MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015732	A	7	7	211580	211586	100 %	0 %	0 %	0 %	339498828
4002	NC_015732	GAA	2	6	211639	211644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498828
4003	NC_015732	GATC	2	8	211681	211688	25 %	25 %	25 %	25 %	339498828
4004	NC_015732	GAT	2	6	211693	211698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498828
4005	NC_015732	CTG	2	6	211828	211833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498828
4006	NC_015732	GGC	2	6	211843	211848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498828
4007	NC_015732	GGT	3	9	211852	211860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498828
4008	NC_015732	ACCT	2	8	211863	211870	25 %	25 %	0 %	50 %	339498828
4009	NC_015732	GAT	2	6	211897	211902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498828
4010	NC_015732	TGA	2	6	211957	211962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498829
4011	NC_015732	AAC	2	6	211966	211971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498829
4012	NC_015732	TGA	2	6	212035	212040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498829
4013	NC_015732	GAAA	2	8	212092	212099	75 %	0 %	25 %	0 %	339498829
4014	NC_015732	AGT	2	6	212153	212158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498829
4015	NC_015732	TAAC	2	8	212205	212212	50 %	25 %	0 %	25 %	339498829
4016	NC_015732	GT	3	6	212306	212311	0 %	50 %	50 %	0 %	339498829
4017	NC_015732	CGT	2	6	212312	212317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498829
4018	NC_015732	GCG	2	6	212323	212328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498829
4019	NC_015732	TGGCTC	2	12	212334	212345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498829
4020	NC_015732	GTA	2	6	212354	212359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498829
4021	NC_015732	TCG	2	6	212371	212376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498829
4022	NC_015732	GAA	2	6	212423	212428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498829
4023	NC_015732	TAAA	2	8	212452	212459	75 %	25 %	0 %	0 %	339498829
4024	NC_015732	A	9	9	212457	212465	100 %	0 %	0 %	0 %	339498829
4025	NC_015732	AG	3	6	212474	212479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015732	CGGT	2	8	212525	212532	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_015732	ATT	2	6	212557	212562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498830
4028	NC_015732	TGT	2	6	212574	212579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498830
4029	NC_015732	AAG	2	6	212675	212680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498830
4030	NC_015732	TA	3	6	212696	212701	50 %	50 %	0 %	0 %	339498830
4031	NC_015732	T	7	7	212706	212712	0 %	100 %	0 %	0 %	339498830
4032	NC_015732	TTTA	2	8	212726	212733	25 %	75 %	0 %	0 %	339498830
4033	NC_015732	AAT	2	6	212796	212801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498830
4034	NC_015732	TTA	2	6	212813	212818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498830
4035	NC_015732	T	7	7	212837	212843	0 %	100 %	0 %	0 %	339498830
4036	NC_015732	CTA	2	6	212911	212916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498830
4037	NC_015732	A	7	7	212943	212949	100 %	0 %	0 %	0 %	339498830
4038	NC_015732	TCT	2	6	212990	212995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498830
4039	NC_015732	TGA	2	6	213033	213038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498830
4040	NC_015732	TGG	2	6	213048	213053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498830
4041	NC_015732	CTT	2	6	213116	213121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498830
4042	NC_015732	TCAA	2	8	213179	213186	50 %	25 %	0 %	25 %	339498830
4043	NC_015732	AAAG	2	8	213288	213295	75 %	0 %	25 %	0 %	339498830
4044	NC_015732	AGA	2	6	213339	213344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498830
4045	NC_015732	GTT	2	6	213357	213362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498830
4046	NC_015732	T	6	6	213563	213568	0 %	100 %	0 %	0 %	339498830
4047	NC_015732	TCTT	2	8	213641	213648	0 %	75 %	0 %	25 %	339498830
4048	NC_015732	GTG	2	6	213649	213654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498830
4049	NC_015732	AAT	2	6	213706	213711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498830
4050	NC_015732	ATTAT	2	10	213728	213737	40 %	60 %	0 %	0 %	339498830
4051	NC_015732	A	6	6	213757	213762	100 %	0 %	0 %	0 %	339498830
4052	NC_015732	T	6	6	213783	213788	0 %	100 %	0 %	0 %	339498831
4053	NC_015732	ACGA	2	8	213981	213988	50 %	0 %	25 %	25 %	339498831
