MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015947	GGC	2	6	418913	418918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205787
11002	NC_015947	CGGG	2	8	418986	418993	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11003	NC_015947	CAG	2	6	418997	419002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_015947	GTT	2	6	419023	419028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_015947	CGAGC	2	10	419056	419065	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11006	NC_015947	GAG	2	6	419140	419145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_015947	GCA	2	6	419164	419169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_015947	CGGC	2	8	419180	419187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_015947	AGAA	2	8	419220	419227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_015947	GCTGAT	2	12	419351	419362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344205788
11011	NC_015947	CGC	3	9	419383	419391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205788
11012	NC_015947	GCACG	2	10	419519	419528	20 %	0 %	40 %	40 %	344205788
11013	NC_015947	GCC	2	6	419573	419578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205788
11014	NC_015947	TCA	2	6	419584	419589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205788
11015	NC_015947	TTGATG	2	12	419592	419603	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	344205788
11016	NC_015947	CG	3	6	419612	419617	0 %	0 %	50 %	50 %	344205788
11017	NC_015947	CTG	2	6	419618	419623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205788
11018	NC_015947	TCG	2	6	419661	419666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205788
11019	NC_015947	CGGT	2	8	419688	419695	0 %	25 %	50 %	25 %	344205788
11020	NC_015947	GCT	2	6	419734	419739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205788
11021	NC_015947	CAG	2	6	419741	419746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205788
11022	NC_015947	ACG	2	6	419754	419759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205788
11023	NC_015947	CCA	2	6	419956	419961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205788
11024	NC_015947	GGT	2	6	419996	420001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205788
11025	NC_015947	CGC	2	6	420013	420018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205788
11026	NC_015947	GGTTGA	2	12	420142	420153	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344205788
11027	NC_015947	GGCGC	2	10	420172	420181	0 %	0 %	60 %	40 %	344205788
11028	NC_015947	GAT	2	6	420203	420208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205788
11029	NC_015947	CAC	3	9	420290	420298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205788
11030	NC_015947	GCA	2	6	420358	420363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205788
11031	NC_015947	TTCA	2	8	420387	420394	25 %	50 %	0 %	25 %	344205788
11032	NC_015947	GC	3	6	420404	420409	0 %	0 %	50 %	50 %	344205789
11033	NC_015947	CAT	2	6	420460	420465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205789
11034	NC_015947	GCG	2	6	420474	420479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205789
11035	NC_015947	GCC	2	6	420538	420543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205789
11036	NC_015947	TCA	3	9	420591	420599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205789
11037	NC_015947	GCA	3	9	420735	420743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11038	NC_015947	CTG	2	6	420841	420846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11039	NC_015947	CGG	3	9	420879	420887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205789
11040	NC_015947	GCA	2	6	420903	420908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11041	NC_015947	CAC	2	6	420958	420963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205789
11042	NC_015947	ACG	2	6	420966	420971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11043	NC_015947	CTG	2	6	420979	420984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11044	NC_015947	CGG	2	6	420999	421004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205789
11045	NC_015947	CG	3	6	421062	421067	0 %	0 %	50 %	50 %	344205789
11046	NC_015947	TTC	2	6	421069	421074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205789
11047	NC_015947	CGC	2	6	421158	421163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205789
11048	NC_015947	GCT	2	6	421312	421317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11049	NC_015947	TGC	2	6	421351	421356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11050	NC_015947	GC	3	6	421355	421360	0 %	0 %	50 %	50 %	344205789
11051	NC_015947	CAC	2	6	421363	421368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205789
11052	NC_015947	CG	3	6	421391	421396	0 %	0 %	50 %	50 %	344205789
11053	NC_015947	TGC	2	6	421431	421436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11054	NC_015947	GCAC	2	8	421514	421521	25 %	0 %	25 %	50 %	344205789
11055	NC_015947	CGC	3	9	421522	421530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205789
11056	NC_015947	GCTGG	2	10	421536	421545	0 %	20 %	60 %	20 %	344205789
11057	NC_015947	GCG	2	6	421550	421555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205789
