MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015732	AGAT	2	8	156420	156427	50 %	25 %	25 %	0 %	339498773
3002	NC_015732	TA	3	6	156538	156543	50 %	50 %	0 %	0 %	339498773
3003	NC_015732	AAG	2	6	156709	156714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498773
3004	NC_015732	ATC	2	6	156831	156836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498773
3005	NC_015732	TA	3	6	156848	156853	50 %	50 %	0 %	0 %	339498773
3006	NC_015732	C	6	6	156891	156896	0 %	0 %	0 %	100 %	339498773
3007	NC_015732	TCA	2	6	156946	156951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498773
3008	NC_015732	TAA	2	6	157061	157066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015732	GT	3	6	157068	157073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015732	GAT	2	6	157185	157190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498774
3011	NC_015732	T	6	6	157260	157265	0 %	100 %	0 %	0 %	339498774
3012	NC_015732	T	6	6	157294	157299	0 %	100 %	0 %	0 %	339498774
3013	NC_015732	ACCGGT	2	12	157415	157426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339498774
3014	NC_015732	CTTT	2	8	157493	157500	0 %	75 %	0 %	25 %	339498774
3015	NC_015732	GGA	2	6	157520	157525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498774
3016	NC_015732	GCG	2	6	157581	157586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498774
3017	NC_015732	GT	3	6	157599	157604	0 %	50 %	50 %	0 %	339498774
3018	NC_015732	TAT	2	6	157664	157669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498774
3019	NC_015732	CTG	2	6	157680	157685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498774
3020	NC_015732	CGGGTG	2	12	157701	157712	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339498774
3021	NC_015732	CAT	2	6	157724	157729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498774
3022	NC_015732	CAGT	2	8	157738	157745	25 %	25 %	25 %	25 %	339498774
3023	NC_015732	GTG	2	6	157807	157812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498774
3024	NC_015732	TGC	2	6	157835	157840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498774
3025	NC_015732	T	6	6	157865	157870	0 %	100 %	0 %	0 %	339498774
3026	NC_015732	TCG	2	6	157877	157882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498774
3027	NC_015732	TA	3	6	157884	157889	50 %	50 %	0 %	0 %	339498774
3028	NC_015732	CGA	2	6	157899	157904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498774
3029	NC_015732	TATTAC	2	12	157911	157922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	339498774
3030	NC_015732	C	6	6	158005	158010	0 %	0 %	0 %	100 %	339498775
3031	NC_015732	CACC	2	8	158153	158160	25 %	0 %	0 %	75 %	339498775
3032	NC_015732	A	6	6	158171	158176	100 %	0 %	0 %	0 %	339498775
3033	NC_015732	GGT	2	6	158262	158267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498775
3034	NC_015732	CAA	2	6	158318	158323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498775
3035	NC_015732	ATC	2	6	158334	158339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498775
3036	NC_015732	CGA	2	6	158414	158419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498775
3037	NC_015732	ATG	2	6	158520	158525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498775
3038	NC_015732	GGT	2	6	158567	158572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498775
3039	NC_015732	TGAT	2	8	158590	158597	25 %	50 %	25 %	0 %	339498775
3040	NC_015732	TG	3	6	158608	158613	0 %	50 %	50 %	0 %	339498775
3041	NC_015732	ATA	2	6	158698	158703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498775
3042	NC_015732	TGA	2	6	158704	158709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498775
3043	NC_015732	AGA	4	12	158735	158746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498775
3044	NC_015732	CCA	2	6	158747	158752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498775
3045	NC_015732	G	7	7	158795	158801	0 %	0 %	100 %	0 %	339498775
3046	NC_015732	TGA	2	6	158805	158810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498775
3047	NC_015732	AGA	2	6	158881	158886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498776
3048	NC_015732	GAA	2	6	158887	158892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498776
3049	NC_015732	TCC	2	6	158935	158940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498776
3050	NC_015732	TGCC	2	8	158949	158956	0 %	25 %	25 %	50 %	339498776
3051	NC_015732	GCT	2	6	159137	159142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498776
3052	NC_015732	TCGG	2	8	159270	159277	0 %	25 %	50 %	25 %	339498776
3053	NC_015732	CGG	2	6	159381	159386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498776
3054	NC_015732	GCC	2	6	159398	159403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498776
3055	NC_015732	GGT	2	6	159458	159463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498776
3056	NC_015732	A	7	7	159533	159539	100 %	0 %	0 %	0 %	339498776
3057	NC_015732	CTT	2	6	159596	159601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498776
3058	NC_015732	TGTCGG	2	12	159628	159639	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339498776
3059	NC_015732	TGGT	2	8	159681	159688	0 %	50 %	50 %	0 %	339498776
3060	NC_015732	GT	3	6	159687	159692	0 %	50 %	50 %	0 %	339498776
3061	NC_015732	TGA	2	6	159726	159731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498776
3062	NC_015732	A	6	6	159745	159750	100 %	0 %	0 %	0 %	339498776
3063	NC_015732	GGC	2	6	159751	159756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498776
3064	NC_015732	AGT	2	6	159787	159792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498776
3065	NC_015732	GGC	2	6	159794	159799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498776
3066	NC_015732	TGC	2	6	159817	159822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498776
