MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015732	GAA	2	6	264420	264425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498875
5002	NC_015732	GTG	2	6	264509	264514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498875
5003	NC_015732	TA	3	6	264519	264524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015732	T	6	6	264581	264586	0 %	100 %	0 %	0 %	339498876
5005	NC_015732	TG	3	6	264590	264595	0 %	50 %	50 %	0 %	339498876
5006	NC_015732	GAT	2	6	264719	264724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
5007	NC_015732	CCA	2	6	264735	264740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498876
5008	NC_015732	TTG	2	6	264807	264812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498876
5009	NC_015732	TGA	2	6	264844	264849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
5010	NC_015732	ATG	2	6	264993	264998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
5011	NC_015732	GTA	2	6	265016	265021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498876
5012	NC_015732	TCT	2	6	265236	265241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498877
5013	NC_015732	TC	4	8	265244	265251	0 %	50 %	0 %	50 %	339498877
5014	NC_015732	GTG	2	6	265255	265260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498877
5015	NC_015732	TAG	2	6	265345	265350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498877
5016	NC_015732	ATGG	2	8	265376	265383	25 %	25 %	50 %	0 %	339498877
5017	NC_015732	AT	3	6	265404	265409	50 %	50 %	0 %	0 %	339498877
5018	NC_015732	TGC	2	6	265433	265438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498877
5019	NC_015732	GCTT	2	8	265451	265458	0 %	50 %	25 %	25 %	339498877
5020	NC_015732	TCA	2	6	265467	265472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498877
5021	NC_015732	CAGC	2	8	265506	265513	25 %	0 %	25 %	50 %	339498877
5022	NC_015732	TCA	2	6	265542	265547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498877
5023	NC_015732	AAT	2	6	265554	265559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498877
5024	NC_015732	TGG	2	6	265577	265582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498877
5025	NC_015732	TTG	2	6	265617	265622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498877
5026	NC_015732	CTA	2	6	265651	265656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498877
5027	NC_015732	TGA	2	6	265785	265790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498877
5028	NC_015732	TTA	2	6	265819	265824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498877
5029	NC_015732	GAAA	2	8	265869	265876	75 %	0 %	25 %	0 %	339498877
5030	NC_015732	TG	3	6	265922	265927	0 %	50 %	50 %	0 %	339498877
5031	NC_015732	GGC	2	6	265947	265952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498877
5032	NC_015732	ATTT	2	8	265994	266001	25 %	75 %	0 %	0 %	339498877
5033	NC_015732	CCG	2	6	266026	266031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498877
5034	NC_015732	CAT	2	6	266140	266145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498877
5035	NC_015732	TAG	2	6	266197	266202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498878
5036	NC_015732	TAA	2	6	266213	266218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498878
5037	NC_015732	T	7	7	266295	266301	0 %	100 %	0 %	0 %	339498878
5038	NC_015732	TTG	2	6	266381	266386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498878
5039	NC_015732	ATG	2	6	266436	266441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498878
5040	NC_015732	GCTT	2	8	266443	266450	0 %	50 %	25 %	25 %	339498878
5041	NC_015732	GT	3	6	266534	266539	0 %	50 %	50 %	0 %	339498878
5042	NC_015732	TTCG	2	8	266547	266554	0 %	50 %	25 %	25 %	339498878
5043	NC_015732	TTC	2	6	266608	266613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498878
5044	NC_015732	A	6	6	266678	266683	100 %	0 %	0 %	0 %	339498878
5045	NC_015732	CTC	2	6	266688	266693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498878
5046	NC_015732	CAA	2	6	266694	266699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498878
5047	NC_015732	ATT	2	6	266755	266760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498878
5048	NC_015732	T	6	6	266759	266764	0 %	100 %	0 %	0 %	339498878
5049	NC_015732	TAA	2	6	266773	266778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498878
5050	NC_015732	ATA	3	9	266790	266798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498878
5051	NC_015732	ATG	2	6	266803	266808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498878
5052	NC_015732	ATG	2	6	266912	266917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498878
5053	NC_015732	CAG	2	6	266925	266930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498879
5054	NC_015732	GCG	2	6	266944	266949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498879
5055	NC_015732	TGA	2	6	267136	267141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498879
