MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 1797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015875	AAAAG	2	10	345	354	80 %	0 %	20 %	0 %	342162672
2	NC_015875	GAAAT	2	10	506	515	60 %	20 %	20 %	0 %	342162672
3	NC_015875	GTAAA	2	10	2446	2455	60 %	20 %	20 %	0 %	342162673
4	NC_015875	TGAAA	2	10	2745	2754	60 %	20 %	20 %	0 %	342162674
5	NC_015875	TGAAA	2	10	2974	2983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015875	AAACA	2	10	4236	4245	80 %	0 %	0 %	20 %	342162676
7	NC_015875	AAGAT	2	10	4899	4908	60 %	20 %	20 %	0 %	342162677
8	NC_015875	TAAAT	2	10	6421	6430	60 %	40 %	0 %	0 %	342162677
9	NC_015875	ACTCT	2	10	6502	6511	20 %	40 %	0 %	40 %	342162677
10	NC_015875	AAACG	2	10	7745	7754	60 %	0 %	20 %	20 %	342162677
11	NC_015875	AGTCA	2	10	7981	7990	40 %	20 %	20 %	20 %	342162677
12	NC_015875	CAATT	2	10	8043	8052	40 %	40 %	0 %	20 %	342162677
13	NC_015875	AGGAA	2	10	9059	9068	60 %	0 %	40 %	0 %	342162680
14	NC_015875	ATTGA	2	10	10477	10486	40 %	40 %	20 %	0 %	342162682
15	NC_015875	ATTCT	2	10	12611	12620	20 %	60 %	0 %	20 %	342162684
16	NC_015875	AAATG	2	10	14929	14938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015875	GAAGA	2	10	15394	15403	60 %	0 %	40 %	0 %	342162688
18	NC_015875	AGAAA	2	10	16093	16102	80 %	0 %	20 %	0 %	342162690
19	NC_015875	ATAAA	2	10	16338	16347	80 %	20 %	0 %	0 %	342162690
20	NC_015875	GCAAG	2	10	17338	17347	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015875	CTTGT	2	10	20928	20937	0 %	60 %	20 %	20 %	342162699
22	NC_015875	GATAG	2	10	21497	21506	40 %	20 %	40 %	0 %	342162700
23	NC_015875	AAACT	2	10	24840	24849	60 %	20 %	0 %	20 %	342162703
24	NC_015875	ATCTT	2	10	26122	26131	20 %	60 %	0 %	20 %	342162706
25	NC_015875	ATTGC	2	10	27897	27906	20 %	40 %	20 %	20 %	342162710
26	NC_015875	TCATC	2	10	28009	28018	20 %	40 %	0 %	40 %	342162711
27	NC_015875	TTTTG	2	10	29403	29412	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015875	AAAGG	2	10	30167	30176	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015875	TCTTG	2	10	31215	31224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015875	GGATG	2	10	31820	31829	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015875	TTGGT	2	10	31861	31870	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015875	TTGGT	2	10	32101	32110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015875	AAGGA	2	10	33026	33035	60 %	0 %	40 %	0 %	342162714
34	NC_015875	GAAGA	2	10	36615	36624	60 %	0 %	40 %	0 %	342162715
35	NC_015875	AACCA	2	10	37644	37653	60 %	0 %	0 %	40 %	342162716
36	NC_015875	ATTCA	2	10	38831	38840	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015875	AGGTA	2	10	39326	39335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015875	TGATT	2	10	40076	40085	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015875	AGAAA	2	10	45906	45915	80 %	0 %	20 %	0 %	342162729
40	NC_015875	ATGAT	2	10	47136	47145	40 %	40 %	20 %	0 %	342162732
41	NC_015875	TAAAT	2	10	47449	47458	60 %	40 %	0 %	0 %	342162734
42	NC_015875	AAGGA	2	10	47504	47513	60 %	0 %	40 %	0 %	342162735
