MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 118295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015947	GCA	2	6	190056	190061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205587
5002	NC_015947	GCA	2	6	190128	190133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205587
5003	NC_015947	CG	3	6	190134	190139	0 %	0 %	50 %	50 %	344205587
5004	NC_015947	GCC	2	6	190168	190173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205587
5005	NC_015947	TCA	2	6	190178	190183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205587
5006	NC_015947	CG	3	6	190193	190198	0 %	0 %	50 %	50 %	344205587
5007	NC_015947	GTG	2	6	190201	190206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205587
5008	NC_015947	CG	3	6	190208	190213	0 %	0 %	50 %	50 %	344205587
5009	NC_015947	GACGTG	2	12	190237	190248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344205587
5010	NC_015947	GC	4	8	190274	190281	0 %	0 %	50 %	50 %	344205587
5011	NC_015947	TGC	2	6	190315	190320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5012	NC_015947	CGA	2	6	190361	190366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5013	NC_015947	CTG	2	6	190368	190373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5014	NC_015947	GCTG	2	8	190393	190400	0 %	25 %	50 %	25 %	344205588
5015	NC_015947	CG	3	6	190453	190458	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5016	NC_015947	GC	3	6	190461	190466	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5017	NC_015947	CGC	2	6	190530	190535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5018	NC_015947	GCC	2	6	190544	190549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5019	NC_015947	GCT	2	6	190571	190576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5020	NC_015947	CG	3	6	190610	190615	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5021	NC_015947	TCG	2	6	190621	190626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5022	NC_015947	GGCCTC	2	12	190685	190696	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344205588
5023	NC_015947	GCC	2	6	190732	190737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5024	NC_015947	GGT	3	9	190739	190747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205588
5025	NC_015947	TGC	2	6	190753	190758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5026	NC_015947	GCC	2	6	190812	190817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5027	NC_015947	CACC	2	8	190829	190836	25 %	0 %	0 %	75 %	344205588
5028	NC_015947	CCGC	2	8	190853	190860	0 %	0 %	25 %	75 %	344205588
5029	NC_015947	GTG	2	6	190866	190871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205588
5030	NC_015947	GCC	2	6	190893	190898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5031	NC_015947	TGC	2	6	190936	190941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5032	NC_015947	CGA	2	6	190961	190966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5033	NC_015947	CCG	2	6	190999	191004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5034	NC_015947	GC	4	8	191006	191013	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5035	NC_015947	TCCG	2	8	191039	191046	0 %	25 %	25 %	50 %	344205588
5036	NC_015947	CGC	2	6	191054	191059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5037	NC_015947	CTT	2	6	191141	191146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344205588
5038	NC_015947	CAT	2	6	191234	191239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205588
5039	NC_015947	TAC	2	6	191265	191270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205588
5040	NC_015947	CCG	2	6	191309	191314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5041	NC_015947	GC	3	6	191337	191342	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5042	NC_015947	GAT	2	6	191367	191372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205588
5043	NC_015947	TGA	2	6	191449	191454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205588
5044	NC_015947	CTG	2	6	191508	191513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5045	NC_015947	AGA	2	6	191515	191520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344205588
5046	NC_015947	CTG	2	6	191523	191528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5047	NC_015947	GCC	2	6	191545	191550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5048	NC_015947	CGG	2	6	191628	191633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205588
5049	NC_015947	GTG	2	6	191634	191639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205588
5050	NC_015947	CAG	2	6	191718	191723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5051	NC_015947	GCC	2	6	191731	191736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5052	NC_015947	CG	3	6	191755	191760	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5053	NC_015947	GGTG	2	8	191807	191814	0 %	25 %	75 %	0 %	344205588
5054	NC_015947	CTG	2	6	191832	191837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205588
5055	NC_015947	CGC	2	6	191843	191848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5056	NC_015947	ATGT	2	8	191853	191860	25 %	50 %	25 %	0 %	344205588
5057	NC_015947	GCC	2	6	191867	191872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205588
5058	NC_015947	GC	3	6	191926	191931	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5059	NC_015947	TGGCGC	2	12	191932	191943	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344205588
5060	NC_015947	GC	4	8	191940	191947	0 %	0 %	50 %	50 %	344205588
5061	NC_015947	GTG	2	6	191948	191953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205588
5062	NC_015947	CGG	2	6	191979	191984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_015947	ACGC	2	8	191987	191994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_015947	GACT	2	8	191999	192006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_015947	GCCCAG	2	12	192025	192036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344205589
5066	NC_015947	GGCT	2	8	192125	192132	0 %	25 %	50 %	25 %	344205589