5056	NC_015732	T	6	6	267167	267172	0 %	100 %	0 %	0 %	339498879
5057	NC_015732	A	6	6	267188	267193	100 %	0 %	0 %	0 %	339498879
5058	NC_015732	CTT	2	6	267263	267268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498879
5059	NC_015732	GGC	2	6	267448	267453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498879
5060	NC_015732	TC	3	6	267458	267463	0 %	50 %	0 %	50 %	339498879
5061	NC_015732	TCG	2	6	267508	267513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498879
5062	NC_015732	ATA	2	6	267514	267519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498879
5063	NC_015732	GCA	2	6	267581	267586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498879
5064	NC_015732	GCC	2	6	267698	267703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498879
5065	NC_015732	TCA	2	6	267704	267709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498879
5066	NC_015732	T	7	7	267713	267719	0 %	100 %	0 %	0 %	339498880
5067	NC_015732	GTT	2	6	267943	267948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498880
5068	NC_015732	AACG	2	8	267995	268002	50 %	0 %	25 %	25 %	339498880
5069	NC_015732	CTT	2	6	268045	268050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498880
5070	NC_015732	G	6	6	268086	268091	0 %	0 %	100 %	0 %	339498880
5071	NC_015732	GT	3	6	268123	268128	0 %	50 %	50 %	0 %	339498880
5072	NC_015732	TTG	2	6	268178	268183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498880
5073	NC_015732	GAG	2	6	268430	268435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498880
5074	NC_015732	CAA	2	6	268459	268464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498880
5075	NC_015732	GTT	2	6	268478	268483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498880
5076	NC_015732	TGA	2	6	268506	268511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498880
5077	NC_015732	CGA	2	6	268647	268652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498880
5078	NC_015732	ATTT	2	8	268736	268743	25 %	75 %	0 %	0 %	339498880
5079	NC_015732	GGT	2	6	268892	268897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498880
5080	NC_015732	AAT	2	6	269048	269053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498880
5081	NC_015732	ATCCA	2	10	269146	269155	40 %	20 %	0 %	40 %	339498880
5082	NC_015732	TTCA	2	8	269201	269208	25 %	50 %	0 %	25 %	339498880
5083	NC_015732	GGAT	2	8	269275	269282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015732	CTG	2	6	269333	269338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498881
5085	NC_015732	TCC	2	6	269378	269383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498881
5086	NC_015732	ATGG	2	8	269470	269477	25 %	25 %	50 %	0 %	339498881
5087	NC_015732	TAA	2	6	269526	269531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498881
5088	NC_015732	TAT	2	6	269547	269552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498881
5089	NC_015732	GTT	2	6	269558	269563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498881
5090	NC_015732	ATCC	2	8	269572	269579	25 %	25 %	0 %	50 %	339498881
5091	NC_015732	A	6	6	269690	269695	100 %	0 %	0 %	0 %	339498881
5092	NC_015732	GGA	2	6	269701	269706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498881
5093	NC_015732	TTC	2	6	269720	269725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498882
5094	NC_015732	CAGG	2	8	269794	269801	25 %	0 %	50 %	25 %	339498882
5095	NC_015732	GAA	2	6	269802	269807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498882
5096	NC_015732	GGT	2	6	269808	269813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498882
5097	NC_015732	GATCTG	2	12	269821	269832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339498882
5098	NC_015732	CTG	2	6	269851	269856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498882
5099	NC_015732	GTC	2	6	269929	269934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498882
5100	NC_015732	CCG	2	6	270027	270032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498882
5101	NC_015732	CTT	2	6	270102	270107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498882
5102	NC_015732	ACC	2	6	270136	270141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498882
5103	NC_015732	A	6	6	270180	270185	100 %	0 %	0 %	0 %	339498882
5104	NC_015732	TCC	2	6	270208	270213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498882
5105	NC_015732	GTG	2	6	270227	270232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498882
5106	NC_015732	CAG	2	6	270277	270282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498882
5107	NC_015732	TG	3	6	270439	270444	0 %	50 %	50 %	0 %	339498882
5108	NC_015732	TATC	2	8	270480	270487	25 %	50 %	0 %	25 %	339498882
5109	NC_015732	ATT	2	6	270529	270534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498882
5110	NC_015732	GAA	3	9	270601	270609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498882
