MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015947	CCA	2	6	20394	20399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205440
502	NC_015947	CG	4	8	20433	20440	0 %	0 %	50 %	50 %	344205440
503	NC_015947	CCTT	2	8	20441	20448	0 %	50 %	0 %	50 %	344205440
504	NC_015947	CAG	2	6	20455	20460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205440
505	NC_015947	GCC	2	6	20534	20539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205440
506	NC_015947	GGT	2	6	20557	20562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205440
507	NC_015947	CGG	2	6	20661	20666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205440
508	NC_015947	TGCT	2	8	20672	20679	0 %	50 %	25 %	25 %	344205440
509	NC_015947	GCAGC	2	10	20728	20737	20 %	0 %	40 %	40 %	344205440
510	NC_015947	CAG	3	9	20803	20811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205440
511	NC_015947	CGC	2	6	20817	20822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205440
512	NC_015947	GGCT	2	8	20843	20850	0 %	25 %	50 %	25 %	344205440
513	NC_015947	TCC	2	6	20861	20866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205440
514	NC_015947	GGC	2	6	20875	20880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205440
515	NC_015947	TGA	2	6	20925	20930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205440
516	NC_015947	CTT	2	6	20938	20943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205440
517	NC_015947	CGA	2	6	21042	21047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205440
518	NC_015947	CGGC	2	8	21080	21087	0 %	0 %	50 %	50 %	344205440
519	NC_015947	CGTG	2	8	21188	21195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
520	NC_015947	CCTT	2	8	21242	21249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_015947	CCAT	2	8	21298	21305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_015947	TCGG	2	8	21312	21319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_015947	CGC	2	6	21378	21383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_015947	GTT	2	6	21472	21477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015947	GTT	2	6	21523	21528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205441
526	NC_015947	TCG	2	6	21584	21589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205441
527	NC_015947	TGA	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205441
528	NC_015947	GCG	2	6	21666	21671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205441
529	NC_015947	CG	3	6	21757	21762	0 %	0 %	50 %	50 %	344205441
530	NC_015947	CCA	2	6	21789	21794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205441
531	NC_015947	GCA	2	6	21797	21802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
532	NC_015947	GTGG	2	8	21805	21812	0 %	25 %	75 %	0 %	344205441
533	NC_015947	CGG	2	6	21876	21881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205441
534	NC_015947	CCA	2	6	21888	21893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205441
535	NC_015947	CGA	2	6	21951	21956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
536	NC_015947	GAT	2	6	21982	21987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205441
537	NC_015947	CGG	2	6	21993	21998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205441
538	NC_015947	CAG	2	6	22072	22077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
539	NC_015947	GCA	2	6	22132	22137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
540	NC_015947	GCA	3	9	22143	22151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
541	NC_015947	CAG	2	6	22186	22191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
542	NC_015947	GGTCG	2	10	22216	22225	0 %	20 %	60 %	20 %	344205441
543	NC_015947	CCA	2	6	22239	22244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205441
544	NC_015947	GCCG	2	8	22252	22259	0 %	0 %	50 %	50 %	344205441
545	NC_015947	GGT	2	6	22275	22280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205441
546	NC_015947	GCA	2	6	22320	22325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
547	NC_015947	CTT	2	6	22327	22332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205441
548	NC_015947	GGT	2	6	22384	22389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205441
549	NC_015947	CGGC	2	8	22394	22401	0 %	0 %	50 %	50 %	344205441
550	NC_015947	CAG	2	6	22405	22410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
551	NC_015947	ATCG	2	8	22468	22475	25 %	25 %	25 %	25 %	344205441
552	NC_015947	CG	3	6	22485	22490	0 %	0 %	50 %	50 %	344205441
553	NC_015947	GCT	3	9	22509	22517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205441
554	NC_015947	GC	3	6	22532	22537	0 %	0 %	50 %	50 %	344205441
555	NC_015947	AGC	2	6	22538	22543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205441
556	NC_015947	TCG	2	6	22559	22564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205441
557	NC_015947	TAG	2	6	22565	22570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205441
558	NC_015947	GGC	2	6	22599	22604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205441
559	NC_015947	AAG	2	6	22670	22675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205441
560	NC_015947	CGG	2	6	22680	22685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205441
561	NC_015947	GGA	2	6	22710	22715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015947	GCC	3	9	22783	22791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_015947	GCGT	2	8	22818	22825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
564	NC_015947	GCC	2	6	22827	22832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_015947	CGC	2	6	22867	22872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205442
566	NC_015947	CTG	2	6	22894	22899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205442
