MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 1495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	CAAAT	2	10	2306	2315	60 %	20 %	0 %	20 %	340397869
2	NC_015760	CAACC	2	10	2610	2619	40 %	0 %	0 %	60 %	340397869
3	NC_015760	TTTCA	2	10	2670	2679	20 %	60 %	0 %	20 %	340397869
4	NC_015760	TGAAA	2	10	2835	2844	60 %	20 %	20 %	0 %	340397870
5	NC_015760	TCTCG	2	10	5266	5275	0 %	40 %	20 %	40 %	340397873
6	NC_015760	GAGAT	2	10	5558	5567	40 %	20 %	40 %	0 %	340397873
7	NC_015760	CTATA	2	10	8491	8500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015760	CTTTT	2	10	8514	8523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015760	GACTA	2	10	12521	12530	40 %	20 %	20 %	20 %	340397879
10	NC_015760	GGTAA	2	10	12770	12779	40 %	20 %	40 %	0 %	340397880
11	NC_015760	TCGTG	2	10	16028	16037	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015760	GTTAA	2	10	16774	16783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015760	GGGAG	2	10	17292	17301	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015760	AGGGA	2	10	19500	19509	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015760	TTGAG	2	10	19734	19743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015760	TTGGT	2	10	21867	21876	0 %	60 %	40 %	0 %	340397881
17	NC_015760	CAATC	2	10	22999	23008	40 %	20 %	0 %	40 %	340397883
18	NC_015760	ATTCA	2	10	24118	24127	40 %	40 %	0 %	20 %	340397883
19	NC_015760	CAATA	2	10	25572	25581	60 %	20 %	0 %	20 %	340397885
20	NC_015760	TATCA	2	10	26047	26056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015760	TTTTA	2	10	26071	26080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015760	TGATT	2	10	27132	27141	20 %	60 %	20 %	0 %	340397886
23	NC_015760	TTTTG	2	10	27746	27755	0 %	80 %	20 %	0 %	340397887
24	NC_015760	GTAGA	2	10	30458	30467	40 %	20 %	40 %	0 %	340397890
25	NC_015760	TGGTA	2	10	30911	30920	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015760	GCTTT	2	10	32038	32047	0 %	60 %	20 %	20 %	340397892
27	NC_015760	GTGAT	2	10	33053	33062	20 %	40 %	40 %	0 %	340397892
28	NC_015760	AAATG	2	10	36541	36550	60 %	20 %	20 %	0 %	340397893
29	NC_015760	TCAAA	2	10	40789	40798	60 %	20 %	0 %	20 %	340397897
30	NC_015760	CTTTT	2	10	41183	41192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015760	ATTTC	2	10	41310	41319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015760	TTTTA	2	10	41581	41590	20 %	80 %	0 %	0 %	340397898
33	NC_015760	TTAAA	2	10	41655	41664	60 %	40 %	0 %	0 %	340397898
34	NC_015760	ATAGC	2	10	42832	42841	40 %	20 %	20 %	20 %	340397899
35	NC_015760	ACAAT	2	10	43438	43447	60 %	20 %	0 %	20 %	340397899
36	NC_015760	TAATA	2	10	45331	45340	60 %	40 %	0 %	0 %	340397901
37	NC_015760	TTTAT	2	10	45607	45616	20 %	80 %	0 %	0 %	340397902
38	NC_015760	TTGAT	2	10	46085	46094	20 %	60 %	20 %	0 %	340397903
39	NC_015760	GAAGC	2	10	48900	48909	40 %	0 %	40 %	20 %	340397905
40	NC_015760	ATTTT	2	10	49213	49222	20 %	80 %	0 %	0 %	340397906
41	NC_015760	GAAAA	2	10	52013	52022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015760	GCTTG	2	10	52088	52097	0 %	40 %	40 %	20 %	340397910
43	NC_015760	TGAGT	2	10	53938	53947	20 %	40 %	40 %	0 %	340397913
44	NC_015760	ATTGT	2	10	54120	54129	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015760	AATTT	2	10	54135	54144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015760	CTTTT	2	10	54606	54615	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015760	TAGGG	2	10	56450	56459	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015760	ACTAT	2	10	56724	56733	40 %	40 %	0 %	20 %	340397915
49	NC_015760	GGCCT	2	10	57742	57751	0 %	20 %	40 %	40 %	340397917
50	NC_015760	TCAGT	2	10	57800	57809	20 %	40 %	20 %	20 %	340397917
51	NC_015760	ATCGT	2	10	59015	59024	20 %	40 %	20 %	20 %	340397917
52	NC_015760	GATAA	2	10	60648	60657	60 %	20 %	20 %	0 %	340397919
53	NC_015760	CTTTA	2	10	63553	63562	20 %	60 %	0 %	20 %	340397922
54	NC_015760	GCAGA	2	10	66483	66492	40 %	0 %	40 %	20 %	340397926
