MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 44852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015875	GTT	2	6	267071	267076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162993
5502	NC_015875	ACC	2	6	267091	267096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342162993
5503	NC_015875	TTA	2	6	267170	267175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162993
5504	NC_015875	AGC	2	6	267304	267309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162993
5505	NC_015875	T	7	7	267320	267326	0 %	100 %	0 %	0 %	342162993
5506	NC_015875	TGA	2	6	267347	267352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162993
5507	NC_015875	T	7	7	267378	267384	0 %	100 %	0 %	0 %	342162993
5508	NC_015875	GAA	2	6	267389	267394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162993
5509	NC_015875	TCC	2	6	267437	267442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162993
5510	NC_015875	TTC	2	6	267508	267513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162993
5511	NC_015875	CTA	2	6	267591	267596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162993
5512	NC_015875	TCA	2	6	267599	267604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162993
5513	NC_015875	TAA	2	6	267624	267629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162993
5514	NC_015875	CAC	2	6	267771	267776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342162993
5515	NC_015875	TCC	2	6	267839	267844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162993
5516	NC_015875	CTA	2	6	267972	267977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162993
5517	NC_015875	TCC	2	6	268087	268092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_015875	AAT	2	6	268158	268163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162994
5519	NC_015875	AGAA	2	8	268221	268228	75 %	0 %	25 %	0 %	342162994
5520	NC_015875	ATT	2	6	268360	268365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162994
5521	NC_015875	GGA	2	6	268399	268404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162994
5522	NC_015875	A	6	6	268440	268445	100 %	0 %	0 %	0 %	342162994
5523	NC_015875	TTA	2	6	268454	268459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162994
5524	NC_015875	TAA	3	9	268494	268502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162994
5525	NC_015875	CCT	2	6	268504	268509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162994
5526	NC_015875	TTA	2	6	268583	268588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162994
5527	NC_015875	ATTG	2	8	268602	268609	25 %	50 %	25 %	0 %	342162994
5528	NC_015875	TA	3	6	268625	268630	50 %	50 %	0 %	0 %	342162994
5529	NC_015875	TAA	2	6	268644	268649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162994
5530	NC_015875	TTTGT	2	10	268662	268671	0 %	80 %	20 %	0 %	342162994
5531	NC_015875	CTT	2	6	268688	268693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162994
5532	NC_015875	AAT	2	6	268806	268811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162994
5533	NC_015875	TGC	2	6	268842	268847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162994
5534	NC_015875	GACT	2	8	268885	268892	25 %	25 %	25 %	25 %	342162994
5535	NC_015875	TTC	2	6	268917	268922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162994
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5539	NC_015875	AGCA	2	8	269043	269050	50 %	0 %	25 %	25 %	342162994
5540	NC_015875	GCT	2	6	269059	269064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162994
5541	NC_015875	TCT	2	6	269093	269098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162994
5542	NC_015875	A	6	6	269155	269160	100 %	0 %	0 %	0 %	342162994
5543	NC_015875	CTA	2	6	269162	269167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162994
5544	NC_015875	T	6	6	269201	269206	0 %	100 %	0 %	0 %	342162994
5545	NC_015875	A	6	6	269216	269221	100 %	0 %	0 %	0 %	342162994
5546	NC_015875	TGCCC	2	10	269266	269275	0 %	20 %	20 %	60 %	342162994
5547	NC_015875	TTG	2	6	269302	269307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162994
5548	NC_015875	TAT	2	6	269322	269327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_015875	ATT	2	6	269337	269342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_015875	A	6	6	269381	269386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_015875	CATA	2	8	269422	269429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_015875	TAAA	2	8	269462	269469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_015875	AATG	2	8	269505	269512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_015875	CAA	2	6	269535	269540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_015875	A	6	6	269539	269544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_015875	ATC	2	6	269549	269554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015875	T	7	7	269570	269576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_015875	TCC	2	6	269622	269627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_015875	ACA	2	6	269661	269666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_015875	GAT	2	6	269668	269673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015875	TTC	2	6	269749	269754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162995
5562	NC_015875	TAG	2	6	269785	269790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162995
5563	NC_015875	TCT	2	6	269813	269818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162995