567	NC_015947	GGC	2	6	22911	22916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205442
568	NC_015947	ACCG	2	8	22932	22939	25 %	0 %	25 %	50 %	344205442
569	NC_015947	GTGCAG	2	12	22951	22962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344205442
570	NC_015947	CG	3	6	22965	22970	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
571	NC_015947	GCCA	2	8	23002	23009	25 %	0 %	25 %	50 %	344205442
572	NC_015947	GCCG	2	8	23029	23036	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
573	NC_015947	GC	3	6	23048	23053	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
574	NC_015947	GC	3	6	23149	23154	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
575	NC_015947	GGCCAG	2	12	23218	23229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344205442
576	NC_015947	TGC	2	6	23270	23275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205442
577	NC_015947	TCC	2	6	23305	23310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205442
578	NC_015947	GGC	2	6	23311	23316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205442
579	NC_015947	TGC	2	6	23318	23323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205442
580	NC_015947	GC	3	6	23333	23338	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
581	NC_015947	GGC	2	6	23360	23365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205442
582	NC_015947	ACA	2	6	23387	23392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205442
583	NC_015947	GC	3	6	23405	23410	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
584	NC_015947	GCCG	2	8	23422	23429	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
585	NC_015947	ACA	2	6	23441	23446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205442
586	NC_015947	CGC	2	6	23448	23453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205442
587	NC_015947	TGGC	2	8	23472	23479	0 %	25 %	50 %	25 %	344205442
588	NC_015947	GC	3	6	23494	23499	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
589	NC_015947	GC	3	6	23515	23520	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
590	NC_015947	GGT	2	6	23524	23529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205442
591	NC_015947	GCT	3	9	23553	23561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205442
592	NC_015947	GGC	2	6	23619	23624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205442
593	NC_015947	CCG	2	6	23642	23647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205442
594	NC_015947	ACA	2	6	23660	23665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205442
595	NC_015947	CAG	3	9	23683	23691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
596	NC_015947	GC	3	6	23757	23762	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
597	NC_015947	CCG	2	6	23785	23790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205442
598	NC_015947	CGG	2	6	23817	23822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205442
599	NC_015947	GATC	2	8	23826	23833	25 %	25 %	25 %	25 %	344205442
600	NC_015947	TGG	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205442
601	NC_015947	CG	3	6	23859	23864	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
602	NC_015947	GCCG	3	12	23887	23898	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
603	NC_015947	GTG	2	6	23905	23910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205442
604	NC_015947	GCACC	2	10	23940	23949	20 %	0 %	20 %	60 %	344205442
605	NC_015947	TGG	2	6	24049	24054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205442
606	NC_015947	GCT	2	6	24075	24080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205442
607	NC_015947	CGA	2	6	24117	24122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
608	NC_015947	CGT	2	6	24129	24134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205442
609	NC_015947	CGA	2	6	24147	24152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
610	NC_015947	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205442
611	NC_015947	GGC	3	9	24318	24326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205442
612	NC_015947	GC	3	6	24325	24330	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
613	NC_015947	GCA	2	6	24350	24355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
614	NC_015947	GCAC	2	8	24360	24367	25 %	0 %	25 %	50 %	344205442
615	NC_015947	CGA	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
616	NC_015947	GCA	2	6	24449	24454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
617	NC_015947	GCC	3	9	24476	24484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205442
618	NC_015947	AGC	2	6	24521	24526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
619	NC_015947	GTT	2	6	24598	24603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344205442
620	NC_015947	CAG	2	6	24699	24704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
621	NC_015947	ACG	2	6	24719	24724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205442
622	NC_015947	CTG	2	6	24754	24759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205442
623	NC_015947	GC	3	6	24804	24809	0 %	0 %	50 %	50 %	344205442
624	NC_015947	CGG	2	6	24904	24909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205442
625	NC_015947	TGG	3	9	24928	24936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205442
626	NC_015947	GCCG	2	8	24952	24959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_015947	CGGC	2	8	25006	25013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_015947	GGC	2	6	25037	25042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015947	CAG	2	6	25067	25072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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758	NC_015947	GGC	2	6	30124	30129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205448
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