MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015947	GCC	2	6	40775	40780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205457
1002	NC_015947	TGG	2	6	40782	40787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205457
1003	NC_015947	CGG	2	6	40863	40868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205457
1004	NC_015947	GC	3	6	40950	40955	0 %	0 %	50 %	50 %	344205457
1005	NC_015947	AGGGCG	2	12	40982	40993	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344205457
1006	NC_015947	GGT	2	6	41009	41014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205457
1007	NC_015947	TGG	2	6	41073	41078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205457
1008	NC_015947	CGG	2	6	41094	41099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205457
1009	NC_015947	GCG	2	6	41108	41113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205457
1010	NC_015947	GGC	2	6	41116	41121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205457
1011	NC_015947	AGC	2	6	41156	41161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205457
1012	NC_015947	GGGC	2	8	41162	41169	0 %	0 %	75 %	25 %	344205457
1013	NC_015947	GTC	2	6	41315	41320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015947	GCGCA	2	10	41337	41346	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_015947	G	6	6	41420	41425	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015947	GA	3	6	41441	41446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015947	GCA	2	6	41455	41460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1018	NC_015947	CTC	2	6	41490	41495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205458
1019	NC_015947	GCC	2	6	41520	41525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205458
1020	NC_015947	GC	3	6	41560	41565	0 %	0 %	50 %	50 %	344205458
1021	NC_015947	ACT	2	6	41584	41589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205458
1022	NC_015947	ATC	2	6	41601	41606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205458
1023	NC_015947	CAG	2	6	41633	41638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1024	NC_015947	CGT	2	6	41645	41650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1025	NC_015947	GCC	2	6	41691	41696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205458
1026	NC_015947	TGG	2	6	41752	41757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205458
1027	NC_015947	CGG	2	6	41774	41779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205458
1028	NC_015947	ATC	2	6	41835	41840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205458
1029	NC_015947	CGG	2	6	41878	41883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205458
1030	NC_015947	ACG	2	6	41959	41964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1031	NC_015947	CAG	3	9	41973	41981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1032	NC_015947	CGC	2	6	42122	42127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205458
1033	NC_015947	GTC	2	6	42161	42166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1034	NC_015947	GCA	2	6	42190	42195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1035	NC_015947	GCC	2	6	42204	42209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205458
1036	NC_015947	CAC	2	6	42212	42217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205458
1037	NC_015947	AGC	2	6	42232	42237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205458
1038	NC_015947	GCC	2	6	42274	42279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205458
1039	NC_015947	GAC	2	6	42334	42339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015947	CTG	2	6	42359	42364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1041	NC_015947	CTGTCC	2	12	42386	42397	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344205459
1042	NC_015947	GCC	2	6	42425	42430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205459
1043	NC_015947	TGCC	2	8	42447	42454	0 %	25 %	25 %	50 %	344205459
1044	NC_015947	TGG	2	6	42459	42464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205459
1045	NC_015947	CGC	2	6	42468	42473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205459
1046	NC_015947	TGA	2	6	42481	42486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205459
1047	NC_015947	GGC	2	6	42544	42549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205459
1048	NC_015947	GCA	2	6	42583	42588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1049	NC_015947	CG	3	6	42677	42682	0 %	0 %	50 %	50 %	344205459
1050	NC_015947	GCA	2	6	42723	42728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1051	NC_015947	GC	3	6	42734	42739	0 %	0 %	50 %	50 %	344205459
1052	NC_015947	GC	5	10	42749	42758	0 %	0 %	50 %	50 %	344205459
1053	NC_015947	GGTG	2	8	42778	42785	0 %	25 %	75 %	0 %	344205459
1054	NC_015947	GCA	3	9	42789	42797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1055	NC_015947	TGC	2	6	42798	42803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1056	NC_015947	GCACAG	2	12	42848	42859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1057	NC_015947	CTG	2	6	42968	42973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1058	NC_015947	CCA	2	6	42984	42989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205459
1059	NC_015947	CGT	2	6	43007	43012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1060	NC_015947	GGC	2	6	43013	43018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205459
1061	NC_015947	CTG	2	6	43034	43039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1062	NC_015947	TGC	2	6	43074	43079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1063	NC_015947	CAC	2	6	43081	43086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205459
1064	NC_015947	TGCGC	2	10	43093	43102	0 %	20 %	40 %	40 %	344205459
1065	NC_015947	GC	4	8	43099	43106	0 %	0 %	50 %	50 %	344205459
1066	NC_015947	TGC	2	6	43182	43187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1067	NC_015947	GCC	3	9	43292	43300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205459
1068	NC_015947	TGC	2	6	43416	43421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1069	NC_015947	CTGCAG	2	12	43478	43489	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205459
1070	NC_015947	CG	4	8	43518	43525	0 %	0 %	50 %	50 %	344205459
1071	NC_015947	GCG	2	6	43550	43555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015947	AGC	2	6	43632	43637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015947	GGCTC	2	10	43646	43655	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1074	NC_015947	CGC	2	6	43722	43727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205460
1075	NC_015947	CCG	2	6	43734	43739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205460
1076	NC_015947	GCA	2	6	43755	43760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205460
1077	NC_015947	GCA	3	9	43800	43808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205460
1078	NC_015947	TGG	2	6	43844	43849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205460
1079	NC_015947	CACCAG	2	12	43852	43863	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344205460
1080	NC_015947	CTG	2	6	43873	43878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205460
1081	NC_015947	CCA	2	6	43899	43904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205460