43	NC_015875	ATGGT	2	10	47697	47706	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015875	TCAGC	2	10	47943	47952	20 %	20 %	20 %	40 %	342162736
45	NC_015875	TATTT	2	10	48542	48551	20 %	80 %	0 %	0 %	342162738
46	NC_015875	TGGAT	2	10	48784	48793	20 %	40 %	40 %	0 %	342162738
47	NC_015875	GGTTA	2	10	49506	49515	20 %	40 %	40 %	0 %	342162739
48	NC_015875	AAGGA	2	10	50031	50040	60 %	0 %	40 %	0 %	342162741
49	NC_015875	TCTTT	2	10	50464	50473	0 %	80 %	0 %	20 %	342162741
50	NC_015875	GGTCT	2	10	50575	50584	0 %	40 %	40 %	20 %	342162741
51	NC_015875	CTCAT	2	10	52654	52663	20 %	40 %	0 %	40 %	342162742
52	NC_015875	AAGAC	2	10	53466	53475	60 %	0 %	20 %	20 %	342162743
53	NC_015875	AGATA	2	10	54917	54926	60 %	20 %	20 %	0 %	342162745
54	NC_015875	TAAAA	2	10	55207	55216	80 %	20 %	0 %	0 %	342162747
55	NC_015875	ATCAA	2	10	56091	56100	60 %	20 %	0 %	20 %	342162749
56	NC_015875	GAGTG	2	10	56118	56127	20 %	20 %	60 %	0 %	342162749
57	NC_015875	GAAAG	2	10	56924	56933	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015875	GAAAA	2	10	57486	57495	80 %	0 %	20 %	0 %	342162753
59	NC_015875	TTGTA	2	10	57554	57563	20 %	60 %	20 %	0 %	342162753
60	NC_015875	GATGA	2	10	57988	57997	40 %	20 %	40 %	0 %	342162754
61	NC_015875	TGAAC	2	10	58344	58353	40 %	20 %	20 %	20 %	342162754
62	NC_015875	TGCGT	2	10	59019	59028	0 %	40 %	40 %	20 %	342162754
63	NC_015875	GAAGC	2	10	59456	59465	40 %	0 %	40 %	20 %	342162754
64	NC_015875	GAGGG	2	10	61576	61585	20 %	0 %	80 %	0 %	342162754
65	NC_015875	AATGT	2	10	61935	61944	40 %	40 %	20 %	0 %	342162754
66	NC_015875	GGTCT	2	10	62574	62583	0 %	40 %	40 %	20 %	342162755
67	NC_015875	TCCAG	2	10	63594	63603	20 %	20 %	20 %	40 %	342162756
68	NC_015875	ATGGT	2	10	64841	64850	20 %	40 %	40 %	0 %	342162758
69	NC_015875	CTTTT	2	10	66009	66018	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015875	TACTT	2	10	68444	68453	20 %	60 %	0 %	20 %	342162763
71	NC_015875	TATTT	2	10	69717	69726	20 %	80 %	0 %	0 %	342162765
72	NC_015875	TTATT	2	10	69727	69736	20 %	80 %	0 %	0 %	342162765
73	NC_015875	CTATT	2	10	71863	71872	20 %	60 %	0 %	20 %	342162768
74	NC_015875	TAAAA	2	10	74320	74329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015875	GACTC	2	10	74540	74549	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015875	AAAAT	2	10	74816	74825	80 %	20 %	0 %	0 %	342162772
77	NC_015875	ACAAG	2	10	75199	75208	60 %	0 %	20 %	20 %	342162773
78	NC_015875	AGCAG	2	10	78067	78076	40 %	0 %	40 %	20 %	342162777
79	NC_015875	TAAAG	2	10	81361	81370	60 %	20 %	20 %	0 %	342162780
80	NC_015875	TGGGG	2	10	86282	86291	0 %	20 %	80 %	0 %	342162785
81	NC_015875	ATGGA	2	10	86547	86556	40 %	20 %	40 %	0 %	342162785
82	NC_015875	ACTAT	2	10	87614	87623	40 %	40 %	0 %	20 %	342162786
83	NC_015875	AGATT	2	10	88184	88193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015875	GAAAA	2	10	90370	90379	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015875	ATTTA	2	10	90444	90453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015875	ATTTA	2	10	90570	90579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015875	AATAA	2	10	90634	90643	80 %	20 %	0 %	0 %	342162790