3067	NC_015732	CCG	2	6	159868	159873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498776
3068	NC_015732	AGA	2	6	159880	159885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498776
3069	NC_015732	GCCC	2	8	159889	159896	0 %	0 %	25 %	75 %	339498776
3070	NC_015732	GGA	2	6	159922	159927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498776
3071	NC_015732	TCC	2	6	159945	159950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498776
3072	NC_015732	GTT	2	6	159989	159994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498776
3073	NC_015732	GCC	2	6	160041	160046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498776
3074	NC_015732	TTG	2	6	160101	160106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498776
3075	NC_015732	CCT	2	6	160129	160134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498776
3076	NC_015732	TGG	2	6	160158	160163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498776
3077	NC_015732	CCTC	2	8	160203	160210	0 %	25 %	0 %	75 %	339498776
3078	NC_015732	GCG	2	6	160289	160294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498776
3079	NC_015732	A	6	6	160316	160321	100 %	0 %	0 %	0 %	339498776
3080	NC_015732	GGGCTA	2	12	160368	160379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3081	NC_015732	TGA	2	6	160468	160473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498777
3082	NC_015732	CTTG	2	8	160515	160522	0 %	50 %	25 %	25 %	339498777
3083	NC_015732	GAT	2	6	160562	160567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498777
3084	NC_015732	CATC	2	8	160577	160584	25 %	25 %	0 %	50 %	339498777
3085	NC_015732	GTT	2	6	160599	160604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498777
3086	NC_015732	TGTT	2	8	160738	160745	0 %	75 %	25 %	0 %	339498777
3087	NC_015732	ATT	2	6	160777	160782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498777
3088	NC_015732	A	6	6	160914	160919	100 %	0 %	0 %	0 %	339498777
3089	NC_015732	T	7	7	160924	160930	0 %	100 %	0 %	0 %	339498777
3090	NC_015732	CCTT	2	8	161026	161033	0 %	50 %	0 %	50 %	339498777
3091	NC_015732	ATG	2	6	161038	161043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498777
3092	NC_015732	GGTA	2	8	161054	161061	25 %	25 %	50 %	0 %	339498777
3093	NC_015732	TGA	2	6	161084	161089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498777
3094	NC_015732	TAA	2	6	161179	161184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015732	TTA	2	6	161197	161202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015732	ACAA	2	8	161212	161219	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_015732	GAG	2	6	161259	161264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015732	GTG	2	6	161297	161302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498778
3099	NC_015732	TGG	2	6	161506	161511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498778
3100	NC_015732	TTTC	2	8	161566	161573	0 %	75 %	0 %	25 %	339498778
3101	NC_015732	AAAGG	2	10	161621	161630	60 %	0 %	40 %	0 %	339498778
3102	NC_015732	TTA	2	6	161808	161813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498778
3103	NC_015732	TTG	2	6	161841	161846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498778
3104	NC_015732	GTT	2	6	161930	161935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498778
3105	NC_015732	AATA	2	8	161956	161963	75 %	25 %	0 %	0 %	339498778
3106	NC_015732	TAA	2	6	162013	162018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498778
3107	NC_015732	ATT	2	6	162035	162040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498778
3108	NC_015732	ATT	2	6	162218	162223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498778
3109	NC_015732	ATG	2	6	162357	162362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498778
3110	NC_015732	TTAT	2	8	162461	162468	25 %	75 %	0 %	0 %	339498778
3111	NC_015732	AGG	2	6	162480	162485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498778
3112	NC_015732	AGA	2	6	162553	162558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498778
3113	NC_015732	GGTCCT	2	12	162584	162595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498778
3114	NC_015732	ATT	2	6	162596	162601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498778
3115	NC_015732	TAT	2	6	162640	162645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498778
3116	NC_015732	GGT	2	6	162653	162658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498778
3117	NC_015732	CGGA	2	8	162662	162669	25 %	0 %	50 %	25 %	339498778
3118	NC_015732	TGTA	2	8	162834	162841	25 %	50 %	25 %	0 %	339498778
3119	NC_015732	CTG	2	6	162860	162865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498778
3120	NC_015732	AAT	2	6	162869	162874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498778
3121	NC_015732	GAAA	2	8	163093	163100	75 %	0 %	25 %	0 %	339498778
3122	NC_015732	AGA	2	6	163105	163110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498778
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3493	NC_015732	A	6	6	184122	184127	100 %	0 %	0 %	0 %	339498801
3494	NC_015732	GTT	2	6	184132	184137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498801
3495	NC_015732	AGA	2	6	184142	184147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498801
3496	NC_015732	GAA	2	6	184191	184196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498801
3497	NC_015732	A	7	7	184195	184201	100 %	0 %	0 %	0 %	339498801
3498	NC_015732	CCA	2	6	184234	184239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498801
3499	NC_015732	CCATA	2	10	184266	184275	40 %	20 %	0 %	40 %	339498801
3500	NC_015732	GGA	2	6	184283	184288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498801

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