MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 5768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	AACA	2	8	380	387	75 %	0 %	0 %	25 %	340397868
2	NC_015760	TATT	2	8	556	563	25 %	75 %	0 %	0 %	340397868
3	NC_015760	ATGG	2	8	1164	1171	25 %	25 %	50 %	0 %	340397868
4	NC_015760	ATTA	2	8	1824	1831	50 %	50 %	0 %	0 %	340397869
5	NC_015760	TTTC	2	8	2336	2343	0 %	75 %	0 %	25 %	340397869
6	NC_015760	AATG	2	8	2887	2894	50 %	25 %	25 %	0 %	340397870
7	NC_015760	AAAT	2	8	3203	3210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015760	ACTG	2	8	3371	3378	25 %	25 %	25 %	25 %	340397871
9	NC_015760	GATT	2	8	3767	3774	25 %	50 %	25 %	0 %	340397871
10	NC_015760	CAAA	2	8	3893	3900	75 %	0 %	0 %	25 %	340397871
11	NC_015760	CTTG	2	8	4061	4068	0 %	50 %	25 %	25 %	340397871
12	NC_015760	ACTT	2	8	4077	4084	25 %	50 %	0 %	25 %	340397871
13	NC_015760	GTGC	2	8	4104	4111	0 %	25 %	50 %	25 %	340397871
14	NC_015760	ATCT	2	8	4603	4610	25 %	50 %	0 %	25 %	340397872
15	NC_015760	ACTG	2	8	5520	5527	25 %	25 %	25 %	25 %	340397873
16	NC_015760	CAGC	2	8	6007	6014	25 %	0 %	25 %	50 %	340397873
17	NC_015760	GTAT	2	8	6594	6601	25 %	50 %	25 %	0 %	340397873
18	NC_015760	CGGA	2	8	6605	6612	25 %	0 %	50 %	25 %	340397873
19	NC_015760	AAGC	2	8	6672	6679	50 %	0 %	25 %	25 %	340397873
20	NC_015760	TGAG	2	8	7535	7542	25 %	25 %	50 %	0 %	340397873
21	NC_015760	AAGA	2	8	8380	8387	75 %	0 %	25 %	0 %	340397873
22	NC_015760	TAAG	2	8	8478	8485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015760	ACGA	2	8	8944	8951	50 %	0 %	25 %	25 %	340397875
24	NC_015760	GAAG	2	8	9108	9115	50 %	0 %	50 %	0 %	340397875
25	NC_015760	AGCT	2	8	9538	9545	25 %	25 %	25 %	25 %	340397877
26	NC_015760	GTCT	2	8	10149	10156	0 %	50 %	25 %	25 %	340397877
27	NC_015760	AAGC	2	8	11353	11360	50 %	0 %	25 %	25 %	340397878
28	NC_015760	TAAT	2	8	12604	12611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015760	TACC	2	8	13034	13041	25 %	25 %	0 %	50 %	340397880
30	NC_015760	TCAA	2	8	13132	13139	50 %	25 %	0 %	25 %	340397880
31	NC_015760	TGCT	2	8	13308	13315	0 %	50 %	25 %	25 %	340397880
32	NC_015760	CTTT	2	8	13344	13351	0 %	75 %	0 %	25 %	340397880
33	NC_015760	ATGG	2	8	13553	13560	25 %	25 %	50 %	0 %	340397880
34	NC_015760	CAAC	2	8	13596	13603	50 %	0 %	0 %	50 %	340397880
35	NC_015760	TGAA	2	8	13803	13810	50 %	25 %	25 %	0 %	340397880
36	NC_015760	AAGA	2	8	13901	13908	75 %	0 %	25 %	0 %	340397880
37	NC_015760	AGCA	2	8	14184	14191	50 %	0 %	25 %	25 %	340397880
38	NC_015760	AAAG	2	8	14552	14559	75 %	0 %	25 %	0 %	340397880
39	NC_015760	ATTT	2	8	15151	15158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015760	GTGA	2	8	15361	15368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015760	AGCG	2	8	15532	15539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015760	TGGT	2	8	16197	16204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015760	AGCC	2	8	16413	16420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015760	TAAT	2	8	16689	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015760	ATAG	2	8	16702	16709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015760	GCGA	2	8	17016	17023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015760	ATTC	2	8	17881	17888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015760	CTAA	2	8	18235	18242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015760	TAGG	2	8	18889	18896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015760	AAAG	2	8	19670	19677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015760	GCGT	2	8	20874	20881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015760	ATCA	2	8	21657	21664	50 %	25 %	0 %	25 %	340397881
