MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Simkania negevensis Z plasmid pSn

Total Repeats: 2855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015710	CT	3	6	22609	22614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015710	GAA	2	6	22703	22708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731788
503	NC_015710	ATC	2	6	22718	22723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731788
504	NC_015710	TCC	2	6	22754	22759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731788
505	NC_015710	TCT	2	6	22785	22790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731788
506	NC_015710	GTAA	2	8	22807	22814	50 %	25 %	25 %	0 %	338731788
507	NC_015710	TAGG	2	8	22816	22823	25 %	25 %	50 %	0 %	338731788
508	NC_015710	TTTGAA	2	12	22934	22945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338731788
509	NC_015710	GCA	2	6	22957	22962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731788
510	NC_015710	TGAA	2	8	23016	23023	50 %	25 %	25 %	0 %	338731788
511	NC_015710	ATC	2	6	23051	23056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731788
512	NC_015710	TTC	2	6	23098	23103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731788
513	NC_015710	GTA	2	6	23163	23168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731788
514	NC_015710	ACT	2	6	23178	23183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731788
515	NC_015710	TCT	2	6	23189	23194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731788
516	NC_015710	AGA	2	6	23195	23200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731788
517	NC_015710	AG	3	6	23247	23252	50 %	0 %	50 %	0 %	338731788
518	NC_015710	AGA	2	6	23259	23264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731788
519	NC_015710	GATT	2	8	23291	23298	25 %	50 %	25 %	0 %	338731788
520	NC_015710	AAG	2	6	23351	23356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731788
521	NC_015710	AAAC	2	8	23378	23385	75 %	0 %	0 %	25 %	338731788
522	NC_015710	GTTT	2	8	23398	23405	0 %	75 %	25 %	0 %	338731788
523	NC_015710	A	6	6	23442	23447	100 %	0 %	0 %	0 %	338731788
524	NC_015710	T	6	6	23553	23558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015710	CTTCT	2	10	23577	23586	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
526	NC_015710	T	6	6	23589	23594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015710	GTC	2	6	23602	23607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015710	A	7	7	23647	23653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015710	GA	3	6	23742	23747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015710	CTC	2	6	23752	23757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_015710	CT	3	6	23840	23845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_015710	TGA	2	6	23914	23919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015710	AAT	2	6	23939	23944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015710	GGAA	2	8	23945	23952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015710	C	6	6	23992	23997	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
536	NC_015710	AGG	3	9	24003	24011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015710	GCAAT	2	10	24077	24086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
538	NC_015710	AGT	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015710	ATG	2	6	24206	24211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015710	TTC	2	6	24316	24321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015710	GTC	2	6	24380	24385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015710	ATGGA	2	10	24420	24429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015710	A	6	6	24462	24467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015710	TTAA	2	8	24554	24561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015710	AGAA	2	8	24608	24615	75 %	0 %	25 %	0 %	338731789
546	NC_015710	ATA	2	6	24625	24630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731789
547	NC_015710	CTAC	2	8	24651	24658	25 %	25 %	0 %	50 %	338731789
548	NC_015710	A	6	6	24721	24726	100 %	0 %	0 %	0 %	338731789
549	NC_015710	AAC	2	6	24775	24780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731789
550	NC_015710	ATTA	2	8	24835	24842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015710	ATTAA	2	10	24863	24872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015710	GA	3	6	24987	24992	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
553	NC_015710	AATC	2	8	25057	25064	50 %	25 %	0 %	25 %	338731790
554	NC_015710	GAAGG	2	10	25113	25122	40 %	0 %	60 %	0 %	338731790
555	NC_015710	A	7	7	25300	25306	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790
556	NC_015710	GAA	2	6	25344	25349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
557	NC_015710	GAA	2	6	25404	25409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
558	NC_015710	A	6	6	25440	25445	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790
559	NC_015710	AATTAC	2	12	25458	25469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731790
560	NC_015710	CAG	2	6	25480	25485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731790
561	NC_015710	CAGAG	2	10	25548	25557	40 %	0 %	40 %	20 %	338731790
562	NC_015710	CAA	2	6	25587	25592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731790
563	NC_015710	CAA	2	6	25627	25632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731790
564	NC_015710	CA	3	6	25661	25666	50 %	0 %	0 %	50 %	338731790
565	NC_015710	ACA	2	6	25728	25733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731790
