MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 44602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015760	TGG	2	6	244207	244212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398076
5003	NC_015760	AAG	2	6	244331	244336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398076
5004	NC_015760	AAC	2	6	244353	244358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398076
5005	NC_015760	CAT	2	6	244563	244568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015760	GAC	2	6	244606	244611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398077
5007	NC_015760	CTTG	2	8	244639	244646	0 %	50 %	25 %	25 %	340398077
5008	NC_015760	TTG	2	6	244734	244739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398077
5009	NC_015760	AAG	2	6	244807	244812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398077
5010	NC_015760	TCC	2	6	244882	244887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340398077
5011	NC_015760	AAG	2	6	244891	244896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398077
5012	NC_015760	CAA	2	6	244899	244904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398077
5013	NC_015760	ACTG	2	8	244928	244935	25 %	25 %	25 %	25 %	340398077
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5015	NC_015760	AAC	2	6	244994	244999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398077
5016	NC_015760	CAA	2	6	245112	245117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398077
5017	NC_015760	CTT	2	6	245204	245209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398077
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5019	NC_015760	GCTTTG	2	12	245384	245395	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340398078
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5021	NC_015760	AGCA	2	8	245469	245476	50 %	0 %	25 %	25 %	340398078
5022	NC_015760	TCCT	2	8	245487	245494	0 %	50 %	0 %	50 %	340398078
5023	NC_015760	A	7	7	245502	245508	100 %	0 %	0 %	0 %	340398078
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5025	NC_015760	ATTG	2	8	245527	245534	25 %	50 %	25 %	0 %	340398078
5026	NC_015760	AAC	2	6	245558	245563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398078
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5032	NC_015760	TGA	2	6	245908	245913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398078
5033	NC_015760	TAC	2	6	245999	246004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398078
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5039	NC_015760	ATT	2	6	246299	246304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398078
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5043	NC_015760	TGC	2	6	246502	246507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398078
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5050	NC_015760	TGA	2	6	247140	247145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398079
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5052	NC_015760	TGG	2	6	247167	247172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398079
5053	NC_015760	GTTAC	2	10	247226	247235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5054	NC_015760	AGG	2	6	247303	247308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_015760	AAG	2	6	247394	247399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398080
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5060	NC_015760	AGTA	2	8	247518	247525	50 %	25 %	25 %	0 %	340398080
5061	NC_015760	CA	3	6	247553	247558	50 %	0 %	0 %	50 %	340398080
5062	NC_015760	CAA	2	6	247603	247608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398080
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5091	NC_015760	CCTA	2	8	248825	248832	25 %	25 %	0 %	50 %	340398080
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5102	NC_015760	A	7	7	249370	249376	100 %	0 %	0 %	0 %	340398081
5103	NC_015760	A	6	6	249383	249388	100 %	0 %	0 %	0 %	340398081
5104	NC_015760	AGAA	2	8	249410	249417	75 %	0 %	25 %	0 %	340398081
5105	NC_015760	GGA	2	6	249435	249440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340398081
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5114	NC_015760	GTT	2	6	249916	249921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_015760	ATC	2	6	250288	250293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398082
5122	NC_015760	TCG	2	6	250313	250318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398082
5123	NC_015760	TTG	2	6	250350	250355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398082
5124	NC_015760	AGT	2	6	250376	250381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398082
5125	NC_015760	GAT	3	9	250392	250400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398082
5126	NC_015760	TGC	2	6	250473	250478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398082
5127	NC_015760	GTA	2	6	250479	250484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398082
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5130	NC_015760	T	6	6	250595	250600	0 %	100 %	0 %	0 %	340398082
5131	NC_015760	CGTT	2	8	250627	250634	0 %	50 %	25 %	25 %	340398082
5132	NC_015760	ATG	2	6	250735	250740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398082
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5134	NC_015760	TGA	2	6	250796	250801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398082
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5139	NC_015760	T	6	6	250960	250965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_015760	T	7	7	250988	250994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_015760	AAGA	2	8	250995	251002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_015760	CTT	2	6	251125	251130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398083
