MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_015947	GGA	2	6	207753	207758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344205605
5503	NC_015947	CCG	2	6	207767	207772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205605
5504	NC_015947	CAGC	2	8	207783	207790	25 %	0 %	25 %	50 %	344205605
5505	NC_015947	CAG	2	6	207817	207822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5506	NC_015947	GAC	2	6	207826	207831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5507	NC_015947	CTG	2	6	207853	207858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5508	NC_015947	CCG	2	6	207899	207904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205605
5509	NC_015947	CGA	2	6	207966	207971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5510	NC_015947	CG	3	6	208002	208007	0 %	0 %	50 %	50 %	344205605
5511	NC_015947	CCG	2	6	208018	208023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_015947	TCCC	2	8	208042	208049	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5513	NC_015947	GCAC	2	8	208054	208061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_015947	GTG	2	6	208175	208180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205606
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5517	NC_015947	GGC	2	6	208357	208362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205606
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5519	NC_015947	CAA	2	6	208444	208449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205606
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5521	NC_015947	GC	3	6	208459	208464	0 %	0 %	50 %	50 %	344205606
5522	NC_015947	CAC	2	6	208475	208480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205606
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5535	NC_015947	TGGTG	2	10	208911	208920	0 %	40 %	60 %	0 %	344205606
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5537	NC_015947	GCT	2	6	208993	208998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205606
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5543	NC_015947	GTC	2	6	209308	209313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205606
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5545	NC_015947	GAA	2	6	209342	209347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205606
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5549	NC_015947	CGGC	2	8	209450	209457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_015947	GCCG	2	8	209510	209517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_015947	GTT	2	6	209536	209541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_015947	GC	3	6	209561	209566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_015947	CAG	2	6	209643	209648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_015947	CCA	2	6	209682	209687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_015947	ATCA	2	8	209699	209706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_015947	GGC	2	6	209786	209791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015947	GAC	2	6	209838	209843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205607
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5559	NC_015947	ATGT	2	8	209986	209993	25 %	50 %	25 %	0 %	344205607
5560	NC_015947	GCA	2	6	210054	210059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205607
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5565	NC_015947	TGG	2	6	210194	210199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205607
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5595	NC_015947	TGA	2	6	211275	211280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205608
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5604	NC_015947	GC	3	6	211490	211495	0 %	0 %	50 %	50 %	344205608
5605	NC_015947	GGC	2	6	211512	211517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205608
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5608	NC_015947	CGG	2	6	211567	211572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205608
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5621	NC_015947	GGC	2	6	212149	212154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205608
5622	NC_015947	ATCGAT	2	12	212156	212167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344205608
5623	NC_015947	GC	3	6	212210	212215	0 %	0 %	50 %	50 %	344205608
5624	NC_015947	GC	3	6	212234	212239	0 %	0 %	50 %	50 %	344205608
5625	NC_015947	GCA	2	6	212248	212253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205608
5626	NC_015947	GCC	2	6	212278	212283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205608
5627	NC_015947	GGC	2	6	212330	212335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205608
5628	NC_015947	TTCG	2	8	212380	212387	0 %	50 %	25 %	25 %	344205608
5629	NC_015947	CTG	2	6	212414	212419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205608
5630	NC_015947	TGC	2	6	212524	212529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205608
5631	NC_015947	CAAC	2	8	212530	212537	50 %	0 %	0 %	50 %	344205608
5632	NC_015947	GCC	2	6	212546	212551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205608
5633	NC_015947	TGA	2	6	212587	212592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205608
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5635	NC_015947	GCA	2	6	212686	212691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205608
5636	NC_015947	TGCG	2	8	212703	212710	0 %	25 %	50 %	25 %	344205608
5637	NC_015947	GCT	3	9	212713	212721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205608
5638	NC_015947	GGC	2	6	212722	212727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205608
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5642	NC_015947	GCA	2	6	212818	212823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205608
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5644	NC_015947	GCT	2	6	212884	212889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205608
5645	NC_015947	TGC	2	6	212898	212903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205608
5646	NC_015947	GAT	2	6	212912	212917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205608
5647	NC_015947	TGGC	2	8	212945	212952	0 %	25 %	50 %	25 %	344205608
5648	NC_015947	GCTG	2	8	213000	213007	0 %	25 %	50 %	25 %	344205608
5649	NC_015947	CTG	2	6	213023	213028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205608
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5652	NC_015947	CTG	2	6	213173	213178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205608
