MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 1612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015710	GCA	2	6	5	10	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731759
2	NC_015710	CTG	2	6	12	17	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731759
3	NC_015710	TGC	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731759
4	NC_015710	ACA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731759
5	NC_015710	CAA	2	6	72	77	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731759
6	NC_015710	ACA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731759
7	NC_015710	GAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731759
8	NC_015710	TCT	2	6	147	152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
9	NC_015710	GAT	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731759
10	NC_015710	TGA	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731759
11	NC_015710	TCT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
12	NC_015710	TCT	3	9	302	310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
13	NC_015710	TCT	3	9	317	325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
14	NC_015710	CTT	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
15	NC_015710	TCT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
16	NC_015710	ATC	2	6	433	438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731759
17	NC_015710	TCA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731759
18	NC_015710	TTC	2	6	481	486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731759
19	NC_015710	AAT	2	6	537	542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731759
20	NC_015710	AGG	2	6	578	583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731759
21	NC_015710	ACA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015710	ACT	2	6	725	730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015710	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015710	CTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731760
25	NC_015710	GGT	2	6	898	903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731760
26	NC_015710	GAT	2	6	904	909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731760
27	NC_015710	CAT	2	6	968	973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731760
28	NC_015710	CTT	2	6	1055	1060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
29	NC_015710	GTT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731761
30	NC_015710	TCT	2	6	1496	1501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
31	NC_015710	CTT	3	9	1520	1528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
32	NC_015710	TGA	2	6	1571	1576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731761
33	NC_015710	TTG	2	6	1676	1681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731761
34	NC_015710	ATG	3	9	1687	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731761
35	NC_015710	TTA	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731761
36	NC_015710	GAC	2	6	1832	1837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731761
37	NC_015710	ATA	2	6	1960	1965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731761
38	NC_015710	GCT	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731761
39	NC_015710	CTT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
40	NC_015710	TTC	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731761
41	NC_015710	GTA	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015710	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015710	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015710	TAA	2	6	2353	2358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015710	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731762
46	NC_015710	ATC	2	6	2496	2501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731762
47	NC_015710	TCA	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731762
48	NC_015710	TTC	2	6	2694	2699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731762
49	NC_015710	AAT	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731762
50	NC_015710	TGT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731762
51	NC_015710	GAC	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731762
52	NC_015710	TGA	2	6	3031	3036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731762
53	NC_015710	TGC	2	6	3183	3188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731763
54	NC_015710	AAT	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731763
55	NC_015710	TGC	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731763
56	NC_015710	GTT	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731763
57	NC_015710	GTG	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731763
58	NC_015710	GCA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731763
59	NC_015710	ATT	3	9	3548	3556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731763
60	NC_015710	GGA	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731763
61	NC_015710	TTC	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731763
62	NC_015710	AAG	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731763
63	NC_015710	ATG	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731763
64	NC_015710	CTT	2	6	3830	3835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731763
65	NC_015710	ACA	2	6	3992	3997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731763
66	NC_015710	TAT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731763
67	NC_015710	TTG	2	6	4136	4141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731763
68	NC_015710	CTT	2	6	4260	4265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731764
69	NC_015710	GAG	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731764
70	NC_015710	TCT	2	6	4465	4470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731765
71	NC_015710	ACC	2	6	4581	4586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731765
72	NC_015710	TCT	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731765
73	NC_015710	TGA	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731765
74	NC_015710	GAA	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
75	NC_015710	ATC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731765
76	NC_015710	AGG	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731765
77	NC_015710	GCA	4	12	5135	5146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731765
78	NC_015710	GAA	2	6	5174	5179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
79	NC_015710	CAA	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731765
80	NC_015710	TGA	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731765
81	NC_015710	GAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
82	NC_015710	AGA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
83	NC_015710	TGA	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731765
84	NC_015710	CAT	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731765
85	NC_015710	AGA	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
86	NC_015710	AGC	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731765
87	NC_015710	CGA	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731765
88	NC_015710	TCT	2	6	5747	5752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731765
89	NC_015710	GGT	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731765
90	NC_015710	ATA	2	6	5775	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731765
91	NC_015710	AAC	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731765
92	NC_015710	GAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731765
93	NC_015710	TAA	2	6	5898	5903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731765
94	NC_015710	TAA	2	6	5986	5991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731765
95	NC_015710	CAC	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731765
96	NC_015710	TGG	2	6	6046	6051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731765
97	NC_015710	GAT	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731766
98	NC_015710	TCT	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731766
99	NC_015710	GGA	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731766
100	NC_015710	TAC	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731766
101	NC_015710	AGC	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731766
102	NC_015710	ACG	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731766
103	NC_015710	TGA	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731766
104	NC_015710	TAT	2	6	6690	6695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731766
105	NC_015710	AGC	2	6	6723	6728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731766
106	NC_015710	AGG	2	6	6865	6870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731767
107	NC_015710	AGG	2	6	6899	6904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731767
108	NC_015710	TTG	2	6	6910	6915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731767
109	NC_015710	CAC	2	6	7008	7013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731767
110	NC_015710	TCA	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731767
111	NC_015710	TGC	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731767
112	NC_015710	TAT	2	6	7584	7589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015710	ACA	2	6	7604	7609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731769
114	NC_015710	GAA	2	6	7654	7659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731769
115	NC_015710	GGC	2	6	7827	7832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338731769
116	NC_015710	ATG	2	6	7853	7858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731769
117	NC_015710	AGA	2	6	7866	7871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731769
118	NC_015710	ATT	2	6	7897	7902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731769
119	NC_015710	TAA	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015710	TGA	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731770
121	NC_015710	CAA	2	6	8085	8090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731770
122	NC_015710	CAA	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731770
123	NC_015710	ATA	2	6	8292	8297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731770
124	NC_015710	GAA	2	6	8384	8389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731770
125	NC_015710	AGA	2	6	8524	8529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731770
126	NC_015710	AGA	2	6	8554	8559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731770
127	NC_015710	TAG	2	6	8565	8570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731770
128	NC_015710	TCT	2	6	8624	8629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015710	TCT	2	6	8898	8903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731771
130	NC_015710	ACC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731771
131	NC_015710	TCT	2	6	9150	9155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731771
132	NC_015710	GAA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731771
133	NC_015710	GAA	2	6	9289	9294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731771
134	NC_015710	ATC	2	6	9345	9350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731771
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138	NC_015710	TGA	2	6	9639	9644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731771
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151	NC_015710	GAA	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731772
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256	NC_015710	AAT	2	6	20407	20412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_015710	AGG	2	6	20443	20448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
258	NC_015710	GAG	2	6	20503	20508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_015710	TGA	2	6	20580	20585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_015710	CAA	2	6	20668	20673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_015710	GAT	3	9	20679	20687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015710	CAA	2	6	20841	20846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731785
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