53	NC_015760	GTGA	2	8	22133	22140	25 %	25 %	50 %	0 %	340397881
54	NC_015760	CTTT	2	8	22406	22413	0 %	75 %	0 %	25 %	340397882
55	NC_015760	AAAT	2	8	24334	24341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015760	GGAG	2	8	24532	24539	25 %	0 %	75 %	0 %	340397884
57	NC_015760	TCTT	2	8	25042	25049	0 %	75 %	0 %	25 %	340397884
58	NC_015760	TAAT	2	8	25135	25142	50 %	50 %	0 %	0 %	340397884
59	NC_015760	TTTG	2	8	25256	25263	0 %	75 %	25 %	0 %	340397884
60	NC_015760	TTCT	2	8	25957	25964	0 %	75 %	0 %	25 %	340397885
61	NC_015760	ATTT	2	8	26177	26184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015760	TTGA	2	8	26908	26915	25 %	50 %	25 %	0 %	340397886
63	NC_015760	TGAT	2	8	26921	26928	25 %	50 %	25 %	0 %	340397886
64	NC_015760	TGAT	2	8	27101	27108	25 %	50 %	25 %	0 %	340397886
65	NC_015760	TTTG	2	8	27186	27193	0 %	75 %	25 %	0 %	340397886
66	NC_015760	AGCT	2	8	27216	27223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015760	CTTA	2	8	27558	27565	25 %	50 %	0 %	25 %	340397887
68	NC_015760	CAAC	2	8	27826	27833	50 %	0 %	0 %	50 %	340397887
69	NC_015760	CCTT	2	8	28941	28948	0 %	50 %	0 %	50 %	340397888
70	NC_015760	GAAA	2	8	29399	29406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015760	GTTT	2	8	29412	29419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015760	TTGA	2	8	31471	31478	25 %	50 %	25 %	0 %	340397891
73	NC_015760	CTTT	2	8	31976	31983	0 %	75 %	0 %	25 %	340397892
74	NC_015760	ATTC	2	8	32322	32329	25 %	50 %	0 %	25 %	340397892
75	NC_015760	TACT	2	8	32388	32395	25 %	50 %	0 %	25 %	340397892
76	NC_015760	CGCT	2	8	33906	33913	0 %	25 %	25 %	50 %	340397892
77	NC_015760	CAAG	2	8	35324	35331	50 %	0 %	25 %	25 %	340397892
78	NC_015760	TTCG	2	8	35564	35571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015760	TTAC	2	8	36312	36319	25 %	50 %	0 %	25 %	340397893
80	NC_015760	CCAA	2	8	36589	36596	50 %	0 %	0 %	50 %	340397893
81	NC_015760	ATTG	2	8	36826	36833	25 %	50 %	25 %	0 %	340397893
82	NC_015760	ACTT	2	8	36887	36894	25 %	50 %	0 %	25 %	340397893
83	NC_015760	TTGA	2	8	36908	36915	25 %	50 %	25 %	0 %	340397893
84	NC_015760	TTCT	2	8	37039	37046	0 %	75 %	0 %	25 %	340397893
85	NC_015760	TGCT	2	8	37434	37441	0 %	50 %	25 %	25 %	340397894
86	NC_015760	GTAT	2	8	37659	37666	25 %	50 %	25 %	0 %	340397894
87	NC_015760	GGTA	2	8	37699	37706	25 %	25 %	50 %	0 %	340397894
88	NC_015760	ACTC	2	8	37800	37807	25 %	25 %	0 %	50 %	340397894
89	NC_015760	GATT	2	8	38466	38473	25 %	50 %	25 %	0 %	340397895
90	NC_015760	GTTT	2	8	38476	38483	0 %	75 %	25 %	0 %	340397895
91	NC_015760	GAAC	2	8	39320	39327	50 %	0 %	25 %	25 %	340397896
92	NC_015760	GAAA	2	8	39535	39542	75 %	0 %	25 %	0 %	340397896
93	NC_015760	ATTG	2	8	39821	39828	25 %	50 %	25 %	0 %	340397897
94	NC_015760	AAAG	2	8	40692	40699	75 %	0 %	25 %	0 %	340397897
95	NC_015760	CCAA	2	8	40730	40737	50 %	0 %	0 %	50 %	340397897
