MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 44602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015760	AGA	2	6	219863	219868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398053
4502	NC_015760	CGAAAT	2	12	219953	219964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340398053
4503	NC_015760	GTT	2	6	219966	219971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398053
4504	NC_015760	AAG	2	6	220036	220041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398053
4505	NC_015760	TAA	2	6	220112	220117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398053
4506	NC_015760	TTA	2	6	220148	220153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015760	TTG	2	6	220214	220219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015760	GGA	2	6	220254	220259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015760	T	6	6	220260	220265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015760	CTT	2	6	220269	220274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_015760	AAG	2	6	220312	220317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015760	AAGA	2	8	220330	220337	75 %	0 %	25 %	0 %	340398054
4513	NC_015760	TAA	2	6	220350	220355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398054
4514	NC_015760	ATCA	2	8	220425	220432	50 %	25 %	0 %	25 %	340398054
4515	NC_015760	TTGA	2	8	220450	220457	25 %	50 %	25 %	0 %	340398054
4516	NC_015760	AAGA	2	8	220555	220562	75 %	0 %	25 %	0 %	340398054
4517	NC_015760	A	7	7	220595	220601	100 %	0 %	0 %	0 %	340398054
4518	NC_015760	A	6	6	220621	220626	100 %	0 %	0 %	0 %	340398054
4519	NC_015760	AGC	2	6	220655	220660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398054
4520	NC_015760	A	6	6	220673	220678	100 %	0 %	0 %	0 %	340398054
4521	NC_015760	T	6	6	220682	220687	0 %	100 %	0 %	0 %	340398054
4522	NC_015760	GATG	2	8	220737	220744	25 %	25 %	50 %	0 %	340398054
4523	NC_015760	A	7	7	220822	220828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015760	ATT	3	9	220953	220961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398055
4525	NC_015760	ATG	2	6	220989	220994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398055
4526	NC_015760	TAT	2	6	221038	221043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398055
4527	NC_015760	CAA	2	6	221091	221096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398055
4528	NC_015760	T	6	6	221105	221110	0 %	100 %	0 %	0 %	340398055
4529	NC_015760	AAGAAA	2	12	221132	221143	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340398055
4530	NC_015760	CT	3	6	221152	221157	0 %	50 %	0 %	50 %	340398055
4531	NC_015760	TTA	2	6	221171	221176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398055
4532	NC_015760	T	7	7	221182	221188	0 %	100 %	0 %	0 %	340398055
4533	NC_015760	AG	3	6	221227	221232	50 %	0 %	50 %	0 %	340398055
4534	NC_015760	ATT	2	6	221345	221350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398055
4535	NC_015760	TCT	2	6	221405	221410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398055
4536	NC_015760	A	6	6	221541	221546	100 %	0 %	0 %	0 %	340398055
4537	NC_015760	GAG	2	6	221591	221596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340398055
4538	NC_015760	CTT	3	9	221685	221693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398055
4539	NC_015760	CT	3	6	221813	221818	0 %	50 %	0 %	50 %	340398055
4540	NC_015760	TGA	2	6	221848	221853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398055
4541	NC_015760	TGA	2	6	221878	221883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398055
4542	NC_015760	A	6	6	221921	221926	100 %	0 %	0 %	0 %	340398055
4543	NC_015760	ATC	2	6	221970	221975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398055
4544	NC_015760	TGA	2	6	222000	222005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398055
4545	NC_015760	AG	3	6	222007	222012	50 %	0 %	50 %	0 %	340398055
4546	NC_015760	TGGC	2	8	222023	222030	0 %	25 %	50 %	25 %	340398055
4547	NC_015760	T	7	7	222040	222046	0 %	100 %	0 %	0 %	340398055
4548	NC_015760	GAA	2	6	222058	222063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398055
4549	NC_015760	TGGT	2	8	222124	222131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015760	TCC	2	6	222164	222169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_015760	AGG	2	6	222199	222204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015760	GAT	2	6	222335	222340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398056
4553	NC_015760	GAA	2	6	222451	222456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398056
4554	NC_015760	TTC	2	6	222475	222480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398056
4555	NC_015760	TTGCAG	2	12	222497	222508	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340398056
4556	NC_015760	AGGAA	2	10	222513	222522	60 %	0 %	40 %	0 %	340398056
4557	NC_015760	GGAG	2	8	222600	222607	25 %	0 %	75 %	0 %	340398056
4558	NC_015760	TA	3	6	222705	222710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015760	TAA	2	6	222717	222722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015760	GTC	2	6	222731	222736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398057
4561	NC_015760	TGA	2	6	222748	222753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398057
4562	NC_015760	TACT	2	8	222774	222781	25 %	50 %	0 %	25 %	340398057
4563	NC_015760	CTT	2	6	222859	222864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398057
4564	NC_015760	CCG	2	6	222891	222896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340398057
4565	NC_015760	T	6	6	222906	222911	0 %	100 %	0 %	0 %	340398057
4566	NC_015760	A	6	6	222954	222959	100 %	0 %	0 %	0 %	340398057
4567	NC_015760	TCA	2	6	222990	222995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398057
4568	NC_015760	TA	3	6	223004	223009	50 %	50 %	0 %	0 %	340398057
4569	NC_015760	AAAT	2	8	223045	223052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015760	TAG	2	6	223089	223094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015760	A	6	6	223113	223118	100 %	0 %	0 %	0 %	340398058
4572	NC_015760	GTA	2	6	223143	223148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398058
4573	NC_015760	TGGT	2	8	223167	223174	0 %	50 %	50 %	0 %	340398058
4574	NC_015760	GGA	2	6	223182	223187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340398058
4575	NC_015760	AT	3	6	223191	223196	50 %	50 %	0 %	0 %	340398058