88	NC_015875	TAAAA	2	10	91825	91834	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015875	AAAAC	2	10	94399	94408	80 %	0 %	0 %	20 %	342162798
90	NC_015875	AAAAG	2	10	94800	94809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015875	GAAGA	2	10	96331	96340	60 %	0 %	40 %	0 %	342162800
92	NC_015875	AATAA	2	10	97346	97355	80 %	20 %	0 %	0 %	342162801
93	NC_015875	AGTAT	2	10	98010	98019	40 %	40 %	20 %	0 %	342162804
94	NC_015875	GAGTA	2	10	98752	98761	40 %	20 %	40 %	0 %	342162806
95	NC_015875	GGCTA	2	10	98798	98807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015875	CTAGC	2	10	100264	100273	20 %	20 %	20 %	40 %	342162809
97	NC_015875	AATTA	2	10	103004	103013	60 %	40 %	0 %	0 %	342162812
98	NC_015875	TTTCT	2	10	104093	104102	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015875	CAGAT	2	10	105055	105064	40 %	20 %	20 %	20 %	342162815
100	NC_015875	TTTAC	2	10	105757	105766	20 %	60 %	0 %	20 %	342162815
101	NC_015875	AGAGG	2	10	106619	106628	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015875	ATTTG	2	10	109188	109197	20 %	60 %	20 %	0 %	342162818
103	NC_015875	AAAAG	2	10	111966	111975	80 %	0 %	20 %	0 %	342162818
104	NC_015875	AAATG	2	10	113804	113813	60 %	20 %	20 %	0 %	342162819
105	NC_015875	AAAAT	2	10	114527	114536	80 %	20 %	0 %	0 %	342162820
106	NC_015875	AGCTA	2	10	114879	114888	40 %	20 %	20 %	20 %	342162820
107	NC_015875	CCTTG	2	10	118041	118050	0 %	40 %	20 %	40 %	342162824
108	NC_015875	TCAAA	2	10	118235	118244	60 %	20 %	0 %	20 %	342162824
109	NC_015875	AGTGG	2	10	120396	120405	20 %	20 %	60 %	0 %	342162827
110	NC_015875	GGGTG	2	10	120434	120443	0 %	20 %	80 %	0 %	342162827
111	NC_015875	GAAGC	2	10	121591	121600	40 %	0 %	40 %	20 %	342162828
112	NC_015875	GCTTG	2	10	122047	122056	0 %	40 %	40 %	20 %	342162830
113	NC_015875	GCTTT	2	10	123476	123485	0 %	60 %	20 %	20 %	342162831
114	NC_015875	TCTGG	2	10	124082	124091	0 %	40 %	40 %	20 %	342162831
115	NC_015875	AGCAT	2	10	125036	125045	40 %	20 %	20 %	20 %	342162831
116	NC_015875	TACCA	2	10	125734	125743	40 %	20 %	0 %	40 %	342162831
117	NC_015875	TTCCT	2	10	126751	126760	0 %	60 %	0 %	40 %	342162831
118	NC_015875	TTTAT	2	10	127322	127331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015875	TTGGT	2	10	130696	130705	0 %	60 %	40 %	0 %	342162834
120	NC_015875	CTTCA	2	10	131750	131759	20 %	40 %	0 %	40 %	342162835
121	NC_015875	AATCA	2	10	131862	131871	60 %	20 %	0 %	20 %	342162836
122	NC_015875	ATTCA	2	10	133241	133250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015875	AGCTC	2	10	134085	134094	20 %	20 %	20 %	40 %	342162838
124	NC_015875	GCTGT	2	10	137437	137446	0 %	40 %	40 %	20 %	342162841
125	NC_015875	TCTTA	2	10	137646	137655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015875	AGAAA	2	10	139169	139178	80 %	0 %	20 %	0 %	342162842
127	NC_015875	GAAAG	2	10	139221	139230	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015875	TAGAA	2	10	139996	140005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015875	GCGGT	2	10	140461	140470	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015875	GGGCA	2	10	144742	144751	20 %	0 %	60 %	20 %	342162848
