MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015732	TGT	2	6	238213	238218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498849
4502	NC_015732	TCA	2	6	238228	238233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498849
4503	NC_015732	AGC	2	6	238239	238244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498849
4504	NC_015732	AAT	2	6	238245	238250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498849
4505	NC_015732	TGT	2	6	238338	238343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498849
4506	NC_015732	GA	3	6	238392	238397	50 %	0 %	50 %	0 %	339498849
4507	NC_015732	T	6	6	238458	238463	0 %	100 %	0 %	0 %	339498849
4508	NC_015732	GTC	2	6	238482	238487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498849
4509	NC_015732	TAAA	2	8	238554	238561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015732	A	6	6	238559	238564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015732	TGGG	2	8	238726	238733	0 %	25 %	75 %	0 %	339498850
4512	NC_015732	GGC	2	6	238751	238756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498850
4513	NC_015732	ACT	2	6	238776	238781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498850
4514	NC_015732	GCG	2	6	238782	238787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498850
4515	NC_015732	AGAT	2	8	238792	238799	50 %	25 %	25 %	0 %	339498850
4516	NC_015732	TCA	2	6	238920	238925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498850
4517	NC_015732	TAC	2	6	238978	238983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498850
4518	NC_015732	CTTTT	2	10	239024	239033	0 %	80 %	0 %	20 %	339498850
4519	NC_015732	AT	3	6	239044	239049	50 %	50 %	0 %	0 %	339498850
4520	NC_015732	ATT	2	6	239073	239078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498850
4521	NC_015732	AGG	2	6	239083	239088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498850
4522	NC_015732	CCT	2	6	239143	239148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498850
4523	NC_015732	A	8	8	239256	239263	100 %	0 %	0 %	0 %	339498850
4524	NC_015732	AAG	2	6	239278	239283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498850
4525	NC_015732	ATT	2	6	239290	239295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498850
4526	NC_015732	CAA	2	6	239360	239365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498850
4527	NC_015732	TGG	2	6	239368	239373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498850
4528	NC_015732	T	6	6	239458	239463	0 %	100 %	0 %	0 %	339498850
4529	NC_015732	TGTAG	2	10	239482	239491	20 %	40 %	40 %	0 %	339498850
4530	NC_015732	ATG	2	6	239498	239503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015732	GCCC	2	8	239546	239553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4532	NC_015732	CGGG	2	8	239562	239569	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4533	NC_015732	AGA	2	6	239589	239594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498851
4534	NC_015732	GAG	2	6	239602	239607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339498851
4535	NC_015732	ATG	3	9	239641	239649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498851
4536	NC_015732	CAT	2	6	239679	239684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498851
4537	NC_015732	TCG	2	6	239692	239697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498851
4538	NC_015732	TTC	2	6	239706	239711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498851
4539	NC_015732	AAC	2	6	239879	239884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498851
4540	NC_015732	GAT	2	6	239904	239909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498851
4541	NC_015732	AAAGG	2	10	239914	239923	60 %	0 %	40 %	0 %	339498851
4542	NC_015732	TCA	2	6	239963	239968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498851
4543	NC_015732	ATG	2	6	240040	240045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498851
4544	NC_015732	ATC	2	6	240058	240063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498851
4545	NC_015732	TCA	2	6	240068	240073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498851
4546	NC_015732	TTAAAT	2	12	240103	240114	50 %	50 %	0 %	0 %	339498851
4547	NC_015732	AG	4	8	240182	240189	50 %	0 %	50 %	0 %	339498851
4548	NC_015732	AT	3	6	240205	240210	50 %	50 %	0 %	0 %	339498851
4549	NC_015732	TCC	2	6	240251	240256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498851
4550	NC_015732	GAA	2	6	240304	240309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498851
4551	NC_015732	ATGA	2	8	240313	240320	50 %	25 %	25 %	0 %	339498851
4552	NC_015732	AGA	2	6	240370	240375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498851
4553	NC_015732	A	7	7	240375	240381	100 %	0 %	0 %	0 %	339498851
4554	NC_015732	AGA	2	6	240420	240425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498851
4555	NC_015732	AAT	2	6	240508	240513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498852
4556	NC_015732	GCCC	2	8	240560	240567	0 %	0 %	25 %	75 %	339498852
4557	NC_015732	A	6	6	240745	240750	100 %	0 %	0 %	0 %	339498852
4558	NC_015732	CGC	2	6	240781	240786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498852
4559	NC_015732	G	6	6	240799	240804	0 %	0 %	100 %	0 %	339498852
4560	NC_015732	AT	3	6	240848	240853	50 %	50 %	0 %	0 %	339498852
4561	NC_015732	TGG	2	6	240873	240878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498852
4562	NC_015732	AGA	2	6	241009	241014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498852
4563	NC_015732	CCG	2	6	241020	241025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498852
