MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 44852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015875	TAT	2	6	47717	47722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015875	GAG	3	9	47728	47736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015875	AGA	2	6	47776	47781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162736
1004	NC_015875	A	6	6	47808	47813	100 %	0 %	0 %	0 %	342162736
1005	NC_015875	GTC	2	6	47818	47823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162736
1006	NC_015875	GAA	2	6	47841	47846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162736
1007	NC_015875	TCA	2	6	47889	47894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162736
1008	NC_015875	CAAG	2	8	47905	47912	50 %	0 %	25 %	25 %	342162736
1009	NC_015875	TCAGC	2	10	47943	47952	20 %	20 %	20 %	40 %	342162736
1010	NC_015875	CAA	2	6	47981	47986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162736
1011	NC_015875	AC	3	6	48004	48009	50 %	0 %	0 %	50 %	342162736
1012	NC_015875	GAA	2	6	48035	48040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162736
1013	NC_015875	AGG	2	6	48042	48047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162736
1014	NC_015875	TATT	2	8	48059	48066	25 %	75 %	0 %	0 %	342162736
1015	NC_015875	CAAG	2	8	48141	48148	50 %	0 %	25 %	25 %	342162736
1016	NC_015875	A	6	6	48213	48218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015875	TAT	2	6	48232	48237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015875	GTT	2	6	48322	48327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162737
1019	NC_015875	GCGT	2	8	48353	48360	0 %	25 %	50 %	25 %	342162737
1020	NC_015875	T	7	7	48424	48430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015875	ATT	2	6	48432	48437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015875	GGT	2	6	48443	48448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015875	GAT	2	6	48489	48494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162738
1024	NC_015875	GA	3	6	48518	48523	50 %	0 %	50 %	0 %	342162738
1025	NC_015875	TATTT	2	10	48542	48551	20 %	80 %	0 %	0 %	342162738
1026	NC_015875	GAA	3	9	48653	48661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162738
1027	NC_015875	AG	3	6	48699	48704	50 %	0 %	50 %	0 %	342162738
1028	NC_015875	TA	3	6	48705	48710	50 %	50 %	0 %	0 %	342162738
1029	NC_015875	TCA	3	9	48722	48730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162738
1030	NC_015875	T	6	6	48731	48736	0 %	100 %	0 %	0 %	342162738
1031	NC_015875	A	6	6	48755	48760	100 %	0 %	0 %	0 %	342162738
1032	NC_015875	TGGAT	2	10	48784	48793	20 %	40 %	40 %	0 %	342162738
1033	NC_015875	TGC	2	6	48803	48808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162738
1034	NC_015875	ATT	2	6	48868	48873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162738
1035	NC_015875	TGA	2	6	48901	48906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162738
1036	NC_015875	GTTT	2	8	48907	48914	0 %	75 %	25 %	0 %	342162738
1037	NC_015875	TCAT	2	8	48917	48924	25 %	50 %	0 %	25 %	342162738
1038	NC_015875	AT	3	6	48944	48949	50 %	50 %	0 %	0 %	342162738
1039	NC_015875	ATT	2	6	49175	49180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015875	GAA	2	6	49236	49241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162739
1041	NC_015875	AAG	2	6	49280	49285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162739
1042	NC_015875	ACT	2	6	49347	49352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162739
1043	NC_015875	ATA	2	6	49444	49449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162739
1044	NC_015875	TGG	2	6	49500	49505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162739
1045	NC_015875	GGTTA	2	10	49506	49515	20 %	40 %	40 %	0 %	342162739
1046	NC_015875	C	6	6	49530	49535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1047	NC_015875	A	7	7	49540	49546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015875	A	6	6	49605	49610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015875	G	6	6	49622	49627	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015875	GAA	2	6	49633	49638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162740
1051	NC_015875	A	7	7	49646	49652	100 %	0 %	0 %	0 %	342162740
1052	NC_015875	A	6	6	49707	49712	100 %	0 %	0 %	0 %	342162740
1053	NC_015875	TATCTT	2	12	49744	49755	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	342162740
1054	NC_015875	GCT	2	6	49761	49766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162740
1055	NC_015875	TCA	2	6	49805	49810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162740
1056	NC_015875	ACA	2	6	49824	49829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162740
1057	NC_015875	TC	3	6	49849	49854	0 %	50 %	0 %	50 %	342162740
1058	NC_015875	TTTGAT	2	12	49906	49917	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342162740
1059	NC_015875	TGA	2	6	49985	49990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162741
1060	NC_015875	GTC	2	6	50022	50027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162741
1061	NC_015875	AAGGA	2	10	50031	50040	60 %	0 %	40 %	0 %	342162741
1062	NC_015875	ATC	2	6	50055	50060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162741
1063	NC_015875	TGA	2	6	50081	50086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162741
1064	NC_015875	T	6	6	50141	50146	0 %	100 %	0 %	0 %	342162741
1065	NC_015875	TTTTTC	2	12	50185	50196	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	342162741