1082	NC_015947	GCT	2	6	43905	43910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205460
1083	NC_015947	CAG	3	9	43948	43956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205460
1084	NC_015947	GC	3	6	43977	43982	0 %	0 %	50 %	50 %	344205460
1085	NC_015947	GCCG	2	8	44008	44015	0 %	0 %	50 %	50 %	344205460
1086	NC_015947	GC	3	6	44030	44035	0 %	0 %	50 %	50 %	344205460
1087	NC_015947	CG	4	8	44079	44086	0 %	0 %	50 %	50 %	344205460
1088	NC_015947	CGG	2	6	44094	44099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205460
1089	NC_015947	CAC	2	6	44119	44124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205460
1090	NC_015947	GAA	2	6	44134	44139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205460
1091	NC_015947	TGC	2	6	44190	44195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205460
1092	NC_015947	TGA	2	6	44325	44330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205460
1093	NC_015947	GCA	2	6	44406	44411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205460
1094	NC_015947	CAC	2	6	44428	44433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205460
1095	NC_015947	G	6	6	44459	44464	0 %	0 %	100 %	0 %	344205460
1096	NC_015947	CGGG	2	8	44475	44482	0 %	0 %	75 %	25 %	344205460
1097	NC_015947	GCG	2	6	44483	44488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205460
1098	NC_015947	TGGCGC	2	12	44493	44504	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205460
1099	NC_015947	CGC	2	6	44572	44577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_015947	CAT	2	6	44605	44610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015947	GGT	2	6	44675	44680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205461
1102	NC_015947	TGG	2	6	44696	44701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205461
1103	NC_015947	TGG	2	6	44709	44714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205461
1104	NC_015947	TCT	2	6	44742	44747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205461
1105	NC_015947	TGGCTG	2	12	44828	44839	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344205461
1106	NC_015947	ACC	2	6	44840	44845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205461
1107	NC_015947	GAT	2	6	44848	44853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205461
1108	NC_015947	GTGG	2	8	44863	44870	0 %	25 %	75 %	0 %	344205461
1109	NC_015947	CAC	2	6	44885	44890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205461
1110	NC_015947	GC	3	6	44981	44986	0 %	0 %	50 %	50 %	344205461
1111	NC_015947	GC	3	6	44992	44997	0 %	0 %	50 %	50 %	344205461
1112	NC_015947	GAC	2	6	45029	45034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205461
1113	NC_015947	TGC	3	9	45081	45089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205461
1114	NC_015947	CGGC	2	8	45168	45175	0 %	0 %	50 %	50 %	344205461
1115	NC_015947	TGG	2	6	45197	45202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205461
1116	NC_015947	CCA	2	6	45234	45239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205461
1117	NC_015947	GAG	2	6	45272	45277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205461
1118	NC_015947	CAA	2	6	45283	45288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205461
1119	NC_015947	CAT	2	6	45290	45295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205461
1120	NC_015947	GC	3	6	45311	45316	0 %	0 %	50 %	50 %	344205461
1121	NC_015947	GCG	2	6	45325	45330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205461
1122	NC_015947	CTG	2	6	45365	45370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205461
1123	NC_015947	TGC	2	6	45393	45398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205461
1124	NC_015947	TGT	2	6	45465	45470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205461
1125	NC_015947	GCC	2	6	45561	45566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205461
1126	NC_015947	TGC	2	6	45567	45572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205461
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1129	NC_015947	GTGG	2	8	45646	45653	0 %	25 %	75 %	0 %	344205461
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1138	NC_015947	GCG	2	6	45889	45894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205462
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1143	NC_015947	TGG	2	6	46198	46203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_015947	GAT	2	6	46316	46321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_015947	C	6	6	46369	46374	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1146	NC_015947	GCT	2	6	46392	46397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205463
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1164	NC_015947	CGA	2	6	47251	47256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1165	NC_015947	CGG	2	6	47265	47270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1236	NC_015947	GC	3	6	49635	49640	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
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1238	NC_015947	GCC	2	6	49685	49690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205465
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1243	NC_015947	GC	3	6	49792	49797	0 %	0 %	50 %	50 %	344205465
1244	NC_015947	GGT	2	6	49920	49925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_015947	ACCC	2	8	49996	50003	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1246	NC_015947	ATGG	2	8	50194	50201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_015947	CCGCC	2	10	50252	50261	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1248	NC_015947	GCTGTT	3	18	50284	50301	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1249	NC_015947	GATC	2	8	50373	50380	25 %	25 %	25 %	25 %	344205466
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1251	NC_015947	TCT	2	6	50400	50405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205466
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1288	NC_015947	GAA	2	6	51731	51736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1373	NC_015947	T	6	6	54606	54611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1374	NC_015947	CG	3	6	54624	54629	0 %	0 %	50 %	50 %	344205470
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1489	NC_015947	GATT	2	8	58698	58705	25 %	50 %	25 %	0 %	344205474
1490	NC_015947	AT	3	6	58722	58727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1491	NC_015947	CGC	2	6	58773	58778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1492	NC_015947	CGGAC	2	10	58790	58799	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1493	NC_015947	TCC	2	6	58816	58821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1494	NC_015947	T	7	7	58869	58875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1495	NC_015947	CGG	2	6	58880	58885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1496	NC_015947	GGC	2	6	59064	59069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205475
1497	NC_015947	TGC	3	9	59072	59080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205475
1498	NC_015947	GTG	2	6	59086	59091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205475
1499	NC_015947	CGG	2	6	59126	59131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205475
1500	NC_015947	GAT	2	6	59179	59184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205475

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