4564	NC_015732	AAT	2	6	241029	241034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498852
4565	NC_015732	ACA	2	6	241035	241040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498852
4566	NC_015732	TTC	2	6	241059	241064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498852
4567	NC_015732	GGC	2	6	241214	241219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498852
4568	NC_015732	A	7	7	241243	241249	100 %	0 %	0 %	0 %	339498852
4569	NC_015732	TAT	2	6	241267	241272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498852
4570	NC_015732	A	7	7	241293	241299	100 %	0 %	0 %	0 %	339498852
4571	NC_015732	T	6	6	241363	241368	0 %	100 %	0 %	0 %	339498852
4572	NC_015732	CTTTT	2	10	241370	241379	0 %	80 %	0 %	20 %	339498852
4573	NC_015732	TG	3	6	241440	241445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015732	CCA	2	6	241463	241468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498853
4575	NC_015732	ACTGCA	2	12	241498	241509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339498853
4576	NC_015732	TCA	2	6	241523	241528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498853
4577	NC_015732	CTT	2	6	241544	241549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498853
4578	NC_015732	TAA	2	6	241550	241555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498853
4579	NC_015732	ATGA	2	8	241580	241587	50 %	25 %	25 %	0 %	339498853
4580	NC_015732	CTT	2	6	241668	241673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498853
4581	NC_015732	AAT	2	6	241703	241708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498853
4582	NC_015732	ATA	2	6	241800	241805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498853
4583	NC_015732	TGT	2	6	241868	241873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498853
4584	NC_015732	ACC	2	6	241986	241991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498853
4585	NC_015732	CTT	2	6	242066	242071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498853
4586	NC_015732	ACT	2	6	242086	242091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498853
4587	NC_015732	CGG	2	6	242161	242166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498853
4588	NC_015732	TAA	2	6	242168	242173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498853
4589	NC_015732	T	6	6	242195	242200	0 %	100 %	0 %	0 %	339498853
4590	NC_015732	TCT	2	6	242273	242278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498853
4591	NC_015732	TTC	2	6	242625	242630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498853
4592	NC_015732	CGC	2	6	242691	242696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498853
4593	NC_015732	TTC	2	6	242746	242751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498853
4594	NC_015732	TCC	2	6	242758	242763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_015732	TGA	2	6	242768	242773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_015732	T	6	6	242946	242951	0 %	100 %	0 %	0 %	339498854
4597	NC_015732	GAA	2	6	242959	242964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498854
4598	NC_015732	T	6	6	242971	242976	0 %	100 %	0 %	0 %	339498854
4599	NC_015732	CAG	2	6	243036	243041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498854
4600	NC_015732	AACTC	2	10	243065	243074	40 %	20 %	0 %	40 %	339498854
4601	NC_015732	TCA	2	6	243098	243103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498854
4602	NC_015732	T	6	6	243122	243127	0 %	100 %	0 %	0 %	339498854
4603	NC_015732	GCC	4	12	243196	243207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498854
4604	NC_015732	CCA	2	6	243218	243223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498854
4605	NC_015732	TCA	2	6	243292	243297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498854
4606	NC_015732	GGT	2	6	243306	243311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498854
4607	NC_015732	CTT	2	6	243440	243445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498854
4608	NC_015732	CAC	2	6	243465	243470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498854
4609	NC_015732	GTC	2	6	243531	243536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498854
4610	NC_015732	GCCT	2	8	243571	243578	0 %	25 %	25 %	50 %	339498855
4611	NC_015732	TC	3	6	243662	243667	0 %	50 %	0 %	50 %	339498855
4612	NC_015732	GGT	2	6	243700	243705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339498855
4613	NC_015732	CAT	2	6	243721	243726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498855
4614	NC_015732	GAT	2	6	243730	243735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498855
4615	NC_015732	TTGC	2	8	243773	243780	0 %	50 %	25 %	25 %	339498855
4616	NC_015732	CCT	2	6	243810	243815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498855
4617	NC_015732	GAAT	2	8	243910	243917	50 %	25 %	25 %	0 %	339498855
4618	NC_015732	CCA	2	6	243939	243944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498855
4619	NC_015732	CGG	2	6	243954	243959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498855
4620	NC_015732	ATG	2	6	244094	244099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498855
4621	NC_015732	CGT	2	6	244102	244107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498855
4622	NC_015732	TTC	2	6	244174	244179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498855
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4624	NC_015732	GCG	2	6	244319	244324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498855
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4997	NC_015732	CCCGG	2	10	264070	264079	0 %	0 %	40 %	60 %	339498875
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