131	NC_015875	CCCAC	2	10	146418	146427	20 %	0 %	0 %	80 %	342162851
132	NC_015875	TAAAT	2	10	147239	147248	60 %	40 %	0 %	0 %	342162852
133	NC_015875	TTGAT	2	10	150377	150386	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015875	ATAAA	2	10	150660	150669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015875	ATTCT	2	10	150933	150942	20 %	60 %	0 %	20 %	342162855
136	NC_015875	AGAAA	2	10	151805	151814	80 %	0 %	20 %	0 %	342162856
137	NC_015875	CTTTT	2	10	154571	154580	0 %	80 %	0 %	20 %	342162858
138	NC_015875	TATTT	2	10	154790	154799	20 %	80 %	0 %	0 %	342162858
139	NC_015875	AAAGG	2	10	155036	155045	60 %	0 %	40 %	0 %	342162858
140	NC_015875	GAAAT	2	10	155493	155502	60 %	20 %	20 %	0 %	342162859
141	NC_015875	GTGTA	2	10	155551	155560	20 %	40 %	40 %	0 %	342162859
142	NC_015875	AGGAG	2	10	156388	156397	40 %	0 %	60 %	0 %	342162860
143	NC_015875	AATCC	2	10	156705	156714	40 %	20 %	0 %	40 %	342162860
144	NC_015875	TTTTG	2	10	157971	157980	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015875	AAATT	2	10	158631	158640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_015875	GTTTG	2	10	165073	165082	0 %	60 %	40 %	0 %	342162871
153	NC_015875	TATTT	2	10	167022	167031	20 %	80 %	0 %	0 %	342162873
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157	NC_015875	ATTTT	2	10	174610	174619	20 %	80 %	0 %	0 %	342162881
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161	NC_015875	AGAAA	2	10	176650	176659	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015875	AAATG	2	10	177639	177648	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_015875	TTAAT	2	10	187690	187699	40 %	60 %	0 %	0 %	342162895
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172	NC_015875	ATGGG	2	10	192912	192921	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_015875	AAGGA	2	10	296842	296851	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015875	GTTCA	2	10	298511	298520	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
256	NC_015875	TTTAC	2	10	301572	301581	20 %	60 %	0 %	20 %	342163040
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260	NC_015875	ATCGA	2	10	303066	303075	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_015875	TCTGT	2	10	307223	307232	0 %	60 %	20 %	20 %	342163049
262	NC_015875	AAGAT	2	10	310355	310364	60 %	20 %	20 %	0 %	342163052
263	NC_015875	ATACC	2	10	310835	310844	40 %	20 %	0 %	40 %	342163052
264	NC_015875	GAGTA	2	10	313560	313569	40 %	20 %	40 %	0 %	342163054
265	NC_015875	ATTCT	2	10	314017	314026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_015875	GATAA	2	10	314594	314603	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_015875	AGAAA	2	10	314909	314918	80 %	0 %	20 %	0 %	342163056
268	NC_015875	CTTTT	2	10	315434	315443	0 %	80 %	0 %	20 %	342163056
269	NC_015875	TAGAA	2	10	316556	316565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015875	GCAAC	2	10	317281	317290	40 %	0 %	20 %	40 %	342163057
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272	NC_015875	ATTAT	2	10	319758	319767	40 %	60 %	0 %	0 %	342163058
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