1066	NC_015875	AC	3	6	50236	50241	50 %	0 %	0 %	50 %	342162741
1067	NC_015875	GGT	2	6	50253	50258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162741
1068	NC_015875	T	6	6	50289	50294	0 %	100 %	0 %	0 %	342162741
1069	NC_015875	AAC	2	6	50454	50459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162741
1070	NC_015875	TCTTT	2	10	50464	50473	0 %	80 %	0 %	20 %	342162741
1071	NC_015875	AAT	2	6	50481	50486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162741
1072	NC_015875	TGA	2	6	50528	50533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162741
1073	NC_015875	GGTCT	2	10	50575	50584	0 %	40 %	40 %	20 %	342162741
1074	NC_015875	TGA	2	6	50696	50701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162741
1075	NC_015875	GAA	2	6	50759	50764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162741
1076	NC_015875	TTGC	2	8	50817	50824	0 %	50 %	25 %	25 %	342162741
1077	NC_015875	ATG	2	6	50842	50847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162741
1078	NC_015875	GTC	2	6	50869	50874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162741
1079	NC_015875	GAC	2	6	50930	50935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162741
1080	NC_015875	CTTG	2	8	50949	50956	0 %	50 %	25 %	25 %	342162741
1081	NC_015875	TTG	2	6	50979	50984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162741
1082	NC_015875	TGT	2	6	51046	51051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162741
1083	NC_015875	ACA	2	6	51080	51085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162741
1084	NC_015875	TGAA	2	8	51214	51221	50 %	25 %	25 %	0 %	342162741
1085	NC_015875	ATC	2	6	51360	51365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162741
1086	NC_015875	ATA	2	6	51430	51435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162741
1087	NC_015875	GAA	2	6	51476	51481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162741
1088	NC_015875	AGA	2	6	51492	51497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162741
1089	NC_015875	TGC	2	6	51524	51529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162741
1090	NC_015875	GGT	2	6	51623	51628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015875	AGGA	2	8	51645	51652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015875	ATTT	2	8	51674	51681	25 %	75 %	0 %	0 %	342162742
1093	NC_015875	TTTTGA	2	12	51705	51716	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	342162742
1094	NC_015875	CGG	2	6	51773	51778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	342162742
1095	NC_015875	TGG	2	6	51821	51826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162742
1096	NC_015875	ATC	2	6	51830	51835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162742
1097	NC_015875	TGA	2	6	51960	51965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162742
1098	NC_015875	ATG	2	6	52016	52021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162742
1099	NC_015875	TCTT	2	8	52088	52095	0 %	75 %	0 %	25 %	342162742
1100	NC_015875	TAA	2	6	52101	52106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162742
1101	NC_015875	TGG	2	6	52169	52174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162742
1102	NC_015875	AAT	2	6	52189	52194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162742
1103	NC_015875	TGA	2	6	52236	52241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162742
1104	NC_015875	AGAA	2	8	52249	52256	75 %	0 %	25 %	0 %	342162742
1105	NC_015875	ATGG	2	8	52324	52331	25 %	25 %	50 %	0 %	342162742
1106	NC_015875	GAA	2	6	52392	52397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162742
1107	NC_015875	TGA	2	6	52413	52418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162742
1108	NC_015875	AT	3	6	52430	52435	50 %	50 %	0 %	0 %	342162742
1109	NC_015875	AGA	2	6	52490	52495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162742
1110	NC_015875	A	6	6	52528	52533	100 %	0 %	0 %	0 %	342162742
1111	NC_015875	A	6	6	52588	52593	100 %	0 %	0 %	0 %	342162742
1112	NC_015875	G	6	6	52611	52616	0 %	0 %	100 %	0 %	342162742
1113	NC_015875	CTCAT	2	10	52654	52663	20 %	40 %	0 %	40 %	342162742
1114	NC_015875	TGG	2	6	52719	52724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162742
1115	NC_015875	AGG	2	6	52776	52781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162742
1116	NC_015875	ATG	2	6	52827	52832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162743
1117	NC_015875	CGA	2	6	52893	52898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162743
1118	NC_015875	TGG	3	9	52930	52938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162743
1119	NC_015875	TGC	2	6	53017	53022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162743
1120	NC_015875	TGC	2	6	53026	53031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162743
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1123	NC_015875	GT	3	6	53148	53153	0 %	50 %	50 %	0 %	342162743
1124	NC_015875	TAA	2	6	53164	53169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162743
1125	NC_015875	GAT	2	6	53213	53218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162743
1126	NC_015875	CTG	2	6	53262	53267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162743
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1128	NC_015875	AGA	2	6	53449	53454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162743
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