MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 44852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015875	ATCT	2	8	22777	22784	25 %	50 %	0 %	25 %	342162701
502	NC_015875	AGA	2	6	22794	22799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162701
503	NC_015875	TGA	2	6	22827	22832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162701
504	NC_015875	TAC	2	6	22841	22846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162701
505	NC_015875	GCA	3	9	22864	22872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162701
506	NC_015875	CAA	2	6	22965	22970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162701
507	NC_015875	GAA	2	6	22978	22983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162701
508	NC_015875	ACT	2	6	23017	23022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162701
509	NC_015875	ATG	2	6	23097	23102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162701
510	NC_015875	T	6	6	23132	23137	0 %	100 %	0 %	0 %	342162701
511	NC_015875	ACT	2	6	23152	23157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162701
512	NC_015875	CTA	2	6	23313	23318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162701
513	NC_015875	ACG	2	6	23328	23333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162701
514	NC_015875	CTG	2	6	23403	23408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162701
515	NC_015875	A	6	6	23455	23460	100 %	0 %	0 %	0 %	342162701
516	NC_015875	ATA	2	6	23505	23510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162701
517	NC_015875	AAC	2	6	23577	23582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162701
518	NC_015875	TA	3	6	23663	23668	50 %	50 %	0 %	0 %	342162701
519	NC_015875	ACA	2	6	23707	23712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162701
520	NC_015875	TAA	2	6	23736	23741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162701
521	NC_015875	AG	3	6	23782	23787	50 %	0 %	50 %	0 %	342162701
522	NC_015875	ATT	2	6	23801	23806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162701
523	NC_015875	A	6	6	23926	23931	100 %	0 %	0 %	0 %	342162701
524	NC_015875	T	6	6	24087	24092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015875	GAC	2	6	24225	24230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015875	AGG	2	6	24240	24245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015875	GAA	2	6	24258	24263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162702
528	NC_015875	GAA	2	6	24285	24290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162702
529	NC_015875	CAA	2	6	24315	24320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162702
530	NC_015875	GAA	2	6	24332	24337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162702
531	NC_015875	ATC	2	6	24363	24368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162702
532	NC_015875	AAG	2	6	24372	24377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162702
533	NC_015875	AAG	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162702
534	NC_015875	AAG	2	6	24423	24428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162702
535	NC_015875	TGA	2	6	24446	24451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162702
536	NC_015875	AAGC	2	8	24702	24709	50 %	0 %	25 %	25 %	342162702
537	NC_015875	AGA	2	6	24737	24742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162702
538	NC_015875	CAG	2	6	24831	24836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162703
539	NC_015875	AAACT	2	10	24840	24849	60 %	20 %	0 %	20 %	342162703
540	NC_015875	ACT	2	6	25049	25054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162703
541	NC_015875	ACT	2	6	25061	25066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162703
542	NC_015875	GCT	2	6	25082	25087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162703
543	NC_015875	TGA	3	9	25186	25194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162703
544	NC_015875	CAA	2	6	25242	25247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162703
545	NC_015875	GAA	2	6	25289	25294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162703
546	NC_015875	ATC	2	6	25313	25318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162703
547	NC_015875	CTA	2	6	25332	25337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162703
548	NC_015875	GTT	2	6	25397	25402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162703
549	NC_015875	A	6	6	25448	25453	100 %	0 %	0 %	0 %	342162703
550	NC_015875	GAA	2	6	25457	25462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162703
551	NC_015875	CAGA	2	8	25502	25509	50 %	0 %	25 %	25 %	342162703
552	NC_015875	AATA	2	8	25517	25524	75 %	25 %	0 %	0 %	342162703
553	NC_015875	TGA	2	6	25674	25679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015875	ACG	2	6	25695	25700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162704
555	NC_015875	AGA	2	6	25758	25763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162704
556	NC_015875	GAA	2	6	25767	25772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162704
557	NC_015875	AAG	2	6	25781	25786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162704
558	NC_015875	GGA	2	6	25839	25844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162704
559	NC_015875	GAG	2	6	25934	25939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162705
560	NC_015875	AGA	2	6	26029	26034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162705
561	NC_015875	GAA	2	6	26060	26065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162706
562	NC_015875	GAA	2	6	26076	26081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162706
563	NC_015875	ATCTT	2	10	26122	26131	20 %	60 %	0 %	20 %	342162706
564	NC_015875	GGT	2	6	26244	26249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162706
565	NC_015875	AGT	2	6	26255	26260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162706
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567	NC_015875	AAG	2	6	26414	26419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162707
568	NC_015875	CAA	2	6	26529	26534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162707
569	NC_015875	CTA	2	6	26540	26545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162707
570	NC_015875	GT	4	8	26561	26568	0 %	50 %	50 %	0 %	342162707
571	NC_015875	ATC	2	6	26624	26629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162707
572	NC_015875	A	7	7	26705	26711	100 %	0 %	0 %	0 %	342162708
573	NC_015875	TGC	2	6	26746	26751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162708
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575	NC_015875	GA	3	6	27088	27093	50 %	0 %	50 %	0 %	342162708
576	NC_015875	GT	3	6	27105	27110	0 %	50 %	50 %	0 %	342162708
577	NC_015875	TTAT	2	8	27179	27186	25 %	75 %	0 %	0 %	342162709
578	NC_015875	T	7	7	27260	27266	0 %	100 %	0 %	0 %	342162709
579	NC_015875	GAA	2	6	27268	27273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162709
580	NC_015875	TGA	2	6	27297	27302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162709
581	NC_015875	TGA	2	6	27345	27350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162709
582	NC_015875	ATCA	2	8	27379	27386	50 %	25 %	0 %	25 %	342162709
583	NC_015875	GAA	2	6	27410	27415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162709
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593	NC_015875	ATTGC	2	10	27897	27906	20 %	40 %	20 %	20 %	342162710
594	NC_015875	TTAA	2	8	27941	27948	50 %	50 %	0 %	0 %	342162710
595	NC_015875	TCATC	2	10	28009	28018	20 %	40 %	0 %	40 %	342162711
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598	NC_015875	A	6	6	28037	28042	100 %	0 %	0 %	0 %	342162711
599	NC_015875	CCT	2	6	28099	28104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162711
600	NC_015875	TGG	2	6	28206	28211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162711
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609	NC_015875	ACA	2	6	28598	28603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162712
610	NC_015875	TTG	2	6	28638	28643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162712
611	NC_015875	AGGA	2	8	28689	28696	50 %	0 %	50 %	0 %	342162712
612	NC_015875	AATG	2	8	28700	28707	50 %	25 %	25 %	0 %	342162712
613	NC_015875	GAA	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015875	AAG	2	6	28772	28777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015875	GAA	2	6	28812	28817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015875	TCTT	2	8	29005	29012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_015875	CTA	2	6	29063	29068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015875	CAA	2	6	29118	29123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015875	GTT	2	6	29164	29169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015875	TTTTG	2	10	29403	29412	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015875	GTG	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015875	AT	3	6	29480	29485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015875	AAG	2	6	29507	29512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015875	ATT	2	6	29538	29543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015875	AAG	2	6	29600	29605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015875	CAA	2	6	29627	29632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015875	CAA	2	6	29651	29656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015875	TGA	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015875	GCA	2	6	29762	29767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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