4054	NC_015732	TTG	2	6	214242	214247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498831
4055	NC_015732	ATTGT	2	10	214260	214269	20 %	60 %	20 %	0 %	339498831
4056	NC_015732	AT	3	6	214279	214284	50 %	50 %	0 %	0 %	339498831
4057	NC_015732	AGGT	2	8	214366	214373	25 %	25 %	50 %	0 %	339498831
4058	NC_015732	AAT	2	6	214410	214415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498831
4059	NC_015732	TTA	2	6	214528	214533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498831
4060	NC_015732	GAA	2	6	214563	214568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498831
4061	NC_015732	TCGA	2	8	214574	214581	25 %	25 %	25 %	25 %	339498831
4062	NC_015732	GCA	2	6	214715	214720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498831
4063	NC_015732	CTTGG	2	10	214745	214754	0 %	40 %	40 %	20 %	339498831
4064	NC_015732	TAG	2	6	214798	214803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498831
4065	NC_015732	GAT	2	6	214809	214814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498831
4066	NC_015732	A	6	6	214822	214827	100 %	0 %	0 %	0 %	339498831
4067	NC_015732	TGT	2	6	214880	214885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498831
4068	NC_015732	A	6	6	214906	214911	100 %	0 %	0 %	0 %	339498831
4069	NC_015732	AAGG	2	8	215030	215037	50 %	0 %	50 %	0 %	339498831
4070	NC_015732	AAC	2	6	215254	215259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498832
4071	NC_015732	TAG	2	6	215338	215343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498832
4072	NC_015732	ATT	2	6	215386	215391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498832
4073	NC_015732	TC	3	6	215538	215543	0 %	50 %	0 %	50 %	339498832
4074	NC_015732	ATTT	2	8	215611	215618	25 %	75 %	0 %	0 %	339498832
4075	NC_015732	T	6	6	215676	215681	0 %	100 %	0 %	0 %	339498832
4076	NC_015732	ATT	2	6	215782	215787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498832
4077	NC_015732	ATA	2	6	215801	215806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498832
4078	NC_015732	GAA	2	6	215810	215815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498832
4079	NC_015732	A	6	6	215814	215819	100 %	0 %	0 %	0 %	339498832
4080	NC_015732	A	6	6	215924	215929	100 %	0 %	0 %	0 %	339498832
4081	NC_015732	GTT	2	6	215933	215938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498832
4082	NC_015732	TTC	2	6	216006	216011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498832
4083	NC_015732	GGA	2	6	216028	216033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498832
4084	NC_015732	GTA	2	6	216050	216055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498832
4085	NC_015732	TAC	2	6	216058	216063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498832
4086	NC_015732	ATTT	2	8	216148	216155	25 %	75 %	0 %	0 %	339498833
4087	NC_015732	TTA	2	6	216158	216163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498833
4088	NC_015732	CGA	2	6	216180	216185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498833
4089	NC_015732	CCA	2	6	216221	216226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498833
4090	NC_015732	GTT	2	6	216233	216238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498833
4091	NC_015732	AGA	2	6	216265	216270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498833
4092	NC_015732	A	6	6	216276	216281	100 %	0 %	0 %	0 %	339498833
4093	NC_015732	TTC	2	6	216450	216455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498833
4094	NC_015732	C	6	6	216471	216476	0 %	0 %	0 %	100 %	339498833
4095	NC_015732	TAT	2	6	216508	216513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498833
4096	NC_015732	A	6	6	216636	216641	100 %	0 %	0 %	0 %	339498833
4097	NC_015732	TTA	2	6	216773	216778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498833
4098	NC_015732	GGT	3	9	216839	216847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498833
4099	NC_015732	TGA	2	6	216922	216927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4100	NC_015732	ACT	2	6	217228	217233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498833
4101	NC_015732	AT	4	8	217347	217354	50 %	50 %	0 %	0 %	339498833
4102	NC_015732	GCA	2	6	217388	217393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498833
4103	NC_015732	TCA	2	6	217430	217435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498833
4104	NC_015732	GTT	2	6	217504	217509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498833
4105	NC_015732	GTT	2	6	217529	217534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498833
4106	NC_015732	GAT	2	6	217564	217569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4107	NC_015732	AAC	2	6	217606	217611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498833
