MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfobacillus acidophilus TPY chromosome

Total Repeats: 2219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015757	CGTGA	2	10	5382	5391	20 %	20 %	40 %	20 %	339626334
2	NC_015757	ACGGG	2	10	5423	5432	20 %	0 %	60 %	20 %	339626334
3	NC_015757	GCCAA	2	10	8335	8344	40 %	0 %	20 %	40 %	339626335
4	NC_015757	CGTGG	2	10	8494	8503	0 %	20 %	60 %	20 %	339626335
5	NC_015757	GGTCC	2	10	10630	10639	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015757	ATTGG	2	10	11827	11836	20 %	40 %	40 %	0 %	339626339
7	NC_015757	GCAAC	2	10	14043	14052	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015757	AGGAG	2	10	16957	16966	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015757	CGGGT	2	10	22938	22947	0 %	20 %	60 %	20 %	339626350
10	NC_015757	CCGGT	2	10	23944	23953	0 %	20 %	40 %	40 %	339626350
11	NC_015757	CCGTG	2	10	24194	24203	0 %	20 %	40 %	40 %	339626350
12	NC_015757	GCCCC	2	10	27878	27887	0 %	0 %	20 %	80 %	339626355
13	NC_015757	CGATC	2	10	28124	28133	20 %	20 %	20 %	40 %	339626355
14	NC_015757	CGGTC	2	10	30167	30176	0 %	20 %	40 %	40 %	339626357
15	NC_015757	GGCCG	2	10	30373	30382	0 %	0 %	60 %	40 %	339626357
16	NC_015757	CGAAC	2	10	32908	32917	40 %	0 %	20 %	40 %	339626359
17	NC_015757	CCACG	2	10	33269	33278	20 %	0 %	20 %	60 %	339626360
18	NC_015757	CGTGA	2	10	36347	36356	20 %	20 %	40 %	20 %	339626364
19	NC_015757	GTCCG	2	10	37451	37460	0 %	20 %	40 %	40 %	339626365
20	NC_015757	CCAGG	2	10	38225	38234	20 %	0 %	40 %	40 %	339626366
21	NC_015757	GACGC	2	10	38712	38721	20 %	0 %	40 %	40 %	339626366
22	NC_015757	AAGCG	2	10	40927	40936	40 %	0 %	40 %	20 %	339626368
23	NC_015757	TGGAA	2	10	42880	42889	40 %	20 %	40 %	0 %	339626371
24	NC_015757	CCGGT	2	10	42967	42976	0 %	20 %	40 %	40 %	339626371
25	NC_015757	CGGGC	2	10	45768	45777	0 %	0 %	60 %	40 %	339626372
26	NC_015757	ATCGC	2	10	49722	49731	20 %	20 %	20 %	40 %	339626376
27	NC_015757	GGCGC	2	10	49766	49775	0 %	0 %	60 %	40 %	339626376
28	NC_015757	GTCGT	2	10	50294	50303	0 %	40 %	40 %	20 %	339626378
29	NC_015757	AGCCG	2	10	50665	50674	20 %	0 %	40 %	40 %	339626378
30	NC_015757	GCCCG	2	10	51661	51670	0 %	0 %	40 %	60 %	339626381
31	NC_015757	GGGCC	2	10	52059	52068	0 %	0 %	60 %	40 %	339626381
32	NC_015757	CCGGC	2	10	52799	52808	0 %	0 %	40 %	60 %	339626382
33	NC_015757	ATACG	2	10	53402	53411	40 %	20 %	20 %	20 %	339626382
34	NC_015757	CGGGA	2	10	54238	54247	20 %	0 %	60 %	20 %	339626385
35	NC_015757	CCGGG	2	10	56390	56399	0 %	0 %	60 %	40 %	339626385
36	NC_015757	ACCCG	2	10	57572	57581	20 %	0 %	20 %	60 %	339626386
37	NC_015757	GCGGA	2	10	60071	60080	20 %	0 %	60 %	20 %	339626388
38	NC_015757	GACCT	2	10	63184	63193	20 %	20 %	20 %	40 %	339626393
39	NC_015757	TACCG	2	10	64189	64198	20 %	20 %	20 %	40 %	339626394
40	NC_015757	TCGAA	2	10	66846	66855	40 %	20 %	20 %	20 %	339626395
41	NC_015757	CGGGG	2	10	69069	69078	0 %	0 %	80 %	20 %	339626396
42	NC_015757	GGCCT	2	10	69703	69712	0 %	20 %	40 %	40 %	339626396
43	NC_015757	TTGGG	2	10	71710	71719	0 %	40 %	60 %	0 %	339626398
44	NC_015757	AGTCG	2	10	76640	76649	20 %	20 %	40 %	20 %	339626399
45	NC_015757	CGTCC	2	10	80500	80509	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_015757	AAAAC	2	10	81205	81214	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015757	AACGA	2	10	85339	85348	60 %	0 %	20 %	20 %	339626401
48	NC_015757	TACGT	2	10	87988	87997	20 %	40 %	20 %	20 %	339626403
49	NC_015757	GAAGC	2	10	92039	92048	40 %	0 %	40 %	20 %	339626404
50	NC_015757	GGGGA	2	10	92582	92591	20 %	0 %	80 %	0 %	339626404
51	NC_015757	GATTA	2	10	92730	92739	40 %	40 %	20 %	0 %	339626405
52	NC_015757	GGCGG	2	10	95263	95272	0 %	0 %	80 %	20 %	339626407
53	NC_015757	GCCCC	2	10	96371	96380	0 %	0 %	20 %	80 %	339626407
