MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti AK83 plasmid pSINME01

Total Repeats: 5078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015597	GCA	2	6	251988	251993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321429
5002	NC_015597	GCC	2	6	252015	252020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321429
5003	NC_015597	TCG	2	6	252031	252036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321429
5004	NC_015597	TGG	2	6	252037	252042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334321429
5005	NC_015597	CTG	2	6	252068	252073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321429
5006	NC_015597	GAAT	2	8	252142	252149	50 %	25 %	25 %	0 %	334321429
5007	NC_015597	CGA	2	6	252178	252183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334321429
5008	NC_015597	GGC	2	6	252221	252226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321429
5009	NC_015597	CGC	2	6	252227	252232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321429
5010	NC_015597	TTCA	2	8	252236	252243	25 %	50 %	0 %	25 %	334321429
5011	NC_015597	GGCT	2	8	252281	252288	0 %	25 %	50 %	25 %	334321429
5012	NC_015597	TG	3	6	252289	252294	0 %	50 %	50 %	0 %	334321429
5013	NC_015597	CGTC	2	8	252313	252320	0 %	25 %	25 %	50 %	334321429
5014	NC_015597	TACCC	2	10	252373	252382	20 %	20 %	0 %	60 %	334321429
5015	NC_015597	CAT	2	6	252535	252540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334321430
5016	NC_015597	CGT	2	6	252603	252608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
5017	NC_015597	CCT	2	6	252666	252671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334321430
5018	NC_015597	CAC	2	6	252673	252678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
5019	NC_015597	CA	3	6	252771	252776	50 %	0 %	0 %	50 %	334321430
5020	NC_015597	CGG	2	6	252805	252810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321430
5021	NC_015597	GAA	2	6	252874	252879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334321430
5022	NC_015597	ACC	2	6	252995	253000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
5023	NC_015597	CGT	2	6	253023	253028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
5024	NC_015597	GCAAG	2	10	253146	253155	40 %	0 %	40 %	20 %	334321430
5025	NC_015597	GTT	2	6	253181	253186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334321430
5026	NC_015597	ACC	2	6	253220	253225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
5027	NC_015597	CGG	2	6	253244	253249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334321430
5028	NC_015597	TTCG	2	8	253268	253275	0 %	50 %	25 %	25 %	334321430
5029	NC_015597	CTT	2	6	253302	253307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334321430
5030	NC_015597	CGC	2	6	253433	253438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334321430
5031	NC_015597	CCA	2	6	253493	253498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334321430
5032	NC_015597	TCG	2	6	253526	253531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
5033	NC_015597	CAA	2	6	253563	253568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334321430
5034	NC_015597	TCG	2	6	253578	253583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334321430
5035	NC_015597	GGT	2	6	253679	253684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015597	TG	3	6	253699	253704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_015597	TTC	2	6	253890	253895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_015597	GGT	2	6	253899	253904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015597	GCTC	2	8	253930	253937	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_015597	TCG	2	6	254028	254033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_015597	AGC	2	6	254075	254080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015597	TCG	2	6	254210	254215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_015597	CT	3	6	254257	254262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_015597	CCG	2	6	254289	254294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_015597	GGC	2	6	254358	254363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_015597	GCG	2	6	254365	254370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_015597	GC	3	6	254455	254460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_015597	CCG	2	6	254466	254471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_015597	CGG	2	6	254519	254524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_015597	CGC	2	6	254545	254550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_015597	GA	4	8	254562	254569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015597	CCGA	2	8	254642	254649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_015597	GCA	2	6	254717	254722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_015597	GCA	2	6	254758	254763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015597	CTT	2	6	254836	254841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_015597	CTG	2	6	254920	254925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_015597	TGC	2	6	254930	254935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_015597	ATCA	2	8	255043	255050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_015597	TCA	2	6	255168	255173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_015597	CA	4	8	255209	255216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_015597	CGG	2	6	255346	255351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_015597	CAG	2	6	255450	255455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_015597	GAA	2	6	255500	255505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015597	GCC	3	9	255542	255550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_015597	GCC	2	6	255568	255573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_015597	CTGGCG	2	12	255620	255631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_015597	ACGC	2	8	255655	255662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_015597	TCA	2	6	255666	255671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_015597	GC	3	6	255703	255708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_015597	CAA	2	6	255721	255726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_015597	AAG	2	6	255749	255754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015597	GCA	2	6	255805	255810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_015597	CAT	2	6	255883	255888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_015597	CAA	2	6	255896	255901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_015597	GCC	2	6	255916	255921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_015597	CTT	2	6	255926	255931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_015597	GC	4	8	256106	256113	0 %	0 %	50 %	50 %	334321431
5078	NC_015597	GCGG	2	8	256125	256132	0 %	0 %	75 %	25 %	334321431

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.