MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 29680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	AAG	2	6	86	91	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015760	ATT	2	6	181	186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397868
3	NC_015760	TCA	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397868
4	NC_015760	TGC	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397868
5	NC_015760	GGA	2	6	567	572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397868
6	NC_015760	TGT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397868
7	NC_015760	TGA	2	6	755	760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397868
8	NC_015760	AAT	3	9	834	842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397868
9	NC_015760	CAC	2	6	943	948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340397868
10	NC_015760	TAA	2	6	980	985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397868
11	NC_015760	TCC	2	6	1010	1015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340397868
12	NC_015760	GCT	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397868
13	NC_015760	GGA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397868
14	NC_015760	CTA	5	15	1580	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015760	ATA	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015760	TAA	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015760	CAT	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397869
18	NC_015760	TAA	2	6	1641	1646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397869
19	NC_015760	TCG	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397869
20	NC_015760	TCT	2	6	1690	1695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397869
21	NC_015760	AGA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397869
22	NC_015760	GTA	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397869
23	NC_015760	TGT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397869
24	NC_015760	GAA	2	6	1912	1917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397869
25	NC_015760	GCA	2	6	2077	2082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397869
26	NC_015760	GTC	2	6	2096	2101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397869
27	NC_015760	TGT	2	6	2223	2228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397869
28	NC_015760	GAT	2	6	2272	2277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397869
29	NC_015760	TCT	2	6	2297	2302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397869
30	NC_015760	CAG	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397869
31	NC_015760	ATG	2	6	2956	2961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397870
32	NC_015760	GTC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397870
33	NC_015760	AAG	2	6	2989	2994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397870
34	NC_015760	TCT	2	6	3092	3097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015760	CAG	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397871
36	NC_015760	GCT	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397871
37	NC_015760	TTA	2	6	3382	3387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397871
38	NC_015760	GAT	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
39	NC_015760	TTC	2	6	3718	3723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397871
40	NC_015760	AGA	2	6	3743	3748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397871
41	NC_015760	ACA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397871
42	NC_015760	TGA	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
43	NC_015760	TGA	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
44	NC_015760	AGT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
45	NC_015760	GAA	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397871
46	NC_015760	GAT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
47	NC_015760	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397871
48	NC_015760	AGC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397871
49	NC_015760	GAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397871
50	NC_015760	TTA	2	6	4216	4221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397871
51	NC_015760	GAA	2	6	4266	4271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397871
52	NC_015760	TGT	2	6	4283	4288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397871
53	NC_015760	CAT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397871
54	NC_015760	AAT	2	6	4397	4402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397872
55	NC_015760	TAG	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397872
56	NC_015760	GAA	2	6	4518	4523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397872
57	NC_015760	TTA	2	6	4637	4642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397872
58	NC_015760	GGA	2	6	4655	4660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397872
59	NC_015760	CAG	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397872
60	NC_015760	GCC	2	6	4807	4812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340397872
61	NC_015760	GAT	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397872
62	NC_015760	GAA	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397873
63	NC_015760	TCA	2	6	4998	5003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397873
64	NC_015760	GAT	2	6	5215	5220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
65	NC_015760	GTA	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
66	NC_015760	GGA	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397873
67	NC_015760	GAT	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
68	NC_015760	AGA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397873
69	NC_015760	GAG	2	6	5740	5745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397873
70	NC_015760	TGA	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
71	NC_015760	TCA	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397873
72	NC_015760	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
73	NC_015760	AGC	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397873
74	NC_015760	GAA	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397873
75	NC_015760	TAG	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
76	NC_015760	CGT	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
77	NC_015760	TGT	2	6	6447	6452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397873
78	NC_015760	ACT	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397873
79	NC_015760	TGC	2	6	6546	6551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
80	NC_015760	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397873
81	NC_015760	ATG	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
82	NC_015760	GAT	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
83	NC_015760	GAT	3	9	6757	6765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
84	NC_015760	GAT	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
85	NC_015760	TGC	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
86	NC_015760	ATG	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
87	NC_015760	ACA	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397873
88	NC_015760	ATT	2	6	7117	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397873
89	NC_015760	CTG	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
90	NC_015760	TGA	2	6	7185	7190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
91	NC_015760	AAC	2	6	7193	7198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397873
92	NC_015760	ATT	2	6	7324	7329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397873
93	NC_015760	GGC	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340397873
94	NC_015760	TAT	2	6	7608	7613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397873
95	NC_015760	GTA	2	6	7715	7720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397873
96	NC_015760	GTG	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340397873
97	NC_015760	TGC	2	6	8202	8207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397873
98	NC_015760	TAT	2	6	8241	8246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397873
99	NC_015760	TTC	2	6	8275	8280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397873
100	NC_015760	GAA	2	6	8401	8406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397873
101	NC_015760	AGA	2	6	8620	8625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015760	AAG	2	6	8713	8718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397874
103	NC_015760	AAG	2	6	8920	8925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397874
104	NC_015760	GTT	2	6	9040	9045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397875
105	NC_015760	GAT	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397875
106	NC_015760	TAT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397875
107	NC_015760	TTA	2	6	9274	9279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397875
108	NC_015760	AGG	2	6	9394	9399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340397876
109	NC_015760	GAA	2	6	9401	9406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340397876
110	NC_015760	TGT	2	6	9439	9444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397877
111	NC_015760	TCT	2	6	9452	9457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340397877
112	NC_015760	TAC	2	6	9532	9537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397877
113	NC_015760	AAC	2	6	9586	9591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397877
114	NC_015760	ACA	2	6	9753	9758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397877
115	NC_015760	AGC	2	6	9895	9900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340397877
116	NC_015760	CTA	2	6	9919	9924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340397877
117	NC_015760	GCT	2	6	10073	10078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397877
118	NC_015760	TAT	2	6	10133	10138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397877
119	NC_015760	CTG	2	6	10197	10202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397877
120	NC_015760	TGA	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397877
121	NC_015760	TTA	2	6	10342	10347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397877
122	NC_015760	TAT	2	6	10486	10491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340397877
123	NC_015760	ATG	2	6	10515	10520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397877
124	NC_015760	GAT	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397877
125	NC_015760	AAT	2	6	10701	10706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340397877
126	NC_015760	TTG	2	6	10717	10722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340397878
127	NC_015760	ATG	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397878
128	NC_015760	TAG	2	6	10769	10774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340397878
129	NC_015760	TGC	2	6	10805	10810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340397878
130	NC_015760	AAC	2	6	10874	10879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340397878
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