MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015947	GCG	2	6	225459	225464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205620
6002	NC_015947	CGC	2	6	225553	225558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205620
6003	NC_015947	GGC	2	6	225629	225634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205620
6004	NC_015947	CG	3	6	225667	225672	0 %	0 %	50 %	50 %	344205620
6005	NC_015947	CGA	2	6	225691	225696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205620
6006	NC_015947	CGGC	2	8	225884	225891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_015947	GCCG	2	8	225917	225924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_015947	CCG	2	6	225936	225941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_015947	CG	3	6	225940	225945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_015947	CG	3	6	225973	225978	0 %	0 %	50 %	50 %	344205621
6011	NC_015947	CCGGC	2	10	225988	225997	0 %	0 %	40 %	60 %	344205621
6012	NC_015947	CGC	2	6	226045	226050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205621
6013	NC_015947	CAG	2	6	226055	226060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205621
6014	NC_015947	CGT	2	6	226096	226101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205621
6015	NC_015947	GCT	2	6	226177	226182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205621
6016	NC_015947	TTC	2	6	226214	226219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205621
6017	NC_015947	CATCG	2	10	226220	226229	20 %	20 %	20 %	40 %	344205621
6018	NC_015947	GCCCG	2	10	226316	226325	0 %	0 %	40 %	60 %	344205621
6019	NC_015947	GCC	2	6	226361	226366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205621
6020	NC_015947	GCC	2	6	226494	226499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205621
6021	NC_015947	GGCG	2	8	226537	226544	0 %	0 %	75 %	25 %	344205621
6022	NC_015947	GTC	2	6	226574	226579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205621
6023	NC_015947	ACC	2	6	226605	226610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205621
6024	NC_015947	CCA	2	6	226657	226662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205621
6025	NC_015947	CG	3	6	226697	226702	0 %	0 %	50 %	50 %	344205621
6026	NC_015947	CAG	2	6	226744	226749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205621
6027	NC_015947	CAG	2	6	226751	226756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205621
6028	NC_015947	TGG	2	6	226783	226788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205621
6029	NC_015947	CCG	2	6	226845	226850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_015947	CAC	2	6	226907	226912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_015947	TCA	2	6	226941	226946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_015947	ACC	2	6	226991	226996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_015947	GCG	2	6	227080	227085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_015947	GTCG	2	8	227153	227160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_015947	ATGTC	2	10	227267	227276	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6036	NC_015947	AC	3	6	227326	227331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_015947	CCA	2	6	227354	227359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
6038	NC_015947	CGC	2	6	227390	227395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
6039	NC_015947	ACC	2	6	227434	227439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
6040	NC_015947	TGG	2	6	227444	227449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205622
6041	NC_015947	CGTG	2	8	227463	227470	0 %	25 %	50 %	25 %	344205622
6042	NC_015947	TTC	2	6	227481	227486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205622
6043	NC_015947	CCA	2	6	227555	227560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
6044	NC_015947	CCG	2	6	227591	227596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
6045	NC_015947	CTG	2	6	227599	227604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6046	NC_015947	GCC	2	6	227627	227632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
6047	NC_015947	GC	3	6	227638	227643	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6048	NC_015947	CTG	2	6	227644	227649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6049	NC_015947	CTG	2	6	227746	227751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6050	NC_015947	CG	3	6	227769	227774	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6051	NC_015947	GC	3	6	227798	227803	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6052	NC_015947	CTG	2	6	227854	227859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6053	NC_015947	GCA	2	6	227895	227900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6054	NC_015947	TTC	2	6	227902	227907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205622
6055	NC_015947	GC	3	6	227921	227926	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6056	NC_015947	CAC	2	6	228018	228023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
6057	NC_015947	AGC	2	6	228029	228034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6058	NC_015947	CTG	2	6	228049	228054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6059	NC_015947	CGC	2	6	228059	228064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
6060	NC_015947	CGG	2	6	228126	228131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205622
6061	NC_015947	TCG	2	6	228232	228237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6062	NC_015947	GGC	2	6	228256	228261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205622
6063	NC_015947	ACA	2	6	228335	228340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205622
6064	NC_015947	CCG	2	6	228354	228359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
6065	NC_015947	AACCTG	2	12	228367	228378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344205622
6066	NC_015947	CG	3	6	228446	228451	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6067	NC_015947	CG	3	6	228543	228548	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6068	NC_015947	ATG	2	6	228565	228570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205622
6069	NC_015947	GC	3	6	228645	228650	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6070	NC_015947	CGA	2	6	228759	228764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6071	NC_015947	CCGC	2	8	228863	228870	0 %	0 %	25 %	75 %	344205622
6072	NC_015947	TTC	2	6	228928	228933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205622
6073	NC_015947	GAA	2	6	228978	228983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205622
6074	NC_015947	CCT	2	6	229019	229024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205622
6075	NC_015947	CGT	2	6	229055	229060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6076	NC_015947	CGC	2	6	229074	229079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