5067	NC_015947	GCG	2	6	192133	192138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205589
5068	NC_015947	GCA	3	9	192168	192176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205589
5069	NC_015947	CGG	2	6	192189	192194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205589
5070	NC_015947	GTG	2	6	192272	192277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205589
5071	NC_015947	AG	3	6	192323	192328	50 %	0 %	50 %	0 %	344205589
5072	NC_015947	CG	3	6	192336	192341	0 %	0 %	50 %	50 %	344205589
5073	NC_015947	TGCGC	2	10	192350	192359	0 %	20 %	40 %	40 %	344205589
5074	NC_015947	GCC	2	6	192409	192414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205589
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5077	NC_015947	CAGC	2	8	192750	192757	25 %	0 %	25 %	50 %	344205589
5078	NC_015947	GAT	2	6	192784	192789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205589
5079	NC_015947	GCA	2	6	192832	192837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205590
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5081	NC_015947	GAT	2	6	192905	192910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205590
5082	NC_015947	GAT	2	6	192923	192928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205590
5083	NC_015947	GCG	2	6	192945	192950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205590
5084	NC_015947	GCTG	2	8	192982	192989	0 %	25 %	50 %	25 %	344205590
5085	NC_015947	GCA	2	6	193204	193209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205590
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5088	NC_015947	CG	4	8	193319	193326	0 %	0 %	50 %	50 %	344205590
5089	NC_015947	GGC	2	6	193385	193390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205590
5090	NC_015947	CCA	2	6	193400	193405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205590
5091	NC_015947	TCG	2	6	193418	193423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205591
5092	NC_015947	CG	3	6	193430	193435	0 %	0 %	50 %	50 %	344205591
5093	NC_015947	AGC	2	6	193495	193500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205591
5094	NC_015947	CG	3	6	193539	193544	0 %	0 %	50 %	50 %	344205591
5095	NC_015947	CAG	2	6	193572	193577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205591
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5102	NC_015947	CGA	2	6	193775	193780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205591
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5105	NC_015947	GCA	2	6	193940	193945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205591
5106	NC_015947	GCC	2	6	193992	193997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205591
5107	NC_015947	CTG	2	6	194004	194009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205591
5108	NC_015947	TGA	2	6	194021	194026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344205591
5109	NC_015947	ATC	2	6	194029	194034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205591
5110	NC_015947	ACCG	2	8	194103	194110	25 %	0 %	25 %	50 %	344205591
5111	NC_015947	CAG	2	6	194136	194141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205591
5112	NC_015947	CG	3	6	194159	194164	0 %	0 %	50 %	50 %	344205591
5113	NC_015947	CGG	2	6	194204	194209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205591
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5120	NC_015947	CAGG	2	8	194400	194407	25 %	0 %	50 %	25 %	344205591
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5122	NC_015947	CA	3	6	194504	194509	50 %	0 %	0 %	50 %	344205591
5123	NC_015947	CAG	2	6	194520	194525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205591
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5240	NC_015947	CG	4	8	199056	199063	0 %	0 %	50 %	50 %	344205598
5241	NC_015947	GCTGGA	2	12	199092	199103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344205598
5242	NC_015947	ACT	2	6	199130	199135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205598
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5244	NC_015947	GC	3	6	199149	199154	0 %	0 %	50 %	50 %	344205598
5245	NC_015947	ACC	2	6	199213	199218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344205598
5246	NC_015947	TGG	2	6	199244	199249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205598
5247	NC_015947	CCG	2	6	199256	199261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205598
5248	NC_015947	CTG	2	6	199262	199267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205598
5249	NC_015947	CGT	3	9	199269	199277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205598
5250	NC_015947	CGA	2	6	199278	199283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205598
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5264	NC_015947	GCCG	2	8	199632	199639	0 %	0 %	50 %	50 %	344205598
5265	NC_015947	G	7	7	199698	199704	0 %	0 %	100 %	0 %	344205598
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5272	NC_015947	TCG	2	6	200006	200011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205598
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5274	NC_015947	GCCG	2	8	200070	200077	0 %	0 %	50 %	50 %	344205598
5275	NC_015947	CGA	2	6	200103	200108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205598
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5322	NC_015947	GCG	2	6	201929	201934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5324	NC_015947	GCCC	2	8	201991	201998	0 %	0 %	25 %	75 %	344205601
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5344	NC_015947	TCCC	2	8	202689	202696	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5345	NC_015947	GCC	2	6	202704	202709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5351	NC_015947	GCT	2	6	202891	202896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205602
5352	NC_015947	GT	3	6	202920	202925	0 %	50 %	50 %	0 %	344205602
5353	NC_015947	CCG	3	9	202926	202934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205602
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5357	NC_015947	CGGT	2	8	203010	203017	0 %	25 %	50 %	25 %	344205602
