MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015732	GAT	2	6	293675	293680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498900
5502	NC_015732	CCG	2	6	293733	293738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498900
5503	NC_015732	GCC	2	6	293776	293781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498900
5504	NC_015732	TAT	2	6	293931	293936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_015732	A	6	6	293939	293944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_015732	T	6	6	293991	293996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_015732	A	6	6	294047	294052	100 %	0 %	0 %	0 %	339498901
5508	NC_015732	TGC	2	6	294136	294141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498901
5509	NC_015732	TCC	2	6	294271	294276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498901
5510	NC_015732	GTA	2	6	294292	294297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498901
5511	NC_015732	TGTT	2	8	294300	294307	0 %	75 %	25 %	0 %	339498901
5512	NC_015732	TAA	3	9	294352	294360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498901
5513	NC_015732	TAT	2	6	294412	294417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498901
5514	NC_015732	CTT	2	6	294467	294472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498902
5515	NC_015732	CAT	2	6	294497	294502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498902
5516	NC_015732	AT	3	6	294581	294586	50 %	50 %	0 %	0 %	339498902
5517	NC_015732	CAA	2	6	294602	294607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498902
5518	NC_015732	T	7	7	294628	294634	0 %	100 %	0 %	0 %	339498902
5519	NC_015732	AAT	2	6	294657	294662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498902
5520	NC_015732	AAGT	2	8	294680	294687	50 %	25 %	25 %	0 %	339498902
5521	NC_015732	TATAA	2	10	294714	294723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_015732	ATA	2	6	294724	294729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015732	TAG	2	6	294764	294769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_015732	TA	3	6	294797	294802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015732	TCT	2	6	294942	294947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498903
5526	NC_015732	GCTCA	2	10	295015	295024	20 %	20 %	20 %	40 %	339498903
5527	NC_015732	GTT	2	6	295036	295041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498903
5528	NC_015732	GA	3	6	295067	295072	50 %	0 %	50 %	0 %	339498903
5529	NC_015732	TA	3	6	295087	295092	50 %	50 %	0 %	0 %	339498903
5530	NC_015732	TCA	2	6	295173	295178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498903
5531	NC_015732	AG	3	6	295195	295200	50 %	0 %	50 %	0 %	339498903
5532	NC_015732	ACC	2	6	295551	295556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498903
5533	NC_015732	TTA	2	6	295559	295564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498903
5534	NC_015732	TG	3	6	295778	295783	0 %	50 %	50 %	0 %	339498903
5535	NC_015732	ATA	2	6	295786	295791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498903
5536	NC_015732	CAT	2	6	295792	295797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498903
5537	NC_015732	CTG	2	6	295862	295867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498904
5538	NC_015732	TGA	2	6	295899	295904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498904
5539	NC_015732	TCA	2	6	295999	296004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498904
5540	NC_015732	TAA	2	6	296084	296089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498904
5541	NC_015732	TTG	2	6	296196	296201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498904
5542	NC_015732	AAGG	2	8	296223	296230	50 %	0 %	50 %	0 %	339498904
5543	NC_015732	TCT	2	6	296233	296238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498904
5544	NC_015732	CAA	2	6	296370	296375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498904
5545	NC_015732	GCCA	2	8	296385	296392	25 %	0 %	25 %	50 %	339498904
5546	NC_015732	A	6	6	296413	296418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015732	G	13	13	296444	296456	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015732	TCT	2	6	296470	296475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_015732	AGA	2	6	296480	296485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_015732	CTGGTT	2	12	296536	296547	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339498905
5551	NC_015732	GCA	2	6	296581	296586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498905
5552	NC_015732	CAA	2	6	296647	296652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498905
5553	NC_015732	GTG	2	6	296717	296722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498905
5554	NC_015732	GCT	2	6	296812	296817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498905
5555	NC_015732	AACT	2	8	296926	296933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_015732	A	6	6	296947	296952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_015732	GAA	2	6	296964	296969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498906
5558	NC_015732	AT	3	6	296970	296975	50 %	50 %	0 %	0 %	339498906
5559	NC_015732	TGA	2	6	297020	297025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498906
5560	NC_015732	TG	3	6	297066	297071	0 %	50 %	50 %	0 %	339498906
5561	NC_015732	A	6	6	297136	297141	100 %	0 %	0 %	0 %	339498906
5562	NC_015732	TTG	2	6	297213	297218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498907