5111	NC_015732	GGA	2	6	270702	270707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498882
5112	NC_015732	TCT	2	6	270708	270713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498882
5113	NC_015732	CAA	2	6	270763	270768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498882
5114	NC_015732	GTC	2	6	270831	270836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498882
5115	NC_015732	TCG	2	6	270921	270926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498883
5116	NC_015732	CCTTT	2	10	270949	270958	0 %	60 %	0 %	40 %	339498883
5117	NC_015732	AAG	2	6	270969	270974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498883
5118	NC_015732	AGA	2	6	271054	271059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498883
5119	NC_015732	ATC	2	6	271103	271108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498883
5120	NC_015732	A	6	6	271248	271253	100 %	0 %	0 %	0 %	339498883
5121	NC_015732	T	6	6	271294	271299	0 %	100 %	0 %	0 %	339498883
5122	NC_015732	ACC	2	6	271300	271305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498883
5123	NC_015732	AAAG	2	8	271306	271313	75 %	0 %	25 %	0 %	339498883
5124	NC_015732	TATGCC	2	12	271382	271393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339498883
5125	NC_015732	CTC	2	6	271422	271427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498883
5126	NC_015732	GT	3	6	271452	271457	0 %	50 %	50 %	0 %	339498883
5127	NC_015732	T	6	6	271648	271653	0 %	100 %	0 %	0 %	339498883
5128	NC_015732	GTA	2	6	271694	271699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498883
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5130	NC_015732	CTG	2	6	271745	271750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498883
5131	NC_015732	ACGG	2	8	271832	271839	25 %	0 %	50 %	25 %	339498883
5132	NC_015732	GTA	2	6	271850	271855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498883
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5134	NC_015732	CAAC	2	8	272258	272265	50 %	0 %	0 %	50 %	339498883
5135	NC_015732	ACC	2	6	272362	272367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498883
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5137	NC_015732	CAAT	2	8	272547	272554	50 %	25 %	0 %	25 %	339498883
5138	NC_015732	TTG	2	6	272655	272660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498883
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5140	NC_015732	TAG	2	6	272734	272739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498883
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5145	NC_015732	ATG	2	6	272877	272882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498883
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5152	NC_015732	GTT	2	6	273146	273151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498883
5153	NC_015732	TCAG	2	8	273153	273160	25 %	25 %	25 %	25 %	339498883
5154	NC_015732	CCT	2	6	273235	273240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498883
5155	NC_015732	GTA	2	6	273279	273284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498883
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5159	NC_015732	TGA	2	6	273570	273575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498883
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5163	NC_015732	GTGTT	2	10	273729	273738	0 %	60 %	40 %	0 %	339498883
5164	NC_015732	A	6	6	273771	273776	100 %	0 %	0 %	0 %	339498883
5165	NC_015732	AGA	2	6	273826	273831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_015732	GAG	2	6	273833	273838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_015732	TAT	2	6	273846	273851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498884
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5222	NC_015732	AAT	2	6	277032	277037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5224	NC_015732	TAG	2	6	277138	277143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5237	NC_015732	TATG	2	8	277946	277953	25 %	50 %	25 %	0 %	339498887
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5247	NC_015732	ATG	2	6	278797	278802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498887
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5363	NC_015732	AATGG	2	10	285407	285416	40 %	20 %	40 %	0 %	339498892
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5495	NC_015732	GAT	2	6	293288	293293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498900
5496	NC_015732	GAT	2	6	293417	293422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498900
5497	NC_015732	AGG	2	6	293479	293484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498900
5498	NC_015732	TGTTT	2	10	293568	293577	0 %	80 %	20 %	0 %	339498900
5499	NC_015732	TGG	2	6	293595	293600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498900
5500	NC_015732	T	7	7	293639	293645	0 %	100 %	0 %	0 %	339498900

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