566	NC_015710	CAA	2	6	25872	25877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731790
567	NC_015710	CAA	2	6	25882	25887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731790
568	NC_015710	GAA	2	6	25890	25895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
569	NC_015710	A	6	6	26023	26028	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790
570	NC_015710	TA	3	6	26058	26063	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
571	NC_015710	AGGA	2	8	26093	26100	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
572	NC_015710	GA	4	8	26099	26106	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
573	NC_015710	AT	3	6	26129	26134	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
574	NC_015710	ATC	2	6	26158	26163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731790
575	NC_015710	AAG	2	6	26176	26181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
576	NC_015710	A	6	6	26182	26187	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790
577	NC_015710	ACCAGA	2	12	26294	26305	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731790
578	NC_015710	AGC	2	6	26340	26345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731790
579	NC_015710	GC	3	6	26366	26371	0 %	0 %	50 %	50 %	338731790
580	NC_015710	TCA	2	6	26394	26399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731790
581	NC_015710	A	6	6	26424	26429	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790
582	NC_015710	TCG	2	6	26453	26458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731790
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584	NC_015710	ATC	2	6	26475	26480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731790
585	NC_015710	AGA	2	6	26654	26659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
586	NC_015710	A	6	6	26727	26732	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790
587	NC_015710	A	7	7	26762	26768	100 %	0 %	0 %	0 %	338731790
588	NC_015710	AAGA	2	8	26803	26810	75 %	0 %	25 %	0 %	338731790
589	NC_015710	TCG	2	6	26942	26947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731790
590	NC_015710	AC	3	6	26962	26967	50 %	0 %	0 %	50 %	338731790
591	NC_015710	ACT	2	6	27001	27006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731790
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593	NC_015710	AAG	2	6	27190	27195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
594	NC_015710	AATT	2	8	27220	27227	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
595	NC_015710	ACCTT	2	10	27254	27263	20 %	40 %	0 %	40 %	338731790
596	NC_015710	GAA	2	6	27276	27281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
597	NC_015710	TAAT	2	8	27310	27317	50 %	50 %	0 %	0 %	338731790
598	NC_015710	AAG	2	6	27334	27339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
599	NC_015710	GACAAC	2	12	27396	27407	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338731790
600	NC_015710	CT	3	6	27440	27445	0 %	50 %	0 %	50 %	338731790
601	NC_015710	TGA	2	6	27463	27468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731790
602	NC_015710	GA	3	6	27467	27472	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
603	NC_015710	CCA	2	6	27475	27480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731790
604	NC_015710	GCA	2	6	27487	27492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731790
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610	NC_015710	AGA	2	6	27818	27823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731790
611	NC_015710	GAATT	2	10	27838	27847	40 %	40 %	20 %	0 %	338731790
612	NC_015710	GGAA	2	8	27877	27884	50 %	0 %	50 %	0 %	338731790
613	NC_015710	TAA	2	6	27948	27953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731790
614	NC_015710	ATA	2	6	27983	27988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731791
615	NC_015710	TGA	2	6	28013	28018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731791
616	NC_015710	TCT	2	6	28070	28075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731792
617	NC_015710	T	10	10	28148	28157	0 %	100 %	0 %	0 %	338731792
618	NC_015710	CGC	2	6	28185	28190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338731792
619	NC_015710	T	6	6	28235	28240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015710	TCAAA	2	10	28274	28283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
621	NC_015710	T	7	7	28388	28394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015710	ATT	2	6	28430	28435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015710	ATTA	2	8	28446	28453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015710	A	7	7	28586	28592	100 %	0 %	0 %	0 %	338731793
625	NC_015710	AG	3	6	28637	28642	50 %	0 %	50 %	0 %	338731793
626	NC_015710	CAG	2	6	28660	28665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731793
627	NC_015710	CTA	2	6	28672	28677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731793
628	NC_015710	GTT	2	6	28697	28702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731793
629	NC_015710	A	6	6	28740	28745	100 %	0 %	0 %	0 %	338731793
630	NC_015710	GCA	2	6	28752	28757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731793
631	NC_015710	T	6	6	28804	28809	0 %	100 %	0 %	0 %	338731794
632	NC_015710	GTG	2	6	28822	28827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731794
633	NC_015710	GAA	2	6	28869	28874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731794
634	NC_015710	ACAT	2	8	28876	28883	50 %	25 %	0 %	25 %	338731794
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