MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 44602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_015760	CAAA	2	8	195199	195206	75 %	0 %	0 %	25 %	340398031
4003	NC_015760	TCTTA	2	10	195241	195250	20 %	60 %	0 %	20 %	340398031
4004	NC_015760	ATT	2	6	195256	195261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398031
4005	NC_015760	TC	3	6	195306	195311	0 %	50 %	0 %	50 %	340398031
4006	NC_015760	AAT	2	6	195319	195324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398031
4007	NC_015760	ATTG	2	8	195333	195340	25 %	50 %	25 %	0 %	340398031
4008	NC_015760	ACT	2	6	195388	195393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398031
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4011	NC_015760	ATG	2	6	195422	195427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398031
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4013	NC_015760	GAG	2	6	195535	195540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340398031
4014	NC_015760	TTA	2	6	195585	195590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398031
4015	NC_015760	TTG	2	6	195632	195637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398031
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4018	NC_015760	CTT	2	6	195733	195738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398031
4019	NC_015760	ATT	2	6	195754	195759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398031
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4022	NC_015760	A	7	7	195879	195885	100 %	0 %	0 %	0 %	340398031
4023	NC_015760	A	6	6	196006	196011	100 %	0 %	0 %	0 %	340398031
4024	NC_015760	AT	3	6	196067	196072	50 %	50 %	0 %	0 %	340398031
4025	NC_015760	TGA	2	6	196137	196142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398031
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4027	NC_015760	AAGT	2	8	196310	196317	50 %	25 %	25 %	0 %	340398031
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4032	NC_015760	TGA	2	6	196524	196529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398031
4033	NC_015760	ATT	2	6	196531	196536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398031
4034	NC_015760	TGATA	2	10	196566	196575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015760	ATTT	2	8	196586	196593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015760	A	6	6	196664	196669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015760	A	6	6	196671	196676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4039	NC_015760	GCT	2	6	196812	196817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398032
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4049	NC_015760	GTCT	2	8	197476	197483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4050	NC_015760	CTTG	2	8	197494	197501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_015760	TAG	3	9	197520	197528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4053	NC_015760	GGA	2	6	197543	197548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4059	NC_015760	TCT	2	6	197763	197768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398033
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4112	NC_015760	CCT	2	6	200912	200917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_015760	ATG	2	6	200928	200933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4124	NC_015760	ATC	2	6	201513	201518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398037
4125	NC_015760	TGG	2	6	201524	201529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398037
4126	NC_015760	GGT	2	6	201537	201542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398037
4127	NC_015760	AGA	2	6	201641	201646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398037
4128	NC_015760	GAA	2	6	201654	201659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398037
4129	NC_015760	AAGA	2	8	201663	201670	75 %	0 %	25 %	0 %	340398037
4130	NC_015760	CAT	2	6	201676	201681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398037
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4132	NC_015760	AC	3	6	201763	201768	50 %	0 %	0 %	50 %	340398037
4133	NC_015760	AAG	3	9	201790	201798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398037
4134	NC_015760	TGA	2	6	201833	201838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398037
4135	NC_015760	TGC	2	6	201842	201847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398037
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4137	NC_015760	TGA	3	9	201899	201907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398037
4138	NC_015760	GTG	2	6	201912	201917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398037
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4142	NC_015760	GTT	2	6	202113	202118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398037
4143	NC_015760	TGA	2	6	202322	202327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398037
4144	NC_015760	AAC	2	6	202402	202407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398037
4145	NC_015760	ATG	2	6	202492	202497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398037
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4148	NC_015760	GAT	2	6	202596	202601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398037
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4150	NC_015760	TTGA	2	8	202749	202756	25 %	50 %	25 %	0 %	340398037
4151	NC_015760	AAC	2	6	202772	202777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398037
4152	NC_015760	A	6	6	202797	202802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_015760	AAG	2	6	202820	202825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_015760	GA	3	6	202858	202863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_015760	AG	3	6	202866	202871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_015760	TTA	2	6	202982	202987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_015760	GTCA	2	8	203032	203039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4158	NC_015760	T	7	7	203167	203173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_015760	A	6	6	203220	203225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_015760	GAAA	2	8	203229	203236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_015760	ATAG	2	8	203244	203251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_015760	A	6	6	203255	203260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_015760	GAA	2	6	203277	203282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398038
4164	NC_015760	ATG	2	6	203296	203301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398038
4165	NC_015760	TTA	2	6	203306	203311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398038
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4167	NC_015760	TCCT	2	8	203391	203398	0 %	50 %	0 %	50 %	340398038
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4169	NC_015760	ATG	2	6	203540	203545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398038
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4176	NC_015760	A	6	6	203752	203757	100 %	0 %	0 %	0 %	340398038
4177	NC_015760	GAA	2	6	203806	203811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398038
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4192	NC_015760	ACA	2	6	204656	204661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398038
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4201	NC_015760	CTTG	2	8	205125	205132	0 %	50 %	25 %	25 %	340398038
4202	NC_015760	ATC	2	6	205135	205140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398038
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4205	NC_015760	TGA	2	6	205363	205368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398039
4206	NC_015760	TGA	2	6	205394	205399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398039
4207	NC_015760	TTG	2	6	205410	205415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398039
