MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 44852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015875	TAT	2	6	240250	240255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162962
5002	NC_015875	GGA	2	6	240262	240267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162962
5003	NC_015875	AAT	2	6	240268	240273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162962
5004	NC_015875	ATT	2	6	240333	240338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015875	TAC	2	6	240344	240349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015875	AAG	2	6	240361	240366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015875	T	6	6	240518	240523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015875	TA	3	6	240566	240571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015875	AGG	2	6	240614	240619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015875	T	7	7	240620	240626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015875	GAGT	2	8	240646	240653	25 %	25 %	50 %	0 %	342162963
5012	NC_015875	GAT	2	6	240657	240662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162963
5013	NC_015875	ATT	2	6	240713	240718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162963
5014	NC_015875	A	6	6	240741	240746	100 %	0 %	0 %	0 %	342162963
5015	NC_015875	GACC	2	8	240747	240754	25 %	0 %	25 %	50 %	342162963
5016	NC_015875	AGA	2	6	240761	240766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162963
5017	NC_015875	CTA	2	6	240777	240782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162963
5018	NC_015875	TGT	2	6	240797	240802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162963
5019	NC_015875	TTGA	2	8	240843	240850	25 %	50 %	25 %	0 %	342162963
5020	NC_015875	ATT	2	6	240860	240865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162963
5021	NC_015875	GAA	2	6	240867	240872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162963
5022	NC_015875	ATT	3	9	240978	240986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162963
5023	NC_015875	GAAC	2	8	240987	240994	50 %	0 %	25 %	25 %	342162963
5024	NC_015875	A	7	7	241028	241034	100 %	0 %	0 %	0 %	342162963
5025	NC_015875	TATTC	2	10	241101	241110	20 %	60 %	0 %	20 %	342162963
5026	NC_015875	AAC	2	6	241142	241147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162963
5027	NC_015875	ACT	2	6	241206	241211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162964
5028	NC_015875	AAC	2	6	241222	241227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162964
5029	NC_015875	TTCT	2	8	241228	241235	0 %	75 %	0 %	25 %	342162964
5030	NC_015875	AGA	2	6	241250	241255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162964
5031	NC_015875	TTA	2	6	241300	241305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162964
5032	NC_015875	TTTG	2	8	241351	241358	0 %	75 %	25 %	0 %	342162964
5033	NC_015875	CTT	2	6	241414	241419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162964
5034	NC_015875	ATC	2	6	241522	241527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162964
5035	NC_015875	ATG	2	6	241591	241596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162964
5036	NC_015875	CTAT	2	8	241600	241607	25 %	50 %	0 %	25 %	342162964
5037	NC_015875	A	7	7	241614	241620	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5038	NC_015875	ATT	2	6	241647	241652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162964
5039	NC_015875	AAC	2	6	241710	241715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162964
5040	NC_015875	AG	3	6	241766	241771	50 %	0 %	50 %	0 %	342162964
5041	NC_015875	A	6	6	241869	241874	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5042	NC_015875	AGCT	2	8	241945	241952	25 %	25 %	25 %	25 %	342162964
5043	NC_015875	ATG	2	6	241969	241974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162964
5044	NC_015875	A	6	6	242002	242007	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5045	NC_015875	T	6	6	242027	242032	0 %	100 %	0 %	0 %	342162964
5046	NC_015875	ATC	3	9	242038	242046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162964
5047	NC_015875	GATC	2	8	242054	242061	25 %	25 %	25 %	25 %	342162964
5048	NC_015875	CTA	2	6	242155	242160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162964
5049	NC_015875	A	6	6	242160	242165	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5050	NC_015875	CTT	2	6	242179	242184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162964
5051	NC_015875	GAA	2	6	242280	242285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162964
5052	NC_015875	A	7	7	242289	242295	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5053	NC_015875	TAA	2	6	242303	242308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162964
5054	NC_015875	GCA	2	6	242406	242411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162964
5055	NC_015875	AACT	2	8	242437	242444	50 %	25 %	0 %	25 %	342162964
5056	NC_015875	A	6	6	242505	242510	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5057	NC_015875	AGA	2	6	242531	242536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162964
5058	NC_015875	TAG	2	6	242566	242571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162964
5059	NC_015875	GAAG	2	8	242619	242626	50 %	0 %	50 %	0 %	342162964
5060	NC_015875	TGA	2	6	242645	242650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162964
5061	NC_015875	AAT	2	6	242729	242734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162964