6077	NC_015947	GTG	2	6	229111	229116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205622
6078	NC_015947	GC	3	6	229146	229151	0 %	0 %	50 %	50 %	344205622
6079	NC_015947	TGA	2	6	229184	229189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205622
6080	NC_015947	GCT	2	6	229229	229234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205622
6081	NC_015947	GAA	2	6	229329	229334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205622
6082	NC_015947	ACCGC	2	10	229433	229442	20 %	0 %	20 %	60 %	344205622
6083	NC_015947	GCC	2	6	229477	229482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205622
6084	NC_015947	TCC	2	6	229555	229560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205622
6085	NC_015947	ATGTAC	2	12	229561	229572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344205622
6086	NC_015947	ACC	2	6	229594	229599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
6087	NC_015947	TAC	2	6	229600	229605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205622
6088	NC_015947	CCA	2	6	229622	229627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205622
6089	NC_015947	CCG	2	6	229746	229751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_015947	CG	3	6	229750	229755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_015947	GCCG	2	8	229761	229768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_015947	ATC	2	6	229792	229797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_015947	TGC	2	6	229878	229883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205623
6094	NC_015947	TTC	2	6	230063	230068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205623
6095	NC_015947	CAA	2	6	230092	230097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205623
6096	NC_015947	GC	3	6	230138	230143	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
6097	NC_015947	GAA	2	6	230168	230173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205623
6098	NC_015947	GC	3	6	230233	230238	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
6099	NC_015947	CGG	2	6	230250	230255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205623
6100	NC_015947	AAG	3	9	230276	230284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205623
6101	NC_015947	CG	3	6	230342	230347	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
6102	NC_015947	CGC	2	6	230383	230388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205623
6103	NC_015947	TTC	3	9	230405	230413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205623
6104	NC_015947	TAC	2	6	230432	230437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205623
6105	NC_015947	CG	3	6	230445	230450	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
6106	NC_015947	CTG	2	6	230453	230458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205623
6107	NC_015947	CGA	2	6	230494	230499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205623
6108	NC_015947	GC	3	6	230502	230507	0 %	0 %	50 %	50 %	344205623
6109	NC_015947	GTG	2	6	230537	230542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205623
6110	NC_015947	AGC	2	6	230580	230585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205623
6111	NC_015947	CGG	2	6	230650	230655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205623
6112	NC_015947	GCA	2	6	230695	230700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205623
6113	NC_015947	AAG	2	6	230738	230743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205623
6114	NC_015947	CTT	2	6	230803	230808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205623
6115	NC_015947	CGC	2	6	230813	230818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205623
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6117	NC_015947	CAGC	2	8	231092	231099	25 %	0 %	25 %	50 %	344205624
6118	NC_015947	GC	3	6	231122	231127	0 %	0 %	50 %	50 %	344205624
6119	NC_015947	TGC	2	6	231145	231150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205624
6120	NC_015947	GAT	2	6	231164	231169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205624
6121	NC_015947	GCA	3	9	231223	231231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
6122	NC_015947	GCA	2	6	231265	231270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
6123	NC_015947	CAG	2	6	231302	231307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
6124	NC_015947	GCC	2	6	231383	231388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205624
6125	NC_015947	CAG	2	6	231416	231421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205624
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6127	NC_015947	CGT	2	6	231448	231453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205624
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6244	NC_015947	GCA	2	6	236804	236809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6246	NC_015947	ATCC	2	8	236827	236834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6368	NC_015947	CGG	2	6	241362	241367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6369	NC_015947	CG	4	8	241423	241430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6370	NC_015947	CG	3	6	241433	241438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6371	NC_015947	CG	3	6	241441	241446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6372	NC_015947	GAC	3	9	241461	241469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6374	NC_015947	CTA	2	6	241574	241579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6375	NC_015947	GC	3	6	241660	241665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6376	NC_015947	TCCC	2	8	241695	241702	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6377	NC_015947	GGGA	2	8	241717	241724	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6378	NC_015947	GCA	2	6	241835	241840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205635
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6382	NC_015947	GCA	2	6	241992	241997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205635
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6484	NC_015947	CGC	2	6	245425	245430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205637
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6491	NC_015947	CAG	2	6	245587	245592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205637
6492	NC_015947	CTG	2	6	245681	245686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205637
6493	NC_015947	TGG	2	6	245696	245701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205637
6494	NC_015947	CAG	2	6	245705	245710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205637
6495	NC_015947	CGC	2	6	245735	245740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205637
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