54	NC_015757	CCCAT	2	10	97723	97732	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_015757	CGTGG	2	10	98266	98275	0 %	20 %	60 %	20 %	339626411
56	NC_015757	AGACG	2	10	100091	100100	40 %	0 %	40 %	20 %	339626412
57	NC_015757	CAATC	2	10	100438	100447	40 %	20 %	0 %	40 %	339626412
58	NC_015757	ACCGG	2	10	101895	101904	20 %	0 %	40 %	40 %	339626413
59	NC_015757	TGACG	2	10	103019	103028	20 %	20 %	40 %	20 %	339626413
60	NC_015757	CCGGC	2	10	106552	106561	0 %	0 %	40 %	60 %	339626416
61	NC_015757	CCCGG	2	10	106597	106606	0 %	0 %	40 %	60 %	339626416
62	NC_015757	CGGGA	2	10	108069	108078	20 %	0 %	60 %	20 %	339626417
63	NC_015757	TTTCC	2	10	110579	110588	0 %	60 %	0 %	40 %	339626419
64	NC_015757	GGGCG	2	10	111276	111285	0 %	0 %	80 %	20 %	339626419
65	NC_015757	GAAAT	2	10	113371	113380	60 %	20 %	20 %	0 %	339626421
66	NC_015757	CTTCC	2	10	113651	113660	0 %	40 %	0 %	60 %	339626421
67	NC_015757	AGCCG	2	10	114469	114478	20 %	0 %	40 %	40 %	339626422
68	NC_015757	TCGGG	2	10	115639	115648	0 %	20 %	60 %	20 %	339626423
69	NC_015757	GATCG	2	10	115756	115765	20 %	20 %	40 %	20 %	339626424
70	NC_015757	GAGCG	2	10	117615	117624	20 %	0 %	60 %	20 %	339626426
71	NC_015757	ATCGG	2	10	117970	117979	20 %	20 %	40 %	20 %	339626426
72	NC_015757	ACTTG	2	10	119723	119732	20 %	40 %	20 %	20 %	339626428
73	NC_015757	GGCTC	2	10	120285	120294	0 %	20 %	40 %	40 %	339626429
74	NC_015757	GGTTC	2	10	126156	126165	0 %	40 %	40 %	20 %	339626434
75	NC_015757	GTCCG	2	10	126397	126406	0 %	20 %	40 %	40 %	339626434
76	NC_015757	CCGGG	2	10	126600	126609	0 %	0 %	60 %	40 %	339626434
77	NC_015757	CGGAC	2	10	128066	128075	20 %	0 %	40 %	40 %	339626436
78	NC_015757	TCCCG	2	10	134603	134612	0 %	20 %	20 %	60 %	339626441
79	NC_015757	CGATT	2	10	136033	136042	20 %	40 %	20 %	20 %	339626445
80	NC_015757	TAACG	2	10	140347	140356	40 %	20 %	20 %	20 %	339626449
81	NC_015757	GATCG	2	10	141780	141789	20 %	20 %	40 %	20 %	339626450
82	NC_015757	GCCGC	2	10	145336	145345	0 %	0 %	40 %	60 %	339626453
83	NC_015757	ATTTG	2	10	152337	152346	20 %	60 %	20 %	0 %	339626463
84	NC_015757	GTCCC	2	10	154112	154121	0 %	20 %	20 %	60 %	339626466
85	NC_015757	GAGAG	2	10	154926	154935	40 %	0 %	60 %	0 %	339626468
86	NC_015757	CCGGC	2	10	156773	156782	0 %	0 %	40 %	60 %	339626470
87	NC_015757	GATTT	2	10	160927	160936	20 %	60 %	20 %	0 %	339626475
88	NC_015757	AGATA	2	10	161166	161175	60 %	20 %	20 %	0 %	339626476
89	NC_015757	CGGTC	2	10	164459	164468	0 %	20 %	40 %	40 %	339626479
90	NC_015757	CCGAG	2	10	164759	164768	20 %	0 %	40 %	40 %	339626479
91	NC_015757	CTGGC	2	10	165852	165861	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015757	TCGTG	2	10	166185	166194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015757	AGGCG	2	10	168398	168407	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015757	CGCGT	2	10	169539	169548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015757	CTGGC	2	10	173432	173441	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015757	TCGTG	2	10	173764	173773	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015757	AGGCG	2	10	175977	175986	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015757	CGCGT	2	10	177118	177127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015757	AACCG	2	10	178124	178133	40 %	0 %	20 %	40 %	339626482
100	NC_015757	GTGGC	2	10	186520	186529	0 %	20 %	60 %	20 %	339626491
101	NC_015757	CGGTA	2	10	188883	188892	20 %	20 %	40 %	20 %	339626493
102	NC_015757	CGTGG	2	10	189793	189802	0 %	20 %	60 %	20 %	339626494
103	NC_015757	AATTA	2	10	190373	190382	60 %	40 %	0 %	0 %	339626495
104	NC_015757	TTTGA	2	10	193689	193698	20 %	60 %	20 %	0 %	339626498
105	NC_015757	GAGCC	2	10	196567	196576	20 %	0 %	40 %	40 %	339626500
106	NC_015757	GGATC	2	10	197194	197203	20 %	20 %	40 %	20 %	339626500