4108	NC_015732	TTC	2	6	217670	217675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498833
4109	NC_015732	ACG	2	6	217720	217725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498833
4110	NC_015732	CAT	2	6	217771	217776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498833
4111	NC_015732	AAC	2	6	217812	217817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498833
4112	NC_015732	AGG	2	6	217914	217919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498833
4113	NC_015732	AAT	2	6	217936	217941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498833
4114	NC_015732	T	6	6	217964	217969	0 %	100 %	0 %	0 %	339498833
4115	NC_015732	CTT	2	6	217983	217988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498833
4116	NC_015732	ATTAC	2	10	218012	218021	40 %	40 %	0 %	20 %	339498833
4117	NC_015732	AAAG	2	8	218030	218037	75 %	0 %	25 %	0 %	339498833
4118	NC_015732	GATT	2	8	218038	218045	25 %	50 %	25 %	0 %	339498833
4119	NC_015732	AAAAT	2	10	218061	218070	80 %	20 %	0 %	0 %	339498833
4120	NC_015732	ATG	2	6	218102	218107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4121	NC_015732	TTC	2	6	218143	218148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498833
4122	NC_015732	TTA	2	6	218184	218189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498833
4123	NC_015732	TTG	2	6	218259	218264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498833
4124	NC_015732	AGC	2	6	218399	218404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498833
4125	NC_015732	GAAT	2	8	218407	218414	50 %	25 %	25 %	0 %	339498833
4126	NC_015732	ATG	2	6	218415	218420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4127	NC_015732	ATCGG	2	10	218440	218449	20 %	20 %	40 %	20 %	339498833
4128	NC_015732	TGA	2	6	218481	218486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4129	NC_015732	TAA	2	6	218620	218625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498833
4130	NC_015732	CAG	2	6	218654	218659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498833
4131	NC_015732	CTG	2	6	218667	218672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498833
4132	NC_015732	GAT	2	6	218675	218680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4133	NC_015732	CAA	2	6	218708	218713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498833
4134	NC_015732	AT	3	6	218722	218727	50 %	50 %	0 %	0 %	339498833
4135	NC_015732	CGC	2	6	218755	218760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498833
4136	NC_015732	GCCA	2	8	218783	218790	25 %	0 %	25 %	50 %	339498833
4137	NC_015732	ATC	2	6	218816	218821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498833
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4139	NC_015732	ATG	2	6	218997	219002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4140	NC_015732	TG	3	6	219005	219010	0 %	50 %	50 %	0 %	339498833
4141	NC_015732	GGC	2	6	219013	219018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498833
4142	NC_015732	TGA	2	6	219042	219047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
4143	NC_015732	AAC	2	6	219055	219060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498833
4144	NC_015732	TTC	2	6	219086	219091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498833
4145	NC_015732	TAA	2	6	219202	219207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498833
4146	NC_015732	TGA	2	6	219214	219219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498833
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4152	NC_015732	AT	3	6	219313	219318	50 %	50 %	0 %	0 %	339498834
4153	NC_015732	A	6	6	219358	219363	100 %	0 %	0 %	0 %	339498834
4154	NC_015732	TTC	2	6	219414	219419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498834
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4156	NC_015732	TTA	2	6	219467	219472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498834
4157	NC_015732	GAA	2	6	219481	219486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498834
4158	NC_015732	GCA	2	6	219495	219500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498834
4159	NC_015732	GTT	2	6	219502	219507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498834
4160	NC_015732	A	6	6	219525	219530	100 %	0 %	0 %	0 %	339498834
4161	NC_015732	TTA	2	6	219604	219609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_015732	GTCCT	2	10	219611	219620	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4163	NC_015732	TTG	2	6	219679	219684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498835