11058	NC_015947	GC	3	6	421648	421653	0 %	0 %	50 %	50 %	344205789
11059	NC_015947	GGC	2	6	421732	421737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205789
11060	NC_015947	CAG	2	6	421759	421764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11061	NC_015947	GCG	2	6	421783	421788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205789
11062	NC_015947	ATGCCG	2	12	421795	421806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344205789
11063	NC_015947	CTC	2	6	421840	421845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_015947	ATT	2	6	421895	421900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_015947	ACC	2	6	421934	421939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_015947	CTGC	2	8	421987	421994	0 %	25 %	25 %	50 %	344205790
11067	NC_015947	CCG	2	6	421997	422002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205790
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11069	NC_015947	GCT	3	9	422016	422024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205790
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11071	NC_015947	CGAT	2	8	422075	422082	25 %	25 %	25 %	25 %	344205790
11072	NC_015947	GCCG	2	8	422172	422179	0 %	0 %	50 %	50 %	344205790
11073	NC_015947	GGC	2	6	422244	422249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205790
11074	NC_015947	CGA	2	6	422277	422282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205790
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11076	NC_015947	GC	3	6	422355	422360	0 %	0 %	50 %	50 %	344205790
11077	NC_015947	TGA	2	6	422385	422390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205790
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11082	NC_015947	TGC	2	6	422507	422512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205790
11083	NC_015947	TGCCG	2	10	422556	422565	0 %	20 %	40 %	40 %	344205790
11084	NC_015947	CG	3	6	422600	422605	0 %	0 %	50 %	50 %	344205790
11085	NC_015947	CAG	2	6	422617	422622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205790
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11089	NC_015947	TGC	2	6	422897	422902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205790
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11092	NC_015947	GC	4	8	422972	422979	0 %	0 %	50 %	50 %	344205790
11093	NC_015947	GCA	2	6	423042	423047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205790
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11097	NC_015947	CGA	2	6	423120	423125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205790
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11099	NC_015947	GGCT	2	8	423181	423188	0 %	25 %	50 %	25 %	344205790
11100	NC_015947	ACC	2	6	423202	423207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205790
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11102	NC_015947	GCCA	2	8	423426	423433	25 %	0 %	25 %	50 %	344205790
11103	NC_015947	GA	3	6	423483	423488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_015947	GCGG	2	8	423516	423523	0 %	0 %	75 %	25 %	344205791
11105	NC_015947	GGT	2	6	423591	423596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205791
11106	NC_015947	GGGC	2	8	423615	423622	0 %	0 %	75 %	25 %	344205791
11107	NC_015947	GCCG	2	8	423627	423634	0 %	0 %	50 %	50 %	344205791
11108	NC_015947	GCT	2	6	423717	423722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205791
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11116	NC_015947	TCG	2	6	424117	424122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205791
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11118	NC_015947	CGG	2	6	424161	424166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205791
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11120	NC_015947	CGG	2	6	424194	424199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205791
11121	NC_015947	TCA	2	6	424202	424207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205791
11122	NC_015947	GCA	2	6	424226	424231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205791
11123	NC_015947	AGGC	2	8	424241	424248	25 %	0 %	50 %	25 %	344205791
11124	NC_015947	CG	3	6	424268	424273	0 %	0 %	50 %	50 %	344205791
11125	NC_015947	ACG	2	6	424301	424306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205791
11126	NC_015947	CGA	2	6	424338	424343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205791
11127	NC_015947	GTT	2	6	424398	424403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205791
11128	NC_015947	CTT	2	6	424404	424409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205791
11129	NC_015947	ACG	2	6	424451	424456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205791
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11132	NC_015947	GCA	2	6	424610	424615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205791
11133	NC_015947	GTGG	2	8	424651	424658	0 %	25 %	75 %	0 %	344205791
11134	NC_015947	CAA	2	6	424692	424697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205791
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11139	NC_015947	CTG	2	6	424924	424929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205791
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11144	NC_015947	CGC	2	6	425080	425085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205791