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5362	NC_015947	CGCTGT	2	12	203058	203069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205602
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5365	NC_015947	TGC	2	6	203106	203111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205602
5366	NC_015947	GCT	2	6	203116	203121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205602
5367	NC_015947	GCG	2	6	203136	203141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205602
5368	NC_015947	ACCT	2	8	203159	203166	25 %	25 %	0 %	50 %	344205602
5369	NC_015947	CG	3	6	203186	203191	0 %	0 %	50 %	50 %	344205602
5370	NC_015947	CTG	2	6	203252	203257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205602
5371	NC_015947	CAT	2	6	203263	203268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205602
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5373	NC_015947	TGC	2	6	203334	203339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205602
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5375	NC_015947	TCGT	2	8	203459	203466	0 %	50 %	25 %	25 %	344205602
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5379	NC_015947	TGG	2	6	203574	203579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205602
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5382	NC_015947	CAG	2	6	203761	203766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205602
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5384	NC_015947	CGG	2	6	203851	203856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205602
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5386	NC_015947	GCG	2	6	203876	203881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205602
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5388	NC_015947	GT	3	6	203895	203900	0 %	50 %	50 %	0 %	344205602
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5391	NC_015947	GCA	2	6	203953	203958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205602
5392	NC_015947	GC	4	8	203959	203966	0 %	0 %	50 %	50 %	344205602
5393	NC_015947	GCCG	2	8	204005	204012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5394	NC_015947	CGGC	2	8	204051	204058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5395	NC_015947	GGGT	2	8	204065	204072	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_015947	GCA	2	6	204102	204107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205603
5397	NC_015947	CGA	2	6	204195	204200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205603
5398	NC_015947	GC	4	8	204202	204209	0 %	0 %	50 %	50 %	344205603
5399	NC_015947	GAC	2	6	204233	204238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205603
5400	NC_015947	CGC	2	6	204247	204252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205603
5401	NC_015947	CGG	3	9	204261	204269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205603
5402	NC_015947	CCT	2	6	204300	204305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344205603
5403	NC_015947	CGG	2	6	204327	204332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205603
5404	NC_015947	GCG	2	6	204379	204384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205603
5405	NC_015947	GCAGG	2	10	204450	204459	20 %	0 %	60 %	20 %	344205603
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5422	NC_015947	CTG	2	6	204877	204882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205603
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5427	NC_015947	CAG	2	6	205086	205091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5428	NC_015947	CAG	2	6	205102	205107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5429	NC_015947	GGGT	2	8	205127	205134	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5430	NC_015947	GCG	2	6	205164	205169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5431	NC_015947	ACCC	2	8	205213	205220	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5432	NC_015947	GACGTT	2	12	205247	205258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5433	NC_015947	TGCAGG	2	12	205276	205287	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5434	NC_015947	CG	3	6	205348	205353	0 %	0 %	50 %	50 %	344205604
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5440	NC_015947	CCAGTT	2	12	205687	205698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344205604
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5471	NC_015947	GCT	2	6	206673	206678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205605
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5474	NC_015947	TCA	2	6	206723	206728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344205605
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5487	NC_015947	TGC	2	6	207302	207307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5488	NC_015947	GCT	2	6	207360	207365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5489	NC_015947	GTG	2	6	207386	207391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344205605
5490	NC_015947	GGC	2	6	207403	207408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205605
5491	NC_015947	CAA	2	6	207429	207434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344205605
5492	NC_015947	GCC	3	9	207439	207447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205605
5493	NC_015947	GC	3	6	207471	207476	0 %	0 %	50 %	50 %	344205605
5494	NC_015947	TGGCGA	2	12	207545	207556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344205605
5495	NC_015947	CGA	2	6	207561	207566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5496	NC_015947	TGC	2	6	207596	207601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5497	NC_015947	CGA	2	6	207624	207629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344205605
5498	NC_015947	GCC	2	6	207642	207647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344205605
5499	NC_015947	TGCG	2	8	207691	207698	0 %	25 %	50 %	25 %	344205605
5500	NC_015947	GGC	2	6	207705	207710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344205605

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