41210	41215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007757
1077	NC_015952	CTGGT	2	10	41274	41283	0 %	40 %	40 %	20 %	345007757
1078	NC_015952	ACG	2	6	41358	41363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015952	TGC	2	6	41378	41383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015952	GT	3	6	41397	41402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015952	TCCG	2	8	41522	41529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_015952	GCG	2	6	41532	41537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015952	GGA	2	6	41738	41743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007758
1084	NC_015952	GA	3	6	41742	41747	50 %	0 %	50 %	0 %	345007758
1085	NC_015952	GTG	2	6	41774	41779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007759
1086	NC_015952	CGC	2	6	41784	41789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007759
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1088	NC_015952	GCA	2	6	41816	41821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007759
1089	NC_015952	AGA	4	12	41822	41833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007759
1090	NC_015952	CCGT	2	8	41850	41857	0 %	25 %	25 %	50 %	345007759
1091	NC_015952	CGG	2	6	41868	41873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007759
1092	NC_015952	CG	3	6	41891	41896	0 %	0 %	50 %	50 %	345007759
1093	NC_015952	GTA	2	6	41901	41906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007759
1094	NC_015952	CCG	2	6	41940	41945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007760
1095	NC_015952	CGG	2	6	41949	41954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007760
1096	NC_015952	CCT	2	6	41975	41980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007760
1097	NC_015952	CG	3	6	42010	42015	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1098	NC_015952	CGAC	2	8	42035	42042	25 %	0 %	25 %	50 %	345007760
1099	NC_015952	CGG	2	6	42084	42089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007760
1100	NC_015952	TCC	2	6	42094	42099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007760
1101	NC_015952	CCGG	2	8	42113	42120	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1102	NC_015952	CAC	2	6	42184	42189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007760
1103	NC_015952	CGA	2	6	42192	42197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007760
1104	NC_015952	CGG	2	6	42223	42228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007760
1105	NC_015952	GCC	2	6	42239	42244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007760
1106	NC_015952	CG	3	6	42295	42300	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1107	NC_015952	GAG	2	6	42316	42321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007760
1108	NC_015952	CATC	2	8	42341	42348	25 %	25 %	0 %	50 %	345007760
1109	NC_015952	CAC	2	6	42387	42392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007760
1110	NC_015952	GCCGG	2	10	42470	42479	0 %	0 %	60 %	40 %	345007760
1111	NC_015952	CG	3	6	42489	42494	0 %	0 %	50 %	50 %	345007760
1112	NC_015952	GCTCC	2	10	42512	42521	0 %	20 %	20 %	60 %	345007760
1113	NC_015952	TCG	2	6	42562	42567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007760
1114	NC_015952	CGGC	2	8	42576	42583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_015952	GTG	2	6	42594	42599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015952	CAC	2	6	42642	42647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_015952	CGG	2	6	42673	42678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015952	CGC	3	9	42736	42744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007761
1119	NC_015952	CAC	2	6	42764	42769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007761
1120	NC_015952	CGC	2	6	42841	42846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007761
1121	NC_015952	CG	3	6	42931	42936	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
1122	NC_015952	CAAC	2	8	42953	42960	50 %	0 %	0 %	50 %	345007761
1123	NC_015952	GTG	2	6	42965	42970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007761
1124	NC_015952	CCT	2	6	42988	42993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007761
1125	NC_015952	GT	3	6	43033	43038	0 %	50 %	50 %	0 %	345007761
1126	NC_015952	GC	3	6	43149	43154	0 %	0 %	50 %	50 %	345007761
1127	NC_015952	CGC	2	6	43187	43192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007761
1128	NC_015952	CAAGCG	2	12	43253	43264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1129	NC_015952	CGG	2	6	43265	43270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007761
1130	NC_015952	TGC	3	9	43306	43314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007761
1131	NC_015952	GCG	2	6	43370	43375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007761
1132	NC_015952	GAA	2	6	43391	43396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007761
1133	NC_015952	GAC	2	6	43448	43453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007761
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1136	NC_015952	CGT	2	6	43669	43674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007761
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1141	NC_015952	GTG	2	6	43896	43901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_015952	CCA	2	6	43950	43955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007762
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1161	NC_015952	GC	3	6	44547	44552	0 %	0 %	50 %	50 %	345007764
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1188	NC_015952	CCGG	2	8	45391	45398	0 %	0 %	50 %	50 %	345007765
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1243	NC_015952	CGA	2	6	47074	47079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007767
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1251	NC_015952	CTT	2	6	47228	47233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007767
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1253	NC_015952	CTT	2	6	47276	47281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007767
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1369	NC_015952	GC	3	6	51272	51277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1372	NC_015952	CAC	2	6	51365	51370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1373	NC_015952	CCGG	2	8	51373	51380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1374	NC_015952	CTG	2	6	51383	51388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_015952	CCT	2	6	51410	51415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1376	NC_015952	TCAGA	2	10	51507	51516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1377	NC_015952	CGA	3	9	51618	51626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007773
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1381	NC_015952	CGG	2	6	51765	51770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007773
1382	NC_015952	CGA	2	6	51813	51818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007773
1383	NC_015952	GCT	2	6	51885	51890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007773
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1385	NC_015952	GGC	4	12	51999	52010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007773
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1387	NC_015952	CGCC	2	8	52062	52069	0 %	0 %	25 %	75 %	345007773
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1424	NC_015952	CTGCC	2	10	53527	53536	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1426	NC_015952	CTGCC	2	10	53560	53569	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1428	NC_015952	G	7	7	53649	53655	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_015952	GGGT	2	8	54054	54061	0 %	25 %	75 %	0 %	345007775
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1452	NC_015952	GGAAGC	2	12	54675	54686	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007776
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1466	NC_015952	GGCA	2	8	55499	55506	25 %	0 %	50 %	25 %	345007776
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1495	NC_015952	CGG	2	6	56903	56908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007776
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1498	NC_015952	GCG	5	15	56956	56970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007776
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1500	NC_015952	TGG	2	6	57034	57039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007776

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