MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015732	GTA	2	6	184415	184420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498801
3502	NC_015732	CTT	2	6	184564	184569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498802
3503	NC_015732	GCC	2	6	184649	184654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498802
3504	NC_015732	GGT	2	6	184660	184665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498802
3505	NC_015732	TGT	2	6	184733	184738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498802
3506	NC_015732	TGA	2	6	184749	184754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498802
3507	NC_015732	TGT	2	6	184817	184822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498803
3508	NC_015732	ACC	2	6	184856	184861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498803
3509	NC_015732	ATCA	2	8	184876	184883	50 %	25 %	0 %	25 %	339498803
3510	NC_015732	TAT	2	6	184887	184892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498803
3511	NC_015732	GCT	2	6	185051	185056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498803
3512	NC_015732	CATG	2	8	185120	185127	25 %	25 %	25 %	25 %	339498803
3513	NC_015732	A	7	7	185152	185158	100 %	0 %	0 %	0 %	339498803
3514	NC_015732	ATA	2	6	185174	185179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498803
3515	NC_015732	T	6	6	185187	185192	0 %	100 %	0 %	0 %	339498803
3516	NC_015732	A	7	7	185233	185239	100 %	0 %	0 %	0 %	339498803
3517	NC_015732	TCA	2	6	185262	185267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498803
3518	NC_015732	GAAAA	2	10	185287	185296	80 %	0 %	20 %	0 %	339498803
3519	NC_015732	TCA	2	6	185372	185377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498803
3520	NC_015732	AAT	2	6	185392	185397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498803
3521	NC_015732	ATTT	2	8	185404	185411	25 %	75 %	0 %	0 %	339498803
3522	NC_015732	TGC	2	6	185488	185493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498803
3523	NC_015732	A	6	6	185532	185537	100 %	0 %	0 %	0 %	339498803
3524	NC_015732	TGT	2	6	185552	185557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498803
3525	NC_015732	T	7	7	185641	185647	0 %	100 %	0 %	0 %	339498803
3526	NC_015732	AGAAT	2	10	185696	185705	60 %	20 %	20 %	0 %	339498803
3527	NC_015732	AGTTG	2	10	185728	185737	20 %	40 %	40 %	0 %	339498803
3528	NC_015732	AGC	2	6	185756	185761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498803
3529	NC_015732	CTA	2	6	185793	185798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498803
3530	NC_015732	TAG	2	6	185865	185870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498803
3531	NC_015732	TAA	2	6	185929	185934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_015732	AAGA	2	8	185959	185966	75 %	0 %	25 %	0 %	339498804
3533	NC_015732	CAC	2	6	186022	186027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498804
3534	NC_015732	TAGC	2	8	186100	186107	25 %	25 %	25 %	25 %	339498804
3535	NC_015732	CGG	2	6	186146	186151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498804
3536	NC_015732	CTG	2	6	186238	186243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498804
3537	NC_015732	GCA	2	6	186432	186437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498804
3538	NC_015732	CGC	2	6	186499	186504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498804
3539	NC_015732	CCA	2	6	186631	186636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498804
3540	NC_015732	GCT	2	6	186666	186671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498804
3541	NC_015732	T	6	6	186756	186761	0 %	100 %	0 %	0 %	339498804
3542	NC_015732	TGA	2	6	186769	186774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498804
3543	NC_015732	GAAG	2	8	186923	186930	50 %	0 %	50 %	0 %	339498804
3544	NC_015732	GAA	2	6	186986	186991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498805
3545	NC_015732	TCA	2	6	187029	187034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498805
3546	NC_015732	GAA	2	6	187285	187290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498805
3547	NC_015732	CAC	2	6	187291	187296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498805
3548	NC_015732	AAT	2	6	187358	187363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498805
3549	NC_015732	AAT	2	6	187447	187452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498805
3550	NC_015732	CGA	2	6	187474	187479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498805
3551	NC_015732	GACT	2	8	187645	187652	25 %	25 %	25 %	25 %	339498805
3552	NC_015732	GCT	2	6	187684	187689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498805
3553	NC_015732	TCA	2	6	187698	187703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498805
3554	NC_015732	AT	3	6	187905	187910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_015732	ATG	2	6	187934	187939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498806
3556	NC_015732	GTA	2	6	187976	187981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498806
3557	NC_015732	TGT	2	6	188065	188070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498806
3558	NC_015732	A	6	6	188108	188113	100 %	0 %	0 %	0 %	339498806
3559	NC_015732	ATG	2	6	188126	188131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498806
3560	NC_015732	TAT	2	6	188164	188169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498806
3561	NC_015732	TG	3	6	188173	188178	0 %	50 %	50 %	0 %	339498806
3562	NC_015732	TGG	2	6	188210	188215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498806
3563	NC_015732	ATT	2	6	188218	188223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498806