5062	NC_015875	AT	3	6	242832	242837	50 %	50 %	0 %	0 %	342162964
5063	NC_015875	A	7	7	242840	242846	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5064	NC_015875	AAT	2	6	242855	242860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162964
5065	NC_015875	CCG	2	6	242949	242954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	342162964
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5068	NC_015875	TGC	2	6	242981	242986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162964
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5070	NC_015875	AAG	2	6	243091	243096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162964
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5072	NC_015875	A	7	7	243485	243491	100 %	0 %	0 %	0 %	342162964
5073	NC_015875	ATT	2	6	243497	243502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162964
5074	NC_015875	CTA	2	6	243521	243526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162964
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5076	NC_015875	ATT	2	6	243570	243575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162964
5077	NC_015875	GAA	2	6	243576	243581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162964
5078	NC_015875	ATG	2	6	243586	243591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162964
5079	NC_015875	GA	3	6	243698	243703	50 %	0 %	50 %	0 %	342162964
5080	NC_015875	T	6	6	243825	243830	0 %	100 %	0 %	0 %	342162964
5081	NC_015875	TAA	2	6	243901	243906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162964
5082	NC_015875	AGC	2	6	243941	243946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162964
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5084	NC_015875	TCA	2	6	244190	244195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162965
5085	NC_015875	TCAA	2	8	244292	244299	50 %	25 %	0 %	25 %	342162965
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5088	NC_015875	T	6	6	244387	244392	0 %	100 %	0 %	0 %	342162965
5089	NC_015875	TAG	2	6	244398	244403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162965
5090	NC_015875	ACC	2	6	244404	244409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_015875	TAA	2	6	244486	244491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015875	ACT	2	6	244497	244502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_015875	A	8	8	244513	244520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015875	TTG	2	6	244582	244587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015875	CAT	2	6	244611	244616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_015875	A	7	7	244650	244656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_015875	GTC	2	6	244657	244662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_015875	CCA	2	6	244685	244690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_015875	ATAG	2	8	244710	244717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015875	AAAT	2	8	244742	244749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015875	T	6	6	244762	244767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015875	T	6	6	244781	244786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015875	TTTA	2	8	244793	244800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015875	CAA	2	6	244810	244815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_015875	TTCCT	2	10	244871	244880	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5106	NC_015875	TCT	2	6	244912	244917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162966
5107	NC_015875	ACA	2	6	245068	245073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162966
5108	NC_015875	TTG	2	6	245140	245145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162966
5109	NC_015875	CTG	2	6	245191	245196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162966
5110	NC_015875	TTAA	2	8	245290	245297	50 %	50 %	0 %	0 %	342162966
5111	NC_015875	GGA	2	6	245307	245312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162966
5112	NC_015875	GAA	2	6	245317	245322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162966
5113	NC_015875	CAT	2	6	245406	245411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162967
5114	NC_015875	TGA	2	6	245483	245488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162967
5115	NC_015875	GAA	2	6	245500	245505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162967
5116	NC_015875	CT	3	6	245557	245562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_015875	CCA	2	6	245621	245626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_015875	AGCG	2	8	245763	245770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_015875	AAC	2	6	245966	245971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_015875	AGG	2	6	246002	246007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015875	GAA	2	6	246061	246066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162968
5122	NC_015875	ACG	2	6	246102	246107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162968
5123	NC_015875	A	6	6	246185	246190	100 %	0 %	0 %	0 %	342162968
5124	NC_015875	AAAGG	2	10	246278	246287	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015875	A	6	6	246305	246310	100 %	0 %	0 %	0 %	342162969
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5127	NC_015875	AT	3	6	246381	246386	50 %	50 %	0 %	0 %	342162969
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