5143	NC_015760	CTGA	2	8	251161	251168	25 %	25 %	25 %	25 %	340398083
5144	NC_015760	CGT	2	6	251188	251193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398083
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5148	NC_015760	CCT	2	6	251318	251323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5149	NC_015760	CTTT	2	8	251334	251341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5150	NC_015760	TCAA	2	8	251422	251429	50 %	25 %	0 %	25 %	340398084
5151	NC_015760	ATT	2	6	251461	251466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398084
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5161	NC_015760	CTG	2	6	252057	252062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398084
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5166	NC_015760	TAT	3	9	252243	252251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398085
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5196	NC_015760	T	6	6	253510	253515	0 %	100 %	0 %	0 %	340398087
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5222	NC_015760	CTTGAG	2	12	254502	254513	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340398087
5223	NC_015760	TTGGC	2	10	254567	254576	0 %	40 %	40 %	20 %	340398087
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5226	NC_015760	ATAA	2	8	254638	254645	75 %	25 %	0 %	0 %	340398087
5227	NC_015760	ATT	2	6	254652	254657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5228	NC_015760	TTA	2	6	254658	254663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5229	NC_015760	ATT	2	6	254701	254706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_015760	A	7	7	254758	254764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_015760	TTA	2	6	254792	254797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398088
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5233	NC_015760	GTG	2	6	254987	254992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340398088
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5237	NC_015760	CG	3	6	255099	255104	0 %	0 %	50 %	50 %	340398088
5238	NC_015760	CTTT	2	8	255184	255191	0 %	75 %	0 %	25 %	340398088
5239	NC_015760	TCT	2	6	255212	255217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398088
5240	NC_015760	CT	3	6	255216	255221	0 %	50 %	0 %	50 %	340398088
5241	NC_015760	ATC	2	6	255239	255244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398088
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5243	NC_015760	GCT	2	6	255385	255390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398088
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5369	NC_015760	TTG	2	6	262159	262164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398098
5370	NC_015760	TAT	2	6	262203	262208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398098
5371	NC_015760	CTT	2	6	262209	262214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398098
5372	NC_015760	TTC	2	6	262235	262240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398098
5373	NC_015760	TGA	2	6	262247	262252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398098
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5375	NC_015760	TCT	2	6	262340	262345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398098
5376	NC_015760	ATG	2	6	262357	262362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398098
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5380	NC_015760	CAGC	2	8	262709	262716	25 %	0 %	25 %	50 %	340398098
5381	NC_015760	GCT	2	6	262725	262730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398098
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5387	NC_015760	TGT	2	6	263165	263170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398100
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5437	NC_015760	ATC	2	6	265864	265869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5439	NC_015760	AT	3	6	265964	265969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5440	NC_015760	GTC	2	6	266033	266038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5442	NC_015760	ATC	2	6	266188	266193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398102
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5452	NC_015760	ACAGT	2	10	266800	266809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5459	NC_015760	AC	3	6	266917	266922	50 %	0 %	0 %	50 %	340398103
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5473	NC_015760	CTT	2	6	267501	267506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398104
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5477	NC_015760	TAT	2	6	267673	267678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398104
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5479	NC_015760	TTG	2	6	267972	267977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398104
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5481	NC_015760	AAAC	2	8	268120	268127	75 %	0 %	0 %	25 %	340398104
5482	NC_015760	T	7	7	268148	268154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_015760	CTT	2	6	268171	268176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5484	NC_015760	TAT	2	6	268209	268214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5485	NC_015760	TAT	2	6	268248	268253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_015760	CAG	2	6	268350	268355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398105
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5489	NC_015760	A	6	6	268478	268483	100 %	0 %	0 %	0 %	340398105
5490	NC_015760	TGA	2	6	268523	268528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398105
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