107	NC_015757	AGTCC	2	10	198608	198617	20 %	20 %	20 %	40 %	339626502
108	NC_015757	TATTT	2	10	198656	198665	20 %	80 %	0 %	0 %	339626502
109	NC_015757	CGGCC	2	10	199909	199918	0 %	0 %	40 %	60 %	339626503
110	NC_015757	CCCAT	2	10	200414	200423	20 %	20 %	0 %	60 %	339626504
111	NC_015757	CACTC	2	10	200473	200482	20 %	20 %	0 %	60 %	339626504
112	NC_015757	TTCGG	2	10	200684	200693	0 %	40 %	40 %	20 %	339626505
113	NC_015757	GGGAC	2	10	202172	202181	20 %	0 %	60 %	20 %	339626508
114	NC_015757	GGGTC	2	10	204606	204615	0 %	20 %	60 %	20 %	339626509
115	NC_015757	CGGAT	2	10	205053	205062	20 %	20 %	40 %	20 %	339626510
116	NC_015757	GGTCA	2	10	207155	207164	20 %	20 %	40 %	20 %	339626513
117	NC_015757	CGGCC	2	10	208028	208037	0 %	0 %	40 %	60 %	339626513
118	NC_015757	GGACG	2	10	208139	208148	20 %	0 %	60 %	20 %	339626513
119	NC_015757	GGTTT	2	10	215309	215318	0 %	60 %	40 %	0 %	339626518
120	NC_015757	ACGGG	2	10	221007	221016	20 %	0 %	60 %	20 %	339626528
121	NC_015757	CCAGG	2	10	222263	222272	20 %	0 %	40 %	40 %	339626529
122	NC_015757	AGGGA	2	10	222494	222503	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015757	GACGT	2	10	224659	224668	20 %	20 %	40 %	20 %	339626531
124	NC_015757	AGGAT	2	10	224988	224997	40 %	20 %	40 %	0 %	339626531
125	NC_015757	ACCCG	2	10	228463	228472	20 %	0 %	20 %	60 %	339626534
126	NC_015757	ATTTT	2	10	233448	233457	20 %	80 %	0 %	0 %	339626537
127	NC_015757	ATTGG	2	10	236131	236140	20 %	40 %	40 %	0 %	339626538
128	NC_015757	GCCCA	2	10	237683	237692	20 %	0 %	20 %	60 %	339626539
129	NC_015757	AGTGG	2	10	237936	237945	20 %	20 %	60 %	0 %	339626540
130	NC_015757	CCCGG	2	10	239188	239197	0 %	0 %	40 %	60 %	339626541
131	NC_015757	CCGGC	2	10	244225	244234	0 %	0 %	40 %	60 %	339626548
132	NC_015757	ACCCT	2	10	244916	244925	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_015757	GCCCA	2	10	245820	245829	20 %	0 %	20 %	60 %	339626549
134	NC_015757	CGACG	2	10	246850	246859	20 %	0 %	40 %	40 %	339626550
135	NC_015757	CACCG	2	10	247066	247075	20 %	0 %	20 %	60 %	339626550
136	NC_015757	ATCGG	2	10	247870	247879	20 %	20 %	40 %	20 %	339626551
137	NC_015757	ACGGC	2	10	249214	249223	20 %	0 %	40 %	40 %	339626552
138	NC_015757	GGGGA	2	10	249306	249315	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015757	CCGAT	2	10	251287	251296	20 %	20 %	20 %	40 %	339626555
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148	NC_015757	CGGTT	2	10	264527	264536	0 %	40 %	40 %	20 %	339626567
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150	NC_015757	CTGGC	2	10	268951	268960	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_015757	TCGTG	2	10	269283	269292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_015757	CGCGT	2	10	272723	272732	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
154	NC_015757	CTGGC	2	10	276799	276808	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_015757	TCGTG	2	10	277132	277141	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_015757	AGGCG	2	10	279430	279439	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_015757	CGCGT	2	10	280571	280580	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
158	NC_015757	TCCGG	2	10	281209	281218	0 %	20 %	40 %	40 %	339626574
159	NC_015757	CTTGG	2	10	282220	282229	0 %	40 %	40 %	20 %	339626576
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231	NC_015757	CGTAC	2	10	394050	394059	20 %	20 %	20 %	40 %	339626707
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250	NC_015757	TCTAT	2	10	415647	415656	20 %	60 %	0 %	20 %	339626732
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262	NC_015757	AATTC	2	10	436513	436522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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