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5654	NC_015947	GCC	2	6	213206	213211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205608
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5660	NC_015947	GC	3	6	213339	213344	0 %	0 %	50 %	50 %	344205608
5661	NC_015947	GCC	2	6	213415	213420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205609
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5668	NC_015947	TGC	2	6	213753	213758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5670	NC_015947	TGCGCC	2	12	213793	213804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205610
5671	NC_015947	GC	3	6	213854	213859	0 %	0 %	50 %	50 %	344205610
5672	NC_015947	GGCC	2	8	213866	213873	0 %	0 %	50 %	50 %	344205610
5673	NC_015947	GCC	2	6	213912	213917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205610
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5690	NC_015947	GCTGCC	2	12	214358	214369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205610
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5702	NC_015947	GCT	2	6	214681	214686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205610
5703	NC_015947	GCT	2	6	214754	214759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205610
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5710	NC_015947	CGGC	2	8	215061	215068	0 %	0 %	50 %	50 %	344205611
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5714	NC_015947	CAG	2	6	215182	215187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205611
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5716	NC_015947	GCA	2	6	215292	215297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205611
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5719	NC_015947	CTG	2	6	215446	215451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205611
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5722	NC_015947	CGCA	2	8	215523	215530	25 %	0 %	25 %	50 %	344205611
5723	NC_015947	GC	4	8	215540	215547	0 %	0 %	50 %	50 %	344205611
5724	NC_015947	CGG	2	6	215559	215564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205611
5725	NC_015947	CAG	2	6	215575	215580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205611
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5727	NC_015947	GCGT	2	8	215657	215664	0 %	25 %	50 %	25 %	344205611
5728	NC_015947	TGG	2	6	215706	215711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205611
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5731	NC_015947	GCG	2	6	215762	215767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205611
5732	NC_015947	ATC	2	6	215801	215806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205611
5733	NC_015947	GTA	2	6	215812	215817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205611
5734	NC_015947	GCAGGC	2	12	215880	215891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344205611
5735	NC_015947	GC	3	6	215947	215952	0 %	0 %	50 %	50 %	344205611
5736	NC_015947	ATGGC	2	10	215957	215966	20 %	20 %	40 %	20 %	344205611
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5738	NC_015947	CG	5	10	216166	216175	0 %	0 %	50 %	50 %	344205611
5739	NC_015947	CGG	2	6	216183	216188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205611
5740	NC_015947	CTT	2	6	216237	216242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205611
5741	NC_015947	TGG	2	6	216254	216259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205611
5742	NC_015947	GCC	2	6	216395	216400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205611
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5744	NC_015947	GCCACC	2	12	216466	216477	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344205611
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5746	NC_015947	CTG	2	6	216544	216549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205611
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5748	NC_015947	CGG	2	6	216643	216648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205611
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5868	NC_015947	GGC	2	6	221180	221185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205615
5869	NC_015947	GAA	2	6	221201	221206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205615
5870	NC_015947	GGT	2	6	221254	221259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5871	NC_015947	GCCG	2	8	221260	221267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5872	NC_015947	CGGC	2	8	221316	221323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5873	NC_015947	CCG	2	6	221340	221345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5874	NC_015947	CGTC	2	8	221428	221435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5875	NC_015947	GCC	2	6	221441	221446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205616
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5979	NC_015947	GCGCG	2	10	224705	224714	0 %	0 %	60 %	40 %	344205619
5980	NC_015947	CTGG	2	8	224735	224742	0 %	25 %	50 %	25 %	344205619
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5986	NC_015947	ACG	2	6	225003	225008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205620
5987	NC_015947	CGCA	2	8	225032	225039	25 %	0 %	25 %	50 %	344205620
5988	NC_015947	GCA	2	6	225129	225134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205620
5989	NC_015947	GTGCTG	2	12	225143	225154	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344205620
5990	NC_015947	TTC	2	6	225161	225166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205620
5991	NC_015947	GCGAT	2	10	225180	225189	20 %	20 %	40 %	20 %	344205620
5992	NC_015947	GCT	2	6	225190	225195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205620
5993	NC_015947	GCT	2	6	225202	225207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205620
5994	NC_015947	CAC	2	6	225241	225246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205620
5995	NC_015947	CTG	2	6	225317	225322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205620
5996	NC_015947	GC	4	8	225373	225380	0 %	0 %	50 %	50 %	344205620
5997	NC_015947	GGC	2	6	225412	225417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205620
5998	NC_015947	TGA	2	6	225424	225429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205620
5999	NC_015947	TGGC	2	8	225431	225438	0 %	25 %	50 %	25 %	344205620
6000	NC_015947	GAAC	2	8	225448	225455	50 %	0 %	25 %	25 %	344205620

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