3564	NC_015732	TTCT	2	8	188224	188231	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_015732	AAT	2	6	188268	188273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015732	GTT	2	6	188278	188283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015732	TTC	2	6	188340	188345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_015732	CGG	2	6	188368	188373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_015732	T	6	6	188406	188411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015732	ACAGT	2	10	188440	188449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3571	NC_015732	TGGA	2	8	188451	188458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_015732	AGA	2	6	188459	188464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015732	TTA	2	6	188489	188494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_015732	T	7	7	188534	188540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_015732	ATG	2	6	188707	188712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498807
3576	NC_015732	ACA	2	6	188745	188750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498807
3577	NC_015732	TTG	2	6	188771	188776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498807
3578	NC_015732	CCT	2	6	188793	188798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498807
3579	NC_015732	AGT	3	9	188834	188842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498807
3580	NC_015732	A	6	6	188894	188899	100 %	0 %	0 %	0 %	339498807
3581	NC_015732	A	7	7	188981	188987	100 %	0 %	0 %	0 %	339498807
3582	NC_015732	TAT	2	6	188995	189000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498807
3583	NC_015732	AT	3	6	189107	189112	50 %	50 %	0 %	0 %	339498807
3584	NC_015732	TG	3	6	189121	189126	0 %	50 %	50 %	0 %	339498807
3585	NC_015732	TGA	2	6	189146	189151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498807
3586	NC_015732	AAT	2	6	189170	189175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498807
3587	NC_015732	TAT	2	6	189197	189202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498807
3588	NC_015732	CTA	2	6	189277	189282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498807
3589	NC_015732	TTAT	2	8	189337	189344	25 %	75 %	0 %	0 %	339498807
3590	NC_015732	GGT	2	6	189429	189434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498807
3591	NC_015732	TGG	2	6	189509	189514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498807
3592	NC_015732	CGGAT	2	10	189602	189611	20 %	20 %	40 %	20 %	339498807
3593	NC_015732	TA	3	6	189662	189667	50 %	50 %	0 %	0 %	339498808
3594	NC_015732	TAT	2	6	189673	189678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498808
3595	NC_015732	ATCA	2	8	189687	189694	50 %	25 %	0 %	25 %	339498808
3596	NC_015732	GTCT	2	8	189767	189774	0 %	50 %	25 %	25 %	339498808
3597	NC_015732	TGA	2	6	189937	189942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498808
3598	NC_015732	A	6	6	189968	189973	100 %	0 %	0 %	0 %	339498808
3599	NC_015732	ATCA	2	8	189982	189989	50 %	25 %	0 %	25 %	339498808
3600	NC_015732	AT	3	6	190021	190026	50 %	50 %	0 %	0 %	339498808
3601	NC_015732	CTT	2	6	190089	190094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498808
3602	NC_015732	T	7	7	190093	190099	0 %	100 %	0 %	0 %	339498808
3603	NC_015732	ATG	2	6	190121	190126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498808
3604	NC_015732	AATA	2	8	190162	190169	75 %	25 %	0 %	0 %	339498808
3605	NC_015732	AT	3	6	190192	190197	50 %	50 %	0 %	0 %	339498808
3606	NC_015732	CAC	2	6	190210	190215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498808
3607	NC_015732	AGG	2	6	190288	190293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498808
3608	NC_015732	TGA	2	6	190311	190316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498809
3609	NC_015732	ATT	2	6	190351	190356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498809
3610	NC_015732	ATC	2	6	190361	190366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498809
3611	NC_015732	ATT	2	6	190423	190428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498809
3612	NC_015732	GAACTT	2	12	190492	190503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339498809
3613	NC_015732	ACA	3	9	190573	190581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498809
3614	NC_015732	GCTG	2	8	190681	190688	0 %	25 %	50 %	25 %	339498809
3615	NC_015732	TGG	2	6	190692	190697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498809
3616	NC_015732	TGA	2	6	190890	190895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498809
3617	NC_015732	TTC	2	6	190952	190957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498809
3618	NC_015732	CAA	2	6	190958	190963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498809
3619	NC_015732	TGT	2	6	191019	191024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498809
3620	NC_015732	AAG	2	6	191138	191143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498809
3621	NC_015732	AAG	2	6	191195	191200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498809
3622	NC_015732	A	6	6	191381	191386	100 %	0 %	0 %	0 %	339498809
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3624	NC_015732	TTTA	2	8	191465	191472	25 %	75 %	0 %	0 %	339498809
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3868	NC_015732	TAA	2	6	204902	204907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498822
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3993	NC_015732	ATT	2	6	211340	211345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498828
3994	NC_015732	ATG	2	6	211426	211431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498828
3995	NC_015732	T	6	6	211438	211443	0 %	100 %	0 %	0 %	339498828
3996	NC_015732	CAA	2	6	211465	211470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498828
3997	NC_015732	TGC	2	6	211478	211483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498828
3998	NC_015732	GA	3	6	211484	211489	50 %	0 %	50 %	0 %	339498828
3999	NC_015732	AGGCG	2	10	211494	211503	20 %	0 %	60 %	20 %	339498828
4000	NC_015732	GGC	2	6	211548	211553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498828

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