4576	NC_015760	AG	3	6	223218	223223	50 %	0 %	50 %	0 %	340398058
4577	NC_015760	TCAA	2	8	223230	223237	50 %	25 %	0 %	25 %	340398058
4578	NC_015760	GAGAA	2	10	223240	223249	60 %	0 %	40 %	0 %	340398058
4579	NC_015760	ATTG	2	8	223309	223316	25 %	50 %	25 %	0 %	340398058
4580	NC_015760	CTTC	2	8	223456	223463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_015760	CAC	2	6	223465	223470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_015760	T	6	6	223521	223526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_015760	GA	4	8	223550	223557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015760	ATC	2	6	223600	223605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398059
4585	NC_015760	CGA	2	6	223684	223689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398059
4586	NC_015760	AGATG	2	10	223787	223796	40 %	20 %	40 %	0 %	340398059
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4589	NC_015760	CAAAAA	2	12	223899	223910	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340398059
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4591	NC_015760	AT	3	6	223978	223983	50 %	50 %	0 %	0 %	340398059
4592	NC_015760	CAA	2	6	223999	224004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398059
4593	NC_015760	TGA	2	6	224102	224107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398059
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4595	NC_015760	CAG	2	6	224229	224234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340398059
4596	NC_015760	CAA	2	6	224271	224276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398059
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4598	NC_015760	GAT	2	6	224385	224390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398059
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4600	NC_015760	TCT	2	6	224484	224489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340398060
4601	NC_015760	TTG	2	6	224492	224497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398060
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4605	NC_015760	AAT	2	6	224591	224596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340398060
4606	NC_015760	TTTA	2	8	224697	224704	25 %	75 %	0 %	0 %	340398060
4607	NC_015760	ATC	2	6	224753	224758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398060
4608	NC_015760	TATG	2	8	224782	224789	25 %	50 %	25 %	0 %	340398060
4609	NC_015760	TG	3	6	224796	224801	0 %	50 %	50 %	0 %	340398060
4610	NC_015760	TAC	2	6	224832	224837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398060
4611	NC_015760	TAG	2	6	224863	224868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398060
4612	NC_015760	T	6	6	224965	224970	0 %	100 %	0 %	0 %	340398060
4613	NC_015760	ACT	2	6	225016	225021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398060
4614	NC_015760	ATGA	2	8	225074	225081	50 %	25 %	25 %	0 %	340398060
4615	NC_015760	GAT	2	6	225110	225115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398060
4616	NC_015760	GTT	2	6	225166	225171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398060
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4619	NC_015760	TAG	2	6	225216	225221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398060
4620	NC_015760	A	6	6	225260	225265	100 %	0 %	0 %	0 %	340398060
4621	NC_015760	GAA	2	6	225302	225307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398061
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4626	NC_015760	GCATC	2	10	225562	225571	20 %	20 %	20 %	40 %	340398061
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4659	NC_015760	TCTAA	2	10	227159	227168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4746	NC_015760	AGG	2	6	232164	232169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4874	NC_015760	TGT	2	6	238423	238428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398074
4875	NC_015760	TGAT	2	8	238536	238543	25 %	50 %	25 %	0 %	340398074
4876	NC_015760	GGC	2	6	238615	238620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340398074
4877	NC_015760	TTGA	2	8	238661	238668	25 %	50 %	25 %	0 %	340398074
4878	NC_015760	TGA	2	6	238801	238806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398074
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4881	NC_015760	ATT	2	6	238979	238984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340398074
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4885	NC_015760	AGA	2	6	239244	239249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340398075
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4900	NC_015760	TGA	2	6	239868	239873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398075
4901	NC_015760	TGT	2	6	239892	239897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340398075
4902	NC_015760	TGA	2	6	239907	239912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340398075
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4939	NC_015760	TAC	2	6	241126	241131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340398075
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4942	NC_015760	T	6	6	241263	241268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4960	NC_015760	GGAA	2	8	242064	242071	50 %	0 %	50 %	0 %	340398076
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4978	NC_015760	GATG	2	8	242976	242983	25 %	25 %	50 %	0 %	340398076
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4990	NC_015760	A	6	6	243685	243690	100 %	0 %	0 %	0 %	340398076
4991	NC_015760	TCCT	2	8	243698	243705	0 %	50 %	0 %	50 %	340398076
4992	NC_015760	TCAC	2	8	243728	243735	25 %	25 %	0 %	50 %	340398076
4993	NC_015760	CTAT	2	8	243764	243771	25 %	50 %	0 %	25 %	340398076
4994	NC_015760	ACA	2	6	243783	243788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398076
4995	NC_015760	CAA	2	6	243793	243798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340398076
4996	NC_015760	CGT	2	6	243832	243837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398076
4997	NC_015760	CT	3	6	243893	243898	0 %	50 %	0 %	50 %	340398076
4998	NC_015760	AG	3	6	243940	243945	50 %	0 %	50 %	0 %	340398076
4999	NC_015760	GTC	2	6	244085	244090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340398076
5000	NC_015760	TCAA	2	8	244109	244116	50 %	25 %	0 %	25 %	340398076

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