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4216	NC_015760	TCG	3	9	205903	205911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398039
4217	NC_015760	GAAAA	2	10	205926	205935	80 %	0 %	20 %	0 %	340398039
4218	NC_015760	TAA	2	6	206016	206021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398039
4219	NC_015760	A	6	6	206024	206029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4220	NC_015760	T	6	6	206061	206066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4221	NC_015760	AT	3	6	206098	206103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_015760	TAA	3	9	206155	206163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_015760	ATCGT	2	10	206208	206217	20 %	40 %	20 %	20 %	340398040
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4226	NC_015760	A	6	6	206241	206246	100 %	0 %	0 %	0 %	340398040
4227	NC_015760	CTG	2	6	206295	206300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398040
4228	NC_015760	ATTG	2	8	206344	206351	25 %	50 %	25 %	0 %	340398040
4229	NC_015760	GCA	2	6	206363	206368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398040
4230	NC_015760	TTG	2	6	206382	206387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398040
4231	NC_015760	GAT	2	6	206420	206425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398040
4232	NC_015760	AAG	2	6	206504	206509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_015760	TCA	2	6	206539	206544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398041
4234	NC_015760	GCA	2	6	206554	206559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398041
4235	NC_015760	GTG	2	6	206567	206572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398041
4236	NC_015760	ATG	2	6	206666	206671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398041
4237	NC_015760	ACGA	2	8	206755	206762	50 %	0 %	25 %	25 %	340398041
4238	NC_015760	AAC	2	6	206778	206783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398041
4239	NC_015760	CGT	2	6	206863	206868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398041
4240	NC_015760	AGC	2	6	206877	206882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398041
4241	NC_015760	TAA	2	6	206931	206936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398041
4242	NC_015760	TCA	2	6	206965	206970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398041
4243	NC_015760	ATG	2	6	207023	207028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398041
4244	NC_015760	GAG	2	6	207043	207048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340398041
4245	NC_015760	TGAC	2	8	207176	207183	25 %	25 %	25 %	25 %	340398041
4246	NC_015760	TTC	2	6	207209	207214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398041
4247	NC_015760	GAA	2	6	207223	207228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398041
4248	NC_015760	GTC	2	6	207242	207247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398041
4249	NC_015760	ATT	2	6	207256	207261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398041
4250	NC_015760	TGA	2	6	207264	207269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398041
4251	NC_015760	TGT	2	6	207327	207332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398041
4252	NC_015760	CGT	2	6	207361	207366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398041
4253	NC_015760	GCA	2	6	207454	207459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398041
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4261	NC_015760	ATC	2	6	207901	207906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398041
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4271	NC_015760	ACC	2	6	208247	208252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4272	NC_015760	AAT	2	6	208442	208447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398042
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4280	NC_015760	GTAA	2	8	208816	208823	50 %	25 %	25 %	0 %	340398042
4281	NC_015760	GCTG	2	8	208903	208910	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4282	NC_015760	ACC	2	6	208939	208944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4283	NC_015760	GGT	2	6	208954	208959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4285	NC_015760	TGT	2	6	208977	208982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4286	NC_015760	TTG	2	6	209019	209024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398043
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4300	NC_015760	TCTTG	2	10	209357	209366	0 %	60 %	20 %	20 %	340398043
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4314	NC_015760	GCT	2	6	209752	209757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398043
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4318	NC_015760	CTTTA	2	10	209915	209924	20 %	60 %	0 %	20 %	340398044
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4354	NC_015760	CTT	2	6	212350	212355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398047
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4356	NC_015760	TTC	2	6	212393	212398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398047
4357	NC_015760	CT	3	6	212399	212404	0 %	50 %	0 %	50 %	340398047
4358	NC_015760	AGCA	2	8	212426	212433	50 %	0 %	25 %	25 %	340398047
4359	NC_015760	AAT	2	6	212456	212461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398047
4360	NC_015760	GCCA	2	8	212498	212505	25 %	0 %	25 %	50 %	340398047
4361	NC_015760	TGC	2	6	212524	212529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398047
4362	NC_015760	TGA	2	6	212542	212547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398047
4363	NC_015760	AGC	2	6	212548	212553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398047
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4365	NC_015760	TGA	2	6	212653	212658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398047
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4367	NC_015760	GTC	2	6	212712	212717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398047
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4369	NC_015760	GAA	2	6	212783	212788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398047
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4371	NC_015760	GATG	2	8	212854	212861	25 %	25 %	50 %	0 %	340398047
4372	NC_015760	GCA	2	6	212881	212886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398047
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4475	NC_015760	TCCT	2	8	218152	218159	0 %	50 %	0 %	50 %	340398053
4476	NC_015760	GCAAC	2	10	218297	218306	40 %	0 %	20 %	40 %	340398053
4477	NC_015760	A	6	6	218542	218547	100 %	0 %	0 %	0 %	340398053
4478	NC_015760	GCTA	2	8	218628	218635	25 %	25 %	25 %	25 %	340398053
4479	NC_015760	GCT	2	6	218748	218753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398053
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4482	NC_015760	AGA	2	6	218807	218812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398053
4483	NC_015760	TTGG	2	8	218834	218841	0 %	50 %	50 %	0 %	340398053
4484	NC_015760	TACC	2	8	218870	218877	25 %	25 %	0 %	50 %	340398053
4485	NC_015760	GTC	2	6	218899	218904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398053
4486	NC_015760	CCAATC	2	12	218922	218933	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340398053
4487	NC_015760	GTC	2	6	219091	219096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398053
4488	NC_015760	TAC	2	6	219138	219143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398053
4489	NC_015760	TGA	2	6	219182	219187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398053
4490	NC_015760	GTGG	2	8	219225	219232	0 %	25 %	75 %	0 %	340398053
4491	NC_015760	ACC	2	6	219370	219375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340398053
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