96	NC_015760	AAAT	2	8	41290	41297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015760	ATAA	2	8	41329	41336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015760	ATCT	2	8	41493	41500	25 %	50 %	0 %	25 %	340397898
99	NC_015760	CTTT	2	8	41686	41693	0 %	75 %	0 %	25 %	340397898
100	NC_015760	AGAA	2	8	41947	41954	75 %	0 %	25 %	0 %	340397898
101	NC_015760	ATTG	2	8	42942	42949	25 %	50 %	25 %	0 %	340397899
102	NC_015760	AAAG	2	8	43367	43374	75 %	0 %	25 %	0 %	340397899
103	NC_015760	AAGT	2	8	43462	43469	50 %	25 %	25 %	0 %	340397899
104	NC_015760	ATTT	2	8	43525	43532	25 %	75 %	0 %	0 %	340397899
105	NC_015760	TAGT	2	8	43744	43751	25 %	50 %	25 %	0 %	340397899
106	NC_015760	TTTA	2	8	43760	43767	25 %	75 %	0 %	0 %	340397899
107	NC_015760	TGGT	2	8	44347	44354	0 %	50 %	50 %	0 %	340397900
108	NC_015760	AGGA	2	8	44869	44876	50 %	0 %	50 %	0 %	340397900
109	NC_015760	ACCT	2	8	44992	44999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015760	AAAG	2	8	45266	45273	75 %	0 %	25 %	0 %	340397901
111	NC_015760	TCAC	2	8	45381	45388	25 %	25 %	0 %	50 %	340397902
112	NC_015760	GCTC	2	8	45396	45403	0 %	25 %	25 %	50 %	340397902
113	NC_015760	TACT	2	8	45733	45740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015760	GCGA	2	8	47247	47254	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015760	CTAT	2	8	47968	47975	25 %	50 %	0 %	25 %	340397905
116	NC_015760	AAAC	2	8	49160	49167	75 %	0 %	0 %	25 %	340397906
117	NC_015760	GCGG	2	8	49380	49387	0 %	0 %	75 %	25 %	340397906
118	NC_015760	AAAC	2	8	49915	49922	75 %	0 %	0 %	25 %	340397906
119	NC_015760	TTGC	2	8	50063	50070	0 %	50 %	25 %	25 %	340397907
120	NC_015760	CTAT	2	8	50094	50101	25 %	50 %	0 %	25 %	340397907
121	NC_015760	TCTT	2	8	50662	50669	0 %	75 %	0 %	25 %	340397908
122	NC_015760	TATC	2	8	50674	50681	25 %	50 %	0 %	25 %	340397908
123	NC_015760	GCTG	2	8	51087	51094	0 %	25 %	50 %	25 %	340397908
124	NC_015760	ATTT	2	8	51325	51332	25 %	75 %	0 %	0 %	340397908
125	NC_015760	AAAG	2	8	51571	51578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015760	GTTG	2	8	51746	51753	0 %	50 %	50 %	0 %	340397909
127	NC_015760	CTAT	2	8	51778	51785	25 %	50 %	0 %	25 %	340397909
128	NC_015760	GAAG	2	8	51963	51970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015760	AATA	2	8	52076	52083	75 %	25 %	0 %	0 %	340397910
130	NC_015760	TCCT	2	8	52662	52669	0 %	50 %	0 %	50 %	340397910
131	NC_015760	TCGA	2	8	52718	52725	25 %	25 %	25 %	25 %	340397910
132	NC_015760	TTGA	2	8	52979	52986	25 %	50 %	25 %	0 %	340397910
133	NC_015760	TTGA	2	8	53105	53112	25 %	50 %	25 %	0 %	340397910
134	NC_015760	TTGA	2	8	53397	53404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015760	TGTA	2	8	54971	54978	25 %	50 %	25 %	0 %	340397914
136	NC_015760	AGAT	2	8	55013	55020	50 %	25 %	25 %	0 %	340397914
137	NC_015760	CAAG	2	8	55247	55254	50 %	0 %	25 %	25 %	340397914
138	NC_015760	ACCA	2	8	55398	55405	50 %	0 %	0 %	50 %	340397914
139	NC_015760	CATC	2	8	55601	55608	25 %	25 %	0 %	50 %	340397914
140	NC_015760	TCAT	2	8	56416	56423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015760	CTGG	2	8	57105	57112	0 %	25 %	50 %	25 %	340397916
142	NC_015760	AGCA	2	8	57190	57197	50 %	0 %	25 %	25 %	340397916
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