5563	NC_015732	GTT	2	6	297234	297239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498907
5564	NC_015732	T	6	6	297238	297243	0 %	100 %	0 %	0 %	339498907
5565	NC_015732	ATT	3	9	297333	297341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498907
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5567	NC_015732	TAT	2	6	297413	297418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498907
5568	NC_015732	TAT	3	9	297449	297457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498907
5569	NC_015732	ATT	2	6	297565	297570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015732	TAT	2	6	297595	297600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_015732	AAAAG	2	10	297623	297632	80 %	0 %	20 %	0 %	339498908
5572	NC_015732	TGT	2	6	297658	297663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498908
5573	NC_015732	TGGT	2	8	297686	297693	0 %	50 %	50 %	0 %	339498908
5574	NC_015732	TAA	2	6	297724	297729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498908
5575	NC_015732	TGT	2	6	297739	297744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498908
5576	NC_015732	TGT	2	6	297748	297753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498908
5577	NC_015732	TAA	2	6	297841	297846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498908
5578	NC_015732	TAT	2	6	297914	297919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498908
5579	NC_015732	AAT	2	6	297965	297970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498908
5580	NC_015732	TATTGT	2	12	297995	298006	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	339498908
5581	NC_015732	T	7	7	298058	298064	0 %	100 %	0 %	0 %	339498908
5582	NC_015732	A	6	6	298094	298099	100 %	0 %	0 %	0 %	339498908
5583	NC_015732	TGA	2	6	298153	298158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498908
5584	NC_015732	TGG	2	6	298213	298218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498908
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5588	NC_015732	GTA	2	6	298324	298329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498908
5589	NC_015732	TTA	2	6	298355	298360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498908
5590	NC_015732	TAA	3	9	298418	298426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_015732	T	6	6	298456	298461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_015732	G	6	6	298540	298545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015732	TGT	2	6	298547	298552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015732	CTT	2	6	298564	298569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498909
5595	NC_015732	GTG	2	6	298752	298757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498909
5596	NC_015732	CTT	2	6	298792	298797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498909
5597	NC_015732	TCT	2	6	299009	299014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498909
5598	NC_015732	GAT	2	6	299041	299046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498909
5599	NC_015732	AGGA	2	8	299242	299249	50 %	0 %	50 %	0 %	339498909
5600	NC_015732	CTTG	2	8	299254	299261	0 %	50 %	25 %	25 %	339498909
5601	NC_015732	CGC	2	6	299341	299346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498909
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5604	NC_015732	CGC	2	6	299412	299417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498909
5605	NC_015732	GCT	2	6	299444	299449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498909
5606	NC_015732	TCG	2	6	299588	299593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498909
5607	NC_015732	CGG	2	6	299603	299608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498909
5608	NC_015732	CTGG	2	8	299730	299737	0 %	25 %	50 %	25 %	339498909
5609	NC_015732	CCA	2	6	299802	299807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498909
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5611	NC_015732	ACCGG	2	10	300016	300025	20 %	0 %	40 %	40 %	339498909
5612	NC_015732	TTC	2	6	300076	300081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498909
5613	NC_015732	T	6	6	300125	300130	0 %	100 %	0 %	0 %	339498909
5614	NC_015732	CCA	2	6	300132	300137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498909
5615	NC_015732	CCGG	2	8	300180	300187	0 %	0 %	50 %	50 %	339498909
5616	NC_015732	CGTAC	2	10	300191	300200	20 %	20 %	20 %	40 %	339498909
5617	NC_015732	TCG	2	6	300233	300238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498909
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5620	NC_015732	CCAT	2	8	300352	300359	25 %	25 %	0 %	50 %	339498909
5621	NC_015732	CTA	2	6	300439	300444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_015732	TA	3	6	300443	300448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_015732	GC	3	6	300463	300468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_015732	AATG	2	8	300478	300485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5626	NC_015732	GCT	2	6	300590	300595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_015732	AGG	2	6	300626	300631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_015732	GCT	2	6	300679	300684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498910
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6000	NC_015732	TTC	2	6	320232	320237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498927

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