MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 44852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015875	CAAG	2	8	213866	213873	50 %	0 %	25 %	25 %	342162936
4502	NC_015875	TCG	2	6	213893	213898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162936
4503	NC_015875	CCAT	2	8	213925	213932	25 %	25 %	0 %	50 %	342162936
4504	NC_015875	AGG	2	6	213961	213966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162936
4505	NC_015875	CTT	2	6	214049	214054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162936
4506	NC_015875	TCTT	2	8	214291	214298	0 %	75 %	0 %	25 %	342162936
4507	NC_015875	ATTA	2	8	214420	214427	50 %	50 %	0 %	0 %	342162936
4508	NC_015875	T	7	7	214485	214491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015875	CAT	2	6	214492	214497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_015875	CCT	2	6	214504	214509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_015875	TAA	2	6	214516	214521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015875	TAT	2	6	214525	214530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015875	AAT	2	6	214539	214544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015875	A	6	6	214583	214588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015875	GGA	2	6	214777	214782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162937
4516	NC_015875	TCC	2	6	214791	214796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162937
4517	NC_015875	TGG	2	6	214806	214811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162937
4518	NC_015875	ACT	2	6	214832	214837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162937
4519	NC_015875	CTC	2	6	214847	214852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162937
4520	NC_015875	CGT	2	6	214870	214875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162937
4521	NC_015875	AT	3	6	214929	214934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015875	AAAAT	2	10	214940	214949	80 %	20 %	0 %	0 %	342162938
4523	NC_015875	T	7	7	214974	214980	0 %	100 %	0 %	0 %	342162938
4524	NC_015875	TAT	2	6	215068	215073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162938
4525	NC_015875	ATG	2	6	215083	215088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162938
4526	NC_015875	T	7	7	215115	215121	0 %	100 %	0 %	0 %	342162938
4527	NC_015875	AAG	2	6	215161	215166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162938
4528	NC_015875	CTTTT	2	10	215201	215210	0 %	80 %	0 %	20 %	342162938
4529	NC_015875	GTT	2	6	215211	215216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162938
4530	NC_015875	T	8	8	215322	215329	0 %	100 %	0 %	0 %	342162938
4531	NC_015875	TGA	2	6	215381	215386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162938
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4533	NC_015875	TAT	2	6	215438	215443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162938
4534	NC_015875	TAG	2	6	215460	215465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162938
4535	NC_015875	TA	3	6	215495	215500	50 %	50 %	0 %	0 %	342162938
4536	NC_015875	TAG	2	6	215625	215630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015875	ATG	2	6	215639	215644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015875	CTAT	2	8	215673	215680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_015875	TTA	2	6	215711	215716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015875	TTC	2	6	215775	215780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162939
4541	NC_015875	T	6	6	215841	215846	0 %	100 %	0 %	0 %	342162939
4542	NC_015875	TCA	2	6	215904	215909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162939
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4545	NC_015875	TTG	2	6	216065	216070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162939
4546	NC_015875	TAG	2	6	216072	216077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162939
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4548	NC_015875	ATT	2	6	216158	216163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162939
4549	NC_015875	TTAGT	2	10	216210	216219	20 %	60 %	20 %	0 %	342162939
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4552	NC_015875	A	6	6	216357	216362	100 %	0 %	0 %	0 %	342162939
4553	NC_015875	AAG	2	6	216375	216380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162939
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4555	NC_015875	ATC	2	6	216418	216423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162939
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4557	NC_015875	CTTGC	2	10	216566	216575	0 %	40 %	20 %	40 %	342162939
4558	NC_015875	CT	3	6	216657	216662	0 %	50 %	0 %	50 %	342162939
4559	NC_015875	CTT	2	6	216686	216691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162939
4560	NC_015875	TAG	2	6	216693	216698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162939
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4567	NC_015875	AT	3	6	217007	217012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015875	ATG	2	6	217040	217045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015875	CAG	2	6	217054	217059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4571	NC_015875	TTA	2	6	217125	217130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_015875	GAG	2	6	217140	217145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_015875	GAAA	2	8	217152	217159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015875	GCAG	2	8	217179	217186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4575	NC_015875	GGCCT	2	10	217219	217228	0 %	20 %	40 %	40 %	342162940
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4583	NC_015875	GTG	2	6	217768	217773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162940
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4588	NC_015875	TAT	2	6	217975	217980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162941
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4591	NC_015875	AGAT	2	8	218339	218346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015875	GGA	2	6	218403	218408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_015875	A	7	7	218418	218424	100 %	0 %	0 %	0 %	342162942
4594	NC_015875	TTG	2	6	218458	218463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162942
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4596	NC_015875	AGC	2	6	218477	218482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162942
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4599	NC_015875	AGC	2	6	218513	218518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162942
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4601	NC_015875	ATC	2	6	218532	218537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162942
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4607	NC_015875	CAA	2	6	218958	218963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162942
4608	NC_015875	CAA	2	6	219084	219089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162942
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4611	NC_015875	TACC	2	8	219216	219223	25 %	25 %	0 %	50 %	342162942
4612	NC_015875	AAT	2	6	219241	219246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162942
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4614	NC_015875	AT	3	6	219297	219302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015875	TA	3	6	219313	219318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015875	TAA	2	6	219329	219334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015875	TAT	2	6	219375	219380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015875	A	6	6	219408	219413	100 %	0 %	0 %	0 %	342162943
4619	NC_015875	AGC	2	6	219425	219430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162943
4620	NC_015875	AGAAA	2	10	219476	219485	80 %	0 %	20 %	0 %	342162943
4621	NC_015875	CAA	2	6	219496	219501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162943
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4623	NC_015875	AAGA	2	8	219573	219580	75 %	0 %	25 %	0 %	342162943
4624	NC_015875	ACT	2	6	219613	219618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162943
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4626	NC_015875	CTT	2	6	219680	219685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162943
4627	NC_015875	AAC	2	6	219687	219692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162943
4628	NC_015875	TC	3	6	219742	219747	0 %	50 %	0 %	50 %	342162943
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4631	NC_015875	TCA	2	6	220002	220007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162943
4632	NC_015875	GCT	2	6	220014	220019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162943
4633	NC_015875	TGA	2	6	220088	220093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162943
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4639	NC_015875	GA	4	8	220272	220279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_015875	AGA	2	6	220318	220323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4641	NC_015875	AG	3	6	220344	220349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4642	NC_015875	ATT	2	6	220414	220419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162944
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4647	NC_015875	TGA	2	6	220715	220720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162944
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4733	NC_015875	A	6	6	224599	224604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4734	NC_015875	CATT	2	8	224648	224655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4735	NC_015875	A	6	6	224664	224669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4736	NC_015875	A	6	6	224719	224724	100 %	0 %	0 %	0 %	342162948
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4745	NC_015875	AG	3	6	225007	225012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_015875	ATG	2	6	225018	225023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162949
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5000	NC_015875	TCA	2	6	240167	240172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162962

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