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11149	NC_015947	ACA	2	6	425237	425242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205791
11150	NC_015947	CG	3	6	425252	425257	0 %	0 %	50 %	50 %	344205791
11151	NC_015947	GCG	2	6	425279	425284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205791
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11157	NC_015947	CAG	2	6	425554	425559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205791
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11159	NC_015947	GAAG	2	8	425766	425773	50 %	0 %	50 %	0 %	344205791
11160	NC_015947	GAC	2	6	425788	425793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205791
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11164	NC_015947	CGC	2	6	426242	426247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205791
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11177	NC_015947	GGC	2	6	426699	426704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205792
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11182	NC_015947	CAG	2	6	426861	426866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205792
11183	NC_015947	CTG	2	6	426882	426887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205792
11184	NC_015947	CGGCCT	2	12	426899	426910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205792
11185	NC_015947	CAT	2	6	426965	426970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205792
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11191	NC_015947	GGT	2	6	427211	427216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205792
11192	NC_015947	GGC	2	6	427256	427261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205792
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11197	NC_015947	GT	3	6	427453	427458	0 %	50 %	50 %	0 %	344205792
11198	NC_015947	ATGG	2	8	427464	427471	25 %	25 %	50 %	0 %	344205792
11199	NC_015947	TCG	2	6	427515	427520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205792
11200	NC_015947	GCT	2	6	427526	427531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205792
11201	NC_015947	GTG	2	6	427551	427556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205792
11202	NC_015947	GC	3	6	427584	427589	0 %	0 %	50 %	50 %	344205792
11203	NC_015947	GCAG	2	8	427601	427608	25 %	0 %	50 %	25 %	344205792
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11207	NC_015947	GCT	2	6	427889	427894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205792
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11212	NC_015947	CTG	2	6	428224	428229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205793
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11214	NC_015947	CCGG	2	8	428310	428317	0 %	0 %	50 %	50 %	344205793
11215	NC_015947	CG	3	6	428357	428362	0 %	0 %	50 %	50 %	344205793
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11217	NC_015947	GCT	2	6	428475	428480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205793
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11221	NC_015947	CG	3	6	428545	428550	0 %	0 %	50 %	50 %	344205793
11222	NC_015947	GCA	2	6	428580	428585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205793
11223	NC_015947	CAG	2	6	428596	428601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205793
11224	NC_015947	GC	3	6	428607	428612	0 %	0 %	50 %	50 %	344205793
11225	NC_015947	GCG	2	6	428619	428624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205793
11226	NC_015947	GTG	2	6	428649	428654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205793
11227	NC_015947	ACG	2	6	428696	428701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205793
11228	NC_015947	GCG	2	6	428730	428735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11229	NC_015947	CCTGCA	2	12	428737	428748	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11230	NC_015947	CAACAG	2	12	428765	428776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11231	NC_015947	GGCGG	2	10	428794	428803	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11232	NC_015947	CCGCC	2	10	428886	428895	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11233	NC_015947	GCT	2	6	428943	428948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11234	NC_015947	T	6	6	428950	428955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11235	NC_015947	TCG	2	6	428959	428964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11236	NC_015947	GCCC	2	8	429071	429078	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11237	NC_015947	CTG	2	6	429137	429142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205794
11238	NC_015947	CTG	2	6	429149	429154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205794
11239	NC_015947	GCT	2	6	429184	429189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205794
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11483	NC_015947	GT	3	6	438787	438792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11484	NC_015947	CCAA	2	8	438794	438801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11485	NC_015947	CGG	2	6	438823	438828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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