MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 28145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015875	TCA	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162672
2	NC_015875	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162672
3	NC_015875	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162672
4	NC_015875	ATG	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162672
5	NC_015875	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162672
6	NC_015875	GCT	2	6	406	411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162672
7	NC_015875	GGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162672
8	NC_015875	GAT	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162672
9	NC_015875	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162672
10	NC_015875	GAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162672
11	NC_015875	TGC	2	6	1029	1034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162672
12	NC_015875	ATA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162672
13	NC_015875	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162672
14	NC_015875	TAT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015875	TAT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015875	TAT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015875	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162673
18	NC_015875	CTT	2	6	1729	1734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162673
19	NC_015875	CTT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162673
20	NC_015875	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162673
21	NC_015875	TGC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162673
22	NC_015875	TGA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162673
23	NC_015875	GAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162673
24	NC_015875	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162673
25	NC_015875	GTT	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162673
26	NC_015875	GAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162673
27	NC_015875	CAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162673
28	NC_015875	TGA	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162673
29	NC_015875	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015875	TGT	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162674
31	NC_015875	ATG	2	6	2866	2871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162674
32	NC_015875	CAG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
33	NC_015875	GCA	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
34	NC_015875	CGA	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
35	NC_015875	CAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162675
36	NC_015875	TGA	3	9	3320	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162675
37	NC_015875	TTC	2	6	3505	3510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162675
38	NC_015875	GAC	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
39	NC_015875	AGT	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162675
40	NC_015875	GAA	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
41	NC_015875	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
42	NC_015875	GTA	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162675
43	NC_015875	CTC	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162675
44	NC_015875	AGC	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
45	NC_015875	AAG	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
46	NC_015875	GAA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
47	NC_015875	TAA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015875	TTA	2	6	4423	4428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162676
49	NC_015875	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162676
50	NC_015875	GAT	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162676
51	NC_015875	CAG	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162676
52	NC_015875	TAT	2	6	4540	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162676
53	NC_015875	GTT	2	6	4616	4621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162676
54	NC_015875	GAT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162676
55	NC_015875	GAC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162676
56	NC_015875	ACT	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162676
57	NC_015875	TTA	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162677
58	NC_015875	TAG	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
59	NC_015875	TCT	2	6	4957	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162677
60	NC_015875	GCA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162677
61	NC_015875	GAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
62	NC_015875	GAG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162677
63	NC_015875	TGA	2	6	5347	5352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
64	NC_015875	AGA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
65	NC_015875	TGA	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
66	NC_015875	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
67	NC_015875	AGA	2	6	5722	5727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
68	NC_015875	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
69	NC_015875	TAT	2	6	5953	5958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162677
70	NC_015875	GGA	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162677
71	NC_015875	CAA	2	6	6056	6061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162677
72	NC_015875	CGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162677
73	NC_015875	GTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162677
74	NC_015875	TGA	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
75	NC_015875	GAT	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
76	NC_015875	GTA	2	6	6612	6617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
77	NC_015875	GTC	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162677
78	NC_015875	CGA	2	6	6762	6767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162677
79	NC_015875	TGT	2	6	6943	6948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162677
80	NC_015875	TGA	2	6	6966	6971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
81	NC_015875	TGA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
82	NC_015875	AAC	2	6	6984	6989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162677
83	NC_015875	GAA	2	6	7027	7032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
84	NC_015875	CCG	2	6	7127	7132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	342162677
85	NC_015875	TAC	2	6	7229	7234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162677
86	NC_015875	ACA	2	6	7239	7244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162677
87	NC_015875	CTA	2	6	7352	7357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162677
88	NC_015875	GAC	2	6	7390	7395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162677
89	NC_015875	ATT	2	6	7400	7405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162677
90	NC_015875	ATA	2	6	8031	8036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162677
91	NC_015875	ATT	2	6	8088	8093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162677
92	NC_015875	CTG	2	6	8204	8209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162677
93	NC_015875	TTA	2	6	8225	8230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162677
94	NC_015875	TCT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015875	AAT	2	6	8301	8306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015875	TAA	2	6	8316	8321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015875	CGT	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162678
98	NC_015875	GCA	2	6	8537	8542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162678
99	NC_015875	AGA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162678
100	NC_015875	AAT	2	6	8607	8612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162679
101	NC_015875	CGT	2	6	8637	8642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162679
102	NC_015875	TGA	2	6	8650	8655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162679
103	NC_015875	TAT	2	6	8710	8715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162679
104	NC_015875	TGA	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162679
105	NC_015875	TGC	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162679
106	NC_015875	TAT	2	6	8895	8900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162679
107	NC_015875	TTA	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162680
108	NC_015875	GAA	2	6	9013	9018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162680
109	NC_015875	ATT	2	6	9036	9041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162680
110	NC_015875	AAG	2	6	9050	9055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162680
111	NC_015875	ATT	2	6	9086	9091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162681
112	NC_015875	TTG	2	6	9092	9097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162681
113	NC_015875	GTC	2	6	9146	9151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162681
114	NC_015875	TTA	2	6	9169	9174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162681
115	NC_015875	TAG	2	6	9267	9272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162681
116	NC_015875	ATC	2	6	9363	9368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162681
117	NC_015875	CAA	2	6	9420	9425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162681
118	NC_015875	AAG	2	6	9483	9488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162681
119	NC_015875	ATC	2	6	9493	9498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162681
120	NC_015875	GAA	2	6	9605	9610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162681
121	NC_015875	ACT	2	6	9692	9697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162681
122	NC_015875	AAG	2	6	9702	9707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162681
123	NC_015875	TAT	2	6	9767	9772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162681
124	NC_015875	ATG	2	6	9789	9794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162681
125	NC_015875	ATA	2	6	9897	9902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162681
126	NC_015875	TTA	2	6	9976	9981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162681
127	NC_015875	GAT	2	6	10037	10042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162681
128	NC_015875	TTC	2	6	10066	10071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162681
129	NC_015875	GGT	2	6	10398	10403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162682
130	NC_015875	TGG	2	6	10416	10421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162682
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255	NC_015875	TGA	2	6	19943	19948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162698
256	NC_015875	GAC	2	6	20053	20058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162698
257	NC_015875	ATG	2	6	20191	20196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162699
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259	NC_015875	GAA	2	6	20264	20269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162699
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272	NC_015875	TAA	2	6	21204	21209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015875	TAA	2	6	21240	21245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015875	TAA	2	6	21273	21278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015875	TAA	2	6	21284	21289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015875	TTA	2	6	21343	21348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162700
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