55	NC_015760	GATAA	2	10	67615	67624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015760	AGTGA	2	10	67884	67893	40 %	20 %	40 %	0 %	340397927
57	NC_015760	TTGAT	2	10	67894	67903	20 %	60 %	20 %	0 %	340397927
58	NC_015760	TCGTG	2	10	69553	69562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015760	GTTAA	2	10	70299	70308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015760	GGGAG	2	10	70817	70826	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015760	AGGGA	2	10	73025	73034	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015760	TTGAG	2	10	73259	73268	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015760	ATGCC	2	10	75523	75532	20 %	20 %	20 %	40 %	340397928
64	NC_015760	TGATT	2	10	75791	75800	20 %	60 %	20 %	0 %	340397928
65	NC_015760	TGGTA	2	10	77984	77993	20 %	40 %	40 %	0 %	340397928
66	NC_015760	TCAAA	2	10	80188	80197	60 %	20 %	0 %	20 %	340397929
67	NC_015760	AATTT	2	10	80748	80757	40 %	60 %	0 %	0 %	340397931
68	NC_015760	AAGAT	2	10	81499	81508	60 %	20 %	20 %	0 %	340397932
69	NC_015760	GGGGC	2	10	86347	86356	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015760	ATAAA	2	10	86378	86387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015760	AAAAG	2	10	87461	87470	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015760	AAATA	2	10	88040	88049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015760	TCAGC	2	10	88608	88617	20 %	20 %	20 %	40 %	340397939
74	NC_015760	CAGAT	2	10	90242	90251	40 %	20 %	20 %	20 %	340397940
75	NC_015760	GGCTT	2	10	93249	93258	0 %	40 %	40 %	20 %	340397943
76	NC_015760	AAGAT	2	10	98468	98477	60 %	20 %	20 %	0 %	340397946
77	NC_015760	AAGGA	2	10	99507	99516	60 %	0 %	40 %	0 %	340397947
78	NC_015760	GCTTC	2	10	100754	100763	0 %	40 %	20 %	40 %	340397950
79	NC_015760	TGTTT	2	10	100964	100973	0 %	80 %	20 %	0 %	340397950
80	NC_015760	GATGA	2	10	104270	104279	40 %	20 %	40 %	0 %	340397953
81	NC_015760	GTATC	2	10	104580	104589	20 %	40 %	20 %	20 %	340397954
82	NC_015760	ATAGA	2	10	104881	104890	60 %	20 %	20 %	0 %	340397954
83	NC_015760	AACAA	2	10	107611	107620	80 %	0 %	0 %	20 %	340397959
84	NC_015760	CACAC	2	10	107745	107754	40 %	0 %	0 %	60 %	340397959
85	NC_015760	TGGAC	2	10	110023	110032	20 %	20 %	40 %	20 %	340397962
86	NC_015760	ATCAA	2	10	112038	112047	60 %	20 %	0 %	20 %	340397963
87	NC_015760	TGAAA	2	10	114494	114503	60 %	20 %	20 %	0 %	340397966
88	NC_015760	GGCTT	2	10	116081	116090	0 %	40 %	40 %	20 %	340397968
89	NC_015760	GTAAA	2	10	117614	117623	60 %	20 %	20 %	0 %	340397970
90	NC_015760	TATTT	2	10	119038	119047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015760	AAAAT	2	10	120683	120692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015760	TCTGT	2	10	122057	122066	0 %	60 %	20 %	20 %	340397974
93	NC_015760	CGGTT	2	10	123031	123040	0 %	40 %	40 %	20 %	340397975
94	NC_015760	CGACA	2	10	125082	125091	40 %	0 %	20 %	40 %	340397978
95	NC_015760	AAGGT	2	10	125397	125406	40 %	20 %	40 %	0 %	340397978
96	NC_015760	GTATC	2	10	127740	127749	20 %	40 %	20 %	20 %	340397980
97	NC_015760	CAAGA	2	10	129236	129245	60 %	0 %	20 %	20 %	340397981
98	NC_015760	TTCAT	2	10	129398	129407	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015760	AAAGG	2	10	130386	130395	60 %	0 %	40 %	0 %	340397982
100	NC_015760	TAAAG	2	10	130556	130565	60 %	20 %	20 %	0 %	340397982
101	NC_015760	TGATA	2	10	130676	130685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015760	TTTGG	2	10	130922	130931	0 %	60 %	40 %	0 %	340397983