4164	NC_015732	TAA	2	6	219688	219693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498835
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4186	NC_015732	AGATG	2	10	221098	221107	40 %	20 %	40 %	0 %	339498836
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4193	NC_015732	TATTTT	2	12	221497	221508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	339498836
4194	NC_015732	TTA	2	6	221609	221614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4195	NC_015732	ACA	2	6	221636	221641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4196	NC_015732	TCCGC	2	10	221684	221693	0 %	20 %	20 %	60 %	339498837
4197	NC_015732	CAAAG	2	10	221813	221822	60 %	0 %	20 %	20 %	339498837
4198	NC_015732	TCT	2	6	221860	221865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498837
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4202	NC_015732	AGA	2	6	221998	222003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498837
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4208	NC_015732	TACC	2	8	222360	222367	25 %	25 %	0 %	50 %	339498838
4209	NC_015732	CTT	2	6	222483	222488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498838
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4213	NC_015732	T	6	6	222608	222613	0 %	100 %	0 %	0 %	339498838
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4229	NC_015732	AAAAC	2	10	223173	223182	80 %	0 %	0 %	20 %	339498838
4230	NC_015732	TGTT	2	8	223245	223252	0 %	75 %	25 %	0 %	339498839
4231	NC_015732	TCT	2	6	223300	223305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498839
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4233	NC_015732	TACT	2	8	223394	223401	25 %	50 %	0 %	25 %	339498839
4234	NC_015732	GCA	2	6	223420	223425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498839
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4238	NC_015732	ATG	2	6	223579	223584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498839
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4240	NC_015732	GCA	2	6	223756	223761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498839
4241	NC_015732	CCAT	2	8	223768	223775	25 %	25 %	0 %	50 %	339498839
4242	NC_015732	TCT	2	6	223849	223854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498839
4243	NC_015732	T	6	6	223879	223884	0 %	100 %	0 %	0 %	339498839
4244	NC_015732	AAT	2	6	223889	223894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498839
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4246	NC_015732	TCA	2	6	223969	223974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498839
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4251	NC_015732	TTG	2	6	224172	224177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498839
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4265	NC_015732	AAAG	2	8	224991	224998	75 %	0 %	25 %	0 %	339498839
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4277	NC_015732	TTC	2	6	225441	225446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498839
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4351	NC_015732	CTC	2	6	230175	230180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4357	NC_015732	T	6	6	230505	230510	0 %	100 %	0 %	0 %	339498844
4358	NC_015732	TGA	2	6	230519	230524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498844
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4365	NC_015732	GGT	2	6	230818	230823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498844
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4399	NC_015732	GA	4	8	232377	232384	50 %	0 %	50 %	0 %	339498845
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4461	NC_015732	AAT	2	6	235897	235902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4482	NC_015732	CCCCA	2	10	236885	236894	20 %	0 %	0 %	80 %	339498848
4483	NC_015732	TGA	2	6	236953	236958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498848
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4486	NC_015732	A	6	6	237106	237111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_015732	AT	3	6	237160	237165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4488	NC_015732	CT	3	6	237403	237408	0 %	50 %	0 %	50 %	339498849
4489	NC_015732	ACA	2	6	237598	237603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498849
4490	NC_015732	TTTC	2	8	237617	237624	0 %	75 %	0 %	25 %	339498849
4491	NC_015732	G	7	7	237644	237650	0 %	0 %	100 %	0 %	339498849
4492	NC_015732	TCA	2	6	237743	237748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498849
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