5564	NC_015875	TCA	2	6	269837	269842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162995
5565	NC_015875	TCATT	2	10	269886	269895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5566	NC_015875	A	6	6	269916	269921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_015875	T	8	8	269961	269968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015875	ATT	2	6	269990	269995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015875	AAAC	2	8	270106	270113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5571	NC_015875	AC	3	6	270287	270292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5572	NC_015875	TCTG	2	8	270314	270321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_015875	TCG	2	6	270381	270386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_015875	GTCT	2	8	270425	270432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_015875	CAA	2	6	270447	270452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162996
5576	NC_015875	CAT	2	6	270549	270554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162996
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5579	NC_015875	TGTCT	2	10	270780	270789	0 %	60 %	20 %	20 %	342162996
5580	NC_015875	TGA	2	6	270813	270818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162996
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5582	NC_015875	A	6	6	270890	270895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015875	TA	4	8	270920	270927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_015875	A	6	6	270953	270958	100 %	0 %	0 %	0 %	342162997
5585	NC_015875	CTT	2	6	271012	271017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162997
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5589	NC_015875	CGATT	2	10	271176	271185	20 %	40 %	20 %	20 %	342162997
5590	NC_015875	T	6	6	271188	271193	0 %	100 %	0 %	0 %	342162997
5591	NC_015875	CCT	2	6	271209	271214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_015875	TATT	2	8	271306	271313	25 %	75 %	0 %	0 %	342162998
5593	NC_015875	T	6	6	271312	271317	0 %	100 %	0 %	0 %	342162998
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5597	NC_015875	TTC	2	6	271585	271590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162998
5598	NC_015875	TTCCC	2	10	271613	271622	0 %	40 %	0 %	60 %	342162998
5599	NC_015875	ACC	2	6	271720	271725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342162998
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5601	NC_015875	TGAC	2	8	271784	271791	25 %	25 %	25 %	25 %	342162998
5602	NC_015875	GTTC	2	8	271826	271833	0 %	50 %	25 %	25 %	342162998
5603	NC_015875	TTC	2	6	271869	271874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162998
5604	NC_015875	TCAA	2	8	271880	271887	50 %	25 %	0 %	25 %	342162998
5605	NC_015875	AGT	2	6	271896	271901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162998
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5607	NC_015875	T	6	6	272034	272039	0 %	100 %	0 %	0 %	342162998
5608	NC_015875	ATC	2	6	272137	272142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162998
5609	NC_015875	TAG	2	6	272331	272336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162998
5610	NC_015875	TCC	2	6	272350	272355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_015875	AGA	2	6	272414	272419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_015875	AGCT	2	8	272502	272509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_015875	AGA	2	6	272587	272592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_015875	A	6	6	272606	272611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_015875	TGCACT	2	12	272681	272692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	342162999
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5622	NC_015875	CCA	2	6	272946	272951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	342162999
5623	NC_015875	AGA	2	6	272967	272972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162999
5624	NC_015875	AATC	2	8	272975	272982	50 %	25 %	0 %	25 %	342162999
5625	NC_015875	AAG	2	6	273009	273014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162999
5626	NC_015875	TGA	2	6	273049	273054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162999
5627	NC_015875	ATC	2	6	273072	273077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162999
5628	NC_015875	ATC	2	6	273086	273091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162999
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5732	NC_015875	A	6	6	278346	278351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5733	NC_015875	A	8	8	278355	278362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5736	NC_015875	A	6	6	278484	278489	100 %	0 %	0 %	0 %	342163003
5737	NC_015875	AGTTA	2	10	278515	278524	40 %	40 %	20 %	0 %	342163003
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5741	NC_015875	GAAA	2	8	278902	278909	75 %	0 %	25 %	0 %	342163004
5742	NC_015875	A	7	7	278912	278918	100 %	0 %	0 %	0 %	342163004
5743	NC_015875	TGGT	2	8	278952	278959	0 %	50 %	50 %	0 %	342163004
5744	NC_015875	A	6	6	278969	278974	100 %	0 %	0 %	0 %	342163004
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5998	NC_015875	AAAT	2	8	292218	292225	75 %	25 %	0 %	0 %	342163021
5999	NC_015875	CTG	2	6	292265	292270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342163021
6000	NC_015875	GAA	2	6	292327	292332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342163021

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