103	NC_015760	GACAA	2	10	132767	132776	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015760	TCGTG	2	10	134108	134117	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015760	GTTAA	2	10	134854	134863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015760	GGGAG	2	10	135372	135381	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015760	AGGGA	2	10	137580	137589	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015760	TTGAG	2	10	137814	137823	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015760	TCGTG	2	10	139910	139919	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015760	GTTAA	2	10	140656	140665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015760	GGGAG	2	10	141174	141183	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015760	AGGGA	2	10	143382	143391	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015760	TTGAG	2	10	143616	143625	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015760	TATTT	2	10	144652	144661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015760	TATCT	2	10	145300	145309	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015760	TAAAC	2	10	146281	146290	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015760	TAAAA	2	10	147685	147694	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015760	ATTAT	2	10	148573	148582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015760	TTTGG	3	15	150677	150691	0 %	60 %	40 %	0 %	340397992
120	NC_015760	GAAGA	2	10	151399	151408	60 %	0 %	40 %	0 %	340397994
121	NC_015760	TTTGG	2	10	154463	154472	0 %	60 %	40 %	0 %	340397997
122	NC_015760	AAGGT	2	10	154489	154498	40 %	20 %	40 %	0 %	340397997
123	NC_015760	CTGGT	2	10	156070	156079	0 %	40 %	40 %	20 %	340397997
124	NC_015760	ACTGT	2	10	156287	156296	20 %	40 %	20 %	20 %	340397998
125	NC_015760	ATAAA	2	10	156760	156769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015760	TGATT	2	10	157587	157596	20 %	60 %	20 %	0 %	340397999
127	NC_015760	GAGAT	2	10	158639	158648	40 %	20 %	40 %	0 %	340397999
128	NC_015760	ATTGA	2	10	158944	158953	40 %	40 %	20 %	0 %	340397999
129	NC_015760	CTGGT	2	10	158954	158963	0 %	40 %	40 %	20 %	340397999
130	NC_015760	CATCA	2	10	160195	160204	40 %	20 %	0 %	40 %	340398001
131	NC_015760	AAGGA	2	10	166533	166542	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015760	AGTAG	2	10	168866	168875	40 %	20 %	40 %	0 %	340398007
133	NC_015760	CACAA	2	10	171765	171774	60 %	0 %	0 %	40 %	340398008
134	NC_015760	CGTAG	2	10	175125	175134	20 %	20 %	40 %	20 %	340398011
135	NC_015760	CACGC	2	10	176238	176247	20 %	0 %	20 %	60 %	340398013
136	NC_015760	CAAGT	2	10	179557	179566	40 %	20 %	20 %	20 %	340398016
137	NC_015760	CTCAG	2	10	182346	182355	20 %	20 %	20 %	40 %	340398019
138	NC_015760	TTTTG	2	10	183421	183430	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015760	AGCTT	2	10	184689	184698	20 %	40 %	20 %	20 %	340398021
140	NC_015760	TTTTA	2	10	185876	185885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015760	AGCTA	2	10	188234	188243	40 %	20 %	20 %	20 %	340398026
142	NC_015760	AAATG	2	10	189206	189215	60 %	20 %	20 %	0 %	340398027
143	NC_015760	TTGGT	2	10	191122	191131	0 %	60 %	40 %	0 %	340398027
144	NC_015760	TGTTT	2	10	191436	191445	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015760	TTTTA	2	10	193858	193867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015760	TAAGG	2	10	194364	194373	40 %	20 %	40 %	0 %	340398030
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151	NC_015760	TGATA	2	10	196566	196575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015760	TTTGA	2	10	197774	197783	20 %	60 %	20 %	0 %	340398033
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162	NC_015760	CCTTT	2	10	215814	215823	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_015760	ATGGG	2	10	217869	217878	20 %	20 %	60 %	0 %	340398053
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172	NC_015760	TGACC	2	10	227423	227432	20 %	20 %	20 %	40 %	340398064
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182	NC_015760	TGGAT	2	10	236711	236720	20 %	40 %	40 %	0 %	340398072
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184	NC_015760	ATTTT	2	10	241961	241970	20 %	80 %	0 %	0 %	340398076
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251	NC_015760	GTTAA	2	10	351262	351271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_015760	TGAAT	2	10	355567	355576	40 